DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Sgs1 and H02F09.3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523475.3 Gene:Sgs1 / 33701 FlyBaseID:FBgn0003372 Length:1286 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_508295.1 Gene:H02F09.3 / 186667 WormBaseID:WBGene00019146 Length:1275 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1294 Identity:387/1294 - (29%)
Similarity:593/1294 - (45%) Gaps:178/1294 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 LTVSILLIQVKNVKANYDWDSMQDGPSEEIIPGCGGDTIYYPDPVQPCDTDSNPTTTKPRQKTKR 72
            |.::|:|:...|..|.:|                 |..|    .|..|:::|.|..:..|  .||
 Worm    27 LILTIVLVSRPNKAAPFD-----------------GRVI----TVSLCNSNSEPQISSLR--FKR 68

  Fly    73 PKSTRRTTKRTKRPRRKTTKWTTKRATKRTTKRTTRRRPTTPKTPDTTDSPITTTGAECTCSDRT 137
            ..:|..:....|...|   .:.|..|.......||....:|...|.|  ..:.....|...:|.:
 Worm    69 DANTDCSFNANKNQLR---NFLTSSAEDANFILTTYSGTSTKTEPLT--KQLALDQLEAIKADGS 128

  Fly   138 TA---SSTDSTTDRTTVTNTD--WTTPLCTD--------------------------------TP 165
            :|   ||...:.|.:..:|||  :.||..|:                                |.
 Worm   129 SAVKQSSAIESYDPSAYSNTDLVFFTPCQTNYDGIEDDIKNVQTAINKVITKTFVIVSLSLNSTD 193

  Fly   166 PCTCSEESSTAIPSSPCIDTSTVIPTSPCTQETTTPTPTCSTQGTQTTPCTCAQTTTTPRSTTTT 230
            ..:...|::..||::|..|.|..|........|.||..|.||..|.|...|.|    .|.:|.|.
 Worm   194 MNSRYGEAAHNIPTTPTEDISNKINNILNIGTTQTPPVTTSTMATTTANVTSA----APNTTVTI 254

  Fly   231 STSRPTT-----TTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTRRPTTTTPRCTTTTSTCAPTTTTPRS 290
            ||| |||     :|.::::|||.:.||||....||..|......|.|....|:....|:|.....
 Worm   255 STS-PTTVVTVPSTAQTSSTTTVTVPTTTVTGPTTVVTVPTTVVTIPSTVVTSPITTPSTVVTVP 318

  Fly   291 TTTTTTSRPTTTTPRCTTTTSTCSPTRTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRCTTTPSTSRPTTTTPRST 355
            :|..|......|.|   :|..|...|..|..||..|..:...|::|...|||:|...|.:|..:.
 Worm   319 STVVTVPSTAVTKP---STVVTAPSTVVTVPSTVVTKPNTVVTSSPTVATTPTTVVTTPSTVVTV 380

  Fly   356 TKTSTCAPTTTTPRPT---TTPST--SRPTTT-TPRSTT----TTSTSRPTT--TTPRSTTTTTT 408
            ..|....|||....|:   |.|||  :.|||. |.|||.    ||..|.|:|  |:..||..||.
 Worm   381 PSTVVTVPTTVVTNPSTVVTAPSTVVTVPTTVMTSRSTVITTPTTGGSSPSTAGTSLASTAVTTE 445

  Fly   409 R---RPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTT-TTCTCSPTTTTPRSTTT 469
            .   ..:|..|..:|:.|.|..:|.||.|:|...||..|..:.:.|. |:.:..|||..|.::|.
 Worm   446 TSIGSSSTPLPSQSTSLSMSSLSTYTPSSSTAGATSPATQQSTKPTIGTSMSSGPTTVAPGASTE 510

  Fly   470 TSTSRPTTTTPRSTTTTSTSGPTT----TTPRSTTTT------TTSGPTTTTPRSTTTTCTCSPT 524
            ::..:  ::||..||.|..||.:|    |:|:::|.|      |.||.|.|:..:.::..|.|||
 Worm   511 STVLQ--SSTPSGTTVTLPSGSSTATAGTSPQASTVTTVTDISTVSGSTVTSQTAESSLSTESPT 573

  Fly   525 TT-TPRSTTTPSTSRPTTTTPRST----------TTTCTCSPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRS 578
            :. :..||.:..:|:|:|..|.|:          :|..|.||.||   .::.:|||.|:|.:..|
 Worm   574 SAGSSISTVSTVSSQPSTYIPVSSASSIYSTLSGSTGSTASPGTT---ESSGSSTSGPSTISGSS 635

  Fly   579 TTTTTTSRPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTT-----STSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTT 638
            .:|.|.|   |.|..||.:.||.  ::|.|.||.:|     :.||.:.:|...:|.::::|.:|.
 Worm   636 ASTVTGS---TVTEASTISGSTE--SSTIPGSTESTVSEASTVSGSSVSTVSGSTESTSAGASTV 695

  Fly   639 TPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTT 703
               |.:|.||...::|...||.:|:..|.|.:|...::.::.||.|.:|..||.:.||.  :|.|
 Worm   696 ---SGSTGSTVSDSSTISDSTGSTNAPGSTESTVTGSSVSTVSGSTGSTGPSTMSASTG--STNT 755

  Fly   704 PRSTTTTSTSGPT----------TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTT 758
            |.||.:|.|.|.|          |..|.| |.:||:|.:|.:..|.:|.|.|..:|.:..|..|.
 Worm   756 PGSTESTITDGSTVSGSTGSTGSTNNPGS-TDSSTTGISTVSGSSLSTISGSTGSTVSGSSDMTV 819

  Fly   759 STSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPR--STTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTT 821
            ||.  :|::|.||.:| .||.:|.:|.  |:..|||||.:.:|...:|::||:|.:|.:..|.:|
 Worm   820 STG--STSSPGSTEST-VSGASTMSPSTGSSVETSTSGSSVSTVSQSTSSSTTGQSTVSESSVST 881

  Fly   822 TSTSGPTTTTPRSTTT--TSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTT---TTPR 881
            .|:....:.:..||||  ::..|.|.:|...::|.|.|..:|.||.||.:|.|....|   |...
 Worm   882 VSSESTISQSTGSTTTGESTVFGSTGSTATGSSTMSASTGSTDTPGSTESTITGSTVTGESTVSG 946

  Fly   882 STTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSCPTTTTPRST----TTTCTSGPTTT 942
            ||.:|.|.|.|.:....||...::|.|.|   ..:|.|.|..:|.|..||    |.:..||.|.:
 Worm   947 STGSTITEGSTISESTMTTVGVSTGSTIT---GESTVSGSTRSTVTGESTVSGSTESTVSGSTES 1008

  Fly   943 TPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTT--TCTSGPTTTTPRSTTKTSTCAPTT 1005
            ||...:|...|..:|.|..||.:..|:..::.:..|:|.  :..||.:.:|..|:|.:||...:|
 Worm  1009 TPTVPSTVSGSTGSTVTGESTVSGSTASTSSGSTGSSTEAGSTVSGSSASTVTSSTGSSTSGEST 1073

  Fly  1006 TTPRSTTTTSTSRPTTTTPRST----TTTTTSRPTTTTPRSTTTPSTSRPTTTTPRSTTTTSTSR 1066
            .:..:.:|.|.|..:|.|..||    |.:|.:..:|.:..|.:|.|.:..:|.|..||.:.||. 
 Worm  1074 VSGSTVSTVSGSTGSTITGESTVSGSTESTVTAESTVSGSSVSTVSGNTGSTITGESTVSGSTG- 1137

  Fly  1067 PTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTPRSTTT--TTTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPCTS 1129
               :|..||...|:.:..:.:..||.|  :|.||.:.:|..::|.:|.|..::.:..||.||.::
 Worm  1138 ---STGESTILESSVSTVSVSTGSTITDGSTASRSSVSTVSASTESTVSGGSSASIGSTNTPDST 1199

  Fly  1130 RPT---TTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPCPTTTPSASPTRTTTTRRPCPCHPQPP 1185
            ..|   :|...||.:|.:|..:..|..:.|:....:|.|.|...|::|........|||
 Worm  1200 ESTISGSTISGSTGSTESSTMSAGTGSTETSTSGGSTVSGSSLSTSSTESSGSSSTQPP 1258

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Sgs1NP_523475.3 None
H02F09.3NP_508295.1 FhaB <333..1227 CDD:442443 294/919 (32%)

Return to query results.
Submit another query.