Protein Alignment Ir25a and grid1b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001260049.1
• Gene: Ir25a / 33683
• FlyBaseID: FBgn0031634
• Length: 947
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_009304811.1
• Gene: grid1b / 557511
• ZFINID: ZDB-GENE-121214-84
• Length: 1048
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1025
• Identity: 242/1025 - (23%)
• Similarity: 415/1025 - (40%)
• Gaps: 217/1025 - (21%)

  Fly    37 NVLFINEVDNEPAAKAVEVVLTYLKKNIRYGLSVQLDSIEANKSDAKVLLEAICNKYATSIE--K 99
            :::.|..:..|.||:..||....:.     .||:..|.:::.|....:......|.:....|  :
Zfish    22 SIIHIGAIFEENAARDDEVFQLAIS-----DLSLNDDILQSEKITHSIKYIEPNNPFQAVQEACE 81

  Fly   100 KQTPHLILDTTKSGIAS-ETVKSFTQALGLPTISASYGQQGDLRQWRDLDEAK--QKYLLQVMPP 161
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Zfish    82 LMTQGILALVTSTGCASASALQSLTDAMHIPHLYVQRNAEGSPRTACQLNPSPDGERYTLAARPP 146

  Fly   162 ADIIPEAIRSIVIHMNITNAAILYDDSFVMDHKYKSL---------------LQNIQTRHVITAI 211
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Zfish   147 VR-LGDVMLTLVGELRWQKFIVFYDS----DYDIRGLQVFLDQTSRQGLDVSLQRVD-RNISGVF 205

  Fly   212 AKDGKREREEQIEKLRNLDINNFFILGTLQSIRMVLESVKPAYF-----ERNFA---WHAITQNE 268
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Zfish   206 SSLFTSMRTEELNRYRD----------TLRRAILLLSPRGAQVFIHQAVETNLASKDSHWVFVNE 260

  Fly   269 GEIS---------SQRDNATIMFMKPMAYTQYRD-RLGLLRTTYNLNE---EPQ--------LSS 312
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Zfish   261 -EISDTEILELAHSSLGRMTVV---RQIFPLWRDSSVSCMRNSHRISSLLCDPQEGYLQSLEVSN 321

  Fly   313 AFYFDLALRSFLTIKEMLQSGAWPKDMEYLNCDDFQGGNTPQRNLDLRDYFTKITEPTSYGTFDL 377
            .:.:|..|.........|:...| ..|..|||
Zfish   322 LYLYDSVLMLANAFYRKLEDRKW-HSMASLNC--------------------------------- 352

  Fly   378 VTQSTQPFNG-------------------HSFMKFEMDINV-LQIRGGSSVNSKSIGK------- 415
            :.:||:|:||                   ..||:...:.:| .:|.|.|.  |::.||
Zfish   353 IRKSTKPWNGGWSMLETIQKGRITGLTGIMDFMENGSNSHVQFEILGTSF--SETFGKDIKRLAT 415

  Fly   416 W--ISGLNSELIVKDEEQMKNLTADTVYRIFTVVQAPFIMRDET---APKGYKGYCIDLINEIAA 475
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Zfish   416 WDSVHGLNGSL---KESRIENGMQGVTVKVVTLLEDPFVMVAENILGQPKRYKGFSIDVLEALAK 477

  Fly   476 IVHFDYTIQEVEDGKFGNMDENGQWNGIVKKLMDKQADIGLGSMSVMAEREIVIDFTVPYYDLVG 540
            |:.|.|.|.:|.|.|:|:...||.|||::.:|::|:||:.:.::::..|||.|:||:..|.| ..
Zfish   478 ILGFKYDIYQVADSKYGSQLSNGSWNGMIGELINKRADLAVSAITITPERENVVDFSKRYMD-YS 541

  Fly   541 ITIMMQRPSSPSSLFKFLTVLETNVWLCILAAYFFTSFLMWIFDRWSPYSYQNNREKYKDDEEKR 605
            :.|:.::|....::|......:..||.||.||......|:::..|......||....:.......
Zfish   542 VGILHRKPEEKINIFSLFAPFDLAVWACIAAAIPVVGVLIFLLTRMQMLRSQNPPGAHHASSMSN 606

  Fly   606 EFNLKECLWFCMTSLTPQGGGEAPKNLSGRLVAATWWLFGFIIIASYTANLAAFLTVSRLDTPVE 670
              :|...:|....:...|||.....:::.|:|..:||||..|:.:||||||||||||||:|..:.
Zfish   607 --SLHSAIWIVYGAFVQQGGDSVVGSVALRIVMGSWWLFTLIVCSSYTANLAAFLTVSRMDNTIR 669

  Fly   671 SLDDLAKQYKILYAPLNGSSAMTYFERMSN--IEQ--MFYEIWKDLSLNDSLTAVERSKLAVWDY 731
            :..|||:|....|..:..|:...||:....  :||  .:.|:|:.:|.|:.           .|:
Zfish   670 TFQDLARQMDFAYGTVRDSAVYDYFKAKGTNPLEQDSTYAELWRTISKNNG-----------QDF 723

  Fly   732 PVSDKYTKMWQAMQEAKLPATLDEAVARVRNSTAATGFAFLGDATDIRYLQLT--NCDLQVVGEE 794
            .||..                 .|.:.:.:...    :|||.|...:.|..||  :|.:.|.|..
Zfish   724 SVSSP-----------------SEGIRKAKKGP----YAFLWDMAVVEYAALTDDDCTITVSGNS 767

  Fly   795 FSRKPYAIAVQQGSHLKDQFNNAILTLLNKRQLEKLKEKWWKNDEALAKCD---KPEDQSDG--I 854
            .|.|.|.||:|.||..:|..:..||.|..|..|:.||:|||..   ..:||   ....|.||  :
Zfish   768 MSSKGYGIAMQHGSPYRDLISQKILELQEKGDLDVLKQKWWPR---TGRCDLNSHSNAQPDGRSL 829

  Fly   855 SIQNIGGVFIVIFVGIGMACITLVFEYWWYRYR---KNPRII----------------DVAEANA 900
            .:.:..|||.::..|:.:||:....|.||...|   :.|:.:                |:|.|::
Zfish   830 KLHSFAGVFCILAAGLLLACLVAALEMWWNSNRCRQEQPKEVTKDYRLARVSGPLTYNDIATASS 894

  Fly   901 ERS----NAADHPGKLVDGVILGHSGEKFEKSKAALRPRFNQYPATFKPR 946
            |.|    ...:......:.:..|..||....:.|..:|....:.....||
Zfish   895 EGSKDIWTDRERDWDEAEAIDTGQGGEPGTGASAFEQPYGRGHGTQADPR 944

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir25a	NP_001260049.1	PBP1_iGluR_AMPA_Like	37..418	CDD:380606	83/458 (18%)
		PBP2_iGluR_putative	438..836	CDD:270435	124/406 (31%)
grid1b	XP_009304811.1	PBP1_iGluR_delta_1	25..426	CDD:380615	86/461 (19%)
		Periplasmic_Binding_Protein_Type_2	437..809	CDD:473866	124/406 (31%)