| Sequence 1: | NP_523475.3 | Gene: | Sgs1 / 33701 | FlyBaseID: | FBgn0003372 | Length: | 1286 | Species: | Drosophila melanogaster |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence 2: | NP_508295.1 | Gene: | H02F09.3 / 186667 | WormBaseID: | WBGene00019146 | Length: | 1275 | Species: | Caenorhabditis elegans |
| Alignment Length: | 1294 | Identity: | 387/1294 - (29%) |
|---|---|---|---|
| Similarity: | 593/1294 - (45%) | Gaps: | 178/1294 - (13%) |
- Green bases have known domain annotations that are detailed below.
|
Fly 8 LTVSILLIQVKNVKANYDWDSMQDGPSEEIIPGCGGDTIYYPDPVQPCDTDSNPTTTKPRQKTKR 72
Fly 73 PKSTRRTTKRTKRPRRKTTKWTTKRATKRTTKRTTRRRPTTPKTPDTTDSPITTTGAECTCSDRT 137
Fly 138 TA---SSTDSTTDRTTVTNTD--WTTPLCTD--------------------------------TP 165
Fly 166 PCTCSEESSTAIPSSPCIDTSTVIPTSPCTQETTTPTPTCSTQGTQTTPCTCAQTTTTPRSTTTT 230
Fly 231 STSRPTT-----TTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTRRPTTTTPRCTTTTSTCAPTTTTPRS 290
Fly 291 TTTTTTSRPTTTTPRCTTTTSTCSPTRTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRCTTTPSTSRPTTTTPRST 355
Fly 356 TKTSTCAPTTTTPRPT---TTPST--SRPTTT-TPRSTT----TTSTSRPTT--TTPRSTTTTTT 408
Fly 409 R---RPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTT-TTCTCSPTTTTPRSTTT 469
Fly 470 TSTSRPTTTTPRSTTTTSTSGPTT----TTPRSTTTT------TTSGPTTTTPRSTTTTCTCSPT 524
Fly 525 TT-TPRSTTTPSTSRPTTTTPRST----------TTTCTCSPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRS 578
Fly 579 TTTTTTSRPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTT-----STSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTT 638
Fly 639 TPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTT 703
Fly 704 PRSTTTTSTSGPT----------TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTT 758
Fly 759 STSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPR--STTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTT 821
Fly 822 TSTSGPTTTTPRSTTT--TSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTT---TTPR 881
Fly 882 STTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSCPTTTTPRST----TTTCTSGPTTT 942
Fly 943 TPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTT--TCTSGPTTTTPRSTTKTSTCAPTT 1005
Fly 1006 TTPRSTTTTSTSRPTTTTPRST----TTTTTSRPTTTTPRSTTTPSTSRPTTTTPRSTTTTSTSR 1066
Fly 1067 PTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTPRSTTT--TTTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPCTS 1129
Fly 1130 RPT---TTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPCPTTTPSASPTRTTTTRRPCPCHPQPP 1185 |
| Gene | Sequence | Domain | Region | External ID | Identity |
|---|---|---|---|---|---|
| Sgs1 | NP_523475.3 | None | |||
| H02F09.3 | NP_508295.1 | FhaB | <333..1227 | CDD:442443 | 294/919 (32%) |