Protein Alignment Vps53 and VPS53

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608825.2
• Gene: Vps53 / 33640
• FlyBaseID: FBgn0031598
• Length: 887
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_012505.1
• Gene: VPS53 / 853423
• SGDID: S000003566
• Length: 822
• Species: Saccharomyces cerevisiae
• Alignment Length: 815
• Identity: 174/815 - (21%)
• Similarity: 342/815 - (41%)
• Gaps: 187/815 - (22%)

  Fly    47 TVDY-----INQLFPNEQSLAGIDETIQ-----KMQCEVSLIDDNIRSVVRGQTNTGQDGQLALC 101
            ||||     |..:..:::||..|||.|.     |.|.:..::.:.         |..::......
Yeast     5 TVDYDPLEDITNILFSKESLNNIDELISITRSYKKQLQEDILKEE---------NELKEHPKNSA 60

  Fly   102 EAQKVISSLFSHIIDVKTRAERTEEMVKEITRDIKQLDCAKRNLTAAITTLNHLHMLVGGIESLN 166
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Yeast    61 EIEASLRKVFQDFKETQDVSASTELTISNLTEGISYLDIAKKNLTHSLTLFQNLKILTDSYIQCN 125

  Fly   167 KLIERRSYGEILNPLQAITEVNQH-FQQFSDIEEIKNLSQSVDKIQVTLAQQITEDFKEAFSAKP 230
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Yeast   126 ELLSQGSFKKMVSPYKIMCSLAENTFISYKSLDEINYLLSSISRLKGDTLSKIKQNYNALFSGGN 190

  Fly   231 SSQNQHRLGLNQLADACKVMSVLDPKVKKELLKWFIAQQLEEYTHLFHENQDIAWLDKIDKRYAW 295
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Yeast   191 ISEHDTALTMELREGACELLD-CDTSTRAQMIDWCLDKLLFEMKEIFRVDDEAGSLENLSRRYIY 254

  Fly   296 LKRHLLDFEDKYGPVFPLDWEVSERITVEFCRQTREQLAQIMAK--RTNEIDVRLLLFAINKTQA 358
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Yeast   255 FKKILNNFNSKFADYFLKDWEMAVRLTTTFYHITHKDLQTLLKREFKDKNPSIDLFMTALQSTLD 319

  Fly   359 FEQLLSKRFTGVTLGAQPTDKARVLAEPTTTDGAVGLTVFHDQIGQCFKPHLDIYIRSIDRNLSE 423
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Yeast   320 FEKYIDVRF------------SKKIKEP--------------KLSSCFEPYLTLWV----SHQNQ 354

  Fly   424 LMD-KFVEMSREP-YKFAEAKTTVYPSSGDLFVFYKKCMVQCNQL----SNEQPMYDLALVFKKY 482
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Yeast   355 MMEKKFLSYMSEPKYPSNETESLVLPSSADLFRTYRSVLTQTLELIDNNANDSILTSLANFFSRW 419

  Fly   483 LREYASKVLEGSTPKLVPATTSSSIGKSVSLLTRDMQNLSTAAGQVFHNFLKEGDTQRFARDDLV 547
            |:.|:.|:|   .|.|:|...             ::|:...||...
Yeast   420 LQTYSQKIL---LPLLLPDNI-------------EVQDKLEAAKYT------------------- 449

  Fly   548 RICCVLTTGEYCLETVQQLEDKL------KEKVTSAYVSKIDMSEEKDVFHRIISNCIQLLVQ-- 604
              ..::.|.:||..|:.||||||      :||:.:::      ::.|:::..:::.....|:.
Yeast   450 --VLLINTADYCATTIDQLEDKLSEFSGNREKLANSF------TKTKNIYDDLLAKGTSFLLNRV 506

  Fly   605 ---DLEAGCEASLQAMAKVQW-QHINN------VGDQSAFISSLCGNFKQTVPTIRD-------- 651
               ||            ...| :.|||      :.|.|.::.:|....|  :|.:.|
Yeast   507 IPLDL------------NFVWREFINNDWSNAAIEDYSRYMVTLKSVLK--MPALTDASIKQQQE 557

  Fly   652 ---TLASSRKYFTQFCHRFVAAFIPKFINVLYRCKLTLSDGSNNV-------------------- 693
               |||.....|.:..:::  .|:.|.|::     :|.:..||.:
Yeast   558 QPSTLAFILSQFNRDVYKW--NFLDKVIDI-----ITTNFVSNTIRLLQPVPPFSLAGSKRKFET 615

  Fly   694 -----LGCEQLLLDTHSLKTALLELP-SVGSSVNRKAPTSYTKV---VVKDMTRAEMIIKVVMTP 749
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Yeast   616 RTVVNIG-EQLLLDLELLKEIFHTLPESVSNDSDLRENTSYKRVKRHADNNIDQLLKFIKLLMAP 679

  Fly   750 VQPPAHFTQQVLKLL---PDITIAEYQKILDMKAV 781
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Yeast   680 LDSADDYYETYSKLTNNNPDSAVWSF--VLALKGI 712

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Vps53	NP_608825.2	Vps53_N	43..433	CDD:427710	83/399 (21%)
VPS53	NP_012505.1	Vps53_N	6..368	CDD:427710	83/401 (21%)
		VPS53_C	575..779	CDD:407097	33/148 (22%)