DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(3)80Fj and Gcn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015316.1 Gene:l(3)80Fj / 3355040 FlyBaseID:FBgn0287182 Length:2630 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001162135.1 Gene:Gcn1 / 690632 RGDID:1593434 Length:2671 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2697 Identity:1167/2697 - (43%)
Similarity:1706/2697 - (63%) Gaps:102/2697 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 DEQLSAALRDLPGRVLNVPVEERQHLFQNVSSVLKNSGINSTIIRGICKVIGTTITKYKDPTSQR 67
            |.|:|..|:....:|....|:||:.:...:...:....:....::|:||:...|:.:|:|..|:|
  Rat     4 DTQVSETLKRFAVKVTTASVKERREILSELGRCIAGKDLPEGAVKGLCKLFCLTLHRYRDAASRR 68

  Fly    68 IVRDLIVDLVTIHHDLTIEHMLNVFKAFIYKEFASVSPQKSCKLAVIALGWISIIQK-----QAQ 127
            .::..|..|.....:.|.:::|:..::......|.|..:.|...|::||.|..::.:     :|:
  Rat    69 ALQAAIQQLAEAQPEATAKNLLHSLQSSGVGSKACVPSKSSGSAALLALTWTCLLVRIVFPLKAK 133

  Fly   128 RESNIFKTEKKKLIEYQTLLYQITVISPNQRVTDARTKILYDLW-NNTEIFNETMDTLFQMESTS 191
            |:.:|:    .||:|.|.||....:...::...|...|.|..|| .|..:..:....:..:|...
  Rat   134 RQGDIW----NKLVEVQCLLLLEVLGGSHKHAVDGAVKKLTKLWKENPGLVEQYFSAILSLEPNQ 194

  Fly   192 NVTIFCMAMFQFKYKNCNALKLNQYTEKLSEYFVKSMISCKHKPDKSFIIACSPLLKSLTDAEFD 256
            |.......:.||...:.....:||:...|.|::||.::..|.||.|..:..|:|||:.::.:||.
  Rat   195 NYAGMLGLLVQFCTNHKEMDVVNQHKSTLLEFYVKHILMSKAKPPKYLLDNCAPLLRFMSHSEFK 259

  Fly   257 SYIYPSLQRSILRSPENTLQSIGLIFNMLNFDCSRYAQKVGIVLIKNLYSKGDIARQESLESLKL 321
            ..|.|::|:|:||||||.:::|..:...:..|.|:||..:...|...|.|.......|::.:|:.
  Rat   260 DLILPTIQKSLLRSPENVIETISSLLASVTLDLSQYALDIVKGLANQLKSNSPRLMDEAVLALRN 324

  Fly   322 LSTKCSNWIIVKELLERIFSVLNGSDGKINVIEYRINILQGAGNLSFNNIDQDHMPN--ILNEAV 384
            ||.:||:....:.|.:.:|::|.||:||:.:|..::::|.|.|:||.:.:..   |:  :||..|
  Rat   325 LSRQCSDSSATEALTKHLFAILGGSEGKLTIIAQKMSVLSGIGSLSHHGVSG---PSGQVLNGCV 386

  Fly   385 T-LFSKALECETQEKVICCTLEMFGLWTQKFIHNLPDVVINIFTSGMRLKTTNQIIRQSYLEWLL 448
            . ||...|:.|..|..:...:.:..||..:|...:|..:.:.|.....|||:...:|.:||:.:|
  Rat   387 AELFIPFLQQEVHEGTLVHAVSVLALWCNRFTTEVPKKLTDWFKKVFSLKTSTSAVRHAYLQCML 451

  Fly   449 LSIQNAEVNNHISIIQDLISFYTKALQNSSQSCYLSE---AACIACILLILEKPSE-NYNFFWTT 509
            .|.:...:...:..:..|:....||...|:|...::|   ||.:...|.:.:..:| ..:.||..
  Rat   452 ASFRGDTLLQALDFLPLLMQTVEKAASQSTQVPTVTEGVAAALLVSKLSVADSQAEAKLSNFWQL 516

  Fly   510 VFDMKKLIFYNEKFTTTAPIPTLCNI-SLMARILINSYPEKIKGKLEPLARTLVSNLCCNSVKVR 573
            |.|.||.||.:|||...|....||.: .|..|:.::........:::...|.||:.|...:..||
  Rat   517 VVDEKKQIFTSEKFLLLASEEALCTVLHLTERLFLDHAHRLTNSRVQQYYRVLVAVLLSRTWHVR 581

  Fly   574 VYTAKQVKQIINSSSGIEFVKLALCEFGKRIN------LVNIETDGEPLIDQFGTSNQVYV---- 628
            ....:.|:::::|..||:.....|.|....:|      |..:.||...:::    :.:.||    
  Rat   582 RQAQQTVRKLLSSLGGIKLANGLLEELKTVLNSHKVLPLETLVTDAGEVME----TGKTYVPPRV 642

  Fly   629 --DALLTLTSIKHITYE--DSVDVAIDLLLISHHPAIVSNEPYLWETTIQKHLNLDAKNVILAKT 689
              :||..::.:..:..:  .:..:|.::|:|||||::|:.:..||...:.: :.:|.:..|....
  Rat   643 LQEALCVISGVPGLKGDITSTEQLAQEMLIISHHPSLVAVQSGLWPALLTR-MKIDPEAFITRHL 706

  Fly   690 NEIVNEYIDNYIASAQYENTISALIRICPNLIVPTVVNNLKNYLSNFSNYNVSNEEYLIFLTPDG 754
            ::|:.........:....|.:.:|..:.|:.::|.:::::...:.|.:...|:.||:.:..||.|
  Rat   707 DQIIPRITTQSPLNQSSMNAMGSLSILSPDRVLPQLISSITASVQNPALCLVTREEFAVMQTPAG 771

  Fly   755 ELFDKSVIPHIDSQYETVR---LKRENKVYSYKEQLEEIQLRREIDDKREKEGKLKTIRYTQKQE 816
            ||||||:|.  .:|.::::   :|||||.||:|||:.|::|:.||   ::|:|..:.::.|.||:
  Rat   772 ELFDKSIIQ--SAQQDSIKKANMKRENKAYSFKEQIIELELKEEI---KKKKGIKEEVQLTSKQK 831

  Fly   817 EQIKNQMEKELHIKLRITLLYEKLISKISLLKASCSGNGEQMAQHFYSLLDGILNASKSPLCAEV 881
            |.::.||:||..|:.|:..|..:|.:.:.||.|..:.|...:.|:...|:|..|...||||.|..
  Rat   832 EMLQAQMDKEAQIRRRLQELDGELEAALGLLDAIMTRNPRGLTQYIPVLVDAFLPLLKSPLAAPR 896

  Fly   882 LTDLYIFLHNLCFTFQPK---LGRAIALATIKLQSPSCVLKKEFEAFNVNQAINDIIIDLDNH-V 942
            :...::.|  ......|:   ||..::..|::|..|.|.|.:.:....:..|:...:..|..| :
  Rat   897 VKGPFLSL--AACVMPPRLKTLGTLVSHVTLRLLKPECALDQSWCQEELPVAVRRAVSLLHTHTI 959

  Fly   943 KSNY---------LDSPSFSYAFEFLKRAL--LLLNTDSDFDLISKGIQILALHTSAGVCCK--- 993
            .|..         |.:|:||..|..||..|  :..:::.:.:.:::.:|||.:|........   
  Rat   960 PSRVGKGEPDAAPLSAPAFSLIFPMLKMVLTEMPYHSEEEEEQMAQILQILTVHAQLRASPDTPP 1024

  Fly   994 -------PQFMPRFGMFKMLLDLLKNNN-KLWAQTSAAILQVAKCSNG-DNCSSPDNHIISIFLQ 1049
                   |:.:||..|.::|..::...: :|....|..:..:...|:| |.|:..:...:.:.|.
  Rat  1025 ERVDENGPELLPRVAMLRLLTWVIGTGSPRLQVLASDTLTALCASSSGEDGCAFAEQEEVDVLLA 1089

  Fly  1050 ALQHCSDAVRKVALQSLKIMVNGIVNHIKV-------DNSLEKVIINRFWVAKHDPEEENRELAL 1107
            |||....:||:.||:.|..:      |:.:       .|.|.  ::.|.||.|.|.|||.|:||.
  Rat  1090 ALQSPCASVRETALRGLMEL------HLVLPAPDTDEKNGLN--LLRRLWVVKFDKEEEIRKLAE 1146

  Fly  1108 FLWNTAKFPLPGYVD--IINDITHSETCIQKSASESLIPLLAGDEVLKKCVIKKLFSIYKAKLSL 1170
            .||.|....|...:.  :|:|:.:.|..::::.:|:|...:|..:.....|:.:|..||:.||..
  Rat  1147 RLWTTMGLDLQSDLCSLLIDDVIYHEAAVRQAGAEALSQAVARYQRQAAEVMGRLMEIYQEKLYR 1211

  Fly  1171 LPPVLDQFDREI-EPAIDQWKPRRGIAIAFSTIAFLLSIEDINDIMNFMVSQGLGDREDVVHKEM 1234
            .|||||...|.| |...|||:.|.|:|:|.:.::..|....:..:..|.|...|.||...|.|.|
  Rat  1212 PPPVLDALGRVISESPPDQWEARCGLALALNKLSQYLDSSQVKPLFQFFVPDALNDRNPDVRKCM 1276

  Fly  1235 LATALKIVDLHGNKAIENLLPVFEDFLDKAPKSQSYDNIRQAVVILMGSLARHLEKDDKRIDPIV 1299
            |..||..::.||.:.:.:||||||:||..||...|||.:||:||:||||||:||:|.|.::.|||
  Rat  1277 LDAALATLNAHGKENVNSLLPVFEEFLKDAPNDASYDAVRQSVVVLMGSLAKHLDKSDPKVKPIV 1341

  Fly  1300 KRLITSLSTPSQQVQEAVSNCLPHLMPSVKDEAPSMIKKLLHSLAKSEKYGERRGAAYGIAGIVK 1364
            .:||.:||||||||||:|::|||.|:|:||::|..||::|:..|.:|:||.||:|||||:||:||
  Rat  1342 AKLIAALSTPSQQVQESVASCLPPLVPAVKEDAGGMIQRLMQQLLESDKYAERKGAAYGLAGLVK 1406

  Fly  1365 GLGILSLKQLDIMSKLTAFIQDKKNYRSREGALFAFEVLCSTLGRLFEPYIVHVLPHLLQCFGDP 1429
            |||||||||.::|:.||..||||||:|.|||||||||:||:.||:|||||:||||||||.||||.
  Rat  1407 GLGILSLKQQEMMAALTDAIQDKKNFRRREGALFAFEMLCTMLGKLFEPYVVHVLPHLLLCFGDG 1471

  Fly  1430 SQYVRQAADDTAKVVMRKLSAHGVKLVLPSLLEALDEDSWRTKTASVELLGAMAFCAPKQLSSCL 1494
            :||||:||||.||.||..||||||||||||||.||:|:|||||..|||||||||:||||||||||
  Rat  1472 NQYVREAADDCAKAVMSNLSAHGVKLVLPSLLAALEEESWRTKAGSVELLGAMAYCAPKQLSSCL 1536

  Fly  1495 PSIVPKLIQVLGDSHTKVQESGGEALKVIGSVIKNPEIQAIVPVLLDALEDPSNNTSTCLQSLLK 1559
            |:|||||.:||.|||.|||::|.:||:.|||||:||||.||.|||||||.|||..|..|||:||.
  Rat  1537 PNIVPKLTEVLTDSHVKVQKAGQQALRQIGSVIRNPEILAIAPVLLDALTDPSRKTQKCLQTLLD 1601

  Fly  1560 TKFIHFIDAPSLALIMPVVQRAFMDRSTETRKMAAQIIGNMYSLTDQKDLAPYLPSIIPGLKSSL 1624
            |||:|||||||||||||:|||||.||||:|||||||||||||||||||||||||||:.||||:||
  Rat  1602 TKFVHFIDAPSLALIMPIVQRAFQDRSTDTRKMAAQIIGNMYSLTDQKDLAPYLPSVTPGLKASL 1666

  Fly  1625 LDPVPEVRAVSARALGAMVKGMGESSFENLLPWLMETLTSESSSVDRSGAAQGLSEVVGGLGVEK 1689
            ||||||||.|||:||||||||||||.||:||||||||||.|.||||||||||||:||:.||||||
  Rat  1667 LDPVPEVRTVSAKALGAMVKGMGESCFEDLLPWLMETLTYEQSSVDRSGAAQGLAEVMAGLGVEK 1731

  Fly  1690 MHKLMPEIISTAERVDIAAHVKDGYIMMFIYMPGAFQEEFTPYIGQIINPILKALADESEFVRDT 1754
            :.||||||::||.:||||.||:|||||||.|:|..|.::||||:|.||..||||||||:||||||
  Rat  1732 LEKLMPEIVATASKVDIAPHVRDGYIMMFNYLPITFGDKFTPYVGPIIPCILKALADENEFVRDT 1796

  Fly  1755 ALKAGQRIVNLYAETAVALLLPELEKGLFDDNWRIRYSSVQLLGDLLYRISGVSGKMTTETASED 1819
            ||:||||::::|||||:|||||:||:|||||.||||:||||||||||:.||||:|||||||||||
  Rat  1797 ALRAGQRVISMYAETAIALLLPQLEQGLFDDLWRIRFSSVQLLGDLLFHISGVTGKMTTETASED 1861

  Fly  1820 DNFGTEHSHTAIIHFLGDERRNRVLSGLYMGRSDVSLMVRQAALHVWKVVVTNTPRTLREILPTL 1884
            |||||..|:.|||..||.:||||||:||||||||..|:||||:|||||:||:|||||||||||||
  Rat  1862 DNFGTAQSNKAIITALGVDRRNRVLAGLYMGRSDTQLVVRQASLHVWKIVVSNTPRTLREILPTL 1926

  Fly  1885 FGLLLGCLASTSYDKRQVAARTLGDLVRKLGERVLPEIIPILENGLNSDHPDQRQGVCIGLSEIM 1949
            ||||||.||||..|||.:||||||||||||||::|||||||||.||.|...|:||||||||||||
  Rat  1927 FGLLLGFLASTCADKRTIAARTLGDLVRKLGEKILPEIIPILEEGLRSQKSDERQGVCIGLSEIM 1991

  Fly  1950 GSTSKEMVLTFIDSLVPTVRKALCDPLPEVREAAAKTFESLHSTVGSRALDEILPFMLQGLSDAD 2014
            .|||::.||.|.:|||||.||||||||.|||||||||||.||||:|.:||::||||:|:.|.|.:
  Rat  1992 KSTSRDAVLYFSESLVPTARKALCDPLEEVREAAAKTFEQLHSTIGHQALEDILPFLLKQLDDEE 2056

  Fly  2015 PFVAENTLDGLRQVMSIKSKVVLPYLVPQLTSPPVNTKALSILVSVAGEALIKYLPKILSSLLEA 2079
              |:|..||||:|||::||:||||||||:||:|||||:.|:.|.||||:||.::|..||.:::.|
  Rat  2057 --VSEFALDGLKQVMAVKSRVVLPYLVPKLTTPPVNTRVLAFLSSVAGDALTRHLGVILPAVMLA 2119

  Fly  2080 LSDAYGYPNEPQENEYCQTVILSVTDETGIRTIMDTLLISANSSDLCTRKSAASLLSAFCIHSPG 2144
            |.:..|.|:|..|...||.|||||.|:||.|.|::.||.:..|.::..|::||.:|:.:|..|..
  Rat  2120 LKEKLGTPDEQLEMANCQAVILSVEDDTGHRIIIEDLLEATRSPEVGMRQAAAIILNMYCSRSKA 2184

  Fly  2145 NYYEYIPQLLRCLLKLLVESDKDILQKSWEALNAVIKGMNAAQQICHVSDVRQAVRFAASELEGT 2209
            :|..::..|:..|::|..:|...:|.:||:||||:.|.::|..|:..:.:..:.:|:..:|..|.
  Rat  2185 DYTSHLRSLVSGLIRLFNDSSPVVLGESWDALNAITKKLDAGNQLALIEEFHKEIRYIGNECRGE 2249

  Fly  2210 ELPGFCLP-KGITPLLPVFREAILNGLPEEKENAAQGLGEVIFLTNAKSLQPSVVHITGPLIRIL 2273
            .:|||||| ||:|.:|||.||.:|.|.||:||.||:.||.||.||:|.:|:||||.|||||||||
  Rat  2250 HVPGFCLPKKGVTSILPVLREGVLTGSPEQKEEAAKALGLVIRLTSADALRPSVVSITGPLIRIL 2314

  Fly  2274 GDRFNAAVKAAVLETLSILLHKVGVMLKQFLPQLQTTFLKALHDQNRNVRMKAGKALSELVAIHS 2338
            ||||:.:||||:|||||:||.|||:.||.|||||||||.|||.|.||.||:||..||.:|::||.
  Rat  2315 GDRFSWSVKAALLETLSLLLGKVGIALKPFLPQLQTTFTKALQDSNRGVRLKAADALGKLISIHI 2379

  Fly  2339 RAEPLFNEIHNGIKNSDDSSVRETMLHALRSIVSRSGDKMSEPIKKQIYVTLLSMIGHHEDATRS 2403
            :.:|||.|:.|||:..:|..:|:|||.|||.::..:|.|:...|:|.|...||.|:||.||.||.
  Rat  2380 KVDPLFTELLNGIRVVEDPGIRDTMLQALRFVIQGAGAKVDAAIRKNIVSLLLGMLGHDEDNTRI 2444

  Fly  2404 AVGGCLGAILKYIASGHVYDLFNNIILTNNTD-DLIVKHGHTIVLFVALKECPTEVLVLDLPEKI 2467
            :..||||.:..::....:..:....:|.:.:. |.:|:||.::.|.||:...|:.:.......::
  Rat  2445 SSAGCLGELCAFLTEEELNTVLQQCLLADVSGIDWMVRHGRSLALSVAVNVAPSRLCTGKYSNEV 2509

  Fly  2468 TSYVLINILSEKVPIASNAVRAATYLLDYYL-VNQNEPPIKIVMALSRAMNHSSNDVKQLVAQSC 2531
            ...||.|.:::::|||.:.:|...:|:.|:: ....:.|.::...|.:.:.:.|:|:: |||:..
  Rat  2510 QDMVLSNAVADRIPIAVSGIRGMGFLMKYHIETGGGQLPPRLSTLLIKCLQNPSSDIR-LVAEKM 2573

  Fly  2532 TYLSKNLAANQSSIDVLKYLVPMLVNGTKEKNGYVKSNSELALISILRLRSDDTSFLKISGLLES 2596
            .:.:............:|.::..|::.||:||..|::.||.|::::|:||..:.....:|.:|:.
  Rat  2574 IWWANKEPRPALEPQAIKPILKALLDNTKDKNTVVRAYSEQAIVNLLKLRQGEELLQSLSKILDV 2638

  Fly  2597 GARDSLNDVVLKVLKRTSSQSIIKEEELDDTL 2628
            .:.::||:...:.||:.:.|: ...|::|||:
  Rat  2639 ASLEALNECSRRSLKKLACQA-DSVEQVDDTI 2669

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(3)80FjNP_001015316.1 HEAT repeat 1142..1162 CDD:293787 4/19 (21%)
HEAT repeat 1174..1204 CDD:293787 13/30 (43%)
HEAT repeat 1214..1244 CDD:293787 11/29 (38%)
HEAT repeat 1252..1283 CDD:293787 19/30 (63%)
HEAT repeat 1297..1323 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 1335..1364 CDD:293787 16/28 (57%)
HEAT 1339..1483 CDD:441023 106/143 (74%)
HEAT repeat 1375..1406 CDD:293787 21/30 (70%)
HEAT repeat 1419..1443 CDD:293787 18/23 (78%)
HEAT 1433..1642 CDD:441023 167/208 (80%)
HEAT repeat 1456..1484 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT repeat 1496..1526 CDD:293787 18/29 (62%)
HEAT repeat 1534..1560 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 1571..1600 CDD:293787 25/28 (89%)
HEAT 1590..1800 CDD:441023 167/209 (80%)
HEAT repeat 1616..1644 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT repeat 1653..1684 CDD:293787 25/30 (83%)
HEAT repeat 1692..1716 CDD:293787 17/23 (74%)
HEAT repeat 1733..1758 CDD:293787 19/24 (79%)
HEAT 1737..1910 CDD:441023 136/172 (79%)
HEAT repeat 1881..1909 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT 1900..2047 CDD:441023 105/146 (72%)
HEAT repeat 1922..1950 CDD:293787 21/27 (78%)
HEAT repeat 1963..1993 CDD:293787 26/29 (90%)
HEAT repeat 2001..2027 CDD:293787 13/25 (52%)
HEAT repeat 2033..2060 CDD:293787 18/26 (69%)
HEAT repeat 2222..2251 CDD:293787 16/28 (57%)
HEAT repeat 2260..2291 CDD:293787 25/30 (83%)
HEAT repeat 2304..2333 CDD:293787 20/28 (71%)
HEAT repeat 2342..2369 CDD:293787 14/26 (54%)
HEAT repeat 2383..2412 CDD:293787 15/28 (54%)
Gcn1NP_001162135.1 HEAT repeat 1215..1249 CDD:293787 13/33 (39%)
HEAT repeat 1259..1290 CDD:293787 13/30 (43%)
HEAT repeat 1294..1325 CDD:293787 19/30 (63%)
HEAT repeat 1337..1364 CDD:293787 17/26 (65%)
HEAT repeat 1378..1403 CDD:293787 13/24 (54%)
HEAT 1394..1566 CDD:441023 129/171 (75%)
HEAT repeat 1418..1447 CDD:293787 20/28 (71%)
HEAT repeat 1461..1485 CDD:293787 18/23 (78%)
HEAT repeat 1498..1526 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT repeat 1538..1568 CDD:293787 18/29 (62%)
HEAT repeat 1577..1601 CDD:293787 16/23 (70%)
HSH155 1586..>2084 CDD:227508 385/499 (77%)
HEAT repeat 1613..1642 CDD:293787 25/28 (89%)
HEAT_2 1616..1721 CDD:433376 92/104 (88%)
HEAT repeat 1660..1683 CDD:293787 19/22 (86%)
HEAT repeat 1696..1725 CDD:293787 25/28 (89%)
HEAT repeat 1734..1766 CDD:293787 23/31 (74%)
HEAT repeat 1777..1802 CDD:293787 19/24 (79%)
HEAT repeat 1813..1842 CDD:293787 23/28 (82%)
HEAT 1942..2095 CDD:441023 110/154 (71%)
HEAT repeat 1964..1992 CDD:293787 21/27 (78%)
HEAT repeat 2005..2035 CDD:293787 26/29 (90%)
HEAT repeat 2043..2067 CDD:293787 13/25 (52%)
HEAT repeat 2073..2100 CDD:293787 18/26 (69%)
HEAT repeat 2265..2289 CDD:293787 14/23 (61%)
HEAT repeat 2310..2332 CDD:293787 17/21 (81%)
HEAT repeat 2344..2374 CDD:293787 21/29 (72%)
HEAT repeat 2383..2414 CDD:293787 15/30 (50%)
HEAT repeat 2423..2452 CDD:293787 15/28 (54%)

Return to query results.
Submit another query.