Protein Alignment Set1 and ash1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001015221.1
• Gene: Set1 / 3354971
• FlyBaseID: FBgn0040022
• Length: 1641
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_524160.2
• Gene: ash1 / 40133
• FlyBaseID: FBgn0005386
• Length: 2226
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1542
• Identity: 295/1542 - (19%)
• Similarity: 522/1542 - (33%)
• Gaps: 418/1542 - (27%)

  Fly   309 DSRDILIMTRERSRDSDSRPRDYCRSRERESFRDR----------KRSHEKGRDQPREKREHYYN 363
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  Fly   196 DTEDTTVEGSFRKAAKDKNLPQY-QSTLLQDFMEKTQMLGQTVNAKLAEEK---VAKAKEETLVQ 256

  Fly   364 SSKDREYRGRDRDRSAEIDQRDRGSLKYCSRYSLHEYIETDVRRSSNTISS-----------YYS 417
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  Fly   257 TAVPRKRRGRPKKVVPTVPAPGN------SGPAINESADSGVISTTSTTQSTTPSPKMQNENAVP 315

  Fly   418 ASSLPIASHGFNSCSFPSIENIKTWSDRRAWTAFQPDFHPVQPPPPPPEEIDNWDEEEHDKNSIV 482
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  Fly   316 TGSLPIA-----SSSKPKID--MAYLDKRMYAT-----ERVLYPPPRSK------RRQNNKKTAC 362

  Fly   483 PTHYGCMAKLQP---PVPSNVNFATKLQSVTQPNSDPGTVDLDTRIALIFKG--KTFGNAPPFLQ 542
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  Fly   363 SSSNKEELQLDPLWREIDVNKKFRLRSMSVGAASGTGASTTICSKVLAAKSGYVSDYGSV---RH 424

  Fly   543 MDSSDSETDQGKPEVFSDVNSDSN-NSENKKRSCEKNNKVLHQPNEASDI-SSDEELIGKKDKSK 605
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  Fly   425 QRSSHNHN--------SGYKSDASCKSRYSTKSCMSRRSRAKSCGYRSDCKESGKSGLRMRRKRR 481

  Fly   606 LSLICEKEVND-----DNMSLSSLSSQEDPIQTKEGAEYKSIMSSYMYSHSNQNPFYYHASGYGH 665
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  Fly   482 ASMLLKSSADDTVEDQDILQLAGLSLGQ---SSEESNEYISKPS--------------------- 522

  Fly   666 YLSGIPSESASRLFSN-GAYVHS-EYL---KAVASFNFDSF-SKPYDYNKGALSDQNDGIRQKVK 724
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  Fly   523 -LKSLPTTSASKKYGEINRYVTTGQYFGRGGSLSATNPDNFISKMMNQRKETPAPSKSSCKIKSR 586

  Fly   725 Q-----VIGYIVEELKQILKRDVNKRMIEITAFKHFETWWDEHTSKARSKPLFEKADSTVNTPLN 784
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  Fly   587 RSSAASMCSSYVSGVSRMRRRHRRK------SFSH-------------NKSL--NIDSKLLTEIE 630

  Fly   785 CIKDTSYNEKNPDINLLINAHREVADFQSYSSIGLRAAMPKLPSFRRIRKHPSPI---------- 839
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  Fly   631 IITST------------FNSRCRIQDDRLTGSSGKEKLLADANKLQATLAAPSPAQQLTLNGGGP 683

  Fly   840 ------PTKRNFLERDLSD---QEEMVQRSDSDKED-SNVEISDTARSKIKGPVPIQESDS---- 890
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  Fly   684 ASTLSKPLKRGLKKRKLSEPLVDFAMLSASASGTPNGSGSSNGNTKRRHKKS----QSNDSSSPD 744

  Fly   891 -------KSH---TSG-------------LNSKRKGSASSFFSSSSSSTSSEAEYEAIDCVEKAR 932
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  Fly   745 DHKLPLKKRHYLLTPGERPPAEVAFANGKLNAEAWAAAAA-AAKSTASTKSQAQFNA-RSVKSAL 807

  Fly   933 T-------SEEDSPRGYGQRNLNQRTTTIRNRNLV--GTMDVINVRNLCSGSNEFKKENVTKRTK 988
            |       .:..|..|.|....|.....:.:.|.:  |.:..|:..:|||    .|::......|
  Fly   808 TPKKRHLLEQPTSVSGAGSSASNSPLRIVVDNNSISGGKLLDISPSSLCS----LKQQRRGGAAK 868

  Fly   989 KNIYSDTDEDNDRT---------LFPALKEKNISTILSDLEE-----------------ISKDSC 1027
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  Fly   869 QKVSAAKDLVQLQSPAGSYPPPGVFEPSVELEIQIPLSKLNESVITKAEVESPLLSALDIKEDTK 933

  Fly  1028 IGLDENGIEPTILRKIPNTPKLNEECRRSLTPVPPPGYNEEEIKKKVDCKQKPSFEYDRIYSDSE 1092
            ..:.:..:| |:|.|......|..:                  :||::....|:.
  Fly   934 KEVGQRVVE-TLLHKTGGNLLLKRK------------------RKKINRTGFPTV---------- 969

  Fly  1093 EEKEYQERRKRNTEYMAQMEREFLEEQEKRIEKSLDKNLQSPNNIVKNNN-----SPRNKNDETR 1152
                   |||:....:.|.....::|.|...:.. |:.|||......:||     :|....|..|
  Fly   970 -------RRKKRKVSVEQQTTAVIDEHEPEFDPD-DEPLQSLRETRSSNNVNVQAAPNPPLDCER 1026

  Fly  1153 KTAISQTRSCFESASKVDTTLVNIISVENDINEFGPHEEGDVLTNGCNKMYTNSKGKTK------ 1211
            .....:.|..|.:.:......::::::|.                 ..:..|.::|:.:
  Fly  1027 VPQAGEARETFVARTNQKAPRLSVVALER-----------------LQRPQTPARGRPRGRKPKN 1074

  Fly  1212 ------RTQSPVYSE----GGSSQASQASQVALEHCYSLPP---------HSVSLGDYPSGKVNE 1257
                  ..|.|..||    ....:..|..|..||.....||         .::.|.|......|.
  Fly  1075 REQAEAAPQPPPKSEPEIRPAKKRGRQPKQPVLEEPPPTPPPQQKKNKMEPNIRLPDGIDPNTNF 1139

  Fly  1258 TKNILKREAENIAIVSQMTRTGPGRP---RKDP--ICIQKKKRDL---APRMSNVKSKMTPNGDE 1314
            :..|..:..:|:...:|..:..|.:|   .:.|  |.:.:::.|.   |.|:.::.::..|
  Fly  1140 SCKIRLKRRKNLEAGTQPKKEKPVQPVTVEEIPPEIPVSQEEIDAEAEAKRLDSIPTEHDP---- 1200

  Fly  1315 WPDLAHKNVHFVPCDMYKTRDQNEEMVILYTFLTKGIDAEDINFIKMSYLDHLHKEPYAMFLNNT 1379
               |.....|......|.:..::.|.....|.|.|      ::.:|.:||      ...:|.|
  Fly  1201 ---LPASESHNPGPQDYASCSESSEDKASTTSLRK------LSKVKKTYL------VAGLFSN-- 1248

  Fly  1380 HWVDHCTTDRAFWPPPSKKRRKDDELIRHKTGCA--------------RTEGFYKL--DV----- 1423
            |:      .::..|||:|..:|..  :..:.|.|              |||..::|  |:
  Fly  1249 HY------KQSLMPPPAKVNKKPG--LEEQVGPASLLPPPPYCEKYLRRTEMDFELPYDIWWAYT 1305

  Fly  1424 -----REKAKHKYHYAKANTEDSFNEDRSDEPTALTNHHHNKLISKMQGISREARSN--QRRLLT 1481
                 .......::|.|..|.......|.:    |....|.....|.|| .:....|  .|.:.|
  Fly  1306 NSKLPTRNVVPSWNYRKIRTNVYAESVRPN----LAGFDHPTCNCKNQG-EKSCLDNCLNRMVYT 1365

  Fly  1482 AFG----SMGESELLKFNQLKFRKKQL-----KFAKSAIHDWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQMI- 1536
            ...    ..||    |....|.::..:     :| .:|...||:....|||....::||||:::
  Fly  1366 ECSPSNCPAGE----KCRNQKIQRHAVAPGVERF-MTADKGWGVRTKLPIAKGTYILEYVGEVVT 1425

  Fly  1537 ------RPVVADLRETKYEAIGIGSSYLFRIDMETIIDATKCGNLARFINHSCNPNCYAKVITIE 1595
                  |.....|.:|.:        |...:|...:||..:.|:..||:||||.|||..:..::.
  Fly  1426 EKEFKQRMASIYLNDTHH--------YCLHLDGGLVIDGQRMGSDCRFVNHSCEPNCEMQKWSVN 1482

  Fly  1596 SEKKIVIYSKQPIGINEEITYDYKFPL--EDEKIPCLCGAQGCRGTL 1640
            ...::|:::|:.|...||:||||.|.|  ..|..||.|....|||.:
  Fly  1483 GLSRMVLFAKRAIEEGEELTYDYNFSLFNPSEGQPCRCNTPQCRGVI 1529

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Set1	NP_001015221.1	RRM_Set1	99..191	CDD:409745
		U2AF_lg	255..>386	CDD:273727	16/86 (19%)
		N-SET	1352..1496	CDD:463344	33/175 (19%)
		SET_SETD1	1490..1637	CDD:380946	45/160 (28%)
ash1	NP_524160.2	PHA03247	<1018..1281	CDD:223021	52/308 (17%)
		AWS	1340..1388	CDD:197795	11/52 (21%)
		SET_ASH1L	1391..1531	CDD:380951	46/148 (31%)
		Bromo_ASH1	1680..1787	CDD:99955
		PHD_ASH1L	1858..1900	CDD:277023
		BAH_polybromo	1929..2073	CDD:240068