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Protein Alignment l(3)80Fj and Gcn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015316.1 Gene:l(3)80Fj / 3355040 FlyBaseID:FBgn0287182 Length:2630 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_766307.2 Gene:Gcn1 / 231659 MGIID:2444248 Length:2671 Species:Mus musculus


Alignment Length:2688 Identity:1161/2688 - (43%)
Similarity:1708/2688 - (63%) Gaps:84/2688 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 DEQLSAALRDLPGRVLNVPVEERQHLFQNVSSVLKNSGINSTIIRGICKVIGTTITKYKDPTSQR 67
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Mouse     4 DTQVSETLKRFAVKVTTASVKERREILSELGRCIAGKDLPEGAVKGLCKLFCLTLHRYRDAASRR 68

  Fly    68 IVRDLIVDLVTIHHDLTIEHMLNVFKAFIYKEFASVSPQKSCKLAVIALGWISIIQK-----QAQ 127
            .::..|..|.....:.|.:::|:..::......|.|..:.|...|::||.|..::.:     :|:
Mouse    69 ALQAAIQQLAEAQPEATAKNLLHSLQSSGVGSKACVPSKSSGSAALLALTWTCLLVRIVFPLKAK 133

  Fly   128 RESNIFKTEKKKLIEYQTLLYQITVISPNQRVTDARTKILYDLW-NNTEIFNETMDTLFQMESTS 191
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Mouse   134 RQGDIW----NKLVEVQCLLLLEVLGGSHKHAVDGAVKKLTKLWKENPGLVEQYFSAILSLEPSQ 194

  Fly   192 NVTIFCMAMFQF--KYKNCNALKLNQYTEKLSEYFVKSMISCKHKPDKSFIIACSPLLKSLTDAE 254
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Mouse   195 NYAAMLGLLVQFCTNHKEMDA--VSQHKSTLLEFYVKNILMSKAKPPKYLLDNCAPLLRFMSHSE 257

  Fly   255 FDSYIYPSLQRSILRSPENTLQSIGLIFNMLNFDCSRYAQKVGIVLIKNLYSKGDIARQESLESL 319
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Mouse   258 FKDLILPTIQKSLLRSPENVIETISSLLASVTLDLSQYALDIVKGLANQLKSNSPRLMDEAVLAL 322

  Fly   320 KLLSTKCSNWIIVKELLERIFSVLNGSDGKINVIEYRINILQGAGNLSFNNIDQDHMPNILNEAV 384
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Mouse   323 RNLARQCSDSSATEALTKHLFAILGGSEGKLTIIAQKMSVLSGIGSLS-HHVVSGPSGQVLNGCV 386

  Fly   385 T-LFSKALECETQEKVICCTLEMFGLWTQKFIHNLPDVVINIFTSGMRLKTTNQIIRQSYLEWLL 448
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Mouse   387 AELFIPFLQQEVHEGTLVHAVSILALWCNRFTTEVPKKLTDWFKKVFSLKTSTSAVRHAYLQCML 451

  Fly   449 LSIQNAEVNNHISIIQDLISFYTKALQNSSQSCYLSEAACIACILLILE----KPSENYNFFWTT 509
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Mouse   452 ASFRGDTLLQALDFLPLLMQTVEKAASQGTQVPTVTEGVAAALLLSKLSVADAQAEAKLSGFWQL 516

  Fly   510 VFDMKKLIFYNEKFTTTAPIPTLCNISLMARILINSYPEKI-KGKLEPLARTLVSNLCCNSVKVR 573
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Mouse   517 VVDEKRQTFTSEKFLLLASEDALCTVLRLTERLFLDHPHRLTNSKVQQYYRVLVAVLLSRTWHVR 581

  Fly   574 VYTAKQVKQIINSSSGIEFVKLALCEFGKRIN------LVNIETD-GEPLIDQFGTS---NQVYV 628
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Mouse   582 RQAQQTVRKLLSSLGGVKLANGLLDELKTVLNSHKVLPLEALVTDAGE--VTEMGKTYVPPRVLQ 644

  Fly   629 DALLTLTSIKHITYE--DSVDVAIDLLLISHHPAIVSNEPYLWETTIQKHLNLDAKNVILAKTNE 691
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Mouse   645 EALCVISGVPGLKGDIPSTEQLAQEMLIISHHPSLVAVQSGLWPALLTR-MKIDPDAFITRHLDQ 708

  Fly   692 IVNEYIDNYIASAQYENTISALIRICPNLIVPTVVNNLKNYLSNFSNYNVSNEEYLIFLTPDGEL 756
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Mouse   709 IIPRITTQSPLNQSSMNAMGSLSVLSPDRVLPQLISTITASVQNPALCLVTREEFSIMQTPAGEL 773

  Fly   757 FDKSVIPHIDSQYETVR---LKRENKVYSYKEQLEEIQLRREIDDKREKEGKLKTIRYTQKQEEQ 818
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Mouse   774 FDKSIIQ--SAQQDSIKKANMKRENKAYSFKEQIIEMELKEEI---KKKKGIKEEVQLTSKQKEM 833

  Fly   819 IKNQMEKELHIKLRITLLYEKLISKISLLKASCSGNGEQMAQHFYSLLDGILNASKSPLCAEVLT 883
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Mouse   834 LQAQMDKEAQIRRRLQELDGELEAALGLLDAIMARNPCGLIQYIPVLVDAFLPLLKSPLAAPRVK 898

  Fly   884 DLYIFLHNLCFTFQPK---LGRAIALATIKLQSPSCVLKKEFEAFNVNQAINDIIIDLDNH-VKS 944
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Mouse   899 GPFLSL--AACVMPPRLKTLGTLVSHVTLRLLKPECALDKSWCQEELPVAVRRAVSLLHTHTIPS 961

  Fly   945 NY---------LDSPSFSYAFEFLKRAL--LLLNTDSDFDLISKGIQILALHTSAGVCCK----- 993
            ..         |.:|:||..|..||..|  :..:::.:.:.:::.:|||.:|........     
Mouse   962 RVGKGEPDAAPLSAPAFSLVFPMLKMVLTEMPYHSEEEEEQMAQILQILTVHAQLRASPDTPPER 1026

  Fly   994 -----PQFMPRFGMFKMLLDLLKNNN-KLWAQTSAAILQVAKCSNG-DNCSSPDNHIISIFLQAL 1051
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Mouse  1027 VDENGPELLPRVAMLRLLTWVIGTGSPRLQVLASDTLTALCASSSGEDGCAFAEQEEVDVLLAAL 1091

  Fly  1052 QHCSDAVRKVALQSLKIMVNGIVNHIKVDNSLEKVIINRFWVAKHDPEEENRELALFLWNTAKFP 1116
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Mouse  1092 QSPCASVRETALRGL-MELRLVLPSPDTDEKSGLSLLRRLWVIKFDKEDEIRKLAERLWSTMGLD 1155

  Fly  1117 LPGYVD--IINDITHSETCIQKSASESLIPLLAGDEVLKKCVIKKLFSIYKAKLSLLPPVLDQFD 1179
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Mouse  1156 LQSDLCSLLIDDVIYHEAAVRQAGAEALSQAVARYQRQAAEVMGRLMEIYQEKLYRPPPVLDALG 1220

  Fly  1180 REI-EPAIDQWKPRRGIAIAFSTIAFLLSIEDINDIMNFMVSQGLGDREDVVHKEMLATALKIVD 1243
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Mouse  1221 RVISESPPDQWEARCGLALALNKLSQYLDSSQVKPLFQFFVPDALNDRNPDVRKCMLDAALATLN 1285

  Fly  1244 LHGNKAIENLLPVFEDFLDKAPKSQSYDNIRQAVVILMGSLARHLEKDDKRIDPIVKRLITSLST 1308
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Mouse  1286 AHGKENVNSLLPVFEEFLKDAPNDASYDAVRQSVVVLMGSLAKHLDKSDPKVKPIVAKLIAALST 1350

  Fly  1309 PSQQVQEAVSNCLPHLMPSVKDEAPSMIKKLLHSLAKSEKYGERRGAAYGIAGIVKGLGILSLKQ 1373
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Mouse  1351 PSQQVQESVASCLPPLVPAVKEDAGGMIQRLMQQLLESDKYAERKGAAYGLAGLVKGLGILSLKQ 1415

  Fly  1374 LDIMSKLTAFIQDKKNYRSREGALFAFEVLCSTLGRLFEPYIVHVLPHLLQCFGDPSQYVRQAAD 1438
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Mouse  1416 QEMMAALTDAIQDKKNFRRREGALFAFEMLCTMLGKLFEPYVVHVLPHLLLCFGDGNQYVREAAD 1480

  Fly  1439 DTAKVVMRKLSAHGVKLVLPSLLEALDEDSWRTKTASVELLGAMAFCAPKQLSSCLPSIVPKLIQ 1503
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Mouse  1481 DCAKAVMSNLSAHGVKLVLPSLLAALEEESWRTKAGSVELLGAMAYCAPKQLSSCLPNIVPKLTE 1545

  Fly  1504 VLGDSHTKVQESGGEALKVIGSVIKNPEIQAIVPVLLDALEDPSNNTSTCLQSLLKTKFIHFIDA 1568
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Mouse  1546 VLTDSHVKVQKAGQQALRQIGSVIRNPEILAIAPVLLDALTDPSRKTQKCLQTLLDTKFVHFIDA 1610

  Fly  1569 PSLALIMPVVQRAFMDRSTETRKMAAQIIGNMYSLTDQKDLAPYLPSIIPGLKSSLLDPVPEVRA 1633
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Mouse  1611 PSLALIMPIVQRAFQDRSTDTRKMAAQIIGNMYSLTDQKDLAPYLPSVTPGLKASLLDPVPEVRT 1675

  Fly  1634 VSARALGAMVKGMGESSFENLLPWLMETLTSESSSVDRSGAAQGLSEVVGGLGVEKMHKLMPEII 1698
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Mouse  1676 VSAKALGAMVKGMGESCFEDLLPWLMETLTYEQSSVDRSGAAQGLAEVMAGLGVEKLEKLMPEIV 1740

  Fly  1699 STAERVDIAAHVKDGYIMMFIYMPGAFQEEFTPYIGQIINPILKALADESEFVRDTALKAGQRIV 1763
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Mouse  1741 ATASKVDIAPHVRDGYIMMFNYLPITFGDKFTPYVGPIIPCILKALADENEFVRDTALRAGQRVI 1805

  Fly  1764 NLYAETAVALLLPELEKGLFDDNWRIRYSSVQLLGDLLYRISGVSGKMTTETASEDDNFGTEHSH 1828
            ::|||||:|||||:||:|||||.||||:||||||||||:.||||:||||||||||||||||..|:
Mouse  1806 SMYAETAIALLLPQLEQGLFDDLWRIRFSSVQLLGDLLFHISGVTGKMTTETASEDDNFGTAQSN 1870

  Fly  1829 TAIIHFLGDERRNRVLSGLYMGRSDVSLMVRQAALHVWKVVVTNTPRTLREILPTLFGLLLGCLA 1893
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Mouse  1871 KAIITALGVDRRNRVLAGLYMGRSDTQLVVRQASLHVWKIVVSNTPRTLREILPTLFGLLLGFLA 1935

  Fly  1894 STSYDKRQVAARTLGDLVRKLGERVLPEIIPILENGLNSDHPDQRQGVCIGLSEIMGSTSKEMVL 1958
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Mouse  1936 STCADKRTIAARTLGDLVRKLGEKILPEIIPILEEGLRSQKSDERQGVCIGLSEIMKSTSRDAVL 2000

  Fly  1959 TFIDSLVPTVRKALCDPLPEVREAAAKTFESLHSTVGSRALDEILPFMLQGLSDADPFVAENTLD 2023
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Mouse  2001 FFSESLVPTARKALCDPLEEVREAAAKTFEQLHSTIGHQALEDILPFLLKQLDDEE--VSEFALD 2063

  Fly  2024 GLRQVMSIKSKVVLPYLVPQLTSPPVNTKALSILVSVAGEALIKYLPKILSSLLEALSDAYGYPN 2088
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Mouse  2064 GLKQVMAVKSRVVLPYLVPKLTTPPVNTRVLAFLSSVAGDALTRHLGVILPAVMLALKEKLGTPD 2128

  Fly  2089 EPQENEYCQTVILSVTDETGIRTIMDTLLISANSSDLCTRKSAASLLSAFCIHSPGNYYEYIPQL 2153
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Mouse  2129 EQLEMANCQAVILSVEDDTGHRIIIEDLLEATRSPEVGMRQAAAIILNMYCSRSKADYSSHLRSL 2193

  Fly  2154 LRCLLKLLVESDKDILQKSWEALNAVIKGMNAAQQICHVSDVRQAVRFAASELEGTELPGFCLPK 2218
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Mouse  2194 VSGLIRLFNDSSPVVLEESWDALNAITKKLDAGNQLALIEELHKEIRFIGNECKGEHVPGFCLPK 2258

  Fly  2219 -GITPLLPVFREAILNGLPEEKENAAQGLGEVIFLTNAKSLQPSVVHITGPLIRILGDRFNAAVK 2282
             |:|.:|||.||.:|.|.||:||.||:|||.||.||:|.:|:||||.||||||||||||||..||
Mouse  2259 RGVTSILPVLREGVLTGSPEQKEEAAKGLGLVIRLTSADALRPSVVSITGPLIRILGDRFNWTVK 2323

  Fly  2283 AAVLETLSILLHKVGVMLKQFLPQLQTTFLKALHDQNRNVRMKAGKALSELVAIHSRAEPLFNEI 2347
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Mouse  2324 AALLETLSLLLGKVGIALKPFLPQLQTTFTKALQDSNRGVRLKAADALGKLISIHVKVDPLFTEL 2388

  Fly  2348 HNGIKNSDDSSVRETMLHALRSIVSRSGDKMSEPIKKQIYVTLLSMIGHHEDATRSAVGGCLGAI 2412
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Mouse  2389 LNGIRAVEDPGIRDTMLQALRFVIQGAGSKVDAAIRKNLVSLLLSMLGHDEDNTRISTAGCLGEL 2453

  Fly  2413 LKYIASGHVYDLFNNIILTNNTD-DLIVKHGHTIVLFVALKECPTEVLVLDLPEKITSYVLINIL 2476
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Mouse  2454 CAFLTDEELNTVLQQCLLADVSGIDWMVRHGRSLALSVAVNVAPSRLCAGRYSNEVQDMILSNAV 2518

  Fly  2477 SEKVPIASNAVRAATYLLDYYL-VNQNEPPIKIVMALSRAMNHSSNDVKQLVAQSCTYLSKNLAA 2540
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Mouse  2519 ADRIPIAMSGIRGMGFLMKYHIETGSGQLPPRLSSLLIKCLQNPCSDIR-LVAEKMIWWANKEPR 2582

  Fly  2541 NQSSIDVLKYLVPMLVNGTKEKNGYVKSNSELALISILRLRSDDTSFLKISGLLESGARDSLNDV 2605
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Mouse  2583 PPLEPQTIKPILKALLDNTKDKNTVVRAYSDQAIVNLLKMRRGEELLQSLSKILDVASLEALNEC 2647

  Fly  2606 VLKVLKRTSSQSIIKEEELDDTL 2628
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Mouse  2648 SRRSLRKLACQA-DSVEQVDDTI 2669

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(3)80FjNP_001015316.1 HEAT repeat 1142..1162 CDD:293787 4/19 (21%)
HEAT repeat 1174..1204 CDD:293787 13/30 (43%)
HEAT repeat 1214..1244 CDD:293787 11/29 (38%)
HEAT repeat 1252..1283 CDD:293787 19/30 (63%)
HEAT repeat 1297..1323 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 1335..1364 CDD:293787 16/28 (57%)
HEAT 1339..1483 CDD:441023 106/143 (74%)
HEAT repeat 1375..1406 CDD:293787 21/30 (70%)
HEAT repeat 1419..1443 CDD:293787 18/23 (78%)
HEAT 1433..1642 CDD:441023 167/208 (80%)
HEAT repeat 1456..1484 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT repeat 1496..1526 CDD:293787 18/29 (62%)
HEAT repeat 1534..1560 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 1571..1600 CDD:293787 25/28 (89%)
HEAT 1590..1800 CDD:441023 167/209 (80%)
HEAT repeat 1616..1644 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT repeat 1653..1684 CDD:293787 25/30 (83%)
HEAT repeat 1692..1716 CDD:293787 17/23 (74%)
HEAT repeat 1733..1758 CDD:293787 19/24 (79%)
HEAT 1737..1910 CDD:441023 136/172 (79%)
HEAT repeat 1881..1909 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT 1900..2047 CDD:441023 105/146 (72%)
HEAT repeat 1922..1950 CDD:293787 21/27 (78%)
HEAT repeat 1963..1993 CDD:293787 26/29 (90%)
HEAT repeat 2001..2027 CDD:293787 13/25 (52%)
HEAT repeat 2033..2060 CDD:293787 18/26 (69%)
HEAT repeat 2222..2251 CDD:293787 17/28 (61%)
HEAT repeat 2260..2291 CDD:293787 26/30 (87%)
HEAT repeat 2304..2333 CDD:293787 20/28 (71%)
HEAT repeat 2342..2369 CDD:293787 14/26 (54%)
HEAT repeat 2383..2412 CDD:293787 15/28 (54%)
Gcn1NP_766307.2 HEAT 1. /evidence=ECO:0000255 140..178 12/37 (32%)
HEAT 2. /evidence=ECO:0000255 257..293 14/35 (40%)
HEAT 3. /evidence=ECO:0000255 294..331 9/36 (25%)
HEAT 4. /evidence=ECO:0000255 385..423 9/37 (24%)
HEAT 5. /evidence=ECO:0000255 425..459 9/33 (27%)
HEAT 6. /evidence=ECO:0000255 460..500 7/39 (18%)
HEAT 7. /evidence=ECO:0000255 560..597 9/36 (25%)
HEAT 8. /evidence=ECO:0000255 599..636 9/38 (24%)
HEAT 9. /evidence=ECO:0000255 700..732 4/31 (13%)
HEAT 10. /evidence=ECO:0000255 733..772 9/38 (24%)
HEAT 11. /evidence=ECO:0000255 879..918 11/40 (28%)
HEAT 12. /evidence=ECO:0000255 979..1016 9/36 (25%)
HEAT 13. /evidence=ECO:0000255 1035..1072 7/36 (19%)
HEAT 14. /evidence=ECO:0000255 1078..1115 9/37 (24%)
HEAT 15. /evidence=ECO:0000255 1155..1192 7/36 (19%)
HEAT 16. /evidence=ECO:0000255 1210..1250 16/39 (41%)
HEAT repeat 1215..1249 CDD:293787 13/33 (39%)
HEAT 17. /evidence=ECO:0000255 1251..1289 12/37 (32%)
HEAT repeat 1259..1290 CDD:293787 13/30 (43%)
HEAT 18. /evidence=ECO:0000255 1290..1332 25/41 (61%)
HEAT repeat 1294..1325 CDD:293787 19/30 (63%)
HEAT 19. /evidence=ECO:0000255 1335..1372 22/36 (61%)
HEAT repeat 1337..1364 CDD:293787 17/26 (65%)
HEAT 20. /evidence=ECO:0000255 1374..1410 21/35 (60%)
HEAT repeat 1378..1403 CDD:293787 13/24 (54%)
HEAT 1394..1566 CDD:441023 129/171 (75%)
HEAT 21. /evidence=ECO:0000255 1413..1451 25/37 (68%)
HEAT repeat 1418..1447 CDD:293787 20/28 (71%)
HEAT 22. /evidence=ECO:0000255 1455..1492 27/36 (75%)
HEAT repeat 1461..1485 CDD:293787 18/23 (78%)
HEAT 23. /evidence=ECO:0000255 1493..1530 30/36 (83%)
HEAT repeat 1498..1526 CDD:293787 22/27 (81%)
HEAT 24. /evidence=ECO:0000255 1534..1571 25/36 (69%)
HEAT repeat 1538..1568 CDD:293787 18/29 (62%)
HEAT 25. /evidence=ECO:0000255 1573..1609 25/35 (71%)
HEAT repeat 1577..1601 CDD:293787 16/23 (70%)
HSH155 1586..>2084 CDD:227508 385/499 (77%)
HEAT 26. /evidence=ECO:0000255 1611..1648 33/36 (92%)
HEAT repeat 1613..1642 CDD:293787 25/28 (89%)
HEAT_2 1616..1721 CDD:433376 92/104 (88%)
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