DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kis and Chd9

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001137761.1 Gene:kis / 33185 FlyBaseID:FBgn0266557 Length:5517 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038953982.1 Gene:Chd9 / 307726 RGDID:1306795 Length:2883 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4019 Identity:1148/4019 - (28%)
Similarity:1617/4019 - (40%) Gaps:1345/4019 - (33%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1136 GHELQ--HQDKLMRMQ-----------ERLNLLTQ---HEVNDQCAGGPQCLLFQ-----NVPPM 1179
            |.|.:  |.|.|..:|           |:||....   |:|| |..|.|...:..     |..|:
  Rat    42 GAEFEPLHIDSLNHVQGTPVHQKMADFEQLNQFDSMKFHQVN-QSFGSPVEHVLSPHSQFNCSPI 105

  Fly  1180 YGPPGNPL-LNQQMVE-SPQVSSTTGRGRGKSANKPRKPRAKKGEKAQVGQQQDLMDISGNVAMG 1242
            : ||..|. |.|.:.: ||.....|..|   .:|:...|..::|....:.|.:..: ...:.|:.
  Rat   106 H-PPNQPNGLFQDVADGSPMWGHQTATG---LSNQNGSPFHQQGHSHSLHQNKSFV-THHDFALF 165

  Fly  1243 AANAVSSIPTTQLPVSEDCVTQGAGDTSVVGMLEYSEGMGDLSQDVHSANELDTSTDGSGKKKKP 1307
            .|.              :..||.:...|.......:.|...|.|   :.:.:||:..|:.:....
  Rat   166 QAG--------------EHQTQCSSLRSQQNRTNLNPGQNSLGQ---AKSFIDTNVSGAHRVNVN 213

  Fly  1308 RKPRTPKDPNKPPRDRTPKAKKPKDPNDPNSTETPAAVKKRAGASKRRKQYGEDGAEQTGEGSEV 1372
            .....|......|...:|.|            ..||...|  .:|::...|.......|  ...|
  Rat   214 HLTSAPSSQQTLPVQFSPTA------------NPPAHFLK--CSSQQDGSYNRPSPSMT--SCSV 262

  Fly  1373 EDNKPLVPKAGSADGEAETTSGGTGVDGESPDYDDIPVSKIPRGSNEDEKEAEAGDETVDSVPDS 1437
            .:::|.......:.|....:|           ....|....|..||:             ::.|.
  Rat   263 SNSQPFPAHYSFSSGHVSPSS-----------LLQSPAGLTPSHSNQ-------------ALSDF 303

  Fly  1438 AGDPASTPSRRDRKRSTAR-----SRRNANSEEGGSARKNRGSLSAKALKKRRNRGRIVPESDGE 1497
            ||..:.:|.|..::..|..     ...|:|:.:...:...:|:.|...|...        ..|..
  Rat   304 AGSNSFSPHRGMKQEPTPHILNPTPSLNSNNFQILHSSHPQGNYSNSKLSPM--------HMDFP 360

  Fly  1498 DDTLDRTPPPSPPPDSEMDSNKRRSSRNTQRKKYIDDVMLRFSD-DENSLLVASPVKKDKKPSAN 1561
            |      |..|.||....:.:...:.               ||. |||.|   ..|:...:|.  
  Rat   361 D------PADSGPPMGHFNDHVETNG---------------FSSLDENLL---HQVESHAEPF-- 399

  Fly  1562 ASNSNAGSDVEKTEPQSGAEGDAAQE----------VGEEKSNLPLDE------SSQLEASSSTS 1610
                 ||.|.|          |..||          .|::.||..||.      :|.|.|..|..
  Rat   400 -----AGLDPE----------DLLQEGLLPQFDESPFGQDNSNHVLDHDLDRQFTSHLMARPSDM 449

  Fly  1611 AVAEKERQIS-------------TDAANAAMSSKPNYVYINTGDEDSMVVQLVLAMRMGKRELIL 1662
            |..:.:.|..             ...::..:..:|.....:.|......:|......|.::    
  Rat   450 AQTQLQYQARGWPSPLPNSHQHVPSRSHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYSRLQNTQVRVMSEK---- 510

  Fly  1663 DKPKEKA-PEPKQDEEKSELDEATTDKPEGDEKFKTEGESKKDLTDSEETKLESSAMEVDSKEES 1726
             ||::|| .|.||::....:.||..       :.|..||.......|.|....||   ||.|||.
  Rat   511 -KPRKKAESESKQEKANRIISEAIA-------RAKERGERNIPRVMSPENFPSSS---VDGKEEK 564

  Fly  1727 EPD--DSKKSDEDNKDKDKMEVDDEVGKSDKESKPEEQSETVKTEENSKAIEEDKSSTVLTADHA 1789
            ...  .||..|.||:                  ||:..|   |.:|.:|.   .|....|..:|.
  Rat   565 RAQRVKSKPKDRDNR------------------KPKACS---KLKEKTKI---GKLIITLGKNHK 605

  Fly  1790 KEPETVLEKMEVDEKANDDQSAVSKAEGSDEKSTDDSNPEEATTEKNKESLEIEGEKERVKEGEE 1854
            :                       ::|.|||.|..:..|:....|::.:......:.:|.|..|:
  Rat   606 R-----------------------RSESSDELSDAEQMPQHTFKEQHSQKRRSNRQVKRKKYAED 647

  Fly  1855 SVKKENDEKTEADMENK----PEP------------------------------------VFIDV 1879
            :..::.:|:....::.|    |.|                                    |.:|:
  Rat   648 AEGRQCEEEVRGSLKVKRTSAPPPGEQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILACRTVKKEVSPGVMLDI 712

  Fly  1880 EEYFVKYRNFSYLHCEWRTEEELLKGDRRVAAKIRRFQQKQSQQLNIFENIEDEPFNQDFTEVDR 1944
            ||:||||:|:|||||||.||::||| |:|:..||:||:.:|:|:.:...::|:||||.|:.||||
  Rat   713 EEFFVKYKNYSYLHCEWATEQQLLK-DKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFLADMEEEPFNPDYVEVDR 776

  Fly  1945 VLDMSVHTDETSGETTKHYLVKWKSLPYEDCTWELEEDVDNDKIEQYLRFNKIPQRSEWKSKKRP 2009
            :|::|...|:.:||:..:|||||.||||||.||||:||||..|||::.:..  ..|.:.:...||
  Rat   777 ILEVSFCEDKDTGESVVYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQLQ--ASRPDTRQLDRP 839

  Fly  2010 HPELWKKLEKTPVYKGGNSLRPYQLEGLNWLKFSWYNTHNCILADEMGLGKTIQSLTFVHSVYEY 2074
            ...:|||::::..||.||.||.|||||||||.|:|||..||||||||||||||||:||::.|...
  Rat   840 PSNIWKKIDQSREYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEVLLT 904

  Fly  2075 GIRGPFLVIAPLSTIPNWQREFEGWTDMNVVVYHGSVTSKQMIQDYEYYYKTESGKVLKEPIKFN 2139
            |||||||:|||||||.||:|||..|||:||||||||:.|:||||.||.|::...|::::...:|.
  Rat   905 GIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQ 969

  Fly  2140 VLITTFEMIVTDYMDLKAFNWRLCVIDEAHRLKNRNCKLLEGLRQLNLEHRVLLSGTPLQNNISE 2204
            .:|||||||:....:|.|..||..:|||||||||:||||||||:.:||||:|||:||||||.:.|
  Rat   970 AIITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEE 1034

  Fly  2205 LFSLLNFLEPSQFSSQEEFMSEFGSLRTEEEVNKLQALLKPMMLRRLKDDVEKSLAPKEETIIEV 2269
            |||||:||||.:|.|:..||.|||.|:|||:|.||||:||||||||||:||||.|||||||||||
  Rat  1035 LFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKRLAPKEETIIEV 1099

  Fly  2270 ELTNIQKKYYRGILEQNFSFLKKGTTSANIPNLMNTMMELRKCCIHPYLLNGAEEQIQYDFKSQH 2334
            |||||||||||.|||:|||||.||....|:|||:||||||||||.||||:.||||:|..:|:..:
  Rat  1100 ELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKIIGEFRDTY 1164

  Fly  2335 GEDPESYY-KNLILSAGKMVLIDKLLPKLKANGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLVYRKYPFERIDG 2398
            ......:: :.:|.||||:|||||||||:||.||:||||||||||||||||||::::|.:|||||
  Rat  1165 NPSASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDG 1229

  Fly  2399 RIRGNLRQEAIDRYSKPGSDRFVFLLCTKAGGLGINLTAADTVIIYDSDWNPQNDLQAQARCHRI 2463
            |:||||||.||||:|||.||||||||||:|||||||||||||.||:|||||||||||||||||||
  Rat  1230 RVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRI 1294

  Fly  2464 GQRKMVKIYRLLCRNTYEREMFDKASMKLGLDKAVLQSMNTQGSKDGNNKQLSKKEIEDLLKKGA 2528
            ||.|.||:|||:.||:|||||||:||:||||||||||||:.:.|.....:|||||||||||::||
  Rat  1295 GQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRDSNVSGIQQLSKKEIEDLLRRGA 1359

  Fly  2529 YGAVMDDDNAGDKFCEEDIDSILKRRTQVITMESEK-GSTFSKASFAASGNRSDITIDDPDFWTK 2592
            |||:|::::.|.||||||||.||.|||:.||:|||. ||||:||||.|||||:||::|||:||.|
  Rat  1360 YGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGCGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQK 1424

  Fly  2593 WAKKVDIDPDACERDETEDLVLSEPRRRTQIKRYG--HEDVMELNSEESSNENSDEEGGIGLRSR 2655
            ||||.::|.||.  .....||:..||.|.|.:.:.  .:::.||:..||..|             
  Rat  1425 WAKKAELDLDAI--SGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDELAELSEAESEGE------------- 1474

  Fly  2656 RRKEKRDRAREKKGNDEYIPRERDALAALGLEEIQYGNWAKSECFKVEKGLLSFGWGRWSELLEL 2720
             .|.|..|           |.:|.            |.:.::|||:|||.||.:|||||.|:|..
  Rat  1475 -EKPKLRR-----------PCDRS------------GGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSH 1515

  Fly  2721 GQFKRGWRDVDVEDCARIILLYCLQVYKGDEKIKTFIWDLITPTEDGEVQKISRDHSGLHNLVPR 2785
            |:|||...:.|||...|.:|.|||..|:||||||.||||||||||||:.::: ::|.||...|||
  Rat  1516 GRFKRQLNEHDVEVICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTREL-QNHLGLSAPVPR 1579

  Fly  2786 GRNGGKSNKESTGVSTPAPGSASGSNSGNTTPAHKSSALDGSDKDSGGINASAVAAAVTSIHDPN 2850
            ||.|.|       |.|                  ::|:.|....:                    
  Rat  1580 GRKGKK-------VKT------------------QTSSFDIQKAE-------------------- 1599

  Fly  2851 HWSKKEKYDADAYLEG-AYKKHLGRHANKVLLRVRMLYYIQHEVIGDFVQQIKDNTPISELPI-R 2913
             |.:  ||:.:..|:. .||||:..|.||||||||||||::.||||:..|::.|....|::.: .
  Rat  1600 -WLR--KYNPEQLLQDEGYKKHVKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEVIGNESQKVFDGVDASDIDVWV 1661

  Fly  2914 PPPTPDQVPSSWWNPICCDKSLLVGTYKHGCEMYRQMRADPNLCFVTHVGAGAAGDDLAVTSLPI 2978
            |.|...:||::||: ...|||||:|.:|||.|.|..:||||.|||:..||   ..|:.||.:   
  Rat  1662 PEPDHSEVPAAWWD-FDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRADPALCFLERVG---KPDEKAVAA--- 1719

  Fly  2979 NEDDANSKHDDGDEVDDDGTTTTKDSDSTKLTGGDNKDSLLDPERPSSSGKSSSENASGGNDKTE 3043
             |..||. :.|||                          :.|||                     
  Rat  1720 -EQRAND-YMDGD--------------------------VEDPE--------------------- 1735

  Fly  3044 SENDATTVSESSYKSEVLPGKGSDLDVSVAQQDALSATPELANTSDPKMNKNDAQVSASVSCDPA 3108
                        ||..                              |.:.|:|.:         .
  Rat  1736 ------------YKPA------------------------------PAIFKDDIE---------D 1749

  Fly  3109 DSSSPEAAGKAQGTGVQTGDAGELDIESEKKDNEKETKESTGDAPAVEAKKDSAAIARAEGDKTE 3173
            |.|||                |:|.|    .|.|.:.                     .||||  
  Rat  1750 DVSSP----------------GDLVI----ADGEGQL---------------------MEGDK-- 1771

  Fly  3174 SCTNNATTNISTTTTTTTITNTTTTTNNPSSKAANSNNTTDHANSNSHLGLDEEESVAGSYPPTV 3238
                                                                             
  Rat  1772 ----------------------------------------------------------------- 1771

  Fly  3239 AAVEDATTMWPSMQDLNTRLRRVITAYQRNYKKEELKLQQKAKLQALVSSTPPLSVPTTPTLQSM 3303
                   ..||:...|.|||||:||||||..|...::..|           |..|||.       
  Rat  1772 -------VYWPTPSALTTRLRRLITAYQRTNKNRHIQQAQ-----------PTFSVPA------- 1811

  Fly  3304 QMQLQSGSGSGGSGIGSSAQHDASGRSLQALMQSQGASTSAAAAAAASSAGGSCSGSGQVGMGGA 3368
                                         ::||                                
  Rat  1812 -----------------------------SVMQ-------------------------------- 1815

  Fly  3369 GVMPAMPTAADISLMLSILNTTDVNQLANLDINKLAMYLVSMNNKMERQGKMELAAKERESQRLQ 3433
               |....||                               :|.||        |||....||  
  Rat  1816 ---PLYEEAA-------------------------------LNPKM--------AAKIERQQR-- 1836

  Fly  3434 LIPKKWNRREEYEFLRVLTGYGVDLHVSTPMASSNGSSLSPDWTKFKQMAHLERKSDETLTDYYK 3498
                 |.||||.:|.||::.:||   |..|   ..|..   |||||:.:|.|.:|:|.:|..|..
  Rat  1837 -----WTRREEADFYRVVSTFGV---VFDP---DRGQF---DWTKFRALARLHKKTDNSLEKYLC 1887

  Fly  3499 VFVAMCKRQAGLKLSESERGLEGIIEEIEKEHAKLILDRLEVLAKLREVA-RNPMLEERLKLCTK 3562
            .|:|||:|...|...|........|:.|.:|.|...|.|:|:|.|:||.| |:|.|.||||||..
  Rat  1888 AFMAMCRRVCRLPSKEELVDPNIFIQPITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHP 1952

  Fly  3563 NADTPDWWEPGRHDKELITAVLKHGLYRSETFIFNDPNFSFGESEKRFIRELEAQIQRTIKLEAF 3627
            |.|.|.|||.|.||::|:....|||:.|::..|..||..||                        
  Rat  1953 NPDLPIWWECGSHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSF------------------------ 1993

  Fly  3628 NAEKAEKLAAAEKDAATEKAAATEKAAAEKAASVKNEVIDLDDELMTNESVIKKESPVT------ 3686
                          .|.:::.:..|....:.::          .|:....|:...||:|      
  Rat  1994 --------------MAAQRSYSQSKVTHSRTST----------PLLQQYQVVLSASPLTSSPRLL 2034

  Fly  3687 ----PIKEE--IKSEESPEKHDTADNLEDKNSDAEESTKIKGKEDFNPET--------TEKEALD 3737
                |:.|:  :|||...|:..:::  |:..|..|..|::| .|..:|:.        .:|....
  Rat  2035 GAKGPLVEDVRVKSESLAEEPQSSE--EESMSSMETRTRVK-SEPVSPKNGVLSQAPGEQKSGGK 2096

  Fly  3738 ESTNLNKDKSSTETLVPEIEDSKPSEDKMEVEELPVAENGEKEGSPEKCSDAEDKKFSEEKPSSP 3802
            ..|:.....:.||.|.|     .|:..|..|         .|.|| |..||::.           
  Rat  2097 SETDRRMVAARTEPLTP-----NPASKKQRV---------HKRGS-ESSSDSDS----------- 2135

  Fly  3803 AVPDGKVSEMEADEAAPNTEENC----SGDSESPEKECEDKVVEKVEEEKGENSYEKAEEQKEET 3863
               |.:.|...:..::.::..:|    ||.|.|....|               |...:......:
  Rat  2136 ---DSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSC---------------SSASSSSSSSSS 2182

  Fly  3864 EKLEKSSIESEPSEKSETVLEPEVAVPKKSTGDQDILDLVAGPSDPDD--DEVMKEKEKAVEEEC 3926
            .....||..||.|:..|.|.:.|.....|:..::.:..|.|...:..|  .:..:....|.|...
  Rat  2183 SSSSSSSSSSEESDSEEEVQKREGTPHAKAYDEESVASLSATQDETQDGTQDSFQASNGAPESAH 2247

  Fly  3927 KKQAAELKARFPDLEVIQPATVKQQKLEKPKLEMCMIRWFKDFALERRIAHIVACVESGNWPVDS 3991
            ..|...:                          :....|.||..:..|:..|...|..|.||...
  Rat  2248 LLQGGYM--------------------------LAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSAR 2286

  Fly  3992 KY------SAFATCK------GATDLSIALHESIPHLSSLERRSTTPDVITITTDQGVTKHLQTS 4044
            ::      ::|.|.|      .||:.|   ..|:|          ||..:.:..:     |.|:.
  Rat  2287 RHYDANTVASFYTTKLLDSPGAATEYS---EPSVP----------TPPAVAVKEE-----HEQSP 2333

  Fly  4045 HMQQVASSASAASTSSGVPQVTQSKPSSSNSLPGLDAKSINAAVAAAVAAAAAGGNATSLSSLLP 4109
            .|.:|                                                            
  Rat  2334 QMSKV------------------------------------------------------------ 2338

  Fly  4110 GMSLSAATGSSAGGVSGLSVPSAGSGVGKKRKRHIAIDVETERAKLHALLNSSTMAPKDWESEIA 4174
                                           |:|:       |.|      ..|:..||      
  Rat  2339 -------------------------------KKHV-------REK------EFTVKIKD------ 2353

  Fly  4175 NMEALSGSSGRGRGGNSSASSGMQPPPAHQHASLSRQSSGQFSKPAVPAMKTPPPSMGAPMDLSS 4239
                        .||                ..|:.|..|.       |.|.|.......:....
  Rat  2354 ------------EGG----------------LKLTFQKQGL-------AQKRPFDGEDGAVGQQQ 2383

  Fly  4240 SLPKMNMTEMLKSASSSGAIDLSEVQDFSMPSKKSSVHAALSSAFPSMGNKSKLDDTLNKLMKKN 4304
            .||:   ...|:|.|.:..::.|:    |:|:..||:.:.|.:      |.:.||          
  Rat  2384 CLPR---PRELQSTSETSVVNTSK----SIPASGSSIQSTLGA------NGAILD---------- 2425

  Fly  4305 NCTIEEPVIGKEKKRKKLDE--IVLGLSAAKEQ---KTFPDPSLPSSKKPQIPPSVSVTPA-NLQ 4363
                .:|::.|.:.|::..|  .:|.|:..|..   .|..:|:|...:..:||.:.|..|. || 
  Rat  2426 ----SQPIVKKRRGRRRNVEGADILFLNRNKPPNHISTGMNPALSYPQPQRIPDTESPVPVINL- 2485

  Fly  4364 SSSNQQSNQKPFTITVTTVPGKSKSGSSNSGSGTGGSSSASGGGAGGSGLSALQNMAMGGLSSKD 4428
                                   |.|:..:|.                                 
  Rat  2486 -----------------------KDGTRLAGD--------------------------------- 2494

  Fly  4429 SLNALLAQTMATDPQTFLKQQQKMMQFLPPAQRKAYENMLAEMEQAMKISSKFSTNSPHDVKVNK 4493
                                                                   ::|....:::
  Rat  2495 -------------------------------------------------------DAPKRKDLDR 2504

  Fly  4494 WLSDMTSPLGDQLSIDYVGGGGASGSGSGNSRRSNRQQGNSQQSSSAAQLQKQQQQQQQQQQQQQ 4558
            ||.:...         ||...||.                           ..:.|..:.:.:|:
  Rat  2505 WLKEHPG---------YVEDLGAF---------------------------IPRVQLHEGRPKQK 2533

  Fly  4559 QHSMPGP-----QNLTGEEPVPVINKQTGKRLGGNKAPQLKRLMQWLTENPNYEVDPKWLEQMQN 4618
            :|....|     .:|||||.|.:||::..:::||..||.||.|.::|.||..|.|.|:|      
  Rat  2534 RHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEW------ 2592

  Fly  4619 PMSTPSPRPASMESGYGSSAVKSHGGRPLSNLSSTSSSSHTQQQSSAAQSQAGGNSGSSKKNSRQ 4683
                             ...||..|..|.|......:....:::             .|::..|.
  Rat  2593 -----------------GDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREE-------------VSRRGRRP 2627

  Fly  4684 QTAASAALDQAALQFGSLAGLNPSLLANLPGLGAFDPKNPLAAFDPKNPLLSMSFGGMPGMGNI- 4747
            ::....|                ::.|..||           :..|.||||:.  |.:||:... 
  Rat  2628 KSGVPKA----------------TIAAAAPG-----------SSGPGNPLLAN--GLLPGVDLTA 2663

  Fly  4748 -----PGLGNLNNMNLFASLAGMGGLGNLAGMDTQSLAALMAAAGPTL-GGLTGASGGAGSGKSQ 4806
                 ..|.||.::::.|.|.||.     ||:.:...|..|||..|.| .|:.|.....|.|   
  Rat  2664 LQALQQNLQNLQSLHVTAGLMGMP-----AGLSSGGEAKTMAAMFPMLFSGMAGLPNLLGMG--- 2720

  Fly  4807 AQSQSSATSSSSSASKKKQQQQQQQAQNEAAQLAAAISASTGGS----GASGGKNAAASASQLAA 4867
              ...|.|:.|.:..||....::.:.:.|..:   :.|...||.    |:....:.||:...||.
  Rat  2721 --GLLSKTAESGAEGKKGNDSKELEGKKERTE---SQSPENGGERCVPGSPSTSSTAAATKPLAL 2780

  Fly  4868 GFPFLFPNPSLLYPPMGLGGLNPYSLGSSGLGSAYDQLAQQYNLLNGATSSASNTSSTQSKSHQS 4932
            . |.|..|  :|||.|         |.:.||......|:|. |..:...:.:|:..|  |||.:.
  Rat  2781 N-PLLLSN--MLYPGM---------LLTPGLNLHLPALSQS-NTFDVQKNKSSDLES--SKSVEI 2830

  Fly  4933 QSKSSQSRNTTASANSAASLMNAMASMGGGASTVTTPSTSASGSGRGRQSSSRN 4986
            :.:.|:.|:......:..|.:|. .|...|:...::.|.|:|.|.....||:.:
  Rat  2831 KEEDSRGRDQEEKGGTEPSPLNE-NSTDEGSERASSGSDSSSSSSEDSDSSNED 2883

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kisNP_001137761.1 Atrophin-1 221..>533 CDD:460830
Med15 <1056..>1265 CDD:312941 33/151 (22%)
PRK12678 1319..>1500 CDD:237171 30/185 (16%)
PTZ00121 <1419..1923 CDD:173412 124/581 (21%)
CD1_tandem_CHD5-9_like 1851..1918 CDD:349315 32/106 (30%)
CD2_tandem_CHD5-9_like 1937..1995 CDD:349310 32/57 (56%)
PLN03142 2029..>2606 CDD:215601 407/578 (70%)
PTZ00341 <3662..3887 CDD:173534 49/248 (20%)
BRK 4568..4611 CDD:462196 20/42 (48%)
Chd9XP_038953982.1 KLF3_N 217..375 CDD:410554 35/211 (17%)
PTZ00121 <510..>765 CDD:173412 79/317 (25%)
CD1_tandem_CHD5-9_like 685..749 CDD:349315 26/64 (41%)
CD2_tandem_CHD5-9_like 769..827 CDD:349310 32/57 (56%)
PLN03142 858..>1479 CDD:215601 419/636 (66%)
BRK 2475..2515 CDD:462196 12/160 (8%)
BRK 2549..2593 CDD:197800 21/66 (32%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.