DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Drp1 and drp-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_608694.2 Gene:Drp1 / 33445 FlyBaseID:FBgn0026479 Length:735 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_741403.2 Gene:drp-1 / 177336 WormBaseID:WBGene00001093 Length:712 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:745 Identity:446/745 - (59%)
Similarity:555/745 - (74%) Gaps:43/745 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEALIPVINKLQDVFNTVG--SDSIQLPQIVVLGSQSSGKSSVIESVVGRSFLPRGTGIVTRRPL 63
            ||.||||:|||||||.|:|  .|.||||||||:||||:|||||:|::|||.||||||||||||||
 Worm     1 MENLIPVVNKLQDVFATLGRKEDQIQLPQIVVVGSQSAGKSSVLENLVGRDFLPRGTGIVTRRPL 65

  Fly    64 VLQLIYSPLDDRENRSAENGTSNAEEWGRFLHT-KKCFTDFDEIRKEIENETERAAGSNKGICPE 127
            :|||.:..|||...|...|||...::|..|.|| .|.|||||.:|||||:||:|..|.||||...
 Worm    66 ILQLNHVALDDESKRRRSNGTLLTDDWAMFEHTGSKVFTDFDAVRKEIEDETDRVTGVNKGISLL 130

  Fly   128 PINLKIFSTHVVNLTLVDLPGITKVPVGDQPEDIEAQIKELVLKYIENPNSIILAVTAANTDMAT 192
            ||:|||:|..||:|:|||||||||:||||||.:||.||:|::|.||.||:|||||||.||.|.||
 Worm   131 PISLKIYSHRVVSLSLVDLPGITKIPVGDQPVNIEEQIREMILLYISNPSSIILAVTPANQDFAT 195

  Fly   193 SEALKLAKDVDPDGRRTLAVVTKLDLMDAGTDAIDILCGRVIPVKLGIIGVMNRSQKDIMDQKHI 257
            ||.:|||::||..|:|||||:|||||||.||||:|:|.|:|||||||||||:||||::|:|.|.|
 Worm   196 SEPIKLAREVDAGGQRTLAVLTKLDLMDQGTDAMDVLMGKVIPVKLGIIGVVNRSQQNILDNKLI 260

  Fly   258 DDQMKDEAAFLQRKYPTLATRNGTPYLAKTLNRLLMHHIRDCLPDLKTRVNIMATQFQSLLNSYG 322
            .|.:|||.:|:|:||||||:|||||||||.||.|||||||:|||.||.||:||..|.||.|.::|
 Worm   261 VDAVKDEQSFMQKKYPTLASRNGTPYLAKRLNMLLMHHIRNCLPALKARVSIMNAQCQSDLVAFG 325

  Fly   323 EDVSDKSQTLLQIITKFSSAYCCTIEGTARNIETTELCGGARMGYIFHETFGRTLDSIHPLAGLS 387
            |.|.||::|||||||:|::||..|||||||||||||||||||:.||||:||||:|:|::||..|:
 Worm   326 EPVEDKNRTLLQIITRFATAYTSTIEGTARNIETTELCGGARICYIFHDTFGRSLESVNPLENLT 390

  Fly   388 KMDILTAIRNATGPRPALFVPEVSFELLVKRQIRRLEEPSLRCVELIHEEMQRIVQHCGNEVQQE 452
            ::|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:||||||:|||||...|||
 Worm   391 QLDILTAIRNATGPRPALFVPEVSFELLVKRQIQRLEEPSLRCVELVHEEMQRMVQHCGFTTQQE 455

  Fly   453 MLRFPKLHEKIVDVVTQLLRRRLPHTNVMVENIVAIELAYINTKHPDFHKDAALVPSLLKTDSDP 517
            |:|||:|::||.:||:.:|:.||..||.:|||:|||||||||||||:| .:|.|| :|||     
 Worm   456 MIRFPRLYDKINEVVSGVLKERLKPTNELVENLVAIELAYINTKHPEF-TEANLV-TLLK----- 513

  Fly   518 YSQINLGQRRANTPRNHMSPQISSHSAGSQQPQQQQPPQP-------NSSQQQYSQVHEQNHVAE 575
             .::.|..|...:...|.|   :...|.|...:||..|.|       |:..||..| ..||..|.
 Worm   514 -EELLLDDRHGRSRNRHAS---TGERAVSAHGEQQLQPVPGVNGVDLNAVLQQQQQ-QSQNQRAS 573

  Fly   576 NSTPSMASTWLSNILPPAPTRPDSIENSTNNTPVHNNIVSPVKPVNLLPDVPANHNPRRLTDKEQ 640
            |....:    ..|....:.|.|...:::                 |.||:||.....|:||.:||
 Worm   574 NGFLGL----FGNAAASSKTSPQEKQSA-----------------NFLPEVPETQLGRKLTSREQ 617

  Fly   641 KDCDVIEHLIKSYFYIVRKSIQDSVPKAIMHFLVNYVKDNLQSELVTHLYKSDKAETLLNESDHI 705
            :|..:||.||::||.||||:||||||||||..|||:|:||||||||..|||.|:.:.||.|::.:
 Worm   618 RDVAIIERLIRNYFIIVRKNIQDSVPKAIMALLVNFVRDNLQSELVRQLYKPDEMDDLLAETEDM 682

  Fly   706 AVRRKEAADMLKALTRANHIISEIRETHMW 735
            |.||::..:.:|||.:|:.||||:|||.:|
 Worm   683 AQRRRDTLETMKALQQASVIISEVRETQVW 712

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Drp1NP_608694.2 DLP_1 23..301 CDD:206738 191/278 (69%)
Dynamin_M 224..507 CDD:460033 203/282 (72%)
GED 639..729 CDD:460495 52/89 (58%)
drp-1NP_741403.2 DLP_1 25..304 CDD:206738 191/278 (69%)
Dynamin_M 227..503 CDD:460033 201/275 (73%)
GED 616..706 CDD:460495 52/89 (58%)

Return to query results.
Submit another query.