Protein Alignment form3 and fhdc1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001097527.1
• Gene: form3 / 3346238
• FlyBaseID: FBgn0053556
• Length: 1717
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002933539.2
• Gene: fhdc1 / 734113
• XenbaseID: XB-GENE-983433
• Length: 1117
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1275
• Identity: 347/1275 - (27%)
• Similarity: 570/1275 - (44%)
• Gaps: 271/1275 - (21%)

  Fly   345 PPPPPPMAPAAPPPPPPPINGAAPPPPPPPMINGGALPPPPPPPSMQMASRPRTPDPLAAEAVAT 409
            ||||||.    |||||||     |||||.|..|   :|||||.|...      .|.|
 Frog    30 PPPPPPQ----PPPPPPP-----PPPPPLPFQN---VPPPPPLPGAP------PPPP-------- 68

  Fly   410 AILLPQQ-----DTPAPKAKMKTINWGKIPHNKVLGKQNIWSIVASNHQDSPMQDIDWNEMEGLF 469
               ||.|     ...:.:.:|::..|..||..:|.||.|||::.|...|    ..||...:|.||
 Frog    69 ---LPHQVGNGHGNNSKRNRMRSFFWKTIPEEQVRGKNNIWTMAAKQQQ----YQIDTKTIEELF 126

  Fly   470 CLQTASAQGSPKLGRDGSQAAAGSNGCDTLDRKSKKESTEITLLDGKRSLNVNIFLKQFRTSNDD 534
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 Frog   127 --------GQKEEPRSGLIKAKGN-----LKSSFREAKEEVSLLDSKRSMNIGIFLKQFKKSTEE 178

  Fly   535 IIQLIRQGAHEEIGAERLRGLLKIMPEVDELDMLKGFNGDKARLGNAEKFLLQLLEVPNYKLRIE 599
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 Frog   179 IIGDIREGRCDLYGPEPLQELLKLSPESEEIKKLKAFSGEVAKLSLADTFMYLLIQVPNYSLRIE 243

  Fly   600 SMLLKEEFAANVAYLEPCINSMLYAGDDLLNNKTLQEVLYMVVVAGNFLNSGGYAGNAAGVKLSS 664
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 Frog   244 AMVLRKEFGSCHSALKNDMTVIRVATKELMSCEQLHSILFLVLQAGNIMNAGGYAGNAVGFKLSS 308

  Fly   665 LQKLTDIRANKPGMNLIHFVALQAEKRNPELLQFTGQLSNLESASKTTSEQINNEINTLDGRIRR 729
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 Frog   309 LLRLADTKANKPGMNLLHFVALEAQKKDVSLLTFSEKLPSVGEAARLSIDNMEAEFKSLSTKTKS 373

  Fly   730 IARQIEQPATDVDIKEQMADFLQAAESELSVLQAGMKQVESMRLKMS-------EFFCDDAATFR 787
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 Frog   374 IKDQIKK---EPELYKQMEDFLKDAVKDL-------KDLESLRAEIKKECHTLIDFFCEDKETMK 428

  Fly   788 LEECFKIFHNFCDKFKQAVKENERRQQQEQQATLRRKQREEQLARRAR-----QIGQAGTPVSDS 847
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 Frog   429 LDECFQIFRDFCDKFNKAVKENREREIQD----LRKQKKLNELEQKRRSWVASENANFGRSSSEN 489

  Fly   848 EHSFLGDA----IFDPRASPALSRRHLGSGEISNGFIRLEQDGASPDITPNGSLRRRR-SRVLAE 907
            :...|..|    ....|...:|:|                          |.|.||.| |..:|.
 Frog   490 DVEILTKAGLEDFLQQRPQSSLNR--------------------------NSSTRRSRLSLGVAA 528

  Fly   908 EDDLMEFLRSSTGPHHDGHNSRERKAAYGSLDRSWARRARSGSSSRKRPDLLNIDFGMDRERASS 972
            :.:|..:|.:|        ...|..:.:.||.||        .:.:.||.:..||..::::.:.:
 Frog   529 DRELQMYLGAS--------QVEETTSKFNSLPRS--------HTHKPRPTVAWIDSKVEKDHSLN 577

  Fly   973 PAPLLQQQQQNVQERLQSPLASTAGTPTTAANTPTGSGSAIAQTPSNNEDAKPRISREWRQKIET 1037
            ... |:.:.::.|:::.|.|..|:.....:.:|...|    .|......|         |...:.
 Frog   578 ILH-LKNETRDTQQQISSSLVITSLEDDQSIHTANNS----VQQQQEKAD---------RNNNKA 628

  Fly  1038 WLQSNESDEKQN----------EEYRRKRRL--------VNANRRSLENETENERKLDPLPEEKI 1084
            .|.....|.||:          ||:...::|        |..|...|.| ||.|      ..:.:
 Frog   629 ELHKYGIDLKQHSSVSPLAVTVEEHELVKKLQQFDLSGTVCENYEQLYN-TEEE------TNDGL 686

  Fly  1085 LPSTTTATPTNTPTTTNPTNSTNRMDQESGKYQRVYADWKPSRTLEQTDVVANLQAIADAQPHDA 1149
            ...:.::|..|   |..|:.:.|...:.|......|.|.|.|.     |::.....|::......
 Frog   687 SLCSFSSTDDN---TIPPSKNNNENSKASDSISNSYGDRKLSE-----DLLNVSTTISERTGTAE 743

  Fly  1150 LRQHRRQRSQEQPSPIALQSIAEEDRRKSLIQKQGERDKSNERLQI-YIRRSSSRELQPAKTEEH 1213
            :.:|..|           ..:|:......::...|..|..:|..:| .|::.:|.:   .|.:.:
 Frog   744 ITEHTPQ-----------FCVADTTENSLMLDATGGTDLLSETEEIEIIQKVNSND---GKKKLN 794

  Fly  1214 PLP--PKSPKPQVSDDTF--ASLLSHHKTQNEMQGSSKDVDADNI-ETPPVSRRVIATPTTTVVT 1273
            |:.  |.|.||:.:|...  |||......:|:          ||: :|..:..|..:|..:::..
 Frog   795 PVAKIPISGKPESTDHNAKKASLTKETTLKNK----------DNLRKTSSIKERFPSTIKSSINN 849

  Fly  1274 VSMTDKPKAATEEKINPAEQDAPGHFDRHALARRTRRYKRPTDYSSGNEEALTTSTAEAKTSPSK 1338
            .|.|...|..  ..:|.:|         |...|:.....:.....|.....|.:|..::.:|.||
 Frog   850 SSNTVSTKPV--RMLNDSE---------HENMRKVVPISKSNRSGSIKRTELRSSLRDSNSSDSK 903

  Fly  1339 ---------PEPPAPEKSKQKERTINKLEKVGRHISSIN--QEDVREAIRNLKSPTGTPERPWSP 1392
                     .....|:.|.:.|..  ||::....|||.:  |.|..:...::|.|...|.|..:.
 Frog   904 QTLRHSFRGKSENLPKNSSKTEEP--KLQRGDSFISSGSRFQRDQLQRNNSVKKPAAKPVRNIAK 966

  Fly  1393 PR----DITPSKLKLSASGHHELNDEGFEETQSLVSDTPSHGKGESTNSSCNEGVNETPARQRPM 1453
            |:    .:..:..|||:|      .|..:...:|...:||     |::|:.:...|...:.:|..
 Frog   967 PKPEETKLCRTTAKLSSS------TEASKVPPALPMKSPS-----SSSSTPSFARNTVASSKRAK 1020

  Fly  1454 QKQKPTT--TSISQMGSRLADRLQQARMKSSGSSGSAASKSQNQIPATQTATVKRSLSASRPLRM 1516
            ....|.|  |::::.||     |:|::.||.      .||:.|........|.||:.|    ||
 Frog  1021 TDPAPPTKVTTMARSGS-----LRQSKTKSD------LSKNGNTKDDGTVNTPKRANS----LR- 1069

  Fly  1517 PNG---QPLASAAPLRSASTVRRSPQEQQVLAGVERSSSR 1553
            .||   :|:..:.|        .|.|:::.:  ||:||.:
 Frog  1070 ANGRLFEPVRDSLP--------ESDQKEKSI--VEKSSMK 1099

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
form3	NP_001097527.1	Drf_FH3	48..309	CDD:461885
		FH2	415..803	CDD:396655	150/399 (38%)
		PTZ00449	<1145..1465	CDD:185628	68/342 (20%)
fhdc1	XP_002933539.2	FH2	82..444	CDD:396655	149/388 (38%)
		ActA	914..>1097	CDD:282861	53/221 (24%)