Protein Alignment Ir25a and gria1b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001260049.1
• Gene: Ir25a / 33683
• FlyBaseID: FBgn0031634
• Length: 947
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_991293.1
• Gene: gria1b / 403044
• ZFINID: ZDB-GENE-020125-2
• Length: 917
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1007
• Identity: 259/1007 - (25%)
• Similarity: 440/1007 - (43%)
• Gaps: 222/1007 - (22%)

  Fly     9 SKILWLLGFLSLLSSFSLEIAAQTTQNINVLFINEVDNEPAAKAVEVVLTYLKKNIRYGLS---- 69
            |.:|.|.|.|.|.|..|.      ..|||:..:...|:.    ..:|        .|:.||
Zfish     4 SFVLLLTGLLGLCSCSSF------PSNINIGGLFPTDSH----EYDV--------FRFALSQHND 50

  Fly    70 -----VQLDSIEANKSDAKVLLEAICNKYATSI------EKKQTPHLILDTTKSGIASETVKSFT 123
                 .|:|.::...|.|  :..|.|::::..:      ..::|.::::             ||.
Zfish    51 VPKLVPQVDMVDTGSSFA--MTYAFCSQFSKGVYAIIGLYDRKTMNMLM-------------SFC 100

  Fly   124 QALGLPTISASYGQQGDLRQWRDLDEAKQKYLLQVMPPADIIPEAIRSIVIHMNITNAAILYDDS 188
            .||.:..::.|:          .:|...| :::|:.|.   :.:|:.::|.|........:|...
Zfish   101 GALHVCFVTPSF----------PIDTNNQ-FVIQLRPE---LQDALIALVEHYKWNKFVYMYSSD 151

  Fly   189 FVMDHKYKSLLQNIQTRHVITAIAKDGKREREEQIEKLRNLDINNFF--ILG-TLQSIRMVLESV 250
            ..:....|.|....:....:|:|..|...| ...::.:::||....|  ||. .|:.:..:|..:
Zfish   152 SGLTVLQKILDTAAEKTWQVTSINFDTLTE-AAFLKAIQDLDNKKEFKIILDCELERLNSILNLI 215

  Fly   251 KPAYFERNFA-WHAITQNEGEI-----SSQRDNATIMFMKPMAYTQYRDRLGLLRTTYNLNEEPQ 309
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Zfish   216 --AAQKKNLKNYHYILANLGFLDLNLTEFRKGGANVTGFQLMNYT-----------------NPT 261

  Fly   310 LSSAF--YFDLALRSFLTIKEMLQ-SGAWPKDMEYLNCDDFQGGNTPQRNLDLR------DYFTK 365
            :|...  :.:...:...:.|..|: :||...|...:....||  |..::.:|:.      :....
Zfish   262 VSRTIQDWLEFDSKDLKSPKRRLKYTGALTYDGVTVMATAFQ--NLRKQRIDISRRGNAGECLAN 324

  Fly   366 ITEPTSYG----------TFDLVTQSTQPFN--GHSFMKFEMDINVLQIRGGSSVNSKSIGKW-- 416
            ...|...|          .|:.:|...| ||  ||   :....::|::.  |.| ..|.:|.|
Zfish   325 PPAPWGQGIDIQRALQQVQFEGLTGHVQ-FNDKGH---RTNFTVSVMEF--GPS-GPKKVGYWNQ 382

  Fly   417 ----ISGLNSELIVKDEEQMKNLTADTVYRIFTVVQAPFIMRDETAPK-----GYKGYCIDLINE 472
                :|......::.:...::|.|    |.:.|:::||::|..:...:     .|:|||::|..|
Zfish   383 REKYVSTATYSNMLNETFGLQNRT----YVVTTILEAPYVMLKKNHEQLVGNDKYEGYCVELAAE 443

  Fly   473 IAAIVHFDYTIQEVEDGKFGNMD-ENGQWNGIVKKLMDKQADIGLGSMSVMAEREIVIDFTVPYY 536
            ||..|.:.|.::.|.|||:|..| |...|||:|.:|:..:||:.:..:::...||.||||:.|:.
Zfish   444 IAKHVGYSYRLELVGDGKYGARDAETMMWNGMVGELVYGKADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFM 508

  Fly   537 DLVGITIMMQRPS-SPSSLFKFLTVLETNVWLCILAAYFFTSFLMWIFDRWSPYSY--------- 591
            .| ||:||:::|: |...:|.||..|...:|:||:.||...|.::::..|:|||.:
Zfish   509 SL-GISIMIKKPTKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHADDEEETA 572

  Fly   592 --------------------QNNRE--KYKDDEEKREFNLKECLWFCMTSLTPQGGGEAPKNLSG 634
                                ||.||  :.|..|...||.:...|||.:.:...||...:|::|||
Zfish   573 DQQNQNQPPSPEPNQSPNQSQNQREEKQEKQPEHTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSG 637

  Fly   635 RLVAATWWLFGFIIIASYTANLAAFLTVSRLDTPVESLDDLAKQYKILYAPLNGSSAMTYFERMS 699
            |:|...||.|..|||:||||||||||||.|:.:|:||.:|||||.:|.|..|:|.|...:|
Zfish   638 RIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDGGSTKEFF---- 698

  Fly   700 NIEQMFYEIWKDLSLNDSLTAVERSKLAVWDYPVSDKYTKMWQAMQEAK---LPATLDEAVARVR 761
                                  .|||:||::        |||..|:.|:   ...|.||.|.|||
Zfish   699 ----------------------RRSKIAVFE--------KMWSYMKSAEPTVFVKTTDEGVVRVR 733

  Fly   762 NSTAATGFAFLGDATDIRYL-QLTNCDLQVVGEEFSRKPYAIAVQQGSHLKDQFNNAILTLLNKR 825
            .|...  :|:|.::|...|: |...||...||.....|.|.:|..:||.|::..|.|:|.|..:.
Zfish   734 KSKGK--YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQG 796

  Fly   826 QLEKLKEKWWKNDEALAKCDK----PEDQSDGISIQNIGGVFIVIFVGIGMACITLVFEYWW--- 883
            .|:|||.|||.:.   .:|..    .:|::..:|:.|:.|||.::..|:|:|.:..:.|:.:
Zfish   797 LLDKLKNKWWYDK---GECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALVEFCYKSR 858

  Fly   884 YRYRKNPRIIDVA--EANAERSNAADHPGKLV 913
            ...|:..:|||.|  .:...|..:....|:::
Zfish   859 IESRRMKQIIDAAMLSSTLTRMGSGGENGRVM 890

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir25a	NP_001260049.1	PBP1_iGluR_AMPA_Like	37..418	CDD:380606	75/431 (17%)
		PBP2_iGluR_putative	438..836	CDD:270435	152/439 (35%)
gria1b	NP_991293.1	PBP1_iGluR_AMPA_GluR1	26..390	CDD:380613	76/433 (18%)
		PBP2_iGluR_AMPA_GluR1	404..812	CDD:270447	155/451 (34%)