DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Gfat1 and gfat-2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015157.2 Gene:Gfat1 / 3354921 FlyBaseID:FBgn0287209 Length:694 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_502156.1 Gene:gfat-2 / 178067 WormBaseID:WBGene00009035 Length:710 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:715 Identity:434/715 - (60%)
Similarity:541/715 - (75%) Gaps:26/715 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MCGIFAYLNYLTPKSRQEVLDLLVTGLKRLEYRGYDSTGVAID-SPDNKN----IVMVKRTGKVK 60
            |||||||||:|.||.|.|::|:||.||:|:|||||||.|:||| |.|.:|    |.::::.|||.
 Worm     1 MCGIFAYLNFLAPKKRSEIVDILVQGLQRMEYRGYDSAGIAIDGSNDIENPHSKIALLRKRGKVS 65

  Fly    61 VLEEAIQEHFSGREYSEPVLTHVGIAHTRWATHGVPCEKNSHPHRSDDENGFVVVHNGIITNYND 125
            ||.:.|:|:............|.|||||||||||.|.:.|||||||:|.|.|:||||||||||.:
 Worm    66 VLNDYIKENNEKLNMDMEYNIHCGIAHTRWATHGSPRDVNSHPHRSNDNNEFLVVHNGIITNYRE 130

  Fly   126 VKTFLSKRGYEFESDTDTEVFAKLVHHLWKTHPTYSFRELVEQAILQVEGAFAIAVKSKYFPGEC 190
            :|.:|.|:|::|||:|||||.|||..|:...:|.:|||:|||..|.|:|||||:|.||..|||:.
 Worm   131 IKEYLEKKGHKFESETDTEVIAKLTQHVHDRYPDFSFRQLVETVIQQLEGAFALAFKSSRFPGQL 195

  Fly   191 VASRRSSPLLVGIKTKTRLATDHIPILYGK------DDKKLCTDQDADSGKPQDI--------RP 241
            |||||.||||||||:.:.|.|.|.|:.|.|      ::.....::.:....|.:|        .|
 Worm   196 VASRRGSPLLVGIKSNSTLHTSHFPVSYSKGRCFMSNNATHLREETSFVETPNNILDLSIAVRNP 260

  Fly   242 HGQSRELPVLPRSESTSEFMPLEEKEVEYFFASDASAVIEHTNRVIYLEDDDVAAVRDGTLSIHR 306
            .|.::    ||.:.||:......:.|||||.||||:|:||||.:|::|||||||.|.||:|:|||
 Worm   261 SGSAK----LPDNNSTTRPFDSTDFEVEYFIASDAAAIIEHTKQVLFLEDDDVAFVEDGSLTIHR 321

  Fly   307 LKKSLDD-PHAREITTLKMEIQQIMKGNYDYFMQKEIFEQPDSVVNTMRGRVRFDGNAIVLGGIK 370
            :.:..|. ...||:..|::|||:||||:|..||||||||||:||||||||||...|. :||||:|
 Worm   322 ISRHADSGEQKREVQLLELEIQEIMKGSYKTFMQKEIFEQPESVVNTMRGRVLPSGQ-VVLGGLK 385

  Fly   371 DYIPEIKRCRRLMLIGCGTSYHSAVATRQLLEELTELPVMVELASDFLDRNTPIFRDDVCFFISQ 435
            :|:|.|||||||:::.||||||||:|.||:||||:||||:||||||||||.|||||:|||.||||
 Worm   386 EYLPAIKRCRRLIMVACGTSYHSAIACRQVLEELSELPVVVELASDFLDRETPIFRNDVCLFISQ 450

  Fly   436 SGETADTLMALRYCKQRGALIVGITNTVGSSICRESHCGVHINAGPEIGVASTKAYTSQFISLVM 500
            |||||||||||||||.||||.:|:||||||||.||||||:|||||||||||||||||||.:||::
 Worm   451 SGETADTLMALRYCKPRGALTIGVTNTVGSSIGRESHCGIHINAGPEIGVASTKAYTSQIVSLLL 515

  Fly   501 FALVMSEDRLSLQQRRLEILQALSKLADQIRDVLQLDSKVKELAKDLYQHKSLLIMGRGYNFATC 565
            |||.:||||:|..:||.||:.||:.|...|||||.||.:|.::|:.:|:.|||||||||.|||||
 Worm   516 FALTISEDRISKMKRRAEIIDALNNLPILIRDVLDLDDQVLKIAEQIYKDKSLLIMGRGLNFATC 580

  Fly   566 LEGALKVKELTYMHSEGIMAGELKHGPLALVDDSMPVLMIVLRDPVYVKCMNALQQVTSRKGCPI 630
            ||||||:|||:|||.||||:|||||||||:||:.:.:.|:|..|.||.|.:||||||.:|||.||
 Worm   581 LEGALKIKELSYMHCEGIMSGELKHGPLAMVDEFLSICMVVCNDHVYKKSLNALQQVVARKGAPI 645

  Fly   631 IICEEGDEETKAFSSRH-LEIPRTVDCLQGILTVIPMQLLSYHIAVLRGCDVDCPRNLAKSVTVE 694
            ||.:....|:.....:| |.:||||||:|.||||||:||||||||.|.|.:||.|||||||||||
 Worm   646 IIADSSVPESDLAGMKHVLRVPRTVDCVQNILTVIPLQLLSYHIAELNGANVDRPRNLAKSVTVE 710

  Fly   695  694
             Worm   711  710

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Gfat1NP_001015157.2 PLN02981 1..694 CDD:215531 432/713 (61%)
gfat-2NP_502156.1 PLN02981 1..710 CDD:215531 432/713 (61%)

Return to query results.
Submit another query.