DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kis and Chd7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001137761.1 Gene:kis / 33185 FlyBaseID:FBgn0266557 Length:5517 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001101376.2 Gene:Chd7 / 312974 RGDID:1311921 Length:2985 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4459 Identity:1247/4459 - (27%)
Similarity:1719/4459 - (38%) Gaps:1697/4459 - (38%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   655 GN--SSGATGGAQNQHQQQPQLAAMSSPLHQQN---------LPNMHHLIQPTMETTQPT----- 703
            ||  |.|..|..:..:.:.|     .:|:.||.         .|::|| ..|....|:.|     
  Rat    14 GNIFSEGLEGLGECGYPENP-----VNPMGQQMPIDQGFPSLQPSLHH-PSPNQNQTKLTHFDHY 72

  Fly   704 QQQQQTSQQQQQPQQ-----PQATLTSPHHQQMQHQSPIHQQQQSPH----------------HQ 747
            .|.:|......||.:     |...|.|||.|  .|..|:   .|.||                :.
  Rat    73 NQYEQKMHLMDQPNRMMGSAPGNGLASPHSQ--YHTPPV---PQVPHGGGSGGGQMGVYPGMQND 132

  Fly   748 QHLPSYNQSQQQFDPFANILGDNQPAASQQTMSPAHVSSPVPAQ-----MQQQ-QHQTQQQPSQQ 806
            :|..|:......:.|.|..:.| |..|..|...|....|..|||     |||. .:..:...|.|
  Rat   133 RHGQSFVDGGSMWGPRAVQVPD-QIRAPYQQQQPQPAPSGPPAQGHPQHMQQMGSYLARGDFSMQ 196

  Fly   807 VPQSQQQQVSQPQQQTQQQQP----STPSHHLSSILNETANSNDSSTLAVAANDSNNSSSNSSTN 867
            .||.:..|.||.|:...|..|    |.|..|||.:..::.|...|....|...            
  Rat   197 QPQQRMSQFSQGQEGLSQGSPFIATSGPGGHLSHMPQQSPNIAPSLRHPVQQQ------------ 249

  Fly   868 SIVNNQPTSVHDSNSQSSINSSSNNQQQLLMDNTNSHGGNSESAQNAGVDVGLFDNNSMSSNSAA 932
              .::.|.::|..:...|...|.|..||         |.......|            .||.|..
  Rat   250 --FHHHPAALHGESVAHSPRFSPNPPQQ---------GAVRPQTLN------------FSSRSQT 291

  Fly   933 VAAVASNAASAAAALLDSNSQSSNAEFEKNQSEGEGLGVVEGVIANETDLPQDENSVSKTQDITL 997
            |.:...|         :|...|.......||      |:|              ||....|::.|
  Rat   292 VPSPTVN---------NSGQYSPYPYRNLNQ------GLV--------------NSTGMNQNLGL 327

  Fly   998 STELPTIQDDLQEKPTAEMEQTQLGQSLGDLSKSLLEEPKTVEESGEDKSQSAPGVAPPADPIIP 1062
            :...| :...:...|.|....:..||.|      :|::|  :..|| ..:|.......|:.|...
  Rat   328 TNSTP-MNQSVPRYPNAVGFPSNSGQGL------MLQQP--IHSSG-SLNQMNTQTMHPSQPQGT 382

  Fly  1063 VTQPPQQQMPPIGMPMHPIAPGYEAQAQGQGHMPPMM-PPYGGAP---GMYP--PYPMLHQQEIA 1121
            ...||         ||.|:    :|.:...|..||.: |...|.|   |.||  |:|....|   
  Rat   383 YASPP---------PMSPM----KAMSNPAGTPPPQVRPGSAGIPMDVGSYPNMPHPQPSHQ--- 431

  Fly  1122 ALQQQIQELYCMPPG-----------HELQHQDKLMRMQERLNLLTQHEVNDQCAG----GPQCL 1171
                        |||           ..:|.....|.|......||.|...:.|.|    ..|.:
  Rat   432 ------------PPGAMGIGQRNMGPRNIQQPRPFMGMSSTPRELTGHMRPNGCPGVGLADAQAI 484

  Fly  1172 LFQNVPPMYGPPGNPLLNQQMVESPQVSSTTGRGRGKSANKPRKPRAK-------KGEKAQVGQQ 1229
            ..:.:|....|...|.. ||:...|.:....|..:....:...:|.|:       ..:|..|.|.
  Rat   485 QERLIPGQQHPGQQPPF-QQLPTCPPLQPHPGLHQSSPPHPHHQPWAQLHPSPQNTPQKVPVRQH 548

  Fly  1230 Q-----------DLMDISGNVAMGAANAVSSIPTTQLPVSEDCVTQ-----------------GA 1266
            .           |:..:||..|             ||..|:|.:..                 .|
  Rat   549 SPSEPFLEKPVPDMTQVSGQNA-------------QLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIAA 600

  Fly  1267 GDTSV-VGMLEYSEGMGDLSQDVHSANELDTSTDGSGKKKKPRKPRTPKDPNKPPRDRTPKA-KK 1329
            ||.|. .|..::..|:.  :|:: |.|.||.|.:.:.|:|:|:..:.||:..:|...:.||. |.
  Rat   601 GDPSKGFGKDDFPGGVD--NQEL-SRNSLDASQEETKKRKRPKVKKDPKELKEPREKKEPKTPKA 662

  Fly  1330 PKDPNDPNSTETPAAVKKRAGASKRRKQYGEDGAEQTGEGSEVEDNKPLVPKAGSADGEAETTSG 1394
            ||.|.:|                |.||.                  |.:.||             
  Rat   663 PKTPKEP----------------KERKA------------------KTVTPK------------- 680

  Fly  1395 GTGVDGESPDYDDIPVSKIPRGSNEDEKEAEAGDETVDSVPDSAGDPASTPSRRDRKRSTARSRR 1459
                               |:.|.:...:.          |||                      
  Rat   681 -------------------PKSSKKSSNKK----------PDS---------------------- 694

  Fly  1460 NANSEEGGSARKNRGSLSAKALKKRRNRGRIVPESDG-EDDTLDRTPPPSPPPDSEMDS--NKRR 1521
                             .|.||||:.|:|:    ::| |:..||:||||||.|:.:.|.  .|||
  Rat   695 -----------------EASALKKKVNKGK----TEGSENSDLDKTPPPSPGPEEDEDPGVQKRR 738

  Fly  1522 SSRNTQRKKYIDDVMLRFSDDENSLLVASPVKKDKKPSANASNSNAGSDVEKTEPQSGAEGDAAQ 1586
            |||..:||:|.:|:..:.||:                                      |.|.|.
  Rat   739 SSRQVKRKRYTEDLEFKISDE--------------------------------------EADDAD 765

  Fly  1587 EVGEEKSNLPLDESSQLEASSSTSAVAEKERQISTDAANAAMSSKPNYVYINTGDEDSMVVQLVL 1651
            ..|.:                |.|..::.|:|.|.||                   :..||:.::
  Rat   766 AAGRD----------------SPSNTSQSEQQESVDA-------------------EGPVVEKIM 795

  Fly  1652 AMRMGKRELILDKPKEKAPEPKQDEEKSELDEATTDKPEGDEKFKTEGESKKDLTDSEETKLESS 1716
            :.|:.|                                                           
  Rat   796 SSRLVK----------------------------------------------------------- 801

  Fly  1717 AMEVDSKEESEPDDSKKSDEDNKDKDKMEVDDEVGKSDKESKPEEQSETVKTEENSKAIEEDKSS 1781
                                                                             
  Rat   802 ----------------------------------------------------------------- 801

  Fly  1782 TVLTADHAKEPETVLEKMEVDEKANDDQSAVSKAEGSDEKSTDDSNPEEATTEKNKESLEIEGEK 1846
                                                                 |.|||       
  Rat   802 -----------------------------------------------------KQKES------- 806

  Fly  1847 ERVKEGEESVKKENDEKTEADMENKPEPVFIDVEEYFVKYRNFSYLHCEWRTEEELLKGDRRVAA 1911
                 |||                      ::|||::|||:|||||||:|.:.|:|.| |:|:..
  Rat   807 -----GEE----------------------VEVEEFYVKYKNFSYLHCQWASVEDLEK-DKRIQQ 843

  Fly  1912 KIRRFQQKQSQQLNIFENIEDEPFNQDFTEVDRVLDMSVHTDETSGETTKHYLVKWKSLPYEDCT 1976
            ||:||:.||.|. .....|||:.||.|:.||||::|.:..||: .||...||||||.||||||.|
  Rat   844 KIKRFKSKQGQS-KFLSEIEDDLFNPDYVEVDRIMDFARSTDD-RGEPVTHYLVKWCSLPYEDST 906

  Fly  1977 WELEEDVDNDKIEQYLRFNKIPQRS-EWKSKKRPHPELWKKLEKTPVYKGGNSLRPYQLEGLNWL 2040
            |||.:|:|..|||:   |.|:..|. |.:..:||..:.|||.|.:..||..|.||.|||||:|||
  Rat   907 WELRQDLDQAKIEE---FEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWL 968

  Fly  2041 KFSWYNTHNCILADEMGLGKTIQSLTFVHSVYEYGIRGPFLVIAPLSTIPNWQREFEGWTDMNVV 2105
            .|:|||..||||||||||||||||:||::.:|..||.|||||||||||||||:|||..||::|||
  Rat   969 LFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVV 1033

  Fly  2106 VYHGSVTSKQMIQDYEYYYKTESGKVLKEPIKFNVLITTFEMIVTDYMDLKAFNWRLCVIDEAHR 2170
            |||||..|::.||.||.|:|...|:|:|...||:.:|||||||:||..:|:...||..|||||||
  Rat  1034 VYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHR 1098

  Fly  2171 LKNRNCKLLEGLRQLNLEHRVLLSGTPLQNNISELFSLLNFLEPSQFSSQEEFMSEFGSLRTEEE 2235
            ||||||||||||:.::|||:|||:||||||.:.||||||:|||||:|.|:..||.|||.|:|||:
  Rat  1099 LKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQ 1163

  Fly  2236 VNKLQALLKPMMLRRLKDDVEKSLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRGILEQNFSFLKKGTTSANIP 2300
            |.||||:||||||||||:||||:||||||||||||||||||||||.|||:||:||.||...||:|
  Rat  1164 VQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVP 1228

  Fly  2301 NLMNTMMELRKCCIHPYLLNGAEEQIQYDFKSQHGED-PESYYKNLILSAGKMVLIDKLLPKLKA 2364
            ||:||||||||||.||||:|||||:|..:||..|..| |:...:.:|.:|||:||||||||||||
  Rat  1229 NLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKDAHNADSPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKA 1293

  Fly  2365 NGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLVYRKYPFERIDGRIRGNLRQEAIDRYSKPGSDRFVFLLCTKAG 2429
            .|||||||||||||||||||||:.|:||:||||||:||||||.||||:|||.||||||||||:||
  Rat  1294 GGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAG 1358

  Fly  2430 GLGINLTAADTVIIYDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQRKMVKIYRLLCRNTYEREMFDKASMKLGL 2494
            |||||||||||.||:|||||||||||||||||||||.|.||||||:.||:||||||||||:||||
  Rat  1359 GLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGL 1423

  Fly  2495 DKAVLQSMNTQGSKDGNNKQLSKKEIEDLLKKGAYGAVMDDDNAGDKFCEEDIDSILKRRTQVIT 2559
            ||||||||:.:.:.....:|||||||||||:||||||:||:::.|.||||||||.||.|||..||
  Rat  1424 DKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTIT 1488

  Fly  2560 MESE-KGSTFSKASFAASGNRSDITIDDPDFWTKWAKKVDIDPDACERDETEDLVLSEPRRRTQI 2623
            :||| |||||:||||.|||||:||::|||:||.|||||.::|.||.  :...:||:..||.|.|.
  Rat  1489 IESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDAL--NGRNNLVIDTPRVRKQT 1551

  Fly  2624 KRYG---HEDVMELNSEESSNENSDEEGGIGLRSRRRKEKRDRAREKKGNDEYIPRERDALAALG 2685
            :.|.   .:::||.:..||.:|...     .::.||.::|..                       
  Rat  1552 RLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKP-----CIKPRRPQDKTQ----------------------- 1588

  Fly  2686 LEEIQYGNWAKSECFKVEKGLLSFGWGRWSELLELGQFKRGWRDVDVEDCARIILLYCLQVYKGD 2750
                   .:|:||||:|||.||.:|||||:::|..|::||...:.|||...|.||:|||..|:||
  Rat  1589 -------GYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEHDVETICRAILVYCLNHYRGD 1646

  Fly  2751 EKIKTFIWDLITPTEDGEVQKISRDHSGLHNLVPRGRNGGKSNKESTGVSTPAPGSASGSNSGNT 2815
            |.||:|||||||||.||:.:.: .:||||...|||||.|.|                        
  Rat  1647 ENIKSFIWDLITPTADGQTRAL-LNHSGLSAPVPRGRKGKK------------------------ 1686

  Fly  2816 TPAHKSSALDGSDKDSGGINASAVAAAVTSIHDPNHWSKKEKYDADAYLEGAYKKHLGRHANKVL 2880
                              :.|.::...|...    .|......|| .:.|.:|||||..|.||||
  Rat  1687 ------------------VKAQSMQPVVQDA----DWLASCNPDA-LFQEDSYKKHLKHHCNKVL 1728

  Fly  2881 LRVRMLYYIQHEVIGDFVQQIKDNTPISELPI-RPPPTPDQVPSSWWNPICCDKSLLVGTYKHGC 2944
            ||||||||::.|||||..::|.:....||..: .|.|...:||:.||:.. .|||||:|.:|||.
  Rat  1729 LRVRMLYYLRQEVIGDQAEKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKE-ADKSLLIGVFKHGY 1792

  Fly  2945 EMYRQMRADPNLCFVTHVGAGAAGDDLAVTSLPINEDDANSKHDDGDEVDDDGTTTTKDSDSTKL 3009
            |.|..|||||.|||:..||   ..|..|:.:                  :..||....|      
  Rat  1793 EKYNSMRADPALCFLERVG---MPDAKAIAA------------------EQRGTDMLAD------ 1830

  Fly  3010 TGGDNKDSLLDPERPSSSGKSSSENASGGNDKTESENDATTVSESSYKSEVLPGKGSDLDVSVAQ 3074
             |||                       ||....|.|:.....:.:.:|.|:              
  Rat  1831 -GGD-----------------------GGEFDREDEDPEYKPTRAPFKDEI-------------- 1857

  Fly  3075 QDALSATPELANTSDPKMNKNDAQVSASVSCDPADSSSPEAAGKAQGTGVQTGDAGELDIESEKK 3139
                   .|.||:  |..:|.|:.                   :||.||                
  Rat  1858 -------DEFANS--PPEDKEDSM-------------------EAQSTG---------------- 1878

  Fly  3140 DNEKETKESTGDAPAVEAKKDSAAIARAEGDKTESCTNNATTNISTTTTTTTITNTTTTTNNPSS 3204
                                                                             
  Rat  1879 ----------------------------------------------------------------- 1878

  Fly  3205 KAANSNNTTDHANSNSHLGLDEEESVAGSYPPTVAAVEDATTMWPSMQDLNTRLRRVITAYQRNY 3269
                     .|:.||:.||                     ...||:...|.|||||:||||||:|
  Rat  1879 ---------KHSESNAELG---------------------QLYWPNTSSLTTRLRRLITAYQRSY 1913

  Fly  3270 KKEELKLQQKAKLQALVSSTPPLSVPTTPTLQSMQMQLQSGSGSGGSGIGSSAQHDASGRSLQAL 3334
            |:::::                                                       .:||
  Rat  1914 KRQQMR-------------------------------------------------------QEAL 1923

  Fly  3335 MQSQGASTSAAAAAAASSAGGSCSGSGQVGMGGAGVMPAMPTAADISLMLSILNTTDVNQLANLD 3399
            |::                                                              
  Rat  1924 MKT-------------------------------------------------------------- 1926

  Fly  3400 INKLAMYLVSMNNKMERQGKMELAAKERE-----SQRLQLIPKKWNRREEYEFLRVLTGYGVDLH 3459
                        ::..|:.:.|:.|.|.|     |::.|    ||.||||.:|.||::.:||   
  Rat  1927 ------------DRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQ----KWTRREEADFYRVVSTFGV--- 1972

  Fly  3460 VSTPMASSNGSSLSPDWTKFKQMAHLERKSDETLTDYYKVFVAMCKRQAGL--KLSESERGLEGI 3522
            :..|:....      ||.:|:..|.|::||||:|..|:..|||||:|...:  |..:....|..:
  Rat  1973 IFDPVKQQF------DWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPAKPEDEPPDLASL 2031

  Fly  3523 IEEIEKEHAKLILDRLEVLAKLRE-VARNPMLEERLKLCTKNADTPDWWEPGRHDKELITAVLKH 3586
            ||.|.:|.|...|.|:|:|.|:|| |..:|.|.:|||||..:.|.|:|||.||||::|:....||
  Rat  2032 IEPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLSDRLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKH 2096

  Fly  3587 GLYRSETFIFNDPNFSFGESEKRFIRELEAQIQRTIKLEAFNAEKAEKLAAAEKDAATEKAAATE 3651
            |:.|::..|.|||..||.::.|.|.:...|....::...|....:|..:.|:        |.|.|
  Rat  2097 GVSRTDYHILNDPELSFLDAHKSFAQNRGASTVPSLNTLAMGFGQAPPVIAS--------AHAHE 2153

  Fly  3652 KAAAEKAASVKNEVIDLDDELMTNESVIKKESPVTPIKEEIKSEESPEKHDTADNLEDKNSDAEE 3716
            :...|:|                                                          
  Rat  2154 EKVMEQA---------------------------------------------------------- 2160

  Fly  3717 STKIKGKEDFNPETTEKEALDESTNLNKDKSSTETLVPEIEDSKPSEDKMEVEELPVAENGEKEG 3781
                                                                           ||
  Rat  2161 ---------------------------------------------------------------EG 2162

  Fly  3782 SPEKCSDAEDKKFSEEKPSSPAVPDGKVSEMEADEAAPNTEENCSGDSESPEKECEDKVVEKVEE 3846
            ..|:|..:..|:.|          |||..|.||. .|.::.:.|..::.|.:.|.  |.||...:
  Rat  2163 KAEECEHSPAKERS----------DGKEEEEEAG-GAKDSRQECEAEASSVKGEL--KGVEGSGD 2214

  Fly  3847 EKGENSYEKAEEQKEETEKLEKSSIESEPSEKSETVLEPEV-AVPKKSTGDQDI-LDLVAGPSDP 3909
            ...::..||..|:.|| |||       |..:|||...:||. ||.:..|.|::. ..:.....:.
  Rat  2215 PGSKSVSEKGSEEDEE-EKL-------EDDDKSEESSQPEAGAVSRGKTFDEESNASMSTARDET 2271

  Fly  3910 DDDEVMKEKEKAVEEECKKQAAELKARFPDLEVIQPATVKQQKLEKPKLEMCMIRWFKDFALERR 3974
            .|...|::.:.:|.:...::.                             .....|.||..:..|
  Rat  2272 RDGFYMEDGDPSVAQLLHERT-----------------------------FAFSFWPKDRVMINR 2307

  Fly  3975 IAHIVACVESGNWPVDSKYSAFATCKGATDLSIALHESIPHLSSLERRSTTPDVITITTDQGVTK 4039
            :.:|...|..|.||::.:                        ...:.:...|.....|.|..:.|
  Rat  2308 LDNICEAVLKGKWPINRR------------------------QMFDFQGLVPGYPPSTVDSPLQK 2348

  Fly  4040 H--LQTSHMQQVASSASAASTSSGVPQVTQSKPSSSNSLPGLDAKSINAAVAAAVAAAAAGGNAT 4102
            .  .:.|.:.|.:.|||...|:|  ||:  ||..:.|                            
  Rat  2349 RSFAELSMVSQASVSASEDITTS--PQL--SKDDALN---------------------------- 2381

  Fly  4103 SLSSLLPGMSLSAATGSSAGGVSGLSVPSAGSGVGKKRKRHIAIDVETERA-------KLHALLN 4160
                                    ||||.      ::|:|...:::|.|||       ::.|.|.
  Rat  2382 ------------------------LSVPR------QRRRRRRKVEIEAERAAKRRNLMEMVAQLR 2416

  Fly  4161 SSTMAPKDWESEIANMEALSGSSGRGRGGNSSASSGMQPPPAHQHASLSRQSSGQFSKPAVPAMK 4225
            .|.:..::.:.::.::...|      |...||.|:         .:||:       ||..:|.:.
  Rat  2417 ESQVVSENGQEKVVDLSKAS------REATSSTSN---------FSSLT-------SKFILPNVS 2459

  Fly  4226 TPPPSMGAPMDLSSSLPKMNMTEMLKSASSSGAIDLSEVQDFSMPSKKSSVHAALSSAFPSMGNK 4290
            ||          .|...|..| |:|::.             .|....:..::.:|....|.|..:
  Rat  2460 TP----------VSDAFKTQM-ELLQAG-------------LSRTPTRHVLNGSLVDGEPPMKRR 2500

  Fly  4291 SKLDDTLNKLMKKNNCTIEEPVIGKEKKRKKLDEIVLG-----LSA--AKEQKTFPD----PSLP 4344
            .                      |:.|..:.||.:.:.     |||  |:..|.|.:    |.:.
  Rat  2501 R----------------------GRRKNVEGLDLLFMSHKRTPLSAEDAEVTKAFEEDIETPPIR 2543

  Fly  4345 SSKKP-QIPPSVSVTPANLQSSSNQQSNQKPFTITVTTVPGKSKSGSSNSGSGTGGSSSASGGGA 4408
            :...| |:.|...:...||:..:.....:.|                                  
  Rat  2544 NIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEEAP---------------------------------- 2574

  Fly  4409 GGSGLSALQNMAMGGLSSKDSLNALLAQTMATDPQTFLKQQQKMMQFLPPAQRKAYENMLAEMEQ 4473
                            .:||.::.|                                        
  Rat  2575 ----------------KNKDLVDWL---------------------------------------- 2583

  Fly  4474 AMKISSKFSTNSPHDVKVNKWLSD-MTSPLGDQLSIDYVGGGGASGSGSGNSRRSNRQQGNSQQS 4537
              |:...::.:.|..|..|   :| :.||.                                   
  Rat  2584 --KLHPMYTVDMPSYVPKN---ADVLFSPF----------------------------------- 2608

  Fly  4538 SSAAQLQKQQQQQQQQQQQQQQHSMPGP-----QNLTGEEPVPVINKQTGKRLGGNKAPQLKRLM 4597
                           |:.:|::|....|     ..|||||.|||:||:.||::||..||.:|.|.
  Rat  2609 ---------------QKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLP 2658

  Fly  4598 QWLTENPNYEVDPKWLEQMQNPMSTPSPR-----PASMESGYGSSAVKSHGGRPLSNLSSTSSSS 4657
            :||.|||.:.|.|.|.:.::.....|...     ...:..|.|:|   ..|.||.|.::      
  Rat  2659 RWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVVRGEGAS---RRGRRPKSEIA------ 2714

  Fly  4658 HTQQQSSAAQSQAGGNSGSSKKNSRQQTAASAALDQAALQFGSLAGLNPSLLANL----PGLGAF 4718
                :::||.:.....||.   |.....:..|.:|..:||  :|..|....||.|    |||...
  Rat  2715 ----RAAAAAAAVASTSGI---NPLLVNSLFAGMDLTSLQ--NLQNLQSLQLAGLMGFPPGLATA 2770

  Fly  4719 -----DPKNPLAAFDPKNPLLSMSFGGMPGMGNIPGLGNLNNMNLFASLAGMGGLGNLAGMDTQS 4778
                 |.|.|.|..    ||:      :|||..:|        |:|    |:|||.|        
  Rat  2771 ATAGGDAKGPAAVL----PLM------LPGMAGLP--------NVF----GLGGLLN-------- 2805

  Fly  4779 LAALMAAAGPTLGGLTGASGGAGSGKSQAQSQSSATSSSSSASKKKQQQQQQQAQNEAAQLAAAI 4843
             ..|.||.|.|               :.|.||......:|.|.:|....:.:...:|.:  ..|:
  Rat  2806 -NPLSAATGNT---------------TTASSQGEPEDGTSKAEEKGNDNEDENRDSEKS--TDAV 2852

  Fly  4844 SASTGGSGASGGKNA-AASASQLAAGFPFLFPN--PSLLYP----PMGLGGLN----PYSLG-SS 4896
            ||:...:|:.|...| ||..|...|..|||...  |.|.||    |.|||||.    |...| .:
  Rat  2853 SAADSANGSVGAATAPAALPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQN 2917

  Fly  4897 GLGSAYDQLAQQYN---LLNGATSSASNTSSTQSKSHQS 4932
            .:|::.::.|.:..   ..:|.|...|:......|:.:|
  Rat  2918 AVGASEEKAADKAEGGPCKDGETLEGSDAEENLDKTIES 2956

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kisNP_001137761.1 Atrophin-1 221..>533 CDD:460830
Med15 <1056..>1265 CDD:312941 52/264 (20%)
PRK12678 1319..>1500 CDD:237171 28/182 (15%)
PTZ00121 <1419..1923 CDD:173412 81/506 (16%)
CD1_tandem_CHD5-9_like 1851..1918 CDD:349315 26/66 (39%)
CD2_tandem_CHD5-9_like 1937..1995 CDD:349310 31/57 (54%)
PLN03142 2029..>2606 CDD:215601 423/578 (73%)
PTZ00341 <3662..3887 CDD:173534 32/224 (14%)
BRK 4568..4611 CDD:462196 24/42 (57%)
Chd7NP_001101376.2 Med15 <2..>318 CDD:312941 84/379 (22%)
Atrophin-1 194..>567 CDD:460830 98/475 (21%)
CD1_tandem_CHD5-9_like 785..849 CDD:349315 35/294 (12%)
CD2_tandem_CHD5-9_like 868..925 CDD:349310 33/60 (55%)
PLN03142 956..>1555 CDD:215601 429/600 (72%)
BRK 2551..2592 CDD:462196 8/132 (6%)
BRK 2630..2674 CDD:197800 24/43 (56%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.