Protein Alignment Ir25a and grin3bb

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001260049.1
• Gene: Ir25a / 33683
• FlyBaseID: FBgn0031634
• Length: 947
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017213803.2
• Gene: grin3bb / 100333101
• ZFINID: ZDB-GENE-131122-77
• Length: 1114
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1029
• Identity: 218/1029 - (21%)
• Similarity: 386/1029 - (37%)
• Gaps: 284/1029 - (27%)

  Fly    66 YGLSVQLDSIEANKSDAKVLLEAICNKYATSIEKKQTPHLIL---DTTKSGIASETVKSFTQALG 127
            |.||:.:.:.||...|.:.|...:|.....     |....:|   .|.:..:..|.:.||   |.
Zfish    82 YNLSLDVVAREAQSGDPESLFRCVCQDIVV-----QGVSAVLAFPQTQEEIVQMEFMSSF---LE 138

  Fly   128 LPTIS-ASYGQQGDLRQWRDLDEAKQKYLLQV---MPPADIIPEAIRSIVIHMNITNA-AIL--- 184
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Zfish   139 IPFISIIEHGEP---------LKTQNRFHLQMTTRIPPSGLV-ELLLAVLQRSGWEESMAVLCHG 193

  Fly   185 YDDSFVMDHKYKSLLQNIQTR--------HVITAIAKDGKREREEQIEKLR----NLD------- 230
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Zfish   194 WEDAGLLD------LLKLQGRFGWGPSQWHLRAALNLSHSTARMANISDFLSEHFNLDHSPPASV 252

  Fly   231 -------------INNFFILG-TLQSIRMVL-ESVKPAYFERNFAWHAI-----TQNEGEISSQ- 274
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Zfish   253 LLFGADPECASSVLRSAHDLGLTLPTVHWIMGHPLSPD------ALHSIGLPLGLLAYGEVDHKP 311

  Fly   275 -----RDNATIMFMKPMAYTQYRDRLGLLRTTYNLNEEPQLSSAFYFDLALRSFLTIKEMLQSGA 334
                 .|...::.....|.|..|..|.|::...|..::|..                .|:..||.
Zfish   312 LDFYISDALQLINRAVTAATVVRPDLALIQNMVNCFDKPNK----------------HELPSSGQ 360

  Fly   335 WPKDMEYLNCDDFQGGNTP---QRNLDLRDYFTKITEPTSYGTF------DLVTQSTQPFNGHSF 390
            :  ...:|:...|.|...|   ||||.        ...||:...      |.|.|.|....| |:
Zfish   361 Y--IARFLSNTSFVGLTGPVIVQRNLS--------RVHTSHKVHIWSLRRDAVGQPTWVTVG-SW 414

  Fly   391 MKFEMDINVLQIRGGSSVNSKSIG-------KWISGL---NSELIVKDEEQMKNLTADTVYRIFT 445
            ....:::....:..|||...::.|       :|.:|.   .|.|                 |:.|
Zfish   415 EGGRLNVEEQGLWQGSSPRQRTEGQMGREGRRWRAGFPVSGSRL-----------------RVVT 462

  Fly   446 VVQAPFIM-----RDETAPKG--------------------------------YK----GYCIDL 469
            :|:.||:.     .|...|.|                                |.    ||||||
Zfish   463 LVEHPFVFTREVDEDGNCPAGQYCLDAGTNSSETLDHLYAERAQGNKSFLPPDYSKCCYGYCIDL 527

  Fly   470 INEIAAIVHFDYTIQEVEDGKFGNMDENGQWNGIVKKLMDKQADIGLGSMSVMAEREIVIDFTVP 534
            :.:::..::|::.:..|.|||:|.: :.|||.|:|..|:...||:.:.|.|:.:.|..|||||.|
Zfish   528 LEKLSEDMNFEFDLYIVGDGKYGAV-KGGQWTGLVGDLLSGVADMAVTSFSINSARSKVIDFTSP 591

  Fly   535 YYDL-VGITIMMQRPSSPSSLFKFLTVLETNVWLCILAAYFFTSFLMWIFDRWSPYS---YQNNR 595
            ::.. :||.:..:..::|  :..|:..|..::|:.|..|...|:..:.:::..||:.   :..||
Zfish   592 FFSTSLGILVRSKDTAAP--IGAFMWPLHWSMWMGIFVALHITALFLTLYEWKSPFGMTPHGRNR 654

  Fly   596 EKYKDDEEKREFNLKECLWFCMTSLTPQG-GGEAPKNLSGRLVAATWWLFGFIIIASYTANLAAF 659
            .|.        |:....|..|...|..:. ..:.||..:||.:...|.:|..::::||||||||.
Zfish   655 VKV--------FSYSSALNLCYAILFGRTVSSKTPKCWTGRFLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAV 711

  Fly   660 LTVSRLDTPVESLDDLAKQYKILYAPLNGSSAMTYFERMSNIEQMFYEIWKDLSLNDSLTAVERS 724
            :...:....|..:.| ||    |:.|..|.       |...:.:...|
Zfish   712 MVGEKTFEEVSGIHD-AK----LHHPSQGF-------RFGTVRESSAE----------------- 747

  Fly   725 KLAVWDYPVSDKYTKMWQAMQEAKLPATLDEAVARVRNSTAATGFAFLGDATDIRY-LQL-TNCD 787
                 || :...:.:|.:.|::...|.|.| .||.::....... ||:.|...:.| :.: .:|.
Zfish   748 -----DY-MKKSFPEMHEYMRKFNEPTTPD-GVATLKTDPPQLD-AFIMDKALLDYEVSIDADCK 804

  Fly   788 LQVVGEEFSRKPYAIAVQQGSHLKDQFNNAILTLLNKRQLEKLKEKWWKNDEALAKCDK---PED 849
            |..||:.|:.:.|.|.:.|.|.|....:..:....:...::.|.:||:|    :..|.|   ...
Zfish   805 LLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNISEFVSRYKSDGYMDMLHDKWYK----VVPCGKRVFAVT 865

  Fly   850 QSDGISIQNIGGVFIVIFVGIGMACITLV------------------FEYWWYRYRKNPRIIDVA 896
            ::..:.|::..|:|:::.||:..|.:||.                  |:||.:..:|..|.:::.
Zfish   866 ETLQMGIRHFSGLFVLLCVGVTGALLTLAGEHAFYRLVLPHIRRKQKFKYWLHTSQKIHRALNMT 930

  Fly   897 -------EANAERS----NAADHPGKLVDGVILGHSGE-KFEKSKAALRPRFNQ 938
                   .||.|:|    .|..||..  ....||.... ..|.:|.|..|:.|:
Zfish   931 YEDVKRQRANTEKSCNIQKAQPHPPP--QPAPLGSFARWNNESAKVAQEPKDNK 982

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir25a	NP_001260049.1	PBP1_iGluR_AMPA_Like	37..418	CDD:380606	80/423 (19%)
		PBP2_iGluR_putative	438..836	CDD:270435	105/445 (24%)
grin3bb	XP_017213803.2	Periplasmic_Binding_Protein_type1	39..427	CDD:471960	75/401 (19%)
		PBP2_iGluR_NMDA_Nr3	457..852	CDD:270438	105/459 (23%)
		Lig_chan	618..885	CDD:459656	68/315 (22%)