DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(3)80Fj and gcn-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015316.1 Gene:l(3)80Fj / 3355040 FlyBaseID:FBgn0287182 Length:2630 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001367648.1 Gene:gcn-1 / 190051 WormBaseID:WBGene00021697 Length:2634 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2776 Identity:873/2776 - (31%)
Similarity:1424/2776 - (51%) Gaps:316/2776 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 DEQLSAALRDLPGRVLNVPVEERQHLFQNVSSVL--KNSGINSTIIRGICKV-IGTTITKYKDPT 64
            ::.|...:|.....|.|..:......:..::.::  :::.|.:..::|:.|: |..:|..|..|.
 Worm    21 EDALKEEIRRFSSAVSNPSLRAHGMAYAALTKLIERRSTEIPAQFVKGLVKMSIANSIRLYGQPK 85

  Fly    65 SQRIVRDLIVDLVTIHHDLTIEHMLNVFKAFIYKEFASVSPQKSCKLAVIALGWISIIQKQAQRE 129
            |.:.|..|:..|.......|::.:|...               :..|.:|               
 Worm    86 SFQAVSKLLQVLAKRDPISTLKSLLQTI---------------TTALPII--------------- 120

  Fly   130 SNIFKTEKKKLIEYQTLLYQITVISPNQ------RVTDARTKILYDLWNNT-----EIFNETMDT 183
            .|:  ||...|.:..|:.:.:..:..|.      .:..|...|.|  |.:.     .:|.:.:..
 Worm   121 PNL--TESHSLSQVPTMKWLLACLDGNSCAENAVEIFGALGAIAY--WMSASDKAWRVFTKKLAQ 181

  Fly   184 LF-QMESTSNVTIFCMAMFQFKYKN-------------CNALKLNQYTEKLSEYFVKSMISCKHK 234
            || :....|||  |...:.:|..:|             ..|.|..:......|.|.||.:..|.:
 Worm   182 LFAKNPEISNV--FTAKIGEFSKENPEKSLALISAFGALGAAKTPEIAPIFVEIFTKSQLLPKLR 244

  Fly   235 PDKSFIIACSPLLKSLTDA-EFDSYIYPSLQRSILRSPENTLQSIGLIFNMLNFDCSRYAQKVGI 298
            |.:.|:...|.....|..: :|::.:.|::::::|||||..:..|..:...::|.....||.:..
 Worm   245 PPQFFVTRISKFAVFLQKSPDFETNLLPNMKKALLRSPEVAIFGIRGLLEHISFSLDFCAQDLLK 309

  Fly   299 VLIKNLYSKGDIARQESLESLKLLSTKCSNWIIVKELLERI---FSVLNGSDGKINVIEYRINIL 360
            ..|.:|.:.....|:..:..:..||.| |...:::::|..:   ||....|       |.:.:::
 Worm   310 STISSLCNTDPEIREAGIGIVVALSRK-SEISVIQKILNTLLDQFSAAKAS-------EIKCSLM 366

  Fly   361 QGAGNLSFNNIDQDHMPNILNEAVTLFSKALECETQEKVICCTLEMFGLWTQKFIHNLPDV-VIN 424
            :|.|.:: ..::...:..|..:.::..:|| :.|:.:..|.........|..:.  :.|.: :.|
 Worm   367 EGVGAIA-KVVEAQDIDKIAEDVISKTAKA-DKESHDGTIEAQWNAAAEWAIRL--SKPAISLTN 427

  Fly   425 IFTSGMRLKTTNQIIRQSYLEWLLLSIQNAEVNNHISIIQDLISFYTKALQNSSQSCYLSEAACI 489
            .|....:|....:.|....|..:|.......:...|.:         |.|....::....|...|
 Worm   428 AFKEASKLAPAVKYIGYRVLADILERRSMTSLPEGIDV---------KPLLTELETGPKGELCSI 483

  Fly   490 ACILLIL---EKPSENYNFFWTTVFDMKKLI----FYNEKFTTTAPIPTLCNISLMARILIN--S 545
            ...||||   :|.|..:...|:.....:.|:    ....|:........|..:.::.|.::|  :
 Worm   484 GLALLILRTTKKGSIEHTKAWSRASHAEALLKEKPLSQTKWQEAIAWAKLVELVILDRPVVNKTA 548

  Fly   546 YPEKIKGKLEPLARTLVSNLCCNSVKVRVYTAKQVKQIINSSSGIEFVKLALCEFGKRIN----- 605
            .|......::||:..|.    ..:.|||...:|.:.:|:::.:.:....||...|.:..|     
 Worm   549 PPSYSLPSIKPLSLLLF----WPNWKVRQQASKSLLRILSTENALFAEALADLIFSETTNGTIDQ 609

  Fly   606 LVNIETDGEPL-IDQFGTSNQVYVDALLTLTSIKHITYEDSVD-VAIDLLLISHHPAIVSNEPYL 668
            |:. ...|.|. :|.:....:.||..|..|.:.|    |..:| :||..||::....:|..:..:
 Worm   610 LLR-RVPGCPTPVDSWQVPGEWYVSTLRLLLTPK----EPELDKLAIHTLLLASVQRLVEVDGSV 669

  Fly   669 WETTIQKHLNLDA------------KNVILAKTNEIVNEYIDNYIA------SAQYENTISALIR 715
            |...:.:|.....            :||:..|...:.|..:...||      .|.....:.|.|:
 Worm   670 WLRWVHEHRESKTWQASEVFRETAIQNVLQCKDRGVRNTALVTLIALHDERLRADLWKHVDASIK 734

  Fly   716 ICPNLIVPTVVNNLKNYLSNFSNY-NVSNEEYLIFLTPDGELFDKSVIPHIDSQYETVRLKRENK 779
               .|.|              ::| .::.:|..|:...:|:|::..|:     .::.....:..|
 Worm   735 ---QLEV--------------TDYGRITEQEISIYKCAEGQLYNTRVL-----DFDEAAGIKGTK 777

  Fly   780 VYSYKEQLEEIQLRREIDDKREKEGKLKTIRYTQKQEEQIKNQMEKELHIKLRITLLYEKLISKI 844
            ..|.::|:.||||.||:..||:|||||     :.||::.::.::..|...:..:..||....:|:
 Worm   778 GTSIQDQMAEIQLIRELAAKRQKEGKL-----SAKQKQVMEKELAAEKDTRDALRELYVTAEAKL 837

  Fly   845 SLLKASCSGNGEQMAQHFYSLLDGILNASKSPLCAEVLTDLYIFLHNLCFTFQPK-LGRAIALAT 908
            ...:|..:.:..........|.:..:..::|.|.:|....|::...:.||..... |...:....
 Worm   838 DECRAMVAADAAGAFARPEILFEYCMPLTRSLLVSEEAARLFLAYRDACFEHSDDYLEELVGSNW 902

  Fly   909 IKL------------QSPSCVLKKEFEAFNVNQAIND---------IIIDLDNHVKSNYLDSPSF 952
            :::            :.....||:.|...|....:.|         :|.| |..|.:|:|     
 Worm   903 LRVIGAHHRIPGWNDEFLDSALKRMFSLLNERAFVIDSGDDDDDEPVIFD-DEIVGANHL----- 961

  Fly   953 SYAFEFLKRALLLLNTDSDFDLISK--GIQIL--ALHTSAGVCCKPQF--------MPRFGMFKM 1005
            :..:..::   ::|.....|...|:  .:|:|  |:|        .:|        :|......|
 Worm   962 TLLYPMIR---IILKNSQRFSDNSRQDALQLLQSAIH--------KKFLRDRDVLNLPMEHYASM 1015

  Fly  1006 LLDLLKNNNKLWAQTSA--AILQVAKCSNGDNCSSPDNHIISIFLQALQHCSD---AVRKVALQS 1065
            |.:....::   ..|:|  |..|:.:.:|..|  ...:.:|.:..:.|.:..:   :||..||:.
 Worm  1016 LFEHFSLDS---GATNAFKATQQLFRLANDTN--DIGDRVIGMVREILAYVGNEQPSVRGAALEI 1075

  Fly  1066 LKI--MVNGIVNHIKVDNSLEKVIINRFWVAKHDPEEENRELALFLWNTAKFPLPGYVD--IIND 1126
            |..  ::..||..:.::.|:.|.|:.|..||:|||.|...|:|..||......:...:.  ::::
 Worm  1076 LGAPHLLMRIVVELGIEQSISKEILVRIHVARHDPIEAVSEIAERLWIENHLQVKQVIGAMLVDE 1140

  Fly  1127 ITHSETCIQKSASESLIPLLAGDEVLKKCVIKKLFSIYKAKLSLLPPVLDQFDREIEPAIDQWKP 1191
            .......:::||:.:::..:.........::.|....||..:.:..|:.|...|....|||:...
 Worm  1141 CVSPSPLVRQSAAHAMVTFIEEHPNEMPAILTKFDETYKDLVLIREPIYDDVGRLQREAIDESDR 1205

  Fly  1192 RRGIAIAFSTIAFLLSIEDINDIMNFMVSQGLGDREDVVHKEMLATALKIVDLHGNKAIENLLPV 1256
            |.||......:|.|...|:...::..:...||.||......|:...|::.:..||...:..|||:
 Worm  1206 RSGIGQTLVLLAGLCRQEEAEQLIRIVAPDGLSDRAQECRNELRNAAVETIRRHGAACMLRLLPL 1270

  Fly  1257 FEDFLDKAPKSQSYDNIRQAVVILMGSLARHLEKDDKRIDPIVKRLITSLSTPSQQVQEAVSNCL 1321
            .|...|:.|...  ||.||.:|:|:|:||::::..:| :..||.||:.:|.||||.|||:||.||
 Worm  1271 LEKLSDETPAQD--DNRRQGLVVLLGTLAQYIDSTEK-VKGIVARLVEALGTPSQTVQESVSRCL 1332

  Fly  1322 PHLMPSVKDEAPSMIKKLLHSLAKSEKYGERRGAAYGIAGIVKGLGILSLKQLDIMSKLTAFIQD 1386
            ..|:|.::.:|..::.||..:|.::|.|||||||||||||::||:||::||..|::..:...::|
 Worm  1333 APLVPKIRQDAKDLVSKLQWTLFEAETYGERRGAAYGIAGLMKGMGIIALKDTDLLGSIHKNMED 1397

  Fly  1387 KKNYRSREGALFAFEVLCSTLGRLFEPYIVHVLPHLLQCFGDPSQYVRQAADDTAKVVMRKLSAH 1451
            ||:.:.|||.|.|.|:||.|:|:||||||:..||.||..|||....|||:|:|||:.:|..::.:
 Worm  1398 KKSPKHREGGLLALEILCCTIGKLFEPYILKALPSLLITFGDTDSNVRQSAEDTARAMMASMTVY 1462

  Fly  1452 GVKLVLPSLLEALDEDSWRTKTASVELLGAMAFCAPKQLSSCLPSIVPKLIQVLGDSHTKVQESG 1516
            |.|||||.|:.|:|:||||||.|:.||||:||||||:|||:|||:||||||::|.||.:|||:||
 Worm  1463 GTKLVLPVLIVAIDDDSWRTKCAATELLGSMAFCAPRQLSACLPNIVPKLIEILADSSSKVQKSG 1527

  Fly  1517 GEALKVIGSVIKNPEIQAIVPVLLDALEDPSNNTSTCLQSLLKTKFIHFIDAPSLALIMPVVQRA 1581
            .:||:.|..|::||||..:...|:..|.||:|.||..||::|.|||||:||||||||:||:|:||
 Worm  1528 EKALQQIARVVRNPEILGVTNQLMAGLLDPANKTSAALQAVLNTKFIHYIDAPSLALMMPIVRRA 1592

  Fly  1582 FMDRSTETRKMAAQIIGNMYSLTDQKDLAPYLPSIIPGLKSSLLDPVPEVRAVSARALGAMVKGM 1646
            |.||.:|||::|||||.|:||||:.||:.|||..::|||:.||||||||:||||||||||:|...
 Worm  1593 FEDRLSETRRVAAQIISNIYSLTENKDMEPYLAHMVPGLQRSLLDPVPEIRAVSARALGAVVSKS 1657

  Fly  1647 GESSFENL----LPWLMETLTSESSSVDRSGAAQGLSEVVGGLGVEKMHKLMPEIISTAERVDIA 1707
            |.|:.|||    :|||.|.|.|..|:||||||||||.||:.|.|.|::..:|||||...|..|::
 Worm  1658 GGSTSENLRAQVIPWLKEKLVSPQSTVDRSGAAQGLCEVLAGAGTEQLEYVMPEIIHATESTDVS 1722

  Fly  1708 AHVKDGYIMMFIYMPGAFQEEFTPYIGQIINPILKALADESEFVRDTALKAGQRIVNLYAETAVA 1772
            |..:||||:|:||:|..|.:.|.||:.|::.|||||||||:|:||.:|||||||:::.|...|..
 Worm  1723 AETRDGYILMYIYLPMTFGDRFVPYLPQVVPPILKALADENEYVRASALKAGQRLISQYCSHARK 1787

  Fly  1773 LLLPELEKGLFDDNWRIRYSSVQLLGDLLYRISGVSGKMTTETASEDDNFGTEHSHTAIIHFLGD 1837
            ||||:|:..|.|:||||||:||||:||.|:.|||::||.|:.||.|||..|.|.:...|:..||.
 Worm  1788 LLLPQLQLALMDENWRIRYASVQLIGDFLFNISGITGKSTSSTADEDDTMGMEQAGKVIVRALGQ 1852

  Fly  1838 ERRNRVLSGLYMGRSDVSLMVRQAALHVWKVVVTNTPRTLREILPTLFGLLLGCLASTSYDKRQV 1902
            :.|:|||:|||:.||||:|:|||||.||||:||:||||||||:...||.:::..||||..:::|:
 Worm  1853 KDRDRVLAGLYLTRSDVALVVRQAAGHVWKMVVSNTPRTLREVTKILFEMVVDSLASTCDERQQM 1917

  Fly  1903 AARTLGDLVRKLGERVLPEIIPILENGLNSDHPDQRQGVCIGLSEIMGSTSKEMVLTFIDSLVPT 1967
            .||.||:||||:|::|:.:|:|:|:....|:...:|.||.|.|.||:|:.|||:...::.::|..
 Worm  1918 GARCLGELVRKMGDKVINDILPVLDANQKSEEVAKRVGVAIALHEIIGNMSKEVTNHYLGAIVAP 1982

  Fly  1968 VRKALCDPLPEVREAAAKTFESLHSTVGSRALDEILPFMLQGLSDADPFVAENTLDGLRQVMSIK 2032
            ||:|:||....||||||.||..|:..||:.|||||:..:|:.|:...    ::.|.||..||...
 Worm  1983 VRRAICDESELVREAAADTFTVLYHVVGNEALDEIICPLLEQLTPEQ----DHILAGLCDVMRQN 2043

  Fly  2033 SKVVLPYLVPQLTSPPVNTKALSILVSVAGEALIKYLPKILSSLLEALSDAYGYPNEPQEN--EY 2095
            |:.:||||:|:||.||||..||..|.||:|::|.:.|||:|.:||.|..     .|:..:.  |.
 Worm  2044 SRSMLPYLLPKLTKPPVNVHALCSLASVSGDSLSRQLPKVLDALLAACE-----TNDESDPMIES 2103

  Fly  2096 CQTVILSVTDETGIRTIMDTLLISANSSDLCTRKSAASLLSAFCIHSPGNYYEYIPQLLRCLLKL 2160
            |:.|:::||||.||..::|.|:..|:..:   ...||.|||.|...|..:..|...::|..||.|
 Worm  2104 CEKVVIAVTDEDGIPVLVDYLIQKASQDE---NVPAAVLLSTFIAKSGVSLAEMAEEVLPGLLNL 2165

  Fly  2161 LVESDKDILQKSWEALNAVIKGMNAAQQICHVSDVRQAVRFAASELEGTELPGFCLPKGITPLLP 2225
            ....:..|:..:..|..|:.:.|:..:.:..:..|::|:....:..:|.::|||..||.:.||:.
 Worm  2166 YTSPNPQIVDHAIAAAVALTQSMDQRELLSVLPVVKKAINIIVAGAKGQQIPGFTHPKSLQPLVV 2230

  Fly  2226 VFREAILNGLPEEKENAAQGLGEVIFLTNAKSLQPSVVHITGPLIRILGDRFNAAVKAAVLETLS 2290
            :.||:||.|..|.|..||:.||.|:.:::..:|:..||:|||||||:|||||.|.||..::||||
 Worm  2231 MLRESILQGQIEMKALAAECLGMVVKVSDVAALKAHVVNITGPLIRVLGDRFPANVKLPIIETLS 2295

  Fly  2291 ILLHKVGVMLKQFLPQLQTTFLKALHD-QNRNVRMKAGKALSELVAIHSRAEPLFNEIHNGIKNS 2354
            .||.||..||:.||||||:||||||.: .:|.||:.||.||:.|:.:|.:.|....|:...:..|
 Worm  2296 KLLDKVDAMLRPFLPQLQSTFLKALQEPTSRPVRLAAGGALARLLKLHPKPEATMTELLKLLATS 2360

  Fly  2355 DDSSVRETMLHALRSIVSRSGDKMSEPIKKQIY-VTLLSMIGHHEDATR--SAVGGCLGAIL-KY 2415
            .|..:.|:.|...|::::..|.|||.....:|| ||.|....:.|:.|.  :::..|.||:| :.
 Worm  2361 TDQQLIESSLATARALIATCGQKMSPTTIDEIYRVTELIYSENVENPTELDASLTACSGALLGET 2425

  Fly  2416 IASGHVYDLFNNIIL------------------------TNNTDDLIVKHGHTIVLFVALKECPT 2456
            ||....:....|.:|                        ::|.|:|.....::     |.:...|
 Worm  2426 IAQKSDWKTAQNCVLSGIESPSTSARGRQAKACALQQLCSSNGDELWASEANS-----ACRSAFT 2485

  Fly  2457 EVLVLDLPEKITSYVLINILSEKVPIASNAVRAATYLLDYYLVNQNEPPIKIVMALSRAMNHSSN 2521
            ....  .|:.|              :||.|:|.|:::|...:...      ::.|::|::||:|.
 Worm  2486 SAFT--SPDPI--------------VASAALRGASHVLKVSIDRD------LMSAVARSLNHAST 2528

  Fly  2522 DVKQLVAQSCTYLSKNLAANQSSIDVLKYLVPMLVNGTKEKNGYVKSNSELALISILRLRSDDTS 2586
            ||::....:..::..:.....   |:||.:||.|:||.||.|..|::.|||||:..|::..::..
 Worm  2529 DVRKTAGIALGHVGHSADLPN---DILKLIVPQLINGCKESNSQVRAASELALVHALKMTQNEDR 2590

  Fly  2587 FLKISGLLESGARDSLNDVVLKVLKRTSSQSIIKEEELD----DTL 2628
            |......||...:.:|::.      |.|...:::..::|    ||:
 Worm  2591 FEAYRNTLEGVVQRNLDET------RVSLARVVRAGDVDLEPLDTI 2630

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(3)80FjNP_001015316.1 HEAT repeat 1142..1162 CDD:293787 1/19 (5%)
HEAT repeat 1174..1204 CDD:293787 8/29 (28%)
HEAT repeat 1214..1244 CDD:293787 6/29 (21%)
HEAT repeat 1252..1283 CDD:293787 12/30 (40%)
HEAT repeat 1297..1323 CDD:293787 16/25 (64%)
HEAT repeat 1335..1364 CDD:293787 17/28 (61%)
HEAT 1339..1483 CDD:441023 77/143 (54%)
HEAT repeat 1375..1406 CDD:293787 12/30 (40%)
HEAT repeat 1419..1443 CDD:293787 14/23 (61%)
HEAT 1433..1642 CDD:441023 131/208 (63%)
HEAT repeat 1456..1484 CDD:293787 18/27 (67%)
HEAT repeat 1496..1526 CDD:293787 17/29 (59%)
HEAT repeat 1534..1560 CDD:293787 10/25 (40%)
HEAT repeat 1571..1600 CDD:293787 19/28 (68%)
HEAT 1590..1800 CDD:441023 125/213 (59%)
HEAT repeat 1616..1644 CDD:293787 21/27 (78%)
HEAT repeat 1653..1684 CDD:293787 21/34 (62%)
HEAT repeat 1692..1716 CDD:293787 11/23 (48%)
HEAT repeat 1733..1758 CDD:293787 15/24 (63%)
HEAT 1737..1910 CDD:441023 99/172 (58%)
HEAT repeat 1881..1909 CDD:293787 10/27 (37%)
HEAT 1900..2047 CDD:441023 63/146 (43%)
HEAT repeat 1922..1950 CDD:293787 11/27 (41%)
HEAT repeat 1963..1993 CDD:293787 15/29 (52%)
HEAT repeat 2001..2027 CDD:293787 7/25 (28%)
HEAT repeat 2033..2060 CDD:293787 15/26 (58%)
HEAT repeat 2222..2251 CDD:293787 14/28 (50%)
HEAT repeat 2260..2291 CDD:293787 20/30 (67%)
HEAT repeat 2304..2333 CDD:293787 18/29 (62%)
HEAT repeat 2342..2369 CDD:293787 5/26 (19%)
HEAT repeat 2383..2412 CDD:293787 9/31 (29%)
gcn-1NP_001367648.1 HEAT repeat 1016..1038 CDD:293787 5/24 (21%)
HEAT repeat 1050..1088 CDD:293787 9/37 (24%)
HEAT repeat 1098..1120 CDD:293787 10/21 (48%)
HEAT repeat 1129..1158 CDD:293787 2/28 (7%)
HEAT repeat 1167..1195 CDD:293787 5/27 (19%)
HEAT repeat 1310..1334 CDD:293787 15/23 (65%)
HEAT repeat 1346..1375 CDD:293787 17/28 (61%)
HEAT repeat 1386..1417 CDD:293787 12/30 (40%)
HEAT repeat 1430..1456 CDD:293787 14/25 (56%)
HEAT repeat 1467..1495 CDD:293787 18/27 (67%)
HEAT_EZ 1480..1534 CDD:463906 37/53 (70%)
HEAT repeat 1507..1543 CDD:293787 20/35 (57%)
HEAT repeat 1584..1613 CDD:293787 18/28 (64%)
HEAT repeat 1624..1653 CDD:293787 21/28 (75%)
HEAT repeat 1668..1699 CDD:293787 19/30 (63%)
HEAT repeat 1707..1733 CDD:293787 12/25 (48%)
HEAT repeat 1748..1773 CDD:293787 15/24 (63%)
HEAT repeat 1791..1815 CDD:293787 15/23 (65%)
HSH155 <1934..>2054 CDD:227508 49/123 (40%)
HEAT repeat 1937..1965 CDD:293787 11/27 (41%)
HEAT repeat 1978..2008 CDD:293787 15/29 (52%)
HEAT repeat 2044..2071 CDD:293787 15/26 (58%)

Return to query results.
Submit another query.