DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment HSPG2 and Hspg2

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_011539620.1 Gene:HSPG2 / 3339 HGNCID:5273 Length:4574 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038967228.1 Gene:Hspg2 / 313641 RGDID:621770 Length:4551 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4585 Identity:3918/4585 - (85%)
Similarity:4164/4585 - (90%) Gaps:45/4585 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGWRAAGALLLALLLHGRLLAVTHGLRAYDGLSLPEDIETVTASQMRWTHSYLSDDEDMLADSIS 65
            ||.||.|:|||.||||.||||||.|||||||||||||.||||||:..||:||||||||:|||..|
  Rat     1 MGQRAVGSLLLGLLLHARLLAVTQGLRAYDGLSLPEDTETVTASRYGWTYSYLSDDEDLLADDAS 65

Human    66 GDDLGSGDLGSGDFQMVYFRALVNFTRSIEYSPQLEDAGSREFREVSEAVVDTLESEYLKIPGDQ 130
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.::||||||||||:.||:||:||||||
  Rat    66 GDGLGSGDLGSGDFQMVYFRALVNFTRSIEYSPQLEDANAKEFREVSEAVVEKLETEYVKIPGDQ 130

Human   131 VVSVVFIKELDGWVFVELDVGSEGNADGAQIQEMLLRVISSGSVASYVTSPQGFQFRRLGTAQTP 195
            :|||||||||||||||||||||||||||:||||:|..|:||||:..|||||.||:||||||||||
  Rat   131 IVSVVFIKELDGWVFVELDVGSEGNADGSQIQEVLHTVVSSGSIGPYVTSPWGFKFRRLGTAQTP 195

Human   196 PPPPAAVAVAVTPVPQFPRACTEAEFACHSYNECVALEYRCDRRPDCRDMSDELNCEEPVLGISP 260
            |||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||.
  Rat   196 PPPPAAVGVAVTPVPQFPRVCTETEFACHSYNECVALEYRCDRRPDCRDMSDELNCEEAVSEISS 260

Human   261 TFSLLVETTSLPPRPETTIMRQPPVTHAPQPLLPGSVRPLPCGPQEAACRNGHCIPRDYLCDGQE 325
            ..|.:|:.:.||..||...: .|||.|.||.|||....|..||||||:|.:||||||||||||||
  Rat   261 LPSAVVKVSPLPLWPEAATL-PPPVMHGPQFLLPNVPGPTACGPQEASCHSGHCIPRDYLCDGQE 324

Human   326 DCEDGSDELDCGPPPPCEPNEFPCGNGHCALKLWRCDGDFDCEDRTDEANCPTKRPEEVCGPTQF 390
            ||.||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.|||||||.|.|.||||||||
  Rat   325 DCRDGSDELGCGPPPPCEPNEFSCENGHCALKLWRCDGDFDCEDHTDEANCPVKHPGEVCGPTQF 389

Human   391 RCVSTNMCIPASFHCDEESDCPDRSDEFGCMPPQVVTPPRESIQASRGQTVTFTCVAIGVPTPII 455
            :|||||.|||||||||||:||||||||||||||||||||::||||||||||||||||.|||||||
  Rat   390 QCVSTNRCIPASFHCDEETDCPDRSDEFGCMPPQVVTPPQQSIQASRGQTVTFTCVATGVPTPII 454

Human   456 NWRLNWGHIPSHPRVTVTSEGGRGTLIIRDVKESDQGAYTCEAMNARGMVFGIPDGVLELVPQRA 520
            ||||||||||.:||||:||||||||||||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||| 
  Rat   455 NWRLNWGHIPVNPRVTMTSEGGRGTLIIRDVKEADQGAYTCEAMNSRGMVFGIPDGVLELVPQR- 518

Human   521 GPCPDGHFYLEHSAACLPCFCFGITSVCQSTRRFRDQIRLRFDQPDDFKGVNVTMPAQPGTPPLS 585
            |||||||||||.||:||||||||:|::|||:|||||||||.||||.||||||||||:|||.||||
  Rat   519 GPCPDGHFYLEDSASCLPCFCFGVTNLCQSSRRFRDQIRLNFDQPSDFKGVNVTMPSQPGVPPLS 583

Human   586 STQLQIDPSLHEFQLVDLSRRFLVHDSFWALPEQFLGNKVDSYGGSLRYNVRYELARGMLEPVQR 650
            ||||||||:|.|||||||||||||||:|||||:||||||||||||.|||.||||||||||||||:
  Rat   584 STQLQIDPTLQEFQLVDLSRRFLVHDAFWALPKQFLGNKVDSYGGFLRYKVRYELARGMLEPVQK 648

Human   651 PDVVLMGAGYRLLSRGHTPTQPGALNQRQVQFSEEHWVHESGRPVQRAELLQVLQSLEAVLIQTV 715
            |||:|:||||||.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||:||.|.||||||:|||
  Rat   649 PDVILVGAGYRLHSRGHTPTHPGALNQRQVQLSEEHWVHESGRPVQRAEMLQALASLEAVLLQTV 713

Human   716 YNTKMASVGLSDIAMDTTVTHATSHGRAHSVEECRCPIGYSGLSCESCDAHFTRVPGGPYLGTCS 780
            |||||.|||||||.||||||:.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   714 YNTKMTSVGLSDIVMDTTVTYTTIHGRAHSVEECRCPIGYSGLSCESCDAHFTRVPGGPYLGTCS 778

Human   781 GCNCNGHASSCDPVYGHCLNCQHNTEGPQCNKCKAGFFGDAMKATATSCRPCPCPYIDASRRFSD 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||.|||||:||||||||||||:||||
  Rat   779 GCNCNGHASSCDPVYGHCLNCQHNTEGPQCDKCKPGFFGDATKATATACRPCPCPYIDASQRFSD 843

Human   846 TCFLDTDGQATCDACAPGYTGRRCESCAPGYEGNPIQPGGKCRPVNQEIVRCDERGSMGTSGEAC 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||:||||||||:..:||||
  Rat   844 TCFLDTDGQATCDACAPGYTGRRCESCAPGYEGNPIQPGGKCRPSNQELVRCDERGSLSATGEAC 908

Human   911 RCKNNVVGRLCNECADGSFHLSTRNPDGCLKCFCMGVSRHCTSSSWSRAQLHGASEEPGHFSLTN 975
            |||||||||.||||::||||||.:|||||||||||||||.|:||||||||:.|||.:|..|:|||
  Rat   909 RCKNNVVGRSCNECSEGSFHLSKQNPDGCLKCFCMGVSRQCSSSSWSRAQVLGASVQPSQFTLTN 973

Human   976 AASTHTTNEGIFSPTPGELGFSSFHRLLSGPYFWSLPSRFLGDKVTSYGGELRFTVTQRSQPGST 1040
            ||.||||:||:.||.||||.|||||.|||.|||||||:.|.||||||||||||||||||.:|||.
  Rat   974 AAGTHTTSEGVSSPAPGELLFSSFHNLLSEPYFWSLPASFRGDKVTSYGGELRFTVTQRPRPGSA 1038

Human  1041 PLHGQPLVVLQGNNIILEHHVAQEPSPGQPSTFIVPFREQAWQRPDGQPATREHLLMALAGIDTL 1105
            |||.|||||||||||:||||.::||||||||.|||||:||.||||||||||||||||||||||.|
  Rat  1039 PLHRQPLVVLQGNNIVLEHHASREPSPGQPSNFIVPFQEQVWQRPDGQPATREHLLMALAGIDAL 1103

Human  1106 LIRASYAQQPAESRVSGISMDVAVPEETGQDPALEVEQCSCPPGYRGPSCQDCDTGYTRTPSGLY 1170
            ||:||:.|||||||:|||||||||||.||||||.|||.|:|||||||||||||||||||..||||
  Rat  1104 LIQASHTQQPAESRLSGISMDVAVPENTGQDPAREVEHCTCPPGYRGPSCQDCDTGYTRVASGLY 1168

Human  1171 LGTCERCSCHGHSEACEPETGACQGCQHHTEGPRCEQCQPGYYGDAQRGTPQDCQLCPCYGDPAA 1235
            |||||||:||||||.|||||||||.|||||||..|||||||||||.|||||||||.|||||.|||
  Rat  1169 LGTCERCNCHGHSETCEPETGACQSCQHHTEGASCEQCQPGYYGDPQRGTPQDCQPCPCYGTPAA 1233

Human  1236 GQAAHTCFLDTDGHPTCDACSPGHSGRHCERCAPGYYGNPSQGQPCQRDSQVPGPIGCNCDPQGS 1300
            |||:||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||||||||.||.|||...||:|||.||
  Rat  1234 GQASHTCFLDTDGHPTCDSCSPGHSGRHCERCAPGYHGNPSQGQPCHRDGQVPEVPGCDCDPHGS 1298

Human  1301 VSSQCDAAGQCQCKAQVEGLTCSHCRPHHFHLSASNPDGCLPCFCMGITQQCASSAYTRHLISTH 1365
            :||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||||:||||.||:|:|.|||||
  Rat  1299 ISSQCDATGQCQCKAQVEGRTCSHCRPHHFHLSASNPEGCLPCFCMGVTQQCTSSSYSRQLISTH 1363

Human  1366 FAPGDFQGFALVNPQRNSRLTGEFTVEPVPEGAQLSFGNFAQLGHESFYWQLPETYQGDKGEAYF 1430
            ||||||||||||||||||:|||.|||||||:||:|||.|||.||.|||||||||||||||.||:|
  Rat  1364 FAPGDFQGFALVNPQRNSQLTGGFTVEPVPDGARLSFSNFAHLGQESFYWQLPETYQGDKREAHF 1428

Human  1431 ARMRRAHQRTLPMALAPGLWEVLARLLPPFHQNRTSLSEEQLRAAVTAGRIPEPPEGRDWAQRAS 1495
            ||:|||                        ||||||||||:.||||.:|||....|||..|||||
  Rat  1429 ARLRRA------------------------HQNRTSLSEEEWRAAVASGRILGDTEGRGRAQRAS 1469

Human  1496 QVDEAQRRMDAEIWQLLSSFAAQPQPPPQGLSPHPQPAAALRAAPPPSSSSSSSSSSA--SLSFS 1558
            ||||||||:||||||||:.|||.|.|||:||.|:||.|.||||.||.||||||.|||:  ||...
  Rat  1470 QVDEAQRRVDAEIWQLLAGFAAHPHPPPRGLRPNPQLATALRAGPPSSSSSSSPSSSSFTSLPSP 1534

Human  1559 PGSQFSLSYEGFSLLPGSLYYWQLPRAFLGDKVAAYGGKLRYTLSYTAGPQGSPLSDPDVQITGN 1623
            .|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||:|||||||||||:|||||
  Rat  1535 AGSQFSLSYEGFSLLPGSLYYWQLPRAFLGNKVAAYGGKLRYTLSYTSGPQGSPLSDPDIQITGN 1599

Human  1624 NIMLVASQPALQGPERRSYEIMFREEFWRRPDGQPATREHLLMALADLDELLIRATFSSVPLAAS 1688
            |||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||
  Rat  1600 NIMLVASQPALQGPERRSYEIIFREEFWRRPDGQPATREHLLMALADLDELLVRATFSSVPRAAS 1664

Human  1689 ISAVSLEVAQPGPSNRPRALEVEECRCPPGYIGLSCQDCAPGYTRTGSGLYLGHCELCECNGHSD 1753
            ||||||||||||||..|:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||.||||||||||:
  Rat  1665 ISAVSLEVAQPGPSGGPQALEVEECRCPPGYVGLSCQDCAPGYTRTGSGLYLGQCELCECNGHSE 1729

Human  1754 LCHPETGACSQCQHNAAGEFCELCAPGYYGDATAGTPEDCQPCACPLTNPENMFSRTCESLGAGG 1818
            :||||||||:.||||..|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1730 VCHPETGACTGCQHNTVGEFCETCATGYYGDATAGTPEDCQPCACPLTNPENMFSRTCESLGAGG 1794

Human  1819 YRCTACEPGYTGQYCEQCGPGYVGNPSVQGGQCLPETNQAPLVVEVHPARSIVPQGGSHSLRCQV 1883
            ||||||||||||||||||.|||.|||:||||:|.|.|.:: |.|::||:||:|||||.|||||||
  Rat  1795 YRCTACEPGYTGQYCEQCAPGYEGNPNVQGGRCQPLTKES-LEVQIHPSRSVVPQGGPHSLRCQV 1858

Human  1884 SGSPPHYFYWSREDGRPVPSGTQQRHQGSELHFPSVQPSDAGVYICTCRNLHQSNTSRAELLVTE 1948
            :||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||..::.|||||||.|
  Rat  1859 NGSPPHYFYWSREDGRPLPSGAQQRHQGSELHFPSVQPSDAGVYICTCRNLIHTSNSRAELLVAE 1923

Human  1949 APSKPITVTVEEQRSQSVRPGADVTFICTAKSKSPAYTLVWTRLHNGKLPTRAMDFNGILTIRNV 2013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat  1924 APSKPITVTVEEQRSQSVRPGADVTFICTAKSKSPAYTLVWTRLHNGKLPSRAMDFNGILTIRNV 1988

Human  2014 QLSDAGTYVCTGSNMFAMDQGTATLHVQASGTLSAPVVSIHPPQLTVQPGQLAEFRCSATGSPTP 2078
            |.||||||||||||||||||||||||||.|||.:|||.|||||||||||||||||||||||:|||
  Rat  1989 QPSDAGTYVCTGSNMFAMDQGTATLHVQVSGTSTAPVASIHPPQLTVQPGQLAEFRCSATGNPTP 2053

Human  2079 TLEWTGGPGGQLPAKAQIHGGILRLPAVEPTDQAQYLCRAHSSAGQQVARAVLHVHGGGGPRVQV 2143
            ||||.|||.||||.|||||.|||||||:||:||.||||||.|||||.|.||:|.||||.||||||
  Rat  2054 TLEWIGGPSGQLPTKAQIHNGILRLPAIEPSDQGQYLCRALSSAGQHVVRAMLQVHGGSGPRVQV 2118

Human  2144 SPERTQVHAGRTVRLYCRAAGVPSATITWRKEGGSLPPQARSERTDIATLLIPAITTADAGFYLC 2208
            ||||||||.||||||||||||||||:|||||||||||||||||.|||.|||||||..||:|||||
  Rat  2119 SPERTQVHEGRTVRLYCRAAGVPSASITWRKEGGSLPPQARSENTDIPTLLIPAIRVADSGFYLC 2183

Human  2209 VATSPAGTAQARIQVVVLSASDASPPPVKIESSSPSVTEGQTLDLNCVVAGSAHAQVTWYRRGGS 2273
            |||||.|||||||||||||||.||..||:||||||||||||||||||.|.|..:.|||||:||||
  Rat  2184 VATSPTGTAQARIQVVVLSASGASSVPVRIESSSPSVTEGQTLDLNCAVMGLTYTQVTWYKRGGS 2248

Human  2274 LPPHTQVHGSRLRLPQVSPADSGEYVCRVENGSGPKEASITVSVLHGTHSGPSYTPVPGSTRPIR 2338
            ||||.|||||||||||||||||||||||||:..|||||||.|||||..||||||||...||.|||
  Rat  2249 LPPHAQVHGSRLRLPQVSPADSGEYVCRVESDLGPKEASIVVSVLHSPHSGPSYTPATSSTPPIR 2313

Human  2339 IEPSSSHVAEGQTLDLNCVVPGQAHAQVTWHKRGGSLPARHQTHGSLLRLHQVTPADSGEYVCHV 2403
            ||.||||||||||||||||||||  |||||.||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat  2314 IESSSSHVAEGQTLDLNCVVPGQ--AQVTWRKRGGSLPARHQTHGSLLRLHQVSPADSGEYVCHV 2376

Human  2404 VGTSGPLEASVLVTIEASV---IPGPIPPVRIESSSSTVAEGQTLDLSCVVAGQAHAQVTWYKRG 2465
            :..|..:|.||||.||.:|   .|||:|||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  2377 LLGSEHIETSVLVAIEPAVSIPAPGPVPPVRIESSSPTVAEGQTLDLNCVVAGQAHAQVTWYKRG 2441

Human  2466 GSLPARHQVRGSRLYIFQASPADAGQYVCRASNGMEASITVTVTGTQGANLAYPAGSTQPIRIEP 2530
            .||||||||||||||||||||||||:|||||.||.||:|||.|||.||||:|||.|||..||||.
  Rat  2442 SSLPARHQVRGSRLYIFQASPADAGEYVCRAGNGQEATITVKVTGNQGANIAYPPGSTPTIRIES 2506

Human  2531 SSSQVAEGQTLDLNCVVPGQSHAQVTWHKRGGSLPVRHQTHGSLLRLYQASPADSGEYVCRVLGS 2595
            |||.|||||||||||||.||:||||||||||||||.|||||||||||:|.||.|||||||||.|.
  Rat  2507 SSSHVAEGQTLDLNCVVQGQAHAQVTWHKRGGSLPARHQTHGSLLRLHQVSPVDSGEYVCRVEGG 2571

Human  2596 SVPLEASVLVTIEPAGSVPALGVTPTVRIESSSSQVAEGQTLDLNCLVAGQAHAQVTWHKRGGSL 2660
            .||||:||||.||||||||||||||.||||||||.|:|||:||||||||||.|.|::||||||||
  Rat  2572 PVPLESSVLVAIEPAGSVPALGVTPPVRIESSSSHVSEGQSLDLNCLVAGQTHPQISWHKRGGSL 2636

Human  2661 PARHQVHGSRLRLLQVTPADSGEYVCRVVGSSGTQEASVLVTIQQRLSGSHSQGVAYPVRIESSS 2725
            |||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||||||||.||.||.|.|.:||||||||
  Rat  2637 PARHQVHGSRLRLLQVTPADSGEYVCRVVSGSGTHEASVLVTIQQHLSPSHPQSVVHPVRIESSS 2701

Human  2726 ASLANGHTLDLNCLVASQAPHTITWYKRGGSLPSRHQIVGSRLRIPQVTPADSGEYVCHVSNGAG 2790
            .||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat  2702 PSLANGHTLDLNCLVASLTPHTITWYKRGGSLPSRHQIVGSRLRIPQVTPADSGEYVCHVSNGVG 2766

Human  2791 SRETSLIVTIQGSGSSHVPSVSPPIRIESSSPTVVEGQTLDLNCVVARQPQAIITWYKRGGSLPS 2855
            |:||||||||:..|.|||||||||:|||:|||||.|||||||||||..:|||.|||||||||||.
  Rat  2767 SQETSLIVTIESRGPSHVPSVSPPMRIETSSPTVTEGQTLDLNCVVVGRPQATITWYKRGGSLPF 2831

Human  2856 RHQTHGSHLRLHQMSVADSGEYVCRANNNIDALEASIVISVSPSAGSPSAPGSSMPIRIESSSSH 2920
            |||.|||.||||||||||||||||||||||||.|.||:|||||:..:|||..|.:||||||||||
  Rat  2832 RHQAHGSRLRLHQMSVADSGEYVCRANNNIDAQETSIMISVSPNTNAPSASASPVPIRIESSSSH 2896

Human  2921 VAEGETLDLNCVVPGQAHAQVTWHKRGGSLPSHHQTRGSRLRLHHVSPADSGEYVCRVMGSSGPL 2985
            ||||:||||||||||||||||||||||||||:|||..||||||:.|||||||||||||:.|||||
  Rat  2897 VAEGQTLDLNCVVPGQAHAQVTWHKRGGSLPAHHQAHGSRLRLYQVSPADSGEYVCRVLSSSGPL 2961

Human  2986 EASVLVTIEASGSSAVHVPAPGGAPPIRIEPSSSRVAEGQTLDLKCVVPGQAHAQVTWHKRGGNL 3050
            ||||||:|.||.|: |||  |||.||||||.|||:|||||||||.||||||||||||||||||:|
  Rat  2962 EASVLVSITASASN-VHV--PGGVPPIRIETSSSQVAEGQTLDLTCVVPGQAHAQVTWHKRGGSL 3023

Human  3051 PARHQVHGPLLRLNQVSPADSGEYSCQVTGSSGTLEASVLVTIEPSSPGPIPAPGLAQPIYIEAS 3115
            ||.|||||.:||||:|||||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||||||||:|
  Rat  3024 PAGHQVHGHILRLNRVSPADSGEYSCQVTGSSGTLEASVLVTIEASQPSPIPAPGLAQPIYIESS 3088

Human  3116 SSHVTEGQTLDLNCVVPGQAHAQVTWYKRGGSLPARHQTHGSQLRLHLVSPADSGEYVCRAASGP 3180
            |||:.||||:||||||||||||||||:|||.|||||||||||.|||:.:||||||||||:.|...
  Rat  3089 SSHLAEGQTVDLNCVVPGQAHAQVTWHKRGSSLPARHQTHGSLLRLYHISPADSGEYVCQVAGSS 3153

Human  3181 GPEQEASFTVTVPPSEGSSYRLRSPVISIDPPSSTVQQGQDASFKCLIHDGAAPISLEWKTRNQE 3245
            .||.||||.:|||.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||:||.||||||||||||
  Rat  3154 HPEHEASFKITVPASEGSSYRLRSPVISIEPPSSTVQQGQDASFKCLIHEGATPISLEWKTRNQE 3218

Human  3246 LEDNVHISPNGSIITIVGTRPSNHGTYRCVASNAYGVAQSVVNLSVHGPPTVSVLPEGPVWVKVG 3310
            |||||||||||||:||||.||||||.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||:|
  Rat  3219 LEDNVHISPNGSIMTIVGARPSNHGAYRCVASNVYGVAQSVVNLIVHGPPTVSVLPEGPVHVKMG 3283

Human  3311 KAVTLECVSAGEPRSSARWTRISSTPAKLEQRTYGLMDSHAVLQISSAKPSDAGTYVCLAQNALG 3375
            |.:||||||:||||||.||||: ..|.|||.|.:|||:|||:|:|:|.||||||||||.||||||
  Rat  3284 KDITLECVSSGEPRSSPRWTRL-GIPVKLEPRMFGLMNSHAMLKIASVKPSDAGTYVCQAQNALG 3347

Human  3376 TAQKQVEVIVDTGAMAPGAPQVQAEEAELTVEAGHTATLRCSATGSPAPTIHWSKLRSPLPWQHR 3440
            |||||||:|||||.:||||||||.||||||:||||||||.|||||:|.|||||||||:|||||||
  Rat  3348 TAQKQVELIVDTGTVAPGAPQVQVEEAELTLEAGHTATLHCSATGNPPPTIHWSKLRAPLPWQHR 3412

Human  3441 LEGDTLIIPRVAQQDSGQYICNATSPAGHAEATIILHVESPPYATTVPEHASVQAGETVQLQCLA 3505
            :||:||:|||||||||||||||||:.|||.|||::|||||.||||.:|||.|||.|:.|||||||
  Rat  3413 IEGNTLVIPRVAQQDSGQYICNATNSAGHTEATVVLHVESHPYATIIPEHTSVQPGKLVQLQCLA 3477

Human  3506 HGTPPLTFQWSRVGSSLPGRATARNELLHFERAAPEDSGRYRCRVTNKVGSAEAFAQLLVQGPPG 3570
            |||||||:||||||..||.:|.|||:||..|.|...|||||||:|:|||||||||||:||||..|
  Rat  3478 HGTPPLTYQWSRVGGILPEKAVARNQLLRLEPAGRADSGRYRCQVSNKVGSAEAFAQVLVQGSSG 3542

Human  3571 SLPATSIPAGSTPTVQVTPQLETKSIGASVEFHCAVPSDRGTQLRWFKEGGQLPPGHSVQDGVLR 3635
            .:|.||.|.|||||||||||.||||||||||||||||::.||.|||.||||||||||||||||||
  Rat  3543 DVPDTSTPVGSTPTVQVTPQQETKSIGASVEFHCAVPNEHGTHLRWLKEGGQLPPGHSVQDGVLR 3607

Human  3636 IQNLDQSCQGTYICQAHGPWGKAQASAQLVIQALPSVLINIRTSVQTVVVGHAVEFECLALGDPK 3700
            |||||||||||||||||||||:|||:|||::|||||||||:||||.:|||||:||||||||||||
  Rat  3608 IQNLDQSCQGTYICQAHGPWGQAQATAQLIVQALPSVLINVRTSVHSVVVGHSVEFECLALGDPK 3672

Human  3701 PQVTWSKVGGHLRPGIVQSGGVVRIAHVELADAGQYRCTATNAAGTTQSHVLLLVQALPQISMPQ 3765
            ||||||||||.||.||||||.|:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.
  Rat  3673 PQVTWSKVGGRLRSGIVQSGSVIRIAHVELADAGQYRCAATNAAGTTQSHVLLLVQALPQISTPP 3737

Human  3766 EVRVPAGSAAVFPCIASGYPTPDISWSKLDGSLPPDSRLENNMLMLPSVRPQDAGTYVCTATNRQ 3830
            ||||||||||||||:|||||||.|:|||:||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat  3738 EVRVPAGSAAVFPCMASGYPTPAITWSKVDGDLPPDSRLENNMLMLPSVRPEDAGTYVCTATNRQ 3802

Human  3831 GKVKAFAHLQVPERVVPYFTQTPYSFLPLPTIKDAYRKFEIKITFRPDSAD------GMLLYNGQ 3889
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||
  Rat  3803 GKVKAFAYLQVPERVVPYFTQTPYSFLPLPTIKDAYRKFEIKITFRPDSADGLLLYSGMLLYNGQ 3867

Human  3890 KRVPGSPTNLANRQPDFISFGLVGGRPEFRFDAGSGMATIRHPTPLALGHFHTVTLLRSLTQGSL 3954
            |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:
  Rat  3868 KHTPGSPTNLANRQPDFISFGLVGGRPEFRFDAGSGMATIRHPTPLALGQFHTVTLLRSLTQGSM 3932

Human  3955 IVGDLAPVNGTSQGKFQGLDLNEELYLGGYPDYGAIPKAGLSSGFIGCVRELRIQGEEIVFHDLN 4019
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||||||:|
  Rat  3933 IVGNLAPVNGTSQGKFQGLDLNEELYLGGYPDYRAIPKAGLSSGFVGCVRELRIQGEEIVFHDVN 3997

Human  4020 LTAHGISHCPTCRDRPCQNGGQCHDSESSSYVCVCPAGFTGSRCEHSQALHCHPEACGPDATCVN 4084
            ||.|||||||||:||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3998 LTTHGISHCPTCQDRPCQNGGQCHDSESSSYTCVCPAGFTGSRCEHSQALHCHPEACGPDATCVN 4062

Human  4085 RPDGRGYTCRCHLGRSGLRCEEGVTVTTPSLSGAGSYLALPALTNTHHELRLDVEFKPLAPDGVL 4149
            |||||||.|||||||||:||||||||||||:|||||||.||||||||||||||||||||.|||:|
  Rat  4063 RPDGRGYNCRCHLGRSGMRCEEGVTVTTPSMSGAGSYLVLPALTNTHHELRLDVEFKPLEPDGIL 4127

Human  4150 LFSGGKSGPVEDFVSLAMVGGHLEFRYELGSGLAVLRSAEPLALGRWHRVSAERLNKDGSLRVNG 4214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||:|:|
  Rat  4128 LFSGGKSGPVEDFVSLAMVGGHLEFRYELGSGLAVLRSLEPLALGRWHRVSAERLNKDGSLQVDG 4192

Human  4215 GRPVLRSSPGKSQGLNLHTLLYLGGVEPSVPLSPATNMSAHFRGCVGEVSVNGKRLDLTYSFLGS 4279
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  4193 GRPVLRSSPGKSQGLNLHTLLYLGGVEPSVQLSPATNMSAHFRGCVGEVSVNGKRLDLTYSFLGS 4257

Human  4280 QGIGQCYDSSPCERQPCQHGATCMPAGEYEFQCLCRDGFKGDLCEHEENPCQLREPCLHGGTCQG 4344
            :|:||||||||||||||::||||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||:||||:|
  Rat  4258 RGVGQCYDSSPCERQPCRNGATCMPAGEYEFQCLCQDGFKGDLCEHEENPCQLQEPCLNGGTCRG 4322

Human  4345 TRCLCLPGFSGPRCQQGSGHGIAESDWHLEGSGGNDAPGQYGAYFHDDGFLAFPGHVFSRSLPEV 4409
            |||||||||||||||||:|:|:.|||||.||||||||||||||||||:||||.||:.||||||||
  Rat  4323 TRCLCLPGFSGPRCQQGAGYGVVESDWHPEGSGGNDAPGQYGAYFHDNGFLALPGNSFSRSLPEV 4387

Human  4410 PETIELEVRTSTASGLLLWQGVEVGEAGQGKDFISLGLQDGHLVFRYQLGSGEARLVSEDPINDG 4474
            |||||.|||||||:|||||||| |.|:.:.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat  4388 PETIEFEVRTSTANGLLLWQGV-VKESSRSKDFISLGLQDGHLVFNYQLGSGEARLVSEDPINDG 4451

Human  4475 EWHRVTALREGRRGSIQVDGEELVSGRSPGPNVAVNAKGSVYIGGAPDVATLTGGRFSSGITGCV 4539
            |||||||||||:||||||||||||.|||||||||||.|..:||||||||||||.|:||||||||:
  Rat  4452 EWHRVTALREGQRGSIQVDGEELVIGRSPGPNVAVNTKDIIYIGGAPDVATLTRGKFSSGITGCL 4516

Human  4540 KNLVLHSARPGAPPPQPLDLQHRAQAGANTRPCPS 4574
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  4517 KNLVLHSARPGAPPPQPLDLQHRAQAGANTRPCPS 4551

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
HSPG2XP_011539620.1 SEA 80..193 CDD:214554 94/112 (84%)
LDLa 216..251 CDD:238060 33/34 (97%)
LDLa 302..336 CDD:238060 29/33 (88%)
LDLa 342..376 CDD:238060 30/33 (91%)
LDLa 385..420 CDD:238060 31/34 (91%)
IG 431..507 CDD:214652 68/75 (91%)
Ig_Perlecan_D2_like 438..515 CDD:143220 70/76 (92%)
LamB 608..734 CDD:214597 109/125 (87%)
EGF_Lam 782..824 CDD:238012 38/41 (93%)
EGF_Lam 831..888 CDD:238012 55/56 (98%)
Laminin_EGF 897..939 CDD:278482 32/41 (78%)
LamB 1003..1130 CDD:214597 106/126 (84%)
EGF_Lam 1176..1225 CDD:238012 42/48 (88%)
EGF_Lam 1227..1282 CDD:238012 50/54 (93%)
Laminin_EGF 1293..1340 CDD:278482 40/46 (87%)
LamB 1574..1699 CDD:214597 118/124 (95%)
EGF_Lam 1746..1794 CDD:238012 39/47 (83%)
Laminin_EGF 1796..1851 CDD:278482 51/54 (94%)
Ig_2 1866..1958 CDD:290606 79/91 (87%)
IG_like 1866..1946 CDD:214653 68/79 (86%)
Ig3_Perlecan_like 1954..2039 CDD:143231 82/84 (98%)
IG 1961..2040 CDD:214652 76/78 (97%)
I-set 2049..2133 CDD:254352 70/83 (84%)
Ig 2063..2133 CDD:299845 57/69 (83%)
I-set 2139..2225 CDD:254352 77/85 (91%)
IGc2 2153..2215 CDD:197706 55/61 (90%)
IG_like 2240..2317 CDD:214653 64/76 (84%)
IGc2 2247..2307 CDD:197706 49/59 (83%)
IG 2341..2418 CDD:214652 64/76 (84%)
IGc2 2348..2408 CDD:197706 52/59 (88%)
IG_like 2434..2508 CDD:214653 66/73 (90%)
IGc2 2441..2500 CDD:197706 54/58 (93%)
IG_like 2530..2607 CDD:214653 64/76 (84%)
IGc2 2537..2595 CDD:197706 50/57 (88%)
I-set 2620..2703 CDD:254352 71/82 (87%)
IGc2 2633..2693 CDD:197706 52/59 (88%)
IG 2731..2800 CDD:214652 64/68 (94%)
IGc2 2731..2790 CDD:197706 56/58 (97%)
IG_like 2819..2896 CDD:214653 64/76 (84%)
IGc2 2826..2885 CDD:197706 51/58 (88%)
IG 2916..2993 CDD:214652 68/76 (89%)
IGc2 2923..2983 CDD:197706 51/59 (86%)
IG 3016..3093 CDD:214652 68/76 (89%)
IGc2 3023..3083 CDD:197706 53/59 (90%)
Ig_2 3112..3192 CDD:290606 60/79 (76%)
IG_like 3115..3192 CDD:214653 58/76 (76%)
I-set 3205..3291 CDD:254352 78/85 (92%)
ig 3209..3289 CDD:278476 72/79 (91%)
IG 3303..3385 CDD:214652 60/81 (74%)
Ig 3313..3382 CDD:143165 51/68 (75%)
IG 3404..3478 CDD:214652 60/73 (82%)
IGc2 3409..3468 CDD:197706 49/58 (84%)
I-set 3482..3565 CDD:254352 60/82 (73%)
IGc2 3496..3555 CDD:197706 41/58 (71%)
IG_like 3589..3666 CDD:214653 68/76 (89%)
Ig 3600..3666 CDD:299845 58/65 (89%)
I-set 3676..3755 CDD:254352 69/78 (88%)
IGc2 3686..3745 CDD:197706 52/58 (90%)
I-set 3764..3841 CDD:254352 68/76 (89%)
Ig 3779..3834 CDD:299845 48/54 (89%)
LamG 3848..4008 CDD:238058 152/165 (92%)
EGF_CA <4035..4064 CDD:238011 27/28 (96%)
LamG 4117..4266 CDD:238058 141/148 (95%)
EGF 4291..4321 CDD:278437 26/29 (90%)
EGF_CA 4328..4359 CDD:238011 27/30 (90%)
LamG 4386..4545 CDD:238058 136/158 (86%)
Hspg2XP_038967228.1 SEA 80..194 CDD:413344 95/113 (84%)
LDLa 216..251 CDD:238060 33/34 (97%)
LDLa 301..332 CDD:197566 26/30 (87%)
LDLa 346..375 CDD:238060 25/28 (89%)
LDLa 384..419 CDD:238060 31/34 (91%)
Ig_Perlecan_like 437..514 CDD:143220 70/76 (92%)
Ig strand B 440..444 CDD:143220 3/3 (100%)
Ig strand C 453..457 CDD:143220 3/3 (100%)
Ig strand E 478..482 CDD:143220 3/3 (100%)
Ig strand F 492..497 CDD:143220 4/4 (100%)
Ig strand G 506..509 CDD:143220 2/2 (100%)
LamB 606..732 CDD:214597 109/125 (87%)
EGF_Lam 780..822 CDD:238012 38/41 (93%)
EGF_Lam 829..886 CDD:238012 55/56 (98%)
Laminin_EGF 895..937 CDD:395007 32/41 (78%)
Laminin_B 1006..1140 CDD:395006 112/133 (84%)
EGF_Lam 1174..1223 CDD:238012 42/48 (88%)
EGF_Lam 1224..1280 CDD:238012 50/55 (91%)
Laminin_EGF 1291..1338 CDD:395007 40/46 (87%)
Laminin_B 1555..1687 CDD:395006 122/131 (93%)
EGF_Lam 1722..1770 CDD:238012 39/47 (83%)
EGF_Lam 1771..1828 CDD:238012 52/56 (93%)
Ig strand A 1835..1840 CDD:409353 2/4 (50%)
IG_like 1841..1921 CDD:214653 68/79 (86%)
Ig strand A' 1843..1847 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand B 1850..1860 CDD:409353 8/9 (89%)
Ig strand C 1865..1872 CDD:409353 6/6 (100%)
Ig strand C' 1873..1876 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand E 1887..1893 CDD:409353 5/5 (100%)
Ig strand F 1900..1908 CDD:409353 7/7 (100%)
Ig strand G 1911..1919 CDD:409353 3/7 (43%)
IgI_Perlecan_like 1929..2014 CDD:409412 82/84 (98%)
Ig strand B 1947..1951 CDD:409412 3/3 (100%)
Ig strand C 1961..1965 CDD:409412 3/3 (100%)
Ig strand E 1981..1985 CDD:409412 3/3 (100%)
Ig strand F 1995..2000 CDD:409412 4/4 (100%)
Ig strand G 2008..2011 CDD:409412 2/2 (100%)
Ig 2024..2108 CDD:416386 70/83 (84%)
Ig strand A' 2032..2035 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand B 2041..2048 CDD:409353 6/6 (100%)
Ig strand C 2054..2058 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C' 2060..2062 CDD:409353 1/1 (100%)
Ig strand D 2068..2072 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 2074..2078 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 2087..2095 CDD:409353 6/7 (86%)
Ig strand G 2098..2108 CDD:409353 6/9 (67%)
I-set 2114..2200 CDD:400151 77/85 (91%)
Ig strand A' 2122..2126 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand B 2129..2139 CDD:409353 9/9 (100%)
Ig strand C 2144..2150 CDD:409353 4/5 (80%)
Ig strand C' 2151..2154 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand E 2166..2172 CDD:409353 4/5 (80%)
Ig strand F 2179..2187 CDD:409353 7/7 (100%)
IG_like 2215..2292 CDD:214653 64/76 (84%)
Ig strand B 2226..2230 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 2239..2243 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 2259..2262 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand F 2272..2277 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 2285..2288 CDD:409353 2/2 (100%)
IG_like 2316..2389 CDD:214653 62/74 (84%)
Ig strand B 2327..2331 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 2338..2342 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 2371..2376 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 2382..2385 CDD:409353 0/2 (0%)
Ig 2404..2484 CDD:416386 72/79 (91%)
Ig strand C 2434..2438 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 2453..2457 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 2467..2472 CDD:409353 3/4 (75%)
Ig strand G 2481..2484 CDD:409353 2/2 (100%)
IG_like 2506..2581 CDD:214653 62/74 (84%)
Ig strand C 2530..2534 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 2549..2553 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 2563..2568 CDD:409353 4/4 (100%)
IG 2602..2679 CDD:214652 66/76 (87%)
IG_like 2707..2776 CDD:214653 64/68 (94%)
Ig strand B 2710..2714 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 2722..2727 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand E 2743..2746 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand F 2756..2761 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 2769..2772 CDD:409353 2/2 (100%)
IGc2 2802..2861 CDD:197706 51/58 (88%)
Ig strand C 2819..2823 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand E 2838..2842 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand F 2852..2857 CDD:409353 4/4 (100%)
IG 2892..2969 CDD:214652 68/76 (89%)
IG_like 2994..3066 CDD:214653 65/71 (92%)
Ig strand B 3000..3004 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 3013..3017 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 3032..3036 CDD:409353 1/3 (33%)
Ig strand F 3046..3051 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 3059..3062 CDD:409353 2/2 (100%)
IG 3087..3165 CDD:214652 58/77 (75%)
Ig 3178..3264 CDD:416386 78/85 (92%)
Ig strand A 3178..3181 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand A' 3186..3190 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand B 3195..3202 CDD:409353 6/6 (100%)
Ig strand C 3208..3215 CDD:409353 6/6 (100%)
Ig strand D 3223..3226 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand E 3230..3236 CDD:409353 4/5 (80%)
Ig strand F 3243..3250 CDD:409353 5/6 (83%)
Ig strand G 3256..3264 CDD:409353 7/7 (100%)
Ig strand A 3267..3270 CDD:409353 2/2 (100%)
IG_like 3276..3357 CDD:214653 60/81 (74%)
Ig strand A' 3276..3279 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand B 3285..3293 CDD:409353 5/7 (71%)
Ig strand C 3299..3303 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand C' 3306..3309 CDD:409353 0/2 (0%)
Ig strand D 3315..3319 CDD:409353 1/3 (33%)
Ig strand E 3323..3328 CDD:409353 2/4 (50%)
Ig strand F 3336..3344 CDD:409353 6/7 (86%)
Ig strand G 3347..3357 CDD:409353 8/9 (89%)
Ig_3 3367..3437 CDD:404760 60/69 (87%)
Ig strand A' 3375..3378 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand B 3384..3391 CDD:409353 5/6 (83%)
Ig strand C 3397..3402 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand C' 3405..3407 CDD:409353 0/1 (0%)
Ig strand D 3410..3414 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 3416..3420 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand F 3429..3437 CDD:409353 7/7 (100%)
Ig strand G 3440..3450 CDD:409353 6/9 (67%)
Ig 3454..3537 CDD:416386 60/82 (73%)
Ig strand B 3471..3475 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 3484..3488 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand F 3517..3522 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig 3560..3638 CDD:416386 69/77 (90%)
Ig strand A' 3563..3567 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand B 3570..3579 CDD:409353 8/8 (100%)
Ig strand C 3585..3590 CDD:409353 3/4 (75%)
Ig strand C' 3593..3596 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand E 3603..3610 CDD:409353 6/6 (100%)
Ig strand F 3617..3625 CDD:409353 7/7 (100%)
Ig strand G 3628..3638 CDD:409353 7/9 (78%)
Ig 3662..3722 CDD:409353 54/59 (92%)
Ig strand B 3662..3665 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand C 3674..3678 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 3693..3697 CDD:409353 1/3 (33%)
Ig strand F 3707..3712 CDD:409353 4/4 (100%)
I-set 3731..3813 CDD:400151 72/81 (89%)
Ig strand A 3733..3736 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand A' 3738..3742 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand B 3745..3754 CDD:409353 7/8 (88%)
Ig strand C 3760..3765 CDD:409353 2/4 (50%)
Ig strand C' 3768..3772 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand E 3778..3785 CDD:409353 6/6 (100%)
Ig strand F 3792..3800 CDD:409353 7/7 (100%)
Ig strand G 3803..3813 CDD:409353 8/9 (89%)
LamG 3820..3986 CDD:238058 152/165 (92%)
EGF_CA 4009..4042 CDD:238011 30/32 (94%)
LamG 4095..4244 CDD:238058 141/148 (95%)
EGF 4269..4299 CDD:394967 26/29 (90%)
EGF_CA 4306..4337 CDD:238011 27/30 (90%)
LamG 4364..4522 CDD:238058 136/158 (86%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 319 1.000 Domainoid score I14424
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 4415 1.000 Inparanoid score I162
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG46672
OrthoDB 1 1.010 - - D17288at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006846
OrthoInspector 1 1.000 - - oto129537
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_107789
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10574
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X4935
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1414.480

Return to query results.
Submit another query.