DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TBCD and Tbcd

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_608648.1 Gene:TBCD / 33389 FlyBaseID:FBgn0027509 Length:1189 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006247923.1 Gene:Tbcd / 100361417 RGDID:2320148 Length:1212 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1231 Identity:488/1231 - (39%)
Similarity:722/1231 - (58%) Gaps:98/1231 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 SNSVEECKDEDL-PANTLEHFTELQQVLEMIDNIKSIAANTFEREF--EQYAQVLSRYQEQPHLL 63
            |.:.||.:|:.| .|:|||.|.|..:...::.::.::......||.  |::..::.:||||||||
  Rat    10 SAAEEEVEDDALVRASTLEAFGESAETRALLRSLPAVHRERAAREVAEERFRVIMDKYQEQPHLL 74

  Fly    64 DPHLEELLGKLLHKIRK----PDLDTGELHAAFKYLYIICKVRTYKVLVKFMPHELSDLEFVLDL 124
            |||||.::..||..::.    |||    :|.|||:||||.|||.|||.::..|||::|::.|||:
  Rat    75 DPHLEWMMNSLLDIVQDETSLPDL----VHLAFKFLYIITKVRGYKVFLRLFPHEVADVQPVLDM 135

  Fly   125 LGQQNPKEFEQWETRYILLLWMSILVLNPFHMSRLDAYDTSTSAPTTNCSPVNHVQSKNTK---M 186
            ...||||:.|.|||||:||||:|:..|.||..||||.     :.||         ||..|:   |
  Rat   136 FTGQNPKDHETWETRYMLLLWLSVTCLIPFDFSRLDG-----NLPT---------QSGETRMPIM 186

  Fly   187 DRIFELIQLYVSSNDTCSSMAAFLAAKYFIRSDIKDLYLERFLDWIM--EQHQA----DTLNVKF 245
            |||.::.|.|:..:|.....||.|.:|:..|.|:|...:..||||.:  ..|.:    |.:....
  Rat   187 DRILQIAQSYLVVSDKARDAAAVLVSKFITRPDVKQRKMASFLDWSLCTLAHSSFQTIDGVITMD 251

  Fly   246 GQLAAVAAILKHGKREDLLPYADKLLQWITSCQYKDDNDFLKYKNYVKIIQRIGLVHLKPRIASW 310
            |.|.|:|.|.|||||||.||||:.:||.:..|:..:.:..|..|..||::||:||..|||::|:|
  Rat   252 GMLQALAQIFKHGKREDCLPYANTVLQCLDGCRLPESSHTLLRKLGVKLVQRLGLTFLKPKVATW 316

  Fly   311 RYKRGTRSLATNLNQTTAAGGEPVVLEQSL--EEGEEIVVPDAIEEVIEELLQALRSGGNDIRWS 373
            ||:||.||||.||........|..:|..||  :..|:..||:.:|.|||:||..|:.....:|||
  Rat   317 RYQRGCRSLAANLQLRAPGKSEQKLLSDSLTSDGDEDYDVPEGVETVIEQLLVGLKDKDTIVRWS 381

  Fly   374 AAKGLGRVTNRLPKELADEVIGSVIDILNPLEPHEAWHGACLALAELAKRGLLLPHRLEELVPLL 438
            ||||:||:..|||:||||:|:|||:|..:..|..:||||.|||||||.:||||||.||.|:|.::
  Rat   382 AAKGIGRMAGRLPRELADDVVGSVLDCFSFQETDKAWHGGCLALAELGRRGLLLPSRLSEVVTVI 446

  Fly   439 MQALFYDEMKGYMSVGQHIRDSACYMCWAFARAYNPDDVKPFVHKISSGLLTVAVFDREVNCRRA 503
            ::||.|||.:|..|||.::||:|||:||||||||.|.::.|||..|||.|:..|||||.||||||
  Rat   447 LKALTYDEKRGACSVGANVRDAACYVCWAFARAYEPQELTPFVTAISSALVIAAVFDRNVNCRRA 511

  Fly   504 ASAAFQESVGRLGNFPFGIEISTTTDFYSVGIRQNSYLNISDYIAQFEVYREPLINHLVQHKVSH 568
            |||||||:|||.|.||.||:|.||.|:::||...|.:|.||.:||.|:.|.:|:|:|||..|::|
  Rat   512 ASAAFQENVGRQGTFPHGIDILTTADYFAVGNISNCFLIISVFIAGFQEYTKPMIDHLVSMKINH 576

  Fly   569 WDSAIRELTAKALHKLSLWEPEYMAAVVLPQLLAKTDTIDINCRHGCVLAMGEITLTLRKLEEKS 633
            ||.|||||:|||||.|:...|||||..|.|.||..|.:.|::.|||.:||..|:|..|.:|..:|
  Rat   577 WDGAIRELSAKALHNLTSLVPEYMATHVFPALLLMTQSPDLHTRHGAILACAEVTYALYELAAQS 641

  Fly   634 DPQVV-YLSNQRVAELNELIITFLDKNFYRGMSGDLMKSCTSSYIKNCSLAKLQATPECLV-SWQ 696
            :..|. ||..:.|..|.::.....|::.|||:.|:||:......|:..||:::....:.:: .||
  Rat   642 NRLVTDYLDEKAVQSLKQIHQQLCDRHLYRGLGGELMRQAVCILIEKLSLSRMPFKGDTVIEGWQ 706

  Fly   697 KVIDSCL----ITKSNA---IRDGAVEAFGELCTTYYCSDSRHGE-----NEAIINTYLTGADND 749
            .:|:..|    :..|::   |::.||.|...:|..||..:.  ||     .|.:|..||....:.
  Rat   707 WLINDTLRSLHLVSSHSREQIKEVAVSALAAVCNEYYKKEP--GEAGSTITEELIPQYLAELRSP 769

  Fly   750 LEEHIRMGYIAALGVLPSFMIRCHLQAILDSL--VKHSLTPLQAVLVGEMGDRENIQAYRWSEAR 812
             ||..|.|:.:|||.||.|::|.|||.:|..|  |..:.:|:..               .::|||
  Rat   770 -EEMTRCGFSSALGALPCFLLRGHLQQVLSGLRRVTCTTSPMDV---------------SFAEAR 818

  Fly   813 TQSVLALTKLVKTVGYG--GGIDSFAEPKNFNKVIECLLRALQEYTLDNRGDIGAWVREAAMSSL 875
            ...:.|::::.:|||..  |..|.....:|.::|...||..:.:||.|:|||:|||||||:|:||
  Rat   819 RDGLKAISRICQTVGVNTQGPPDEVICQENISEVYAALLGCMSDYTTDSRGDVGAWVREASMTSL 883

  Fly   876 YE---IVTTCPPDLLAPEQVHEIVVGFMQQAVEKIDRTRGLGGRLCCQLIH-HQPRIPYIREHSK 936
            .:   ::....|.|:.......::....|||.|||||.|....|:...|:| ..|.||::....:
  Rat   884 MDLMLLLAQTEPVLIEAHICERVMCCVAQQASEKIDRFRAHAARVFLTLLHFDSPPIPHVPHRKE 948

  Fly   937 LLEIFP-ADADSVLWLFADHTFPLFCELLSLPDYSKRVLLGLSASIGQLTESLIKYASSALFHFL 1000
            |..:|| :|..:|.|......|||..:||.||.|...|||||:.|:|.||||.:::::.:||.::
  Rat   949 LESLFPRSDVATVNWNAPSQAFPLITQLLGLPTYRYHVLLGLAVSVGGLTESTVRHSTQSLFEYM 1013

  Fly  1001 R---SNPETVPRLCSEVVQIFEEHLLNERVTYPLLSFLDILIGSGTVESVLHDEANPFAEDIFRL 1062
            :   .:.:.:......::::||::|||:||:..||..||.|:.:|..:....:|.:||...:..|
  Rat  1014 KGIQKDAQVLESFSETLLKVFEDNLLNDRVSVSLLKMLDQLLANGCFDIFTAEENHPFCVKLLTL 1078

  Fly  1063 LNLEVKGYKKLYKTATSISAFCQLLQVP-RLSKRILSKLSVFLG---------------LQHVHV 1111
            ...|:|..|.:.|..:||:..|.::|.. .:.|::|.:|.:.||               |....:
  Rat  1079 CKEEIKKSKDIQKLRSSIAVLCGMVQFSGDVRKKVLLQLFLLLGHPFPVVLMAFPPVDLLFSFQI 1143

  Fly  1112 RKTAATKLYEALALHGDVTEVPEENMDEILTLLSETDWTQPLVEVRPLRNQLCQLMDIKPP 1172
            ||:.|:::||.:..:.|:  |..|.:||::::||:|.|...|..||..||.||.|:.:..|
  Rat  1144 RKSTASQVYEMVLTYSDL--VDAEVLDEVMSVLSDTAWDSELPVVRGQRNHLCDLLGVPRP 1202

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TBCDNP_608648.1 TFCD_C 24..>584 CDD:303064 277/576 (48%)
HEAT repeat 355..383 CDD:293787 15/27 (56%)
HEAT repeat 393..423 CDD:293787 17/29 (59%)
TFCD_C 890..1075 CDD:289385 62/189 (33%)
TbcdXP_006247923.1 TFCD_C 35..>888 CDD:303064 379/888 (43%)
TFCD_C 901..1091 CDD:289385 62/189 (33%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166338248
Domainoid 1 1.000 673 1.000 Domainoid score I133
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG2116
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H4368
Inparanoid 1 1.050 827 1.000 Inparanoid score I434
OMA 1 1.010 - - QHG55142
OrthoDB 1 1.010 - - D79003at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004779
OrthoInspector 1 1.000 - - oto98398
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102599
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12658
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X3933
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1514.810

Return to query results.
Submit another query.