DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FASN3 and FASN1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015405.3 Gene:FASN3 / 3355111 FlyBaseID:FBgn0287184 Length:2394 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001137778.2 Gene:FASN1 / 33524 FlyBaseID:FBgn0283427 Length:2540 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:2469 Identity:989/2469 - (40%)
Similarity:1462/2469 - (59%) Gaps:197/2469 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    19 DDIVISGMAGKFPNCRNITEYQYKLYNKIDMVDDDERRWRHFNPEIPKRSGKI--CDLEKFDATF 81
            |:|.|:|.:|:.|....|.|::..|::.:|||:||.|||......:|.|.||:  .|||.||..|
  Fly   140 DEIAITGFSGRLPESSTIEEFKQNLFDGVDMVNDDPRRWERGLYGLPDRIGKLKDSDLENFDQQF 204

  Fly    82 FGVHFKQAHTMDPQTRILIETAYEAVIDSGVNPKSLRGSKTGVYIGSCISESEKTWFYEKVSSGG 146
            ||||.|||..|||..|:|:|..:||:||:|:||..||||:||||||...||:|:.|..:.....|
  Fly   205 FGVHQKQAECMDPLLRMLLELTHEAIIDAGLNPSDLRGSRTGVYIGVSNSETEQHWCSDADRVNG 269

  Fly   147 FGITGCSRAMMANRISYCLGLEGPSFLLDTACSSSMYALDNAFSAIRNGEIDAAIIGGSNLLLHP 211
            :|:|||:|||.|||||:....:|||:.:|||||||:|||:.|||.:|.|::|.|::.|:.|:|.|
  Fly   270 YGLTGCARAMFANRISFTFDFKGPSYSIDTACSSSLYALEQAFSDMREGKVDNALVAGAGLILKP 334

  Fly   212 FVTLQFARLGVLAPDGFCRPFDKNASGYTRSETINCLFLQKKKHAKRVYASIVYSKTNCDGYKPE 276
            .::|||.||.:|:|||.|:.||::.:||.||:....|.||:...|:||||||:..:||.||:|.:
  Fly   335 TMSLQFKRLNMLSPDGSCKAFDESGNGYVRSDGCVVLLLQRTSAARRVYASILNVRTNTDGFKEQ 399

  Fly   277 GITYPSGIVQEKLLDQFYKDIDHKPSDLGYLEAHSTGTVVGDPEECKAIDNVLCSQREEPLLVGS 341
            |||||.|.:|.:|:.:.|::|...|:|:.|:|||.|||.||||:|..:|.:..|..|..|||:||
  Fly   400 GITYPIGKMQNRLIRETYEEIGLNPADVVYVEAHGTGTKVGDPQEVNSITDFFCKDRTTPLLIGS 464

  Fly   342 VKSNVGHSEAASGICSLVKACFAFETGLIAPNINFTEVKQIIAPLAEGRLIVVKDVVPLPKPYIG 406
            ||||:||||.|||:||:.|...|.|.|:|..|:::.:....:..|.:|||.||...:|.....||
  Fly   465 VKSNMGHSEPASGVCSVAKILIAMEEGVIPGNLHYNKPNPDLYGLVDGRLKVVDRNLPWNGGIIG 529

  Fly   407 INSFGFGGANAHALLKGYPKSKNNFGIPADDVPRLLTWAGRTEEAVEEIFNAVEKNPLDAEFIGL 471
            :|||||||||||.:||..||.|..  .|.|...:::..:|||.||||::..:...|..|.|::.|
  Fly   530 LNSFGFGGANAHVILKSNPKPKAL--TPKDGALKVVLASGRTFEAVEQLLESASTNADDDEYLQL 592

  Fly   472 LQNIQEEDVSGMVFRGYAIFAKQGTGPCKLLAKDVQHYTGLQRPIVWVYSGMGSQWNQMGNSLMI 536
            :..|..:.:....||||.:.:.:||.     .::|......:|||.::||||||||..|...||.
  Fly   593 INEIHSKAIPNHFFRGYGVVSSKGTH-----QREVIESNDDKRPIWYIYSGMGSQWASMAKDLMK 652

  Fly   537 IPRFRESVEICHQILLAKGLNLIHILTSNDPEVYQNILNSFVGIAAVQIGLTDVLRSLNIQPDYI 601
            |..|.::::.|..:|..:|::||.:||.:..:.::||||||:.|||:|:.|||:|.||.|.||.|
  Fly   653 IEAFAKTIQRCADVLKPEGVDLIDVLTRSTDKSFENILNSFISIAAMQVALTDLLSSLGIHPDGI 717

  Fly   602 IGHSVGELGCAYADGGLTAQQMILAAYYRGRVSVDLEKIRGSMAAVGLGYKTVLHMLPKSIETAC 666
            :||||||||||||||..|.:|.:||||:||:..:|.:..:|.||||||.::.....:|......|
  Fly   718 VGHSVGELGCAYADGCFTPEQTVLAAYWRGKSILDTQLAKGKMAAVGLSWEDAHSRVPSDCFPVC 782

  Fly   667 HNGPDSCTISGPVDDVAQFVADLKTKGIFAKEVPCSNIAYHSKYISHMGPPLLNYMNEIIPHPKP 731
            ||..|:||||||...:...||.|..:|:|||.|..|..|:|||||:..||.|...:.:|||:.|.
  Fly   783 HNSEDNCTISGPEASIEALVAKLNAEGVFAKAVNSSGYAFHSKYIAEAGPKLRKSLEKIIPNAKN 847

  Fly   732 RTKKWLSTSVPKIDWNKDKAKFCSAEYHTNNLLNSVLFDETFSLIPKNSLTIEVAPHGLLGAILK 796
            ||.:|:|||:|:..||...||..||.||.||||:.|||.|....:|||::::|:||||||.||||
  Fly   848 RTARWISTSIPESAWNTPVAKQSSAAYHVNNLLSPVLFHEALQHVPKNAISVEIAPHGLLQAILK 912

  Fly   797 RSM-PSGVHIPLTNRGNQNNASFFLSALGKIYLNGVLLPAANLYERIQFPVSRTTPSVSSLIRWD 860
            |:: |...::.|..||::||..|||:.:||::..|.......|...|.:||.|.||.::|.:.||
  Fly   913 RALGPDATNLSLVKRGHENNVEFFLTNVGKLFAAGAQPQVLTLVRPISYPVGRGTPMLNSKVGWD 977

  Fly   861 HSEDWFVTKYENMKTKSSGERVFSVNLASDNEEFLSGHIIDGKILVPATCYLQYVWETFSLMYHG 925
            |::.|.|.|:.  |..||||.:..|:|:.:::.||:||.|||:||.|||.|:...|:||:.| .|
  Fly   978 HTQKWLVAKFG--KETSSGETIVEVDLSKEDDAFLAGHTIDGRILFPATGYMTLAWQTFAKM-QG 1039

  Fly   926 PSYMDVPVEFEDIRFIRATSMPVDGKVDLTVMIHYGTGHFEITEMGSLVVTGIIRETENPSIPEV 990
            ..:...||..|::.|.|||.:..:..|...:....|||.|||.|.|||.|:|.|      :|||.
  Fly  1040 SEFHKTPVVMENLVFHRATILNKNAVVKFGINFFDGTGAFEICESGSLAVSGKI------TIPES 1098

  Fly   991 YNFQSKSKFPM-------IAKK----DFYKELKLRGYHYNGAFQAVNLARSDGL--FGRVQWNYN 1042
            .:   ..:.|:       :||:    |.||||:||||.|.|.|:.:  .|||.:  .|::||..|
  Fly  1099 ID---NEELPLEEQTPSAVAKELGTNDVYKELRLRGYDYGGIFRGI--VRSDTVASTGKLQWVDN 1158

  Fly  1043 WVTFMDAMLQIQILGTDSRNLLLPTKIRKLKINGVHHFDLMTKMDPENRV---------FDVYVD 1098
            |::|||.|||..||..:.|.|.|||:|.:..||...||:|::.:..|.:|         .|:.| 
  Fly  1159 WISFMDTMLQFSILSKNLRELYLPTRIERAVINPAKHFELLSALTKEEQVETGLPVQWYSDINV- 1222

  Fly  1099 PMYDRIIAGGIEIFGLHASLVQRRRPPGI---PVLEEYVFLPFFSSSILSLK------NAARVCV 1154
                 |.:.|:|:.||.|:|.|||  ||.   |.||.|.|:|..:::.|:..      :|..|.:
  Fly  1223 -----IKSAGVELRGLKANLAQRR--PGTQAPPTLERYQFVPNINTTDLNENSEKARLHALDVAI 1280

  Fly  1155 QIAIENNP-TLKLKLVEVGADGKNH---MLTEFIEAIQDLPVITGDYILLTSQNLEDL------- 1208
            |:.|||:. .:|||.||: |:|:|.   :....::.|:..||:|||..::||.|.|:.       
  Fly  1281 QVIIENSSGAVKLKGVEL-ANGRNPDVLVANRLLQIIEGEPVLTGDVAVVTSNNNEETITAALGD 1344

  Fly  1209 PGVHIENGSL---STQTNCHII----IIGGYEEDEVHEKITSAYNVLVDNGYIVFRQ------KC 1260
            .||.:.:..:   ..:.|||.:    ::...:...:...|.|    :.:||:::..:      |.
  Fly  1345 SGVRVVSKDVLKEPVEQNCHFVFGIDVLSRPDTKTLENSIAS----IRENGFLILEETLPTYTKT 1405

  Fly  1261 AKNVSCKIAEKFRTISKIPINNTEENLVLLQKISKKLTVPPVLVKVSQHDKTFEWILELQSAIIT 1325
            .:.:..|..  |..:.:..:..|.. |||.:|.....|...|:|..:  ::.|.|:.:|::|:.|
  Fly  1406 GRALLTKFG--FVAVQEQSLGATRV-LVLARKAVDLKTRKSVVVVAT--EQNFNWVDDLKAALAT 1465

  Fly  1326 KAP----VVVYSFNEKLNGQIGLVNCLRKEPDGNLIRCFFIDDDSAPDFDLSHPFYSTQYSLGLA 1386
            .|.    |.|....|:|.|.:||:.|::.|..|.|.|..|:.|..|..|.|:...|..|....|.
  Fly  1466 AATEEQYVYVVCQGEELFGAVGLMTCIKNENGGKLARLVFVQDAKAEKFSLTSTLYRQQLEKDLI 1530

  Fly  1387 FNIYRNGSWGSYRHLQLLKNDQPSKRLDHIYGNVIQRGDLSSLQWLKG---------PFNSQNCH 1442
            .|:.:||:||::|||: |:..|.:.:::|.|.|.:.:|||:||:|::.         ..|.:.| 
  Fly  1531 SNVLKNGAWGTFRHLK-LETQQATLQVEHAYVNALVKGDLASLKWIEAAQADTAATVDKNLETC- 1593

  Fly  1443 IKIAFSSLNFRDVMLATGRLAVELYGSSRIDQNCVLGFEYSGINMLTGRRIMSMVVKGGVASYVE 1507
             .:.::.:|||||||.:|:||.:.......:|:||||.|::|.: ..|||:|:||....:|:...
  Fly  1594 -TVYYAPINFRDVMLTSGKLAADALPGDLAEQDCVLGLEFAGRD-TQGRRVMAMVPAKSLATTCV 1656

  Fly  1508 KPSKLIWDIPDDWSLEEAATVPVVYITVYYAFFMATDIRKGKSILIHAGTGGIGLAAIRVALAYN 1572
            ...:::|.||:.|::|||:|||.||.|||||..:...::||:.||||||:||:|.|||.||||:.
  Fly  1657 ASKRMMWQIPEKWTMEEASTVPCVYSTVYYALVVRGQMKKGEKILIHAGSGGVGQAAISVALAHG 1721

  Fly  1573 LEVFTTCSTANKKEFLLKTFPKLKESHIGNSRNTSFELMVHRETNGKGVDFVLNSLSEEKLLASL 1637
            |.||||..:..|:|||||.||||:|.:|||||:||||.:|.|||.|:|||.||||||||||.||:
  Fly  1722 LTVFTTVGSKEKREFLLKRFPKLQERNIGNSRDTSFEQLVLRETKGRGVDLVLNSLSEEKLQASI 1786

  Fly  1638 RCLGKSGHFLEIGKYDMANDNKIGLGCFLKEITFHAVLADSLLVAPDEDIWHLKSLIDMDISNGI 1702
            ||||.:|.||||||:|::|::.:|:..|||..:||.:|.||::...:|....:.||:...|..|.
  Fly  1787 RCLGLNGRFLEIGKFDLSNNSPLGMSVFLKNTSFHGILLDSVMEGEEEMQNQVVSLVAEGIKTGA 1851

  Fly  1703 IQPLPVKVFLAHEIEQAFRHLIGGKHIGKVVIQVREQPHDPSTL--PVRVLNQV---YFKHNHTY 1762
            :.|||..||...::|||||.:..|||||||||:||::......|  ..|::|.:   |.....:|
  Fly  1852 VVPLPTSVFNDQQVEQAFRFMASGKHIGKVVIKVRDEEAGKKALQPKPRLINAIPRTYMHPEKSY 1916

  Fly  1763 VIPGGLGGFGMELADWMAIRGARKLLLSSSRGITKDYQLYRIALWKTYGCEVAISTADITSKKGC 1827
            ::.|||||||:||.:|:..||||.::|:|..|:...||...|..|:..|.:|.|.|:|:|:..|.
  Fly  1917 ILVGGLGGFGLELTNWLVTRGARYIVLTSRSGVKTGYQGLMIRRWQERGVKVVIDTSDVTTAAGA 1981

  Fly  1828 AQLLSEANGMGPVGGIFNLAVVLKDCIFSNQNVNQFLECFAPKAIATTYLDDLSRIYCPELEHFV 1892
            .:||..:|.:..||||||||.||:|.:..:|....|.....||..||.|||..||..|.||::|:
  Fly  1982 KKLLENSNKLALVGGIFNLAAVLRDALIEDQTAKDFKTVADPKVTATKYLDQFSRDICTELDYFI 2046

  Fly  1893 VFSSVSCGRGNAGQSNYGMANSVMERIIEHRNREGFPGKAIQWGAIGEVGLVADMAEDKIDMEIG 1957
            .||||||||||.||:|||:|||.||||.|.|...||||.||||||||:.|||.:...|. |..||
  Fly  2047 CFSSVSCGRGNIGQTNYGLANSAMERICEQRQVSGFPGTAIQWGAIGDTGLVLENLGDN-DTVIG 2110

  Fly  1958 GTLQQRISSCIQELDHLLCADASIVSSMVVAEKRTMRSGQG-NVIDAVMNIMGIRDLKSVSLSTT 2021
            |||.||:.||:|.:|..|.....:|:||||||||......| ::|..:.||:|:||.|::....:
  Fly  2111 GTLPQRMPSCLQTIDLFLQQPHPVVASMVVAEKRKSDQSAGVSLIATIANILGLRDTKNIQDGAS 2175

  Fly  2022 LSEMGMDSLMAVEIKQTLERDFELILTPQDLRHLTFQKLQEF---IDAK-------------EKE 2070
            |:::||||||:.||||||||:|:::|:.|::|.|||..|:..   .|.|             |..
  Fly  2176 LADLGMDSLMSAEIKQTLERNFDIVLSAQEIRQLTFGALKAMDGGADVKPAAAAPAAAAGVPEAN 2240

  Fly  2071 NT------------DGIQIIFASDNKLLGMELLIRNLGDEANCDQIIIPLQTSA-APSKQNLQPN 2122
            .|            ||.|::|.:.        ||..        :.|:.|.|.| |.|||:  |.
  Fly  2241 ITSGGSSRTASPMGDGTQVVFTTS--------LIPT--------EAIVQLDTKAPANSKQS--PI 2287

  Fly  2123 IIIPGLEGTAGRAWYQLGSKLQSPAIVLQLHQFAHLENLKDVAQQSFDQIKLILKQTEPFYIIAY 2187
            ..|..:||.|. |...|..:|:.||..||..:....::|:..|:....|::.: :...|:.:..|
  Fly  2288 FFISPIEGFAS-ALEPLAKRLEVPAYGLQYTEAVPSDSLESAAKFFIKQLRTV-QPKGPYKLAGY 2350

  Fly  2188 SYGTFVALLLAEMLENSGFRGHLMLLDGAPHFLKRLTNLHLGEQF-------SDNDLYDLLFSSI 2245
            |:|..:..::|.:||.:....::::|||||.::...|: ...:::       :||..|.|.:..|
  Fly  2351 SFGCLLTYVMAGILEETNEVANVIMLDGAPSYVNWYTS-SFKQRYTDGTNADNDNQSYGLAYFGI 2414

  Fly  2246 VNHIFPEASKESMSTVFHQVDCLSDKMSLFMNYVEK---QNMYSKKYSSTMVKAMFNRVKMAASF 2307
            |   ......:::..:...:....:|:..|...:..   |.:.:.|.|:|:   .:.::::|   
  Fly  2415 V---LANIDYKALVRLLIVIPTWEEKLERFAELMSNEITQPVETIKKSATL---FYKKLELA--- 2470

  Fly  2308 DLDG---IIKIKSPITLVRPAEASLQDIDEDYCISLLTSGVVTLKVIEGNHTT-MLDNPSLSQI 2367
              ||   .:|:|:.:|||:|.:.|.: :||||.:..:.:..|.:..:||||.| ::::.||..|
  Fly  2471 --DGYQPTLKLKTNVTLVKPTDNSAK-LDEDYRLKEVCTKPVEVHTVEGNHRTFLIEDQSLKTI 2531

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FASN3NP_001015405.3 PksD 16..>839 CDD:442550 382/822 (46%)
hot_dog 877..1125 CDD:469797 104/269 (39%)
Rossmann-fold NAD(P)(+)-binding proteins <1301..>1411 CDD:473865 38/113 (34%)
PKS_ER 1443..1734 CDD:214840 148/290 (51%)
KR_1_FAS_SDR_x <1761..1988 CDD:187657 115/226 (51%)
PKS_PP 2000..2067 CDD:214834 31/69 (45%)
alpha/beta hydrolases 2120..>2265 CDD:473884 34/151 (23%)
FASN1NP_001137778.2 PksD 139..>950 CDD:442550 382/816 (47%)
hot_dog 990..1193 CDD:469797 87/214 (41%)
Rossmann-fold NAD(P)(+)-binding proteins 1358..>1550 CDD:473865 53/201 (26%)
PKS_ER 1593..1883 CDD:214840 149/292 (51%)
KR_1_FAS_SDR_x <1901..2141 CDD:187657 117/240 (49%)
PKS_PP 2154..>2206 CDD:214834 25/51 (49%)
EntF2 <2284..2540 CDD:442548 64/265 (24%)

Return to query results.
Submit another query.