DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FASN3 and fasn

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015405.3 Gene:FASN3 / 3355111 FlyBaseID:FBgn0287184 Length:2394 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_009305081.1 Gene:fasn / 559001 ZFINID:ZDB-GENE-030131-7802 Length:2511 Species:Danio rerio


Alignment Length:2579 Identity:953/2579 - (36%)
Similarity:1459/2579 - (56%) Gaps:312/2579 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    19 DDIVISGMAGKFPNCRNITEYQYKLYNKIDMVDDDERRWRHFNPEIPKRSGKICDLEKFDATFFG 83
            :||||:|::|:.|...|:.|:...|:|.:|||.:|:|||:.....:|:|:||:.::::|||.|||
Zfish     2 EDIVIAGISGRLPESNNLEEFWQNLFNGVDMVTEDDRRWKPGLYGLPRRNGKLKEIDRFDAAFFG 66

  Fly    84 VHFKQAHTMDPQTRILIETAYEAVIDSGVNPKSLRGSKTGVYIGSCISESEKTWFYEKVSSGGFG 148
            ||.|||||||||.|:::|.:|||::|.|:||.|:||||||||||...||:.:.:..:.....|:.
Zfish    67 VHPKQAHTMDPQLRLMLEISYEAIVDGGINPVSMRGSKTGVYIGVSGSEAGEAFSKDPEELLGYS 131

  Fly   149 ITGCSRAMMANRISYCLGLEGPSFLLDTACSSSMYALDNAFSAIRNGEIDAAIIGGSNLLLHPFV 213
            :|||.|||.|||:||.....|||..:|||||||:.||:|||:|||:|:.|||:|||.||||.|..
Zfish   132 MTGCQRAMFANRLSYFFDFNGPSTAIDTACSSSLLALENAFNAIRHGKCDAALIGGVNLLLKPNT 196

  Fly   214 TLQFARLGVLAPDGFCRPFDKNASGYTRSETINCLFLQKKKHAKRVYASIVYSKTNCDGYKPEGI 278
            ::||.:||:|:|:|.|:.||.:.:||.|||....:.|.||..|||:||:::.:..|.||||.:|:
Zfish   197 SVQFMKLGMLSPEGTCKSFDASGNGYCRSEAAVAVLLTKKSMAKRIYATVLNAGNNTDGYKEQGV 261

  Fly   279 TYPSGIVQEKLLDQFYKDIDHKPSDLGYLEAHSTGTVVGDPEECKAIDNVLCSQREEPLLVGSVK 343
            |:|||.:|::|:...|::.:..|..:.|:|||.|||.||||:|...|.:|.|..:.:|||:||.|
Zfish   262 TFPSGEMQQRLVRSLYQEANISPEQVEYIEAHGTGTKVGDPQEVNGIVSVFCQSQRDPLLIGSTK 326

  Fly   344 SNVGHSEAASGICSLVKACFAFETGLIAPNINFTEVKQIIAPLAEGRLIVVKDVVPLPKPYIGIN 408
            ||:||.|.|||:.:|.|...:.|.|:.|||::|.|....|..|.:|||.||....|:....:|||
Zfish   327 SNMGHPEPASGLAALAKVVLSLEHGVWAPNVHFNEPNPDIPALTDGRLCVVSKPTPVRGGIVGIN 391

  Fly   409 SFGFGGANAHALLKGYPKSKNNFGIPADDVPRLLTWAGRTEEAVEEIFNAVEKNPLDAEFIGLLQ 473
            ||||||:|.|.:|..: .|.::...||..|||||..:|||||||..:|:..:::..::.::.||.
Zfish   392 SFGFGGSNVHVILSPH-VSDSSDKTPAPSVPRLLQASGRTEEAVTALFSNAQQHQENSSYLSLLN 455

  Fly   474 NIQEEDVSGMVFRGYAIFAKQGTGPCKLLAKDVQHYTGLQRPIVWVYSGMGSQWNQMGNSLMIIP 538
            ::.....:||.:|||.:...||.      ..:||......||:.::.||||:||..||.|||.:.
Zfish   456 DVSGVPTAGMPYRGYTLIGAQGE------LTEVQQTQPTPRPLWYICSGMGTQWAGMGQSLMQLS 514

  Fly   539 RFRESVEICHQILLAKGLNLIHILTSNDPEVYQNILNSFVGIAAVQIGLTDVLRSLNIQPDYIIG 603
            .||||::.....|...||.:..:|...|...:::.:::|||:||:|:...|:||.:.::|:.|:|
Zfish   515 EFRESIKRSDIALKDTGLCVSRLLMEADESTFEDTVHAFVGLAAIQVAQIDMLRKMGLEPNGIVG 579

  Fly   604 HSVGELGCAYADGGLTAQQMILAAYYRGRVSVDLEKIRGSMAAVGLGYKTVLHMLPKSIETACHN 668
            ||||||.|.||||.|:..:.|||||:|||...:.....|.||||||.::......|:.:..||||
Zfish   580 HSVGELACGYADGSLSHSEAILAAYWRGRCIKEANLPPGGMAAVGLTWEECKAQCPQGVVPACHN 644

  Fly   669 GPDSCTISGPVDDVAQFVADLKTKGIFAKEVPCSNIAYHSKYISHMGPPLLNYMNEIIPHPKPRT 733
            ..|:.|||||.|.|::|||.||..|:|||||..:.:|:||.|::.:.|.||:.:.::|..|:|||
Zfish   645 AEDTVTISGPQDSVSKFVAQLKESGVFAKEVRSAGVAFHSYYMASIAPALLSALQKVIKSPRPRT 709

  Fly   734 KKWLSTSVPKIDWNKDKAKFCSAEYHTNNLLNSVLFDETFSLIPKNSLTIEVAPHGLLGAILKRS 798
            .:|:|||:|:.||....|.:.|||||.|||::.|||.|..:.:|.|::.:|:|||.||.||||||
Zfish   710 ARWISTSIPQSDWESPLALYSSAEYHVNNLVSPVLFQEGLNHVPDNAVVVEIAPHALLQAILKRS 774

  Fly   799 M-PSGVHIPLTNRGNQNNASFFLSALGKIYLNGVLLPAANLYERIQFPVSRTTPSVSSLIRWDHS 862
            : |:...:||..||:.||..||||.:||:|:||:.:.:..||..:::||.|.||.:|..|:||||
Zfish   775 LKPTCSILPLMKRGHANNLEFFLSHVGKVYMNGINVDSNKLYPAVKYPVPRGTPLISPYIQWDHS 839

  Fly   863 EDWFVTKYENMKTKSSGE---RVFSVNLASDNEE-FLSGHIIDGKILVPATCYLQYVWETFSLMY 923
            :.|.|.|.|:....|.|.   .|:::::..::.: ::.||.|||::|.|||.||...|.|  ||.
Zfish   840 QSWDVPKVEDFPAGSGGSTSATVYNIDMNPESPDYYMIGHCIDGRVLYPATGYLVLAWRT--LMR 902

  Fly   924 HGPSYMD-VPVEFEDIRFIRATSMPVDGKVDLTVMIHYGTGHFEITEMGSLVVTGIIRETENPSI 987
            ...:.|| .||.|||:...|||.:|..|.|.|.|.:...|..||::|.|:|.|:|.:...|:..:
Zfish   903 SLGTVMDHTPVTFEDVTIHRATILPKTGSVQLEVRLMPATNRFEVSENGNLAVSGKVSVLEDSGL 967

  Fly   988 PEVYNFQSKSKFPMIAKK----------DFYKELKLRGYHYNGAFQAVNLARSDGLFGRVQWNYN 1042
            ..   |.::...|:.|..          |.||||:||||.|...||.:..:.:.|..|::.|..|
Zfish   968 DA---FHAELNKPITADNEDPKLRLKSGDIYKELRLRGYDYGKTFQGILESNNAGDSGKLHWTGN 1029

  Fly  1043 WVTFMDAMLQIQILGTDSRNLLLPTKIRKLKINGVHHFDLMTKMDPENRVFDVYVDPMYDRIIAG 1107
            ||||:|.|||:.::|...|:|.|||:||.:.::...|.:.:...:.:.:..:|:|:...|.|.||
Zfish  1030 WVTFLDTMLQMIVVGLPGRSLRLPTRIRSVCVDPKLHEERVNDYEGDQKAVNVFVNRCLDNITAG 1094

  Fly  1108 GIEIFGLHASLVQRRRPPGI-PVLEEYVFLPFFSS------------------------------ 1141
            |::|.||||:...||:.... |.|||:||:|:..:                              
Zfish  1095 GVQICGLHATAAPRRQQQQTPPTLEEFVFVPYEDADCLRTNEKLADQLRHCKGLVQRLQRKLAKQ 1159

  Fly  1142 ----SILSLKNAA---------------------------------------------------- 1150
                ||..|:.|:                                                    
Zfish  1160 GVKISIPGLEGASEGQLIEAEAEKGLLRLLSVLCGLELNGNLRSELEQTVQKERDCLLQDPLLNG 1224

  Fly  1151 -------RVCVQIAIENNPTLKLKLVE-VGADGKNHMLTEFIEAIQDLPVITGDYIL-------L 1200
                   |.|:..|:||:...|.|::| :.|||:  :.::.:..:...|::..||..       |
Zfish  1225 LLDSQALRHCLDTALENSTPGKFKVLEALAADGR--VFSQAVSLLNIQPMLRLDYTASDISADQL 1287

  Fly  1201 TSQ--NLED------------------LPGVHIE--NGSLSTQTNCHIIIIGGYEEDEVHEKITS 1243
            ::|  :||:                  |.|..:.  |.::.:.||..::|          |.:||
Zfish  1288 SAQQSSLEEQGISTAQWDPLQGPVTGGLDGADLVVCNCAVGSATNPALLI----------ENLTS 1342

  Fly  1244 AYNVLVDNGYIVFRQKCAKNVSCKIAEKFRTISKIPINNTEENLV-------LLQKISKKLTV-- 1299
            |..   :.|:|:.......:.   :.|   |::.:...|..:.|:       |.||.|..:.:  
Zfish  1343 AAR---EGGFILLHTLLRGDT---LGE---TVAFLTSQNNRKGLLTQTEWEELFQKASLNVVMLR 1398

  Fly  1300 --------------------PPVLVKVSQHDKTFEWILELQSAIITKAPVVVYSFNEK-LNGQIG 1343
                                .|:.:.|...|  ::|:..|:|.:...:.:.|:....| .||.:|
Zfish  1399 KSYYGSALFLCRRSQQSSQKQPIHIFVDPTD--YKWVETLKSTLAESSDIPVWLIATKGHNGVVG 1461

  Fly  1344 LVNCLRKEPDGNLIRCFFIDDDS----APDFDLSHPFYSTQYSLGLAFNIYRNGSWGSYRHLQLL 1404
            :|||||:||.||.|||.|:.:.|    .|....:...........|..|::|:|.||.:|| |||
Zfish  1462 MVNCLRQEPGGNRIRCTFVSNLSKGAAVPSLLPNEKVMKALLKKDLVMNVHRDGLWGVFRH-QLL 1525

  Fly  1405 KNDQPSKRLDHIYGNVIQRGDLSSLQWLKGPF--------NSQNCHIKIAFSSLNFRDVMLATGR 1461
            ..|...:..:..|.||:.|||||||:|:..|.        |.|.|  ::.:|||||||:|||||:
Zfish  1526 TQDLSEELTEQAYVNVLTRGDLSSLRWIASPLRHFVASSPNVQLC--RVYYSSLNFRDIMLATGK 1588

  Fly  1462 LAVELYGSSRIDQNCVLGFEYSGINMLTGRRIMSMVVKGGVASYVEKPSKLIWDIPDDWSLEEAA 1526
            |..:........|.|:||.|:||.:. :|||:|.::...|:|:.|:...:.:||:|..|:||:||
Zfish  1589 LPPDAIPGDVALQQCMLGMEFSGRDP-SGRRVMGLLPAKGLATCVDADKRFLWDVPSSWTLEQAA 1652

  Fly  1527 TVPVVYITVYYAFFMATDIRKGKSILIHAGTGGIGLAAIRVALAYNLEVFTTCSTANKKEFLLKT 1591
            :|||||.|.||:..:...:|.|:|:|||:|:||:|.|||.:||:....||||..:..||::|.:.
Zfish  1653 SVPVVYATAYYSLVVRGRLRPGESVLIHSGSGGVGQAAIAIALSMRCRVFTTVGSKEKKQYLQER 1717

  Fly  1592 FPKLKESHIGNSRNTSFELMVHRETNGKGVDFVLNSLSEEKLLASLRCLGKSGHFLEIGKYDMAN 1656
            ||:|......|||::|||..|...|.|||||.|||||:||||.||||||.:.|.||||||||::|
Zfish  1718 FPQLTAESFANSRDSSFEQHVMLNTQGKGVDLVLNSLAEEKLQASLRCLARHGRFLEIGKYDLSN 1782

  Fly  1657 DNKIGLGCFLKEITFHAVLADSLLVAPDEDIWHLKSLIDMDISNGIIQPLPVKVFLAHEIEQAFR 1721
            :..:|:..|||.:.||.:|.|:|....:.:...:..|:...||:|::|||...||..:::|:|||
Zfish  1783 NTPLGMALFLKNVAFHGILLDALFEEGNREWEEVSDLLKKGISSGVVQPLRTTVFERNQVEEAFR 1847

  Fly  1722 HLIGGKHIGKVVIQVREQPHDP-----STLPVRVLNQVYFKHNHTYVIPGGLGGFGMELADWMAI 1781
            ::..|||||||::|||.:....     |.|.:..:.:.:...:.:|:|.|||||||:|||.|:..
Zfish  1848 YMAQGKHIGKVLLQVRSEESSSSGPAVSALSIPAICRTFCPASLSYIITGGLGGFGLELAQWLTE 1912

  Fly  1782 RGARKLLLSSSRGITKDYQLYRIALWKTYGCEVAISTADITSKKGCAQLLSEANGMGPVGGIFNL 1846
            ||||||:|:|..||...||..|:..|:..|.:|.:||:|:::..|..:|::||..:|||||||:|
Zfish  1913 RGARKLVLTSRSGIRNGYQAKRVREWQAMGIQVLVSTSDVSTLDGTERLITEACRLGPVGGIFHL 1977

  Fly  1847 AVVLKDCIFSNQNVNQFLECFAPKAIATTYLDDLSRIYCPELEHFVVFSSVSCGRGNAGQSNYGM 1911
            |:||||.:..|....:|:|...||...|..||.::|..||:|:.||||||||||||||||||||.
Zfish  1978 AMVLKDGMLENLTPQEFIEVNRPKYDGTINLDSVTRQKCPQLQQFVVFSSVSCGRGNAGQSNYGF 2042

  Fly  1912 ANSVMERIIEHRNREGFPGKAIQWGAIGEVGLVADMAEDKIDMEIGGTLQQRISSCIQELDHLLC 1976
            |||.||||.|.|.:|..||.|:||||||:||:|.:..... |..|||||.||:|||::.||..||
Zfish  2043 ANSTMERICEQRRQENLPGLAVQWGAIGDVGVVLETMGGN-DAVIGGTLPQRMSSCLEVLDRFLC 2106

  Fly  1977 ADASIVSSMVVAEKRTMRSGQG----NVIDAVMNIMGIRDLKSVSLSTTLSEMGMDSLMAVEIKQ 2037
            ....::||.|:|||..:..|:|    ::::||.:|:|:||:.|::...:|:::|:||||.||::|
Zfish  2107 QQRPVMSSFVLAEKVVVTKGEGSGQKDLVEAVAHILGVRDVNSLNADASLADLGLDSLMGVEVRQ 2171

  Fly  2038 TLERDFELILTPQDLRHLTFQKLQEFIDAKE---KENT----DGIQIIFASDNKLLGMELLIRNL 2095
            |||||:::::..:::|.||..||:|.  :|:   ||.:    .|.|.:..||        |.|.|
Zfish  2172 TLERDYDIVMAMREIRQLTINKLREL--SKQSGGKEESPVKRSGAQALLESD--------LSRML 2226

  Fly  2096 GDEANCD-QIIIPLQTSAAPSKQNLQPNIIIPGLEGTAGRAWYQLGSKLQSPAIVLQLHQFAHLE 2159
               .|.| ..:.||....:..:    |..::..:||:.. |:..|.:||..|...||..:.|.|:
Zfish  2227 ---VNPDGPTMAPLNEVQSAER----PLFLVHPIEGSIA-AFRTLTAKLSVPCYGLQCTKAAPLD 2283

  Fly  2160 NLKDVAQQSFDQIKLILKQTE-PFYIIAYSYGTFVALLLAEMLENSGFR-GHLMLLDGAPHFLKR 2222
            :::.:|....:.::.:  |.| |:.|..||:|..||..:...|:.:... .:|.|.||:..::..
Zfish  2284 SIQSLAAYYVECVRQV--QLEGPYRIAGYSFGACVAFEMCSQLQLAKCPVEYLFLFDGSHSYVAA 2346

  Fly  2223 LTNLHLG-------------------EQFSDNDLYDLLFSSIVNHIFPEASKESMSTVFHQVDCL 2268
            .|..:..                   :||:     .:.::.::..:.|.:..|:      :||..
Zfish  2347 YTQSYRAKLTPGKESEAETEALCAFIQQFT-----GIEYNKLLETLLPLSDLEA------RVDKA 2400

  Fly  2269 SDKMSLFMNYVEKQNMYSKKYSSTMVKAMFNRVKMAASFDLDGII---KIKSPITLVRPAEASLQ 2330
            .|.::.....|.:..::..  :||    .::::|.|     |..:   |....:||:| |:||.:
Zfish  2401 VDLITSSHKNVSRDMLHFA--AST----FYHKLKAA-----DRYVPTSKYHGNVTLLR-AKASSE 2453

  Fly  2331 ---DIDEDYCISLLTSGVVTLKVIEGNHTTMLDN---PSLSQII 2368
               .:..||.:..:..|.|::.||||:|.|.|:.   .|:|.||
Zfish  2454 YGDGLGSDYKLHEVCDGKVSVHVIEGDHRTFLEGEGVESISSII 2497

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FASN3NP_001015405.3 PksD 16..>839 CDD:442550 372/820 (45%)
hot_dog 877..1125 CDD:469797 92/262 (35%)
Rossmann-fold NAD(P)(+)-binding proteins <1301..>1411 CDD:473865 38/114 (33%)
PKS_ER 1443..1734 CDD:214840 135/290 (47%)
KR_1_FAS_SDR_x <1761..1988 CDD:187657 121/226 (54%)
PKS_PP 2000..2067 CDD:214834 27/66 (41%)
alpha/beta hydrolases 2120..>2265 CDD:473884 32/165 (19%)
fasnXP_009305081.1 PksD 1..>829 CDD:442550 378/833 (45%)
hot_dog 873..1112 CDD:469797 89/243 (37%)
UbiG <1276..1354 CDD:441829 18/90 (20%)
Rossmann-fold NAD(P)(+)-binding proteins 1331..>1530 CDD:473865 55/220 (25%)
PKS_ER 1570..1860 CDD:214840 136/292 (47%)
KR_1_FAS_SDR_x <1863..2118 CDD:187657 124/255 (49%)
PKS_PP 2134..>2186 CDD:214834 21/51 (41%)
alpha/beta hydrolases 2245..2487 CDD:473884 59/271 (22%)

Return to query results.
Submit another query.