DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-2 and Dnah9

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015505.5 Gene:kl-2 / 3355181 FlyBaseID:FBgn0001313 Length:4459 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414026.1 Gene:Dnah9 / 117251 RGDID:621799 Length:4484 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4628 Identity:1425/4628 - (30%)
Similarity:2330/4628 - (50%) Gaps:418/4628 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    52 VLTIFYD-------CDVL---TGCLGFPVAPVIDL-----------CYFIRSSKEIISIHSFHDM 95
            :|..|.|       |.:|   :|..|..|.|.:|.           .:|:|:..|....||....
  Rat    53 LLQAFLDHNAAAGPCPLLVVQSGPGGLVVRPGLDAGPEPNQARAKGLFFLRTRSEPPGNHSLRGT 117

  Fly    96 VNFGTVQDDVDGCLLKILELIYAPIF---RNFMEWGDNVKQRFCTSLDKFLGILTAIYFKMSGMT 157
            |..|.:.......|..:|..:..|:.   :|.::|...|.|............|..|...|.|.|
  Rat   118 VLCGDLPAVPLEHLAPLLSEVIIPVLDNEKNHLDWPHMVCQDIRHHAHSLQSDLLVILEHMKGRT 182

  Fly   158 VLYVP-------YVVKEIAKEISSYDREFVKNLECIAVSWATLIRILLNDKTLTSPNEYISVGD- 214
            :|.:|       :|..:....:.|.|:..|..:|...:.|:..::::|..::    ::.:..|: 
  Rat   183 LLPLPVGSEKVEFVDGQSEPVLDSIDKSTVYAMESAVIKWSHQVQVVLKRES----SQPLIQGEK 243

  Fly   215 -----EFEFWLYRFEVLQGLNAQLDQVDVQQIIRVLRSTHSVYIKQIDELIFESTHELMEAMENI 274
                 |.|||..|.|.|:.:..||..:.|:.:..:|....|.|:... :.:|:.....:...::|
  Rat   244 PTPKVELEFWKSRCEDLEHIYNQLMTIKVRGMAGLLDKLQSSYLPAF-KAMFQDVEAALTEAQDI 307

  Fly   275 KFLHLLMQPCSQ----LDFSESPTFVSQLIPRTIHLIRFIWLNSEQYNRRDLITGIFRNLSNQII 335
            : :|||  |..|    |:..|.|....:|.| .:|::..||.|.:.|.....:|.:.:.:.|.:|
  Rat   308 R-VHLL--PLQQHLDILENMEFPEVKGRLRP-LLHVVCLIWANCKWYRSPGRLTVLLQEICNLLI 368

  Fly   336 RFCTEKVNVEKILSGSSRFGIKICNMCIDCCLTYKGIYDIMSK---THAKINIRI-GWSLDNAMI 396
            :..:..::.|.:|........:...:..|....:|..:....:   |:.|.:..: .|....:::
  Rat   369 QQASNYLSPEDLLRSEVEESQRKLQIVSDTLSFFKQAFQDRREHLHTYFKEDSEVRAWDFQASLV 433

  Fly   397 FNHVDAFMERLNDVIDICESMMVFGRLDESESIPKPQFGGTSGTEFEATADNVENEFLVTLTALC 461
            |..:|.|:.||..|.|:.::.:.|.:|:      |.:|.|..|.........:..|| ..:..:.
  Rat   434 FVRLDGFLGRLRMVEDLLKTALDFNKLE------KLEFSGLRGNSLSQKVQQMHEEF-EEMYKVF 491

  Fly   462 TDSKEIILNVHKNEWYEEVIKYRRTVQSMEETVQRLMSNVFQHICNVEEALESLNVM-------- 518
            .|.....||....|:..:|..:.:.|:.::..:..::...|..:..||.|.:.|::.        
  Rat   492 LDCSYDCLNPESMEFENDVCGFNKRVEDLDRRLGTILIQAFDDVPEVEHAFKLLDITGTLVERPL 556

  Fly   519 ----IFYSYRSTIRKTFLRQVSSAWVFFSNEID-------SSVHMLMDRSKMHESWVPYYASRAL 572
                :.:.|.:.|| .|..::.:..:.:|..|.       |.||..|........|......|..
  Rat   557 VAQDVSHKYLALIR-MFNTELDAVRIIYSQHIREEVEHGFSPVHKNMPTMAGGIRWAQELRQRIK 620

  Fly   573 GYRVHLDRLVWLCNRLNSSDWLPNVSEASVVLKKFESVRREFDKEVKKSFDEWQKNCCSLLLNQK 637
            |.         ..|..|...|....:|...:::|:|.:....::..::.:::|    |. .:::|
  Rat   621 GP---------FSNFKNIPHWCLQSAEGKRMIQKYEDLLTLLEEYERRLYEDW----CQ-TVSEK 671

  Fly   638 LDRY----LLIRSKKKKGLIECNIDRTILTICEQAQHFERLGLGVPGMVRKIYEKHETL---RFV 695
            ..|.    ||.|....|.| ..|.:..::::.::..:.:      |..|:.|.|....:   |..
  Rat   672 SQRNLSLPLLHRDPITKQL-SVNFNSQLISVLKEMNYLQ------PTEVKPIPETAAAMFSSREF 729

  Fly   696 YNSVV---QVCLN-YNHILSALSEQERKLFRALIQACDRKIAPGVFKLTYGGELSDAYIADCAKH 756
            |..:|   ::..| ||.:::.|.|.|..|....:|..|.::......|::..|    .|.|.|..
  Rat   730 YRQLVANLELMANWYNKVITTLLEVEFPLVEEELQNIDLRLRAAEETLSWKTE----GIWDYAMQ 790

  Fly   757 -TNKLQETMDIYKRAIQNIARFCEKICDTPMLKFNFSGAVTISIFENHLSSYLRR---------- 810
             ||.:.:    .:|.||......|:|               .:|.:..:|...:|          
  Rat   791 ITNSIHD----LERRIQKTKDNVEEI---------------QTIMKTWVSPIFKRKDGKKECPLS 836

  Fly   811 ---VSNILRGFYSTITD---LIFAVFKEFQAVIEDMPIE--WYGFVNVFDDMLATAFLTSSKNSL 867
               ..::|..:||.|.:   .|.|:.:|...:....|..  |..:|...|.||...|..:.:.||
  Rat   837 LDDQQDLLEKYYSLIRESGLKIHALVQENLVLFAADPASSTWKSYVGHIDSMLLDGFFLAIECSL 901

  Fly   868 NMLTNALHRDPDMAAAPILVMESDVRERCIVLTPDIDVIANLLSGYIDRIHNILEQF-------- 924
            ..|.......|.:..    :.|:.:.    ::||::....:|.||....:::|::..        
  Rat   902 KYLLENTECKPGLTP----IFEAQLN----LVTPELVFYPSLDSGVKGGLYDIVQSLVTSIFAVP 958

  Fly   925 ---PRIGIKMKLPKEHQYE----------SFSKAFLEDSESTQLIC----NIEAEINH----ERE 968
               ||:......|   .|:          |.....||..::...:|    |..::.::    :|:
  Rat   959 SLVPRLSPHSGSP---HYQGDLEEMADLASLRSLLLERVQTMMTLCCSYRNTLSQYSYLYVEDRK 1020

  Fly   969 EIDGYITFWNSHRMLWETTELEFTKRVKATQMTADIFEASIEYYSAMADDISYVDAITHVY--FI 1031
            |..|....: .|.:..|..|......:..:......|:..|:.|..:.:|:..::. :.|:  ::
  Rat  1021 EALGQFLLY-GHVLTPEEIEAHVEDGIPESPPLLHHFKDQIDSYEKLYEDVVSLEP-SKVFDGWM 1083

  Fly  1032 LMNQNYIKSSILDCIEKWQALNIKILLSHSFSLIRAIYRYMRKNERKMM-MVPR----------- 1084
            .::....|:|:|:.|:||..:..:.|:....:.:..:..:::..|..:: .|.:           
  Rat  1084 RVDVRPFKASLLNTIKKWSLMFKQHLVDFVTNSLADLDSFIKSTECGLLKRVEKGDFQGLVEIMG 1148

  Fly  1085 ---TLKE-SLLAKQFFERIINEVPLKQAGFPPTLELFAILDKYQVEIPEEIRVKVIGLEAAWHHY 1145
               |||| .......||      ||||     |:||   |..|:.|:||.:..::..|...|.: 
  Rat  1149 HLVTLKERQSSTDDMFE------PLKQ-----TIEL---LKSYEQELPETVFKQLEELPEKWKN- 1198

  Fly  1146 LKRLG----------EADEMLDNNREEFKKILVQQAEKFKIILKEFLDDFFLKLP-TSANINPRI 1199
            :|::.          :|:|:         .:|.|:...|....::|.:.|..:.| ...:|||. 
  Rat  1199 VKKMAITVRQQVAPLQANEV---------ALLRQRCSAFDDEQQQFQERFHKEAPFRFDSINPH- 1253

  Fly  1200 ALKFLRIIALKIEDCFTFEESLMRDLAVFNVNQPESIDLRKLDFEVRIVKNIWELIFEWQTNWEG 1264
              :.|.:..::|:...:...::.:...:|.||.|:...||:...|...:|.:|:.|....::.:.
  Rat  1254 --QMLDVWHMEIQHMESTMATISKSADLFEVNVPDYKQLRQCRKEACQLKELWDTIGMVTSSIQA 1316

  Fly  1265 WKKGYFWKMNINEMEDTALNLYKEFTTLNKKFYDRHWEM---LEATTKNVDSFRRTLPLITALKN 1326
            |:...:..:::..|:.......::...|:|:|  |.|:.   ||:|..|.   ..:|..:..|:|
  Rat  1317 WEATSWRNISVEAMDSECKQFARQIRNLDKEF--RTWDAFTGLESTVLNT---LTSLRAVAELQN 1376

  Fly  1327 PCMRERHWNRVRDVIHVNFDENSKNFTLELIINLDFQAFSEDIQDISNPATMELQIENSIKNIAT 1391
            |.:|||||.::.....|||..: ::.||..::.|....|.::::||.:.|..|:.:|.::|.:.|
  Rat  1377 PAIRERHWRQLMQATGVNFTMD-RDTTLAHLLQLQLHHFEDEVRDIVDRAVKEMSMEKTLKELQT 1440

  Fly  1392 IWKKQSFEMAFY-HDGIYRIKNVEDCFQLLEEHMVQISAMKATRFVEPFITIVDYWEKTLSYISE 1455
            .|....|:...: ...|..:::.||..::||::.||:..:..:::|..|:..|..|:|.||....
  Rat  1441 TWASMEFQYETHARTHIPLLQSDEDLIEVLEDNQVQLQNLMMSKYVAFFLEEVSSWQKKLSTADS 1505

  Fly  1456 TLEKGLTVQRQWLYLENIFQG-DDIRKQLPEEAKRFATITEEFRTISSKMFQAKTAVKATNLRPP 1519
            .:.....|||.|.:||:||.| :|||.|||::||||.:|..:||.:.....:....|:|||   .
  Rat  1506 VISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPQDAKRFESIDSDFRELVYDAQKTPNVVEATN---K 1567

  Fly  1520 PFLLNRFSRMDERLELIQRALEIYLEAKRQLFPRFYFISNDDLLEILGNSKRPDLVQTHLKKLFD 1584
            ..|..:...:..||.|.::||..||:.||..||||||:|:.|||:||.|...|..||.||.||||
  Rat  1568 SGLYEKLEDIQSRLCLCEKALAEYLDTKRLAFPRFYFLSSSDLLDILSNGTAPQQVQRHLSKLFD 1632

  Fly  1585 NLYKLELKRVGKTLSRWQASGMHSDDGEYVEFMMVIYIDGPSERWLKQVEEYM-LVVMKEMLKLT 1648
            |:.|::.:..........:.||:|.:.|||.|.......|..|.||.:|..:| ..|..||.:..
  Rat  1633 NMAKMQFQLDASQNPTKTSLGMYSKEEEYVAFSEPCDCSGQVEIWLNRVLRHMKATVRHEMTEAV 1697

  Fly  1649 RGSLKKLVGNREKWISLWPGQMVLTTAQIQWTTECTRSLIHCSMVDQ--KKPLRKLKKKQIKVLS 1711
            ....:|   .|::|:..:|.|:.||..||.||||..   |..:.:::  :..::...|||:..|.
  Rat  1698 TAYEEK---PRDQWLFDYPAQVALTCTQIWWTTEVG---IAFARLEEGYENAMKDYYKKQVAQLK 1756

  Fly  1712 KLSEMSRKDLTKTMRLKVNTLITLEIHGRDVIERMYKSNCKDTGHFEWFSQLRFYWHRESELCVI 1776
            .|..|....|:|..|.|:.|:.|:::|.|||:.:|......:...|.|.||||..|..|::.|..
  Rat  1757 TLITMLIGQLSKGDRQKIMTICTIDVHARDVVAKMIAQKVDNAQAFLWLSQLRHRWDDEAKHCFA 1821

  Fly  1777 RQTNTEHWYGYEYTGNSGRLVITPLTDRCYITLTTALHLHRGGSPKGPAGTGKTETVKDLGKALG 1841
            ...:.:..|.|||.||:.||||||||||||||||.:|||...|:|.||||||||||.||||:|||
  Rat  1822 NICDAQFLYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALG 1886

  Fly  1842 IWVIVTNCSEGLDYKSIGKNFSGLAQSGCWGCFDEFNRINIEVLSVVAQQIMSIMAALSTKALEL 1906
            |.|.|.||||.:||||.|..:.||||:|.||||||||||::|||||||.|:.||..|:..|....
  Rat  1887 IMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKSIQDAIRDKKQRF 1951

  Fly  1907 MFEGQMIKLKHTVGLFITMNPGYAGRTELPDNLKSMFRPISMMVPDNIIIAENLLFSDGFTNTRN 1971
            .|.|:.|.|..:||:|||||||||||||||:|||::|||.:|:|||..:|.|.:|.::||...|.
  Rat  1952 SFLGEEISLDPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFIEARL 2016

  Fly  1972 LARKVYTLYELAKQQLSKQYHYDFGLRSMVALLRYAGRKRRQLPNTTEEEIVYLAMKDMNVARLT 2036
            ||||..|||.|.|:.||||.|||:|||::.::|..||..:|..|:..|::::..:::|.|:.::.
  Rat  2017 LARKFITLYRLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPDRPEDQVLMRSLRDFNIPKIV 2081

  Fly  2037 ANDLPLFNGIMSDIFPGVSLPTIDYSEFNIAIYEEFREAGLQPITIAVKKVIELFETKNSRHSVM 2101
            .:|:|:|.|::||:||.:.:|.....:|...:.:...:..||.....|.||::|.|....||||.
  Rat  2082 TDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDLDFEAVVRKAIVDLKLQAEDNFVLKVVQLEELLAVRHSVF 2146

  Fly  2102 IIGDTGTAKSVTWRTLQNCFYRMNSQRFSGWEAVTVYPVNPKALNLAELYGEYNLSTGEWLDGVL 2166
            |:|..||.||...::|...:..|..:..  |.     .:||||:...||:|..|.:|.||.||:.
  Rat  2147 IVGGAGTGKSQVLKSLHKTYQIMRCRPV--WT-----DLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLF 2204

  Fly  2167 SSIMRIICGDEEPTQKWLLFDGPVDAVWIENMNSVMDDNKLLTLVNSERITMPVQVSLLFEVGDL 2231
            |||||.:........||:|.||.:|.:|||::|:||||||:|||.::|||.:...:.||||:..|
  Rat  2205 SSIMRELANISHDGPKWILLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNPTMRLLFEISHL 2269

  Fly  2232 AVASPATVSRCGMVYNDYNDWGWKPFVNSWLQRLRIKEFADFLRIHFDYMVPKILDFKRMRCKEP 2296
            ..|:||||||.|::|.:..|.||.|.||||:.:..::.....|.|.||..:|..||..|.|.|:.
  Rat  2270 RTATPATVSRAGILYINPADLGWNPPVNSWIDQREVQTERANLTILFDKYLPTCLDTLRTRFKKI 2334

  Fly  2297 VRTNELNGVVSLCKLLEIFGTKVNGINPINLELLEEMTRLWFMFCLVWSICSSVDEDSRQRLDS- 2360
            :...|.:.:..||.|||...||    ..:..:..:|:..|:|:|..:|:..||:.:|  |.:|. 
  Rat  2335 IPVPEQSMIQMLCYLLECLLTK----EAVPADCPKEIYELYFVFAAIWAFGSSMVQD--QLVDYR 2393

  Fly  2361 ------FIRELESC-FPIKDTVFDYFVDPNERTFLPWDSKLLSSWKCDFESPFYKIIVPTGDTVR 2418
                  ::.|.::. ||.:.|||||::|...:.|.|| .||:..::.|.|.|....:|.|.:|:|
  Rat  2394 AEFSKWWLTEFKTVKFPSQGTVFDYYIDQETKKFEPW-GKLIPQFEFDPEMPLQACLVHTSETIR 2457

  Fly  2419 YEYVVSKLLAEEYPVMLVGNVGTGKTSTAISVMEACDKNKFCILAVNMSAQTTAAGLQESIENRT 2483
            ..|.:.:|:....||||||:.|:||:....:.:.:.:..::.:..|..:..||:|.||..:|...
  Rat  2458 VCYFMERLMERRRPVMLVGSAGSGKSVLVGAKLSSLNPEEYMVKNVPFNYYTTSAMLQAVLEKPL 2522

  Fly  2484 EKRTKTQFVPIGGKRMICFMDDFNMPAKDIYGSQPPLELIRQWIDYKYWFNRKTQQKIYVQNTLL 2548
            ||:....:.|.|.:::|.|:||.|||..|.||:..|..:|||.:||.:|::|.......:.|...
  Rat  2523 EKKAGRNYGPPGNRKLIYFIDDMNMPEVDAYGTVQPHTVIRQHLDYGHWYDRNKLSLKEIMNVQY 2587

  Fly  2549 MAAMGPPGGGRQTISSRTQSRFVLLNLTFPSQETIIRIFGTMLCQ--KLESYPNEVREMWLPITL 2611
            ::.|.|..|. .||:.|.|..|.:..|.||..:.:..|:.|:|..  ||.::|..:::. :|   
  Rat  2588 ISCMNPTAGS-FTINPRLQRHFSVFALCFPGADALSSIYSTILTHHLKLGNFPTTLQKS-IP--- 2647

  Fly  2612 CTINLYVSMISKM----LPTPNKSHYLFNLRDISKVFQGLLRSEKELQNKKNFFLRLWVHECFRV 2672
            ..|||.|:...|:    |||..|.||:|||||.:.:|||:|.|..|........::|::||..||
  Rat  2648 SLINLAVTFHQKIATTFLPTAIKFHYIFNLRDFANIFQGILFSSTECVKSTQDLVKLYLHESDRV 2712

  Fly  2673 FSDRLVDDSDQFWFVNTINDILGKHFEVTFHSLCPSKVPPFFGDFAHPQGFYEDLQV---DFLRT 2734
            :.|::|::.|...|.....:.|.|:|:.:...|..::....:..||:..|..:.:.|   |.|..
  Rat  2713 YRDKMVEEKDFNLFDKLQTEFLKKNFDDSKGMLEQTQNLNMYCHFANGIGEPKYMPVQSWDLLSQ 2777

  Fly  2735 FMKNQLEEYNNFPGMTRMNLVFFREAIEHIVRILRVISQPRGHILNMGIGGSGRQVLTKLAAFIL 2799
            .:...||.:|....:  |:||.|.:||.||..|.|::..|||:.|.:|:||||:|.||:|||||.
  Rat  2778 TLVEALESHNEVNAV--MDLVLFEDAIHHICHINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLAAFIS 2840

  Fly  2800 EMAVFQIEVTKKYKTGDFREDLKNLYKVTGIKQRLTIFIFSSDQIAEVSFLEITNNMLSTGEI-N 2863
            .|.||||.:.|.|:..||:.||.:|....|:|...|:|:.:...:|:..||.:.|::|::||| :
  Rat  2841 SMDVFQITLRKGYQIPDFKVDLASLCLKAGVKNLSTVFLMTDAHVADERFLVLINDLLASGEIPD 2905

  Fly  2864 LFKSDEFDELKPELERPAKKNGVLLTTEALYSYFILNVRDFLHVALCFSPIGENFRSYIRQYPAL 2928
            |:..:|.:.:...:....|..|::.:.|..:.:||..||..|.|.|||||:|...|...|::||:
  Rat  2906 LYSEEEEENIINNVRNEVKSQGLIDSRENCWKFFIERVRRQLKVTLCFSPVGNKLRIRSRKFPAI 2970

  Fly  2929 LSSTTPNWFRFWPQEALLEVASHFLIGFPLNVVVSGKEDEKHRESLVISTEAILQRDIAYVFSVI 2993
            ::.|..|||..||||||..|:..||            ::.|:.|..|       ::.|:...:.:
  Rat  2971 VNCTAINWFHEWPQEALESVSLRFL------------QNTKNIEPAV-------KQSISKFMAFV 3016

  Fly  2994 HSSVAKMSENMYAEVKRYNYVTSPNYLQLVSGFKKLLEKKRLEVSTASNRLRNGLSKISETQEKV 3058
            |.||.|:|::.....:||||.|..::|:.:..::.|||:...|:.:...||.|||.|:..|..:|
  Rat  3017 HISVNKISQSYLINEQRYNYTTPKSFLEFIRLYQSLLERNGKELQSKVERLENGLLKLHSTSAQV 3081

  Fly  3059 SLMSEELKA--SSEQVKILARECEDFISMIEI----------QKSEATEQKEKVDAEAVLIRRDE 3111
                ::|||  ::::|: |.::.||...:|::          :|:.|.|:::||....:.:::.:
  Rat  3082 ----DDLKAKLATQEVE-LRQKNEDTDKLIQVVGVETSKVSREKAIADEEEQKVALIMLEVQQKQ 3141

  Fly  3112 IICLELAATARADLEVVMPMIDAAVKALDALNKKDISEVKSYGRPPMKIEKVMEAVLILL---GK 3173
            ..|.|       ||....|.:.||..||:.|||.:::|:||:|.||:.:..|..||::|:   ||
  Rat  3142 KDCEE-------DLAKAEPALTAAQAALNTLNKTNLTELKSFGSPPLAVSNVSAAVMVLMAPGGK 3199

  Fly  3174 EP---TWENAKKVLSE-STFLNDLKNFDRDHISDKTLKRIAIYTKNPELEPDKVAVVSLACKSLM 3234
            .|   :|:.||..::: .:||:.|.:||:::|.:..||.|..|.::|...|:.||..|.|...|.
  Rat  3200 VPKDRSWKAAKITMTKVDSFLDSLIHFDKENIHENCLKAIRPYLQDPAFNPEFVATKSYAAAGLC 3264

  Fly  3235 QWIMAIENYGKVYRIVAPKQEKLDSAMKSLEEKQAALAAAKKKLEELQVVIEELYRQLEEKTNLL 3299
            .|::.|..:.:|:..|.||::.|:.|...|...|..|||.|.|:..|...:.:|..:.|      
  Rat  3265 SWVINIVRFYEVFCDVEPKRQALNKATSDLTAAQEKLAAIKAKITHLNENLAKLTTKFE------ 3323

  Fly  3300 NELRAKEERLRKQLERAII---------LVESLSGERERWIETVNQLDLSFEKLPGDCLLSVAFM 3355
               :|..|:|:.|.|..:.         ||..|:.|..||.|.|.........|.||.||:.||:
  Rat  3324 ---KATAEKLKCQQEAEVTAGTISLANRLVGGLASENVRWAEAVQNFRQQERTLCGDILLTTAFI 3385

  Fly  3356 SYLGAFDTKYREELL-VKWSLLIKDLL--IPATLELKVTYFLVDAVSIREWNIQGLPADDLSTEN 3417
            ||||.|..|||:.|: ..|...:..|.  ||.|..|.....|.|...:..|..:|||||.:|.||
  Rat  3386 SYLGFFTKKYRKSLMDGTWKPYLSQLKVPIPTTPTLDPLKMLTDDADVATWQNEGLPADRMSMEN 3450

  Fly  3418 GVIVTQGSRWPLIIDPQMQANNWIKNMEERNQLMTLDFGMADYLRQLERALKEGLPVLLQNVGEY 3482
            ..|:....||||::|||:|...|||| :...:|.....|....|:.:||||:.|..||::|:.|.
  Rat  3451 ATILINCERWPLMVDPQLQGIKWIKN-KYGEELRVTQIGQKGCLQTIERALEAGDVVLIENLEES 3514

  Fly  3483 LDQAINPILRQSFTIQSGERLLKFNDKYISYNNSFRFYITTKISNPHYPPEISSKTTIVNFALKQ 3547
            :|..:.|:|.:. .|:.| |.:|..||...:|..||..:.||::||||.||:.::.|::||.:.:
  Rat  3515 IDPVLGPLLGRE-VIKKG-RFIKIGDKECEFNPKFRLILHTKLANPHYQPELQAQATLINFTVTR 3577

  Fly  3548 DGLEAQLLGIIVRKEKPALEEQKDELVMTIARNKRTLIDLDNEILRLLNESRGSLLDDDELFSTL 3612
            ||||.|||..:|..|.|.||..|.:|.......|.||..|::.:|..|:.:.|:.|.:..|...|
  Rat  3578 DGLEDQLLAAVVSMEIPDLEHLKSDLTKQQNGFKITLKTLEDNLLSRLSSASGNFLGETALVENL 3642

  Fly  3613 QKSRQTSVLVKESLSIAEVTEVEIDAARQEYKPASERASILFFVLMDMSKIDPMYVFSLAAYILL 3677
            :.::||:..|:|.:..|::|||:|:.||:.|:||:.|||:|:|::.|:|||.|||.|||.|:.::
  Rat  3643 EVTKQTAAEVQEKVQEAKLTEVKINEAREHYRPAAARASLLYFIMNDLSKIHPMYQFSLKAFSIV 3707

  Fly  3678 FTQSIERSPRNQLVHERIQNINEYHSYAVYRNTCRGLFERHKLLFSIHMTAKILSNAGKLLEEEY 3742
            |.:::|::..::.|.||:.|:.:..:::||:.|.|||||..||.:...:|.:||....::...|.
  Rat  3708 FQKAVEKAAPSEDVKERVTNLIDSITFSVYQYTTRGLFECDKLTYLAQLTFQILLVNQEVNAAEL 3772

  Fly  3743 DFILKGGIVLDKLGQAPNPAPW-WISEQNWDNITELDKVSGFHGIIDSFEQHYKAWNGWYATTFP 3806
            ||:|:..:      ||..|:|. ::|.|.|.:|..|..:..|..:....|...|:|..:..:..|
  Rat  3773 DFLLRAPV------QAGTPSPMEFLSHQAWGSIKALSSMEEFCNLDRDIEGSAKSWKKFVESECP 3831

  Fly  3807 EQEDLVGEWNDKLTDFQKICVLRSLRPDRISFCLTQFIITKLGPRYVDPPVLDLKATFDESISQT 3871
            |:|....:|.:| |..|::|::|::||||:::.:..|:..|||.:||....||..::|:||...|
  Rat  3832 EKEKFPQDWKNK-TGLQRLCMMRAMRPDRMTYAMRDFVEEKLGSKYVMGRPLDFVSSFEESGPAT 3895

  Fly  3872 PLIFVLSPGVDPAQSLISLSESVKMA---QRMYSLSLGQGQAPIATKLIMDGIKDGNWVFLANCH 3933
            |:.|:|||||||.:.:.:..:.:...   :..:::||||||..:|...:....|.|:||.|.|.|
  Rat  3896 PMFFILSPGVDPLKDVENQGKKLGYTFNNRNFHNVSLGQGQEVVAEAALDLAAKKGHWVILQNIH 3960

  Fly  3934 LSLSWMPTLDKMIATMQSMKLHKKFRLWLSSSPHPD-----FPISILQTSIKMTTEPPRGIKSNM 3993
            |...|:.||:|.:..: |.:.|..||:::|:.|.|.     .|..||:.|||:|.|||.|:.:|:
  Rat  3961 LVAKWLSTLEKKLEEL-SEESHPDFRVFISAEPAPSPEGHIIPQGILENSIKITNEPPTGMHANL 4024

  Fly  3994 KRLYNNINEANMENCSEPSKYKKLLFALCFFHTVLLERKKFLELGWNVIYSFNDSDFEVSEILLL 4058
            .:..:|..:..:|.||..:::|.:|||||:||.|:.||:||...|||..|.||..|..:|..:|.
  Rat  4025 HKALDNFTQDTLEMCSRETEFKTILFALCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNTGDLTISVNVLY 4089

  Fly  4059 LYLNEYEDTPWGALKYLIAGVNYGGHITDDWDRRLLITYINQFFCDQALQTRKFRLSTLPNYFIP 4123
            .:|......|:..|:||...:.|||||||||||||..||:.:|...:.|:.   .||..|.:.:|
  Rat  4090 NFLEANTKVPYDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFIRPEMLEG---ELSLAPGFPLP 4151

  Fly  4124 DDGDVQSYLDQIQMFPNFDKPDAFGQHSNADIASLIGETRMLFEALLSMQVQTNST--SSNENGE 4186
            .:.|...|...|......:.|..:|.|.||:|..|...:..||..:|.||.:.:..  .:....|
  Rat  4152 GNMDYSGYHQYIDAELPPESPYLYGLHPNAEIGFLTQTSEKLFRTVLEMQPRDSQAGDGAGSTRE 4216

  Fly  4187 TKVFDLAKEILMNTPDEINY-EQTAKIIGINRTPLEVVLLQEIERYNKLLVDMSTQLRDLRRGIQ 4250
            .||....:|||....||.|. |..||:  ..|||..||.|||.||.|.|..::...||:|..|:|
  Rat  4217 EKVKAFLEEILDRVTDEFNIPELMAKV--EERTPYIVVALQECERMNILTREIQRSLRELHLGLQ 4279

  Fly  4251 GLVVMSSDLEDIYLAVSEGRVPLQWL-KAYNSLKPLAAWARDLIHRVGHFNSWAKTLRPPILFWL 4314
            |.:.|:|::|::..|:....||..|. :||.|...||||..||::|:....:|......|...||
  Rat  4280 GELTMTSEMENLQNALYLDVVPEPWARRAYPSTAGLAAWFLDLLNRIKELETWTGDFVMPSTVWL 4344

  Fly  4315 AAYTFPTGFVTAVLQTSARATKTPIDELSWDFYVFVEEDTAAARIIREGGGVYIRSLFLEGGGWL 4379
            ..:..|..|:||::|:.||..:.|:|:::....|..:.........||  |.||..||:||..|.
  Rat  4345 TGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDQMALQCDVTKKNREEFRSPPRE--GAYIYGLFMEGACWD 4407

  Fly  4380 RKNQCLQDPLPMELICPLPVIHFKPVENLKKRCRGVYQCPAYYYPVRSGSFVIAVDLKSGNEKAD 4444
            .:...:.:....:|..|:||:..|.:...|:.||.:|.||.|....|..::|...:||: .|...
  Rat  4408 TQAGIIAEAKLKDLTPPMPVMFLKAIPAEKQDCRSIYACPVYKTCQRGPTYVWTFNLKT-KENPS 4471

  Fly  4445 YWIKRGTALLLSL 4457
            .|:..|.||||.:
  Rat  4472 KWVLAGVALLLQI 4484

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-2NP_001015505.5 DHC_N1 180..749 CDD:462457 118/612 (19%)
DHC_N2 1238..1646 CDD:462462 132/413 (32%)
DYN1 <1478..4135 CDD:227570 996/2717 (37%)
AAA_6 1785..2111 CDD:463697 172/325 (53%)
Dynein_C 4161..4455 CDD:465677 97/297 (33%)
Dnah9NP_001414026.1 None

Return to query results.
Submit another query.