Protein Alignment Ir25a and gria4a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001260049.1
• Gene: Ir25a / 33683
• FlyBaseID: FBgn0031634
• Length: 947
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_999971.1
• Gene: gria4a / 407735
• ZFINID: ZDB-GENE-020125-7
• Length: 898
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1030
• Identity: 274/1030 - (26%)
• Similarity: 444/1030 - (43%)
• Gaps: 259/1030 - (25%)

  Fly    11 ILWLLGFLSLLSSFSLEIAAQTTQNINVLFINEVDNEPAAKAVEVVLTYLKKNIR---YGLSVQL 72
            :||.||          |.|..::..|..|||...|.|..|..:.:.|.....|..   :.|...:
Zfish     9 LLWGLG----------EGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNATEAPFNLVPHV 63

  Fly    73 DSIEANKSDAKVLLEAICNKYATSI------EKKQTPHLILDTTKSGIASETVKSFTQALGLPTI 131
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Zfish    64 DNIETANSFA--VTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVH-------------TLTSFCSALHISLV 113

  Fly   132 SASYGQQGDLRQWRDLDEAKQKYLLQVMPPADIIPEAIRSIVIHMNITNAAILYD---------- 186
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Zfish   114 TPSFPAEGE-----------TQFVLQLRPS---IRGALLSLLDHYDWSRFVFLYDTDRGYAVLQA 164

  Fly   187 -----------------DSFVMDHKYKSLLQNIQTRHVITAIAKDGKREREEQIEKLRNLDINNF 234
                             ::| .|..|:.||:::..|       ::.|...:.:.|:|:|:
Zfish   165 IMEKAGQNGWQVSAICVENF-NDASYRRLLEDLDRR-------QEKKFVIDLEAERLQNI----- 216

  Fly   235 FILGTLQSIRMVLESVKPAYFERNFAWHAITQNEG--EISSQR-----DNAT----IMFMKPMAY 288
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Zfish   217 -----LEQIVSVGKHVK--------GYHYIVANLGFKDISLERFMHGGANVTGFQLVDFSKPMV- 267

  Fly   289 TQYRDRLGLLRTTYNLNEE--------PQLSSAFYFDLALRSFLTIKEMLQSGAWPKDMEYLNCD 345
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Zfish   268 ------IKLMQRWNKLDQREYPGSESPPRYTSSLTYD----GVLVMAEAFR-------------- 308

  Fly   346 DFQGGNTPQRNLDLRDYFTKITEPTSYGTFDLVTQSTQPFNGHSFMKFEMDINVLQIRG------ 404
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Zfish   309 -----NLRRQKID-------ISRRGNAG--DCLANPAAPWN--QGIDMERTLKQVRIQGLTGNIQ 357

  Fly   405 ----GSSVN------------SKSIGKWISGLNSELIVKDEEQMKNLTA--DTVYRIFTVVQAPF 451
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Zfish   358 FDHYGRRVNYTMDVFELKSNGPRKIGYW-NDLDKLVLVQNELSMGNDSAMENRTVIVTTIMEGPY 421

  Fly   452 IMRDET-----APKGYKGYCIDLINEIAAIVHFDYTIQEVEDGKFGNMD-ENGQWNGIVKKLMDK 510
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Zfish   422 VMLKKNWEMYEGNEQFEGYCVDLASEVAKHIGIKYKISIVLDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYG 486

  Fly   511 QADIGLGSMSVMAEREIVIDFTVPYYDLVGITIMMQRP-SSPSSLFKFLTVLETNVWLCILAAYF 574
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Zfish   487 KAEIAVAPLAITLVREEVIDFSKPFMSL-GISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYI 550

  Fly   575 FTSFLMWIFDRWSPYSYQNNR-EKYKD----DEEKREFNLKECLWFCMTSLTPQGGGEAPKNLSG 634
            ..|.::::..|:|||.:.... |:..|    |:...||.:...|||.:.:...||....|::|||
Zfish   551 GVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEEGSDGPPSDQPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDFTPRSLSG 615

  Fly   635 RLVAATWWLFGFIIIASYTANLAAFLTVSRLDTPVESLDDLAKQYKILYAPLNGSSAMTYFERMS 699
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Zfish   616 RIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFF---- 676

  Fly   700 NIEQMFYEIWKDLSLNDSLTAVERSKLAVWDYPVSDKYTKMWQAMQEAK---LPATLDEAVARVR 761
                                  .|||:||        |.|||..|:.|:   ...|..|.|||||
Zfish   677 ----------------------RRSKIAV--------YEKMWSYMKSAEPTVFTKTTAEGVARVR 711

  Fly   762 NSTAATGFAFLGDATDIRYL-QLTNCDLQVVGEEFSRKPYAIAVQQGSHLKDQFNNAILTLLNKR 825
            .|...  :|||.::|...|. |...||...||.....|.|.:|..:||.|....|.|:|.|....
Zfish   712 KSKGK--YAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSQLGTPVNLAVLKLSEAG 774

  Fly   826 QLEKLKEKWWKNDEALAKCDKPED------QSDGISIQNIGGVFIVIFVGIGMACITLVFEYWWY 884
            .|:|||.|||.:.   .:|. |:|      .|..:|:.|:.|||.::..|:|:|.:..:.|: .|
Zfish   775 VLDKLKNKWWYDK---GECG-PKDSGSKDKSSQALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALVEF-CY 834

  Fly   885 RYRKNPRIIDVAEANAERSNA-ADHPGKL-VDGVILG-------HSGEKFEKSKA 930
            :.|...:.:.:..:.|.|:.| ....|.| .:|.:|.       |||..:....|
Zfish   835 KSRAEAKKLKLTFSEAMRNKARLSITGSLGENGRVLTPDCPKAVHSGPSYRHGPA 889

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir25a	NP_001260049.1	PBP1_iGluR_AMPA_Like	37..418	CDD:380606	87/457 (19%)
		PBP2_iGluR_putative	438..836	CDD:270435	147/413 (36%)
gria4a	NP_999971.1	PBP1_iGluR_AMPA_GluR4	23..395	CDD:380611	89/468 (19%)
		PBP2_iGluR_AMPA_GluR4	408..790	CDD:270445	148/421 (35%)