Protein Alignment Vps52 and vps52

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608931.1
• Gene: Vps52 / 33774
• FlyBaseID: FBgn0031710
• Length: 662
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_596131.1
• Gene: vps52 / 2540233
• PomBaseID: SPBC336.11
• Length: 508
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 521
• Identity: 120/521 - (23%)
• Similarity: 238/521 - (45%)
• Gaps: 31/521 - (5%)

  Fly    42 VENKSIED-YIAESQNIANLHNQINDCDDVLERMENMLMSFQSVLNNISTEITQLQRKSVSMSLQ 105
            ::..|.:| |.....::..|.:..:..:|||..:|.    ||..|:..:::|.::..:|..:.:.
pombe     1 MQRASTQDVYDGSGDDLNKLDSLKSVLNDVLSSLER----FQVDLDVATSDIYKVSERSNKIQVN 61

  Fly   106 LTNRQSVKAQLSQFIEDMAVSEEMINIIMETPVTERDFSTQLNVLNHKLSLVKELS-----FKES 165
            |.|.::|::.|...|:...:..::|..|....:....:::.|..|...|...::.|     |...
pombe    62 LNNLKAVESALGAEIDGAILPPDLIKTISTGDMDHPSWNSALEKLTSFLEGGEDDSSLGNMFNSL 126

  Fly   166 KSTSDVSDVLQKLRLKAMAKIRSYLLEQIYKFRKPMTN-YQIPQNAMLKHKFFFEFILSNERHVA 229
            :...|...::.|||.||:.:||:|::..|..||:...: :.|.::.::.:|.::.|:....|.:|
pombe   127 QINKDQKKLVDKLRDKAIERIRNYIVVTIKMFRQAFVDVFPIRKHRLIANKNYYLFLFKFNRKLA 191

  Fly   230 QEICSEYIDTMGKIYYSYFKSYSTRLTSLKFEESCTKDDLMGIEDNASKGLF--SKTTSLKHKST 292
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pombe   192 LELQRAYINTMNWFYLYHFEQYSRFLDKV----HVLKGETIRVEED-RKGLFNLSKGAQQSYGNQ 251

  Fly   293 IFTIGKRGD--ILNQQLEAPIIVPHAQLKNRYTAEALFRSEQYALVDNACREYLFVTEFFMVRGT 355
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pombe   252 MLSVNLRPQDFDMNSVLTAS-TMHHIESSPQY-IERVYCSWELVLTEHVSSEYAFLLEYFNLSKD 314

  Fly   356 QAQDLFNQIMGKTLTLMIKNLETSIHDCFDTIAMFLCIHLIFRYQLMCHKRCVPALDKYWDSLQA 420
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pombe   315 QQATVFAAIFEKTLHFSRKYITGLISSSIDCIGILKSIRFTQKLALQAQTNIVPVIEPHYNSMIL 379

  Fly   421 VIWPRFELVFRLNIQSIHDCDPTKFNKEL--GPHYITRRYAE----FSAAIVGISEHFPNELVSR 479
            .:||||:.|..::.:|:...:.:...:|:  .||.:::|.||    .|...|.:.|..|   |:|
pombe   380 FLWPRFQAVMDMHCESLRKTNLSVKPEEITSRPHPLSQRVAELLYSLSMLSVNVVEAEP---VAR 441

  Fly   480 LLLELQNEVECFILRMAAIFPTRKDQLIYLINNYDLVLGVLMEHTRDNSKEAEAFREQLNSRSAE 544
            ....|..:....:..:......::.|..:|.|||.|:..||...:.:.:.|.:.:.|:||.....
pombe   442 SASRLAQDYVSMLQNLCKTVNDKRRQSRFLSNNYTLISTVLSGVSGNLAIEQKTYFEKLNENLTN 506

  Fly   545 Y 545
            :
pombe   507 F 507

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Vps52	NP_608931.1	Vps52	42..546	CDD:282044	120/521 (23%)
vps52	NP_596131.1	Vps52	1..508	CDD:282044	120/521 (23%)