DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ds and Dchs2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001285551.1 Gene:ds / 33245 FlyBaseID:FBgn0284247 Length:3556 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017446779.1 Gene:Dchs2 / 310550 RGDID:1563329 Length:3348 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3638 Identity:1171/3638 - (32%)
Similarity:1766/3638 - (48%) Gaps:512/3638 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    56 RSSLLILLAIVLLGSSQAASHDQERERKLEVFEGVAVDYQIGYI-------------GDFGGIDS 107
            :||||.......|.::..:| .|.....|.|.||:..|..:|.|             |.|...||
  Rat    28 QSSLLRFFVHAWLWAASGSS-AQVFNLSLSVDEGLPPDTLVGDIRAGLPAAQQEEGNGFFLSEDS 91

  Fly   108 GPPYIIVAEAGVETDLAIDRATGEIRTKVKLDRETRASYSLVAIPLSGRNIRVLVTVKDENDNAP 172
            .       ::.:..|..:...||.|||..:||||.|..||.||..|.|..::|.:.|.|.||::|
  Rat    92 D-------DSPLLDDFHVHPDTGIIRTARRLDRERRDHYSFVAATLLGEVVQVEIRVNDVNDHSP 149

  Fly   173 TFPQTSMHIEFPENTPREVKRTLLPARDLDLEPYNTQRYNIVSGN------VNDAFRL------- 224
            .||:.|:.::..|.:|......|..|:|.|...::.|.|.::..:      ....|:|       
  Rat   150 RFPRDSLQLDVSELSPPGTAFRLPGAQDPDAGLFSIQGYTLLQASDLPQDPAGPFFQLRYGTPGL 214

  Fly   225 ----SSHRERDGVLYLDLQISGFLDRETTPGYSLLIEALDGGTPPLRGFMTVNITIQDVNDNQPI 285
                |.......:..|||.:...||||....:.|.|||.|||:|...|.:.|.:.:.|.|||.|:
  Rat   215 PASPSLPASLSPLEPLDLVLLRRLDREAAAAHELHIEAWDGGSPRRTGLLHVQLRVLDENDNPPV 279

  Fly   286 FNQSRYFATVPENATVGTSVLQVYASDTDADENGLVEYAINRRQS----------DKEQMFRIDP 340
            |.|..|.|.|.|:|..|..|.:|.|:|.|...||||.|:|..||.          .....|.::.
  Rat   280 FEQGEYRAAVREDAQPGAEVCRVRATDRDLGPNGLVRYSIRERQGPVAGTGGGPPGDPGYFSVEE 344

  Fly   341 RTGAIYINKALDFETKELHELVVVAKDHGEQPLETTAFVSIRVTDVNDNQPTINVIFLSDDASPK 405
            .:|.:.:.:.||.|.:..|:|||.|:|.|.:|...|..|||.|.|||||.|.|:::||::..:.:
  Rat   345 LSGVVRVQRPLDREEQSWHQLVVQARDGGAEPEVATVRVSIDVLDVNDNPPAIHLLFLTEGGTAQ 409

  Fly   406 ISESAQPGEFVARISVHDPDSKTE---------------YANVNVTLNGGDGHFALTT-RDNSIY 454
            :||.|:||::||||||.|.|...|               ..:..::|.||:|.|||.. ....::
  Rat   410 VSEGARPGDYVARISVSDADGDPENEEEAEGVLDARLLGAGSTKLSLEGGNGAFALRPGGPPGVF 474

  Fly   455 LVIVHLPLDREIVSNYTLSVVATDKGTPPLHASKSIFLRITDVNDNPPEFEQDLYHANVMEVADP 519
            .:.....||||....|.|.:||||.|:|||...:|:.|.::|:||.||.|..:.|.|:|.|.|.|
  Rat   475 FLCTESLLDRESQDLYELRLVATDAGSPPLSTEESLLLWVSDLNDQPPVFSLEHYWASVSEAAVP 539

  Fly   520 GTSVLQVLAHDRDE-GLNSA-LTYSLAE----------TPETH-AQWFQIDPQTGLITTRSHIDC 571
            ||||:.|.|.|.|: |.:.| |.|:|.:          :|:.. ...|.|:|..|||:|...:|.
  Rat   540 GTSVVWVSALDADQAGTDHARLRYALVQLSDPCESEALSPKAECVPSFSINPDNGLISTTRALDR 604

  Fly   572 ETEPVPQLTVVARDGGVPPLSSTATVLVTIHDVNDNEPIFDQSFYNVSVAENEPVGRCILKVSAS 636
            |.:...:|.|||:|.|.||||:|..|.:::.|||||||:|.:..|||:|||:..:|.|.|:|.||
  Rat   605 EVQETVELRVVAQDLGEPPLSATCLVSISVDDVNDNEPVFRRQVYNVTVAEHSALGHCFLQVKAS 669

  Fly   637 DPDCGVNAMVNYTIGEGFKHL---TEFEVRSASGEICIAGELDFER-RSSYEFPVLATDRGGLST 697
            |.|.|:..:|.|::.:||:..   ..|::....|.||::.::|.|| ..:::..|.|.|.||||.
  Rat   670 DADAGLYGLVQYSLYDGFQSYEAPPAFQIDPQDGRICVSQDIDRERDPGTFDLLVKAKDGGGLSA 734

  Fly   698 TAMIKMQLTDVNDNRPVFYPREYKVSLRESPKASSQASSTPIVAVVATDPDYGNFGQVSYRIVAG 762
            .|.:::::.|||||.|||.|..|..|:     :......|.|:.|:|:|.|.|.:|.|:|.::.|
  Rat   735 QAFVRVEVEDVNDNYPVFNPSTYVTSI-----SGQTPPGTEIINVLASDRDSGIYGTVAYELIPG 794

  Fly   763 NEAGIFRIDRSTGEIFVVRPDMLSVRTQPMHMLNISATDGGNLRSNADAVVFLSIIDAMQRPPIF 827
            :::.:|.||.:||.|::.  ..||........|.:.|.|||.|.:..:|.|.:.:......|..|
  Rat   795 DQSSLFTIDSTTGIIYLT--STLSHLEATTLFLMVCARDGGGLTAANNADVTIHVTQTTLAPAEF 857

  Fly   828 EKARYNYYVKEDIPRGTVVGSVIAASGDVAHRSPVRYSIYSGDPDGYFSIETNSGNIRIAKPLDH 892
            |:.:|.:.|.||:|..|:||:| .|...:.....:.|.|.|||.:|.|||....|.||..|||||
  Rat   858 ERPKYTFSVYEDVPEDTLVGTV-KARESLNSSEAITYRISSGDLEGKFSIHRWLGTIRTLKPLDH 921

  Fly   893 EAKSQVLLNIQATLGEPPVYGHTQVNIEVEDVNDNAPEFEASMVRISVPESAELGAPLYAAHAHD 957
            ||:..|:|.:||.||..|....|:|||.|.|||||.|||..:...|.:..:...|..||.|.|.|
  Rat   922 EAQPMVVLTVQAQLGSSPACSSTEVNITVMDVNDNRPEFPTASDEIRISLTTAPGTALYLARAVD 986

  Fly   958 KDSGSSGQVTYSLVKESGKGLFAIDARSGHLILSQHLDYESSQRHTLIVTATDGGVPSLSTNLTI 1022
            :|||.:|.|.|| :..|....|::|...|.|.|.:.|......|.||:  |.|.|||..::.|.:
  Rat   987 RDSGLNGLVRYS-IANSQPSEFSMDQGRGVLYLRESLGSHGDFRLTLV--AKDQGVPPQASQLVL 1048

  Fly  1023 LVDVQDVNDNPPV-FEKDEYSVNVSESRSINAQIIQVNASDLDTGNNARITYRIVDAGVDNVTNS 1086
            .|.::.....|.: ||...|.|.||||..::.||:||.|..|...:.|           ..:.:|
  Rat  1049 TVVIESQEGIPAIAFENLVYQVEVSESLPLSTQILQVQAYPLSPWHPA-----------SKIIHS 1102

  Fly  1087 ISSSDVSQHFGIFPNSGWIYLRAPLDRETRDRYQLTVLATDNGTP-AAHAKTRVIVRVLDANDND 1150
            ::.|..|..|.|.|.:||||||..||.|:...|:..|.|...|.. ..:....|||.|||.||:.
  Rat  1103 LAVSVDSAVFRIHPRTGWIYLRRQLDYESTQTYKFRVFAQIPGDRLLQNVSALVIVHVLDENDHS 1167

  Fly  1151 PKFQKSKYEFRIEENLRRGSVVGVVTASDLDLGENAAIRYSLLPINSSFQVHPVTGEISTREPLD 1215
            |.|.::|....|||:.....|:|.:||.|.|.|:|..:.|.||.....|:::|.|||:.....||
  Rat  1168 PAFLQNKVFLNIEESPIPLGVMGRMTAIDADSGKNGQLSYFLLTDGKFFKMNPNTGELINWSALD 1232

  Fly  1216 RELRELYDLVVEARDQGTPVRSARVPVRIHVSDVNDNA---PEIADPQEDVVSVREEQPPGTEVV 1277
            ||.:..:.:.|...|.|:|.|:|.:.|.:.::|:|||.   |:....:|......|.||..|.|.
  Rat  1233 REHQAHHHMTVLVTDHGSPPRNATMLVYVTITDINDNRPFFPQCLPGKEFHFKALEGQPVNTLVT 1297

  Fly  1278 RVRAVDRDHGQNASITYSIVKGRDSDGHGLFSIDPTSGVIRTRVVLDHEERSIYRLGVAASDGGN 1342
            .:.|.|.|.|.:|.:||||    .||....|.||..:|.|||..:|.|:.|..||:.|.|||.|.
  Rat  1298 TIFAKDLDEGLSAELTYSI----SSDYPAHFKIDANNGEIRTTTILSHDYRPSYRMTVIASDHGV 1358

  Fly  1343 PPRETVRMLRVEVLDLNDNRPTFTSSSLVFRVREDAALGHVVGSISPIERPADVVRNSVEESFED 1407
            ||.:...::.::|:.|:..| .|.|.:          :.|:|  |....:||.:           
  Rat  1359 PPLQGQAVINIQVIPLSKGR-NFMSQN----------IRHLV--IPENTKPAKI----------- 1399

  Fly  1408 LRVTYTLNPLTKDLI------------EAAFDIDRHSGNLVVARLLDREVQSEFRLEIRALDTTA 1460
            :.:|.:.:|..:|..            :..|:||..:|:|.:.:.||.|:.|.:.  ||.:....
  Rat  1400 MSLTKSPDPFQQDHSGKSHFSVVAEDKDDHFEIDSLTGDLFLTKELDYEMTSHYL--IRVISKDH 1462

  Fly  1461 SNNPQ-SSAITVKIEVADVNDNAPEWPQDPIDLQVSEATPVGTIIHNFTATDADTGTNGDLQYRL 1524
            |.:|. :|.:.:.|:|.|.|:::|.:....|.:.:.|..||||:::.|.|.|.|    |......
  Rat  1463 SRSPAWNSTVFLSIDVEDQNEHSPSFQDGFIVISIEENVPVGTLVYVFNAKDGD----GSFLNSR 1523

  Fly  1525 IRYFPQLNESQEQAMSLFRMDSLTGALSLQAPLDFEAVQEYLLIVQALDQSSNVTERLQTSVTVR 1589
            ::||.   ||.....|.|.:...:|||...:|||.|.|..::|.:.|.||:.|||:|...|:...
  Rat  1524 VQYFA---ESSYIGTSSFLIHPSSGALVTASPLDRENVPTFILTITASDQAVNVTDRRWRSLVAE 1585

  Fly  1590 LRILDANDHAPHFVS-PNSSGGKTASLFISDATRIGEVVAHIVAVDEDSGDNGQLTYEITGGNGE 1653
            :.|||.|||:|.||| |.:        ::.:...:|.||..:.|.|.|:..||.:.|.|..||.:
  Rat  1586 VVILDVNDHSPTFVSYPIT--------YVREDAEVGSVVHRLSAQDPDAEKNGDVAYSILSGNED 1642

  Fly  1654 GRFRINSQTGIIELVKSLPPATEDVEKGGRFNLIIGAKDHGQPEPKKSSLNLHLIVQGSHNNPPR 1718
            ..|.::|.:.  .|:::..|.  |.|...:..|.|.|:|.|.| .:.||..|.:.|...::..|.
  Rat  1643 MVFVLDSSSA--GLLRTACPL--DYEVKAQHVLTIVAQDGGVP-TRSSSQTLTVTVLDVNDETPV 1702

  Fly  1719 FLQAVYRATILENVPSGSFVLQVTAKSLHGAENANLSYEIPAGVANDLFHVDWQRGIITTRGQFD 1783
            |.|.:|:|::.||...|:||.:|.|:.:....|:...:||..|.|..||.::...|.:.|...||
  Rat  1703 FKQLLYKASVKENQSPGAFVTRVEAEDMDSGVNSKCRFEIMPGPAFGLFEINPDTGEVVTTVTFD 1767

  Fly  1784 RESQASYVLPVYVRDANRQSTLSSSAVRKQRSSDSIGDTSNGQHFDVATIYITVGDVNDNSPEFR 1848
            ||:|..:.|.|.|||....| |||:                      |.|..|:.|.||::||. 
  Rat  1768 REAQGIFRLQVLVRDGGVPS-LSST----------------------AAIVCTIEDENDHTPEL- 1808

  Fly  1849 PGSCYGLSVPENSEPGVIHTVVASDLDEGPNADLIYSITGGNLGNKFSIDSSSGELS-ARPLDRE 1912
            ....:.:.:|||.||.|::||:|.|||.|.|..:.|.||.||....|:|..:||||| .|.||||
  Rat  1809 IALHHDIEIPENQEPEVVYTVLAFDLDAGNNGAVTYHITEGNTDEYFAIHKTSGELSTTRALDRE 1873

  Fly  1913 QHSRYTLQIQASDRGQPKSRQGHCNITIFVEDQNDNAPRFKLSKYTGSVQEDAPLGTSVVQISAV 1977
            |.:.:||.|..||.|.| .|.....:.:.|.|.||::|.|.:..|..:|:|||.:||.|:.:|||
  Rat  1874 QTNNFTLTILCSDLGNP-PRSSAVQLRVRVLDDNDHSPAFPMLHYQSAVREDAEVGTVVLVLSAV 1937

  Fly  1978 DADLGVNARLVYSLANETQWQFAIDGQSGLITTVGKLDRELQASYNFMVLATDGGRYEVRSATVP 2042
            |.|.|:|.::.|.|..||...||||..:|.:.|.|.||||.::.|.|..:|.|......:||.:.
  Rat  1938 DKDEGLNGQVEYFLMEETSGAFAIDPVTGTLRTSGALDREARSQYTFQAVARDCSTRGAKSARLT 2002

  Fly  2043 VQINVLDINDNRPIFERYP---YIGQVPALIQPGQTLLKVQALDADLGANAEIVYSLNAENSAVS 2104
            :.|.|.|.|||.|::|..|   :|...|||   .||:::::|.|.|.|.|..:.:|. ||..:| 
  Rat  2003 ILIAVTDANDNDPVWEENPVDAFIAPTPAL---NQTIVRLRAKDPDAGPNGTVTFSF-AERQSV- 2062

  Fly  2105 AKFRINPSTGALSASQSLASESGKLLHLEVVARDKGNPPQSSLGLIELLIGEAPQGTPVLRFQNE 2169
              |.|:..||.:...|:.:||... :.:::.|.|:|||.::::|   |::....:....|.|.:.
  Rat  2063 --FSIDEYTGEIKLQQNPSSEHFP-MWVQLKATDQGNPARATVG---LMVVHMEREDVKLSFSHR 2121

  Fly  2170 TYRVMLKENSPSGTRLLQVVALRSDGRRQKVQFSFGAGNEDGILSLDSLSGEIRVNKPHLLDYDR 2234
            .|..::.||...||.::.|.|.........:::|..:|||||:.||.|.||::.|.:|.|||:: 
  Rat  2122 LYTGLVTENCEPGTSVVTVKAFVPVSIPDSIKYSVFSGNEDGVFSLGSNSGQLIVEEPRLLDFE- 2185

  Fly  2235 FSTPSMSALSRGRALHYEEEIDESSEEDPNNSTRSQRALTSSSFALTNSQPNEIRVVLVARTADA 2299
                                            .||                 |:|::::   ||.
  Rat  2186 --------------------------------VRS-----------------EVRLIVL---ADN 2198

  Fly  2300 PFLASYAELVIELEDENDNSPKFSQKQFVATVSEGNNKGTFVAQVHAFDSDAGSNARLRYHIVDG 2364
            ....::.::.:.:.|.|||.|:|:|..:.|:||||......|.||.|.|.|.|.|:::.|.||.|
  Rat  2199 NGHKAFTKVAVSIRDRNDNPPRFAQTVYQASVSEGQFYSAHVIQVSATDLDGGLNSQIEYSIVSG 2263

  Fly  2365 NHDNAFVIEPAFSGIVRTNIVLDREIRDIYKLKIIATDEGVPQMTGTATIRVQIVDVNDNQPTFP 2429
            |...||.|: ..||::.||.:||.|....|.|.:.|||.|||:::.||.:::|::|||||.|.|.
  Rat  2264 NQAGAFRID-ELSGVIVTNSILDYESTSSYSLIVQATDRGVPRLSDTAMVKIQVIDVNDNAPVFL 2327

  Fly  2430 PNNLVTVSEATELGAVITSISANDVDTYPALTYRLGAESTVDIENMSIFALDRYSGKLVLKRRLD 2494
            |:..|.::|.:..|.:::.:|.:|.|..||.|:.|..||....:    ||:.:.:|.:||...||
  Rat  2328 PSEAVEIAENSLPGIIVSRVSIHDADLNPAFTFSLVKESNSGAK----FAISQDTGVVVLVETLD 2388

  Fly  2495 YELQQEYELDVIASDAAHEARTVLTVRVNDENDNAPVFLAQQPPAYFAILPAISEISESLSVDFD 2559
            :|...||||.:..||:.|.....|.:.|.|.|||.|||...   .|.|::|      |.:...:.
  Rat  2389 FEEVTEYELIIRVSDSGHHTEGSLVIHVLDVNDNPPVFTQD---FYQAVVP------ELIPGGYM 2444

  Fly  2560 LLTVNATDADSEGNNSKVIYIIEPAQEGFSVHPSNGVVSVNMSRLQPAVSSSGDYFVRIIAKDAG 2624
            :||::|||.:|.||   :.|.|....|||::.|.||.:....|...|.......:.|.  |.|.|
  Rat  2445 VLTLSATDLESSGN---ISYRILSPPEGFAIDPRNGTIFTTDSLSLPEKIPILRFLVE--ASDGG 2504

  Fly  2625 KPALKSSTLLRVQANDNGSGRSQFLQNQYRAQISEAAPLGSVVLQLGQDALDQSL-------AII 2682
            .|:|::.|.:.::..|..:...:|....|...:||.||:||.::.......|.|.       :||
  Rat  2505 IPSLRALTSVEIEIQDVNNYAPEFTVGSYNLSLSEDAPIGSTLMTFSTIDHDYSFENTHTEYSII 2569

  Fly  2683 AGNEESAFEL-----------LQSKAIVLVKPLDRERNDLYKLRLVLSHPHG-PPLISSLNSSSG 2735
            :||..:.|.:           .:|.|:||:..||||.:..::| ::|:..|| |||.|:      
  Rat  2570 SGNLHNYFHIETSLLGSESPHQKSGALVLLHALDREASASHRL-VILASDHGCPPLTST------ 2627

  Fly  2736 ISVIITILDANDNFPIFDRSAKYEAEISELAPLRYSIAQLQAIDADQENTPNSEVVYDITSGNDE 2800
            ..|:|.:||.|||.|.|. |.:|...:.|..|:...|..:.|.|.|..:  :::::|.|.|||::
  Rat  2628 SVVVIKVLDINDNAPTFS-SRQYHTHVKESTPVGSHITMVSADDRDTGS--HAQIIYGIISGNEK 2689

  Fly  2801 HMFTIDLVTGVLFVNNRLDYDSGAKSYELIIRACDSHHQRPLCSLQPFRLELHDENDNEPKFPLT 2865
            ..|.::..||||::...|||:. ..::.|.|:|.|...:.  .|.....:.:.|:||:.|:|..:
  Rat  2690 EHFYLEDRTGVLYLVKPLDYEE-TTAFTLTIQAADEEEKH--VSFAAVHISVLDDNDHTPQFLSS 2751

  Fly  2866 EYVHFLAENEPVGSSVFRAHASDLDKGPFGQLNYSI--------GPAPSDESSWKMFRVDSESGL 2922
            .....:.||.||.|::...||.|.|.||:|::.|||        |..|..    .:|.:|..:|.
  Rat  2752 TLACVIPENLPVLSTICSVHALDFDAGPYGEVTYSILSPCLVTHGMHPYQ----GLFVIDPLTGD 2812

  Fly  2923 VTSAFVFDYEQRQRYDMELLASDMGGKKASVAVRVEIESRDEFTPQFTERTYRFVLPAAVALPQG 2987
            :.:..|.|||....|...:.|.|.||..||:.|.||:|..|||.|.||:..|.|.||..   .||
  Rat  2813 IHTEQVLDYESVSEYCFLVQARDRGGASASLEVWVEVEGIDEFEPIFTQDQYFFSLPEK---GQG 2874

  Fly  2988 -YVVGQVTATDSDSGPDGRVVYQLSAPHSHFKVNRSSGAVLIKRKLKLDGDGDGNLYMDGRDISL 3051
             .::|:|.|:|:|:|.||.|:|.|..|.:.|.||:::|.:.:.|                  ..|
  Rat  2875 QQLIGRVEASDADAGVDGVVLYSLRTPSTVFSVNKTNGNIYLVR------------------APL 2921

  Fly  3052 VISASSGRHNSLSSMAVVEIALDPLAH---PGTNLASAGGSSSGS------------IGDWAIGL 3101
            :||:...:.::|      |:.:  :||   ||:...|.....:.|            :..::|.|
  Rat  2922 LISSQFNKEDTL------EVKI--IAHSPKPGSKSTSCSVFVNVSLPAEGRHHRTVLVHSFSISL 2978

  Fly  3102 LVA---FLLVLCAAAGIFLFIHMRSRKP-------RNAVKPHLATDNAGVGNTNSYVDPSAFDTI 3156
            :|:   ||.::|..  |.|.:..:.:.|       :....|.  .|:...|.|:..  .:..:|.
  Rat  2979 VVSLLVFLSLVCTL--IVLILRHKQKDPLHSYEEKKTPASPE--ADSRLTGATSEL--KAGQETA 3037

  Fly  3157 PIRGSISGGAAGAASGQFAPPKY---------DEIPPFGAHAGSSGAATTSELSGSEQSGSSGRG 3212
            ..|| ::|      .|:..|.::         |.|..| .|...||..:.               
  Rat  3038 EYRG-LTG------PGEVMPAEWLNLMSVMEKDIIHIF-RHPNCSGHCSV--------------- 3079

  Fly  3213 SAEDDG---EDEEIRMINEGPLHHRNGGAGAGSD-DGRISDISVQNTQEYLARLGIVDHDPSGAG 3273
                ||   ||:||:.|||.|  :|.....|.|| ..|:.|..:....:.|:.|          .
  Rat  3080 ----DGETAEDKEIQRINENP--YRKDSDSALSDGSSRVPDSGIPRDSDQLSCL----------S 3128

  Fly  3274 GGASSMAGSS--HPMHLYHDDDATARSDITNLIYAKLNDVTGAGSEIGSSADDAGTTAGSIGTIG 3336
            .....|.||.  ...|::   |.....:..:.||.:.|          :|:.....|||.:    
  Rat  3129 EETDVMTGSEVIEASHMF---DGGVGEEGCDTIYVQNN----------TSSPRREATAGVM---- 3176

  Fly  3337 TAITHGHGVMSSYGEVPVPVPVVVGGSNVGGSLSSIVHSEEELTGSYNWDYLLDWGPQYQPLAHV 3401
             |.:.....|....|.....|            |:...|::::.||:.|||.|.|.|::|.||.|
  Rat  3177 -AESRKESFMLGNQEGRYSAP------------STQTTSDDDVRGSHAWDYFLSWEPKFQHLASV 3228

  Fly  3402 FSEIARLKDDTLSEHSGSGASSSAKSKHSSSHSSAGAGSVVLKPPPSAP--PTHI-PPPLLTNVA 3463
            |::||||||    |||                           ..|..|  .|.: ||||:|.||
  Rat  3229 FNDIARLKD----EHS---------------------------QVPGIPKDTTFVFPPPLITAVA 3262

  Fly  3464 PRAIN-LPMRLPP-HLSLAPAHLPRSPIGHEASGSFSTSSAMSPSFSPSLSPLATRSPSISPL 3524
            ...|. :|.|:|. .||......||||:.:...   |...||:|:||||||.|..::|:.||:
  Rat  3263 QPGIKAVPPRMPAVTLSQVLQKFPRSPLPYHGG---SLPEAMTPNFSPSLSLLTMQTPARSPV 3322

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
dsNP_001285551.1 CA 111..172 CDD:214520 22/60 (37%)
Cadherin_repeat 178..282 CDD:206637 31/120 (26%)
Cadherin_repeat 291..389 CDD:206637 40/107 (37%)
Cadherin_repeat 406..500 CDD:206637 39/109 (36%)
Cadherin_repeat 509..607 CDD:206637 44/110 (40%)
Cadherin_repeat 616..711 CDD:206637 37/98 (38%)
Cadherin_repeat 719..820 CDD:206637 29/100 (29%)
Cadherin_repeat 832..927 CDD:206637 44/94 (47%)
Cadherin_repeat 937..1032 CDD:206637 31/94 (33%)
Cadherin_repeat 1040..1149 CDD:206637 39/109 (36%)
Cadherin_repeat 1158..1252 CDD:206637 32/93 (34%)
Cadherin_repeat 1263..1361 CDD:206637 37/97 (38%)
Cadherin_repeat 1369..1481 CDD:206637 26/124 (21%)
Cadherin_repeat 1489..1598 CDD:206637 38/108 (35%)
Cadherin_repeat 1614..1710 CDD:206637 27/95 (28%)
Cadherin_repeat 1723..1843 CDD:206637 37/119 (31%)
Cadherin_repeat 1853..1948 CDD:206637 43/95 (45%)
Cadherin_repeat 1957..2053 CDD:206637 40/95 (42%)
Cadherin_repeat 2061..2154 CDD:206637 30/95 (32%)
Cadherin_repeat 2170..2318 CDD:206637 31/147 (21%)
Cadherin_repeat 2326..2424 CDD:206637 42/97 (43%)
Cadherin_repeat 2434..2528 CDD:206637 31/93 (33%)
Cadherin_repeat 2549..2641 CDD:206637 26/91 (29%)
Cadherin_repeat 2652..2748 CDD:206637 35/114 (31%)
Cadherin_repeat 2758..2858 CDD:206637 27/99 (27%)
Cadherin_repeat 2866..2960 CDD:206637 34/101 (34%)
Cadherin_repeat 2985..3071 CDD:206637 23/86 (27%)
Dchs2XP_017446779.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D23733at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001195
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100175
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.910

Return to query results.
Submit another query.