Protein Alignment CG1801 and CG42816

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_728408.3
• Gene: CG1801 / 33104
• FlyBaseID: FBgn0031171
• Length: 1655
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_730301.3
• Gene: CG42816 / 39977
• FlyBaseID: FBgn0261998
• Length: 1459
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1609
• Identity: 324/1609 - (20%)
• Similarity: 634/1609 - (39%)
• Gaps: 324/1609 - (20%)

  Fly   189 DKQQDIYIREGFLQLQH---QIFVEW----YHQLRKDI----VSTYPEPNVEVYNILLKAADEPC 242
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  Fly     5 DGSYPLY-KTGFLAVQQALSQVHIKHKCKEFNKTQGDIKFPPIKDLPSPPI-------FKSDNSS 61

  Fly   243 SVMSVAQLPTFLYNFIYLLPFLNIIRNVAAQVED------------GV-MVHQWHYGYSFGMQWG 294
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  Fly    62 TLQDVGIM------IIVIIIFFVVVSLTKSIVEEKELQLKVTLNLMGVGSCLQW-------VAWY 113

  Fly   295 IKFLVLFLRMCILGVIYTIMLLAFWGFGGREGEFSGTGTIAFVCF----ITLYTVEI-----IIT 350
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  Fly   114 IQTFIIFL-------IGSSIITLFWKLVLPNSE------ISFMPFTHWSMALFVLLVLSHCTICF 165

  Fly   351 GMVVAKLFANPTNAVLFALMLWLFMYAAFCIILERYWD--IHKYYVFFIL-------VAFCNCQM 406
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  Fly   166 SFLMSSLISTTYRISLVTFLALIATYLPFLILHSKGCSEGLNVFLSLFLLSGLQVLVVGICMWED 230

  Fly   407 HFSMSLFRNCIEKPEMVNTIDFVLIFTSAISSALIYFLILLAIQWRMPGTF-------------- 457
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  Fly   231 YGEGLQWGNLFETSWPGGTLSVGYILLVMILASFLSLLLCLYLEKIRPGPYGVPQPWHFPCTRCC 295

  Fly   458 ----------LSRRIVNNRPRKQQESDTTIMYLGRAPSFQNFEFGDVGSVELMRLRHVSTSHRDS 512
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  Fly   296 STESLLPYSRLFNRIFGIYSAAPDE---------ERPDLQLIEPDPVDKIAGVQIRGLSKTF--G 349

  Fly   513 ERKILKNISMRIYRGEVFVILGHIGSGKLTLLRILAGLKFPLRGNVYIMGNPF-EPNGEARRLVD 576
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  Fly   350 KMEVVKNVSFDMFEGQITVLMGHNGAGKTTLISMLAGFISPTSGTALINGFDIRQERRQAQRCIG 414

  Fly   577 FRFDEHGLNKHLTVEQTIDYHVRLKLSPSESDRYEIERRKWLAILDQHVESRGVRIGKLSSGSMK 641
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  Fly   415 LCPQQNVLFKHLSSVSHIQLFSRLRGLRGAEVKSEVQ--NYLKKLNLQ-EKKRLAARNLSGGTQR 476

  Fly   642 LVALCCCLAGDTPIIILEEPTTQLTGREAQIFWSIVHAEKENRAFIIATYNVGEAEHVADRIGIL 706
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  Fly   477 RLSVACSLCGGVKVLICDEPSTGLDPSARRELWRLILEAKEGCTILLTTHQLDDGEVLGDRVVII 541

  Fly   707 SMGVLEASGTPFFLRSKFSSSVDLVIIKKPHVPDQPITDYINQFMQNIEPENEIGDSLTYRLPVI 771
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  Fly   542 SDGQLRCIGSLPFLKKQVDASCLITCEARKRCDLEKLTSLISRHVGTIQPFSIKGRDVCYKLPLS 606

  Fly   772 YRPRLQKLLIHLEIDRKMLGIENVRVVGAELSDIYMTLVTSFRLQ----------QQMIPDVTQT 826
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  Fly   607 KSKYFSSLFRDLESQMNILGVRGFSLSSVSLEEIFM----SFGAEDLNSRQSGGAEKRDDDDRDD 667

  Fly   827 FKYQVVSQKQL--TKQRMRAMFYKKMIHTAPN--------VWPIIMIFTSFVLIAI--------- 872
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  Fly   668 DEENEVQDGNVRSCKKQWRAMMTKKVMALYDNKVYFLLLLLTPIVYYITTLMMATKPHHSGRPTF 732

  Fly   873 ------IARLSVLLDMP------KERQNSIHIGFREPEDVVKYLPNLKDCGYIDIRSAVKVNKKK 925
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  Fly   733 NISDYGVDKFTILLSVPVSKSYTEERRAD------------------------SIASLIK-GKLK 772

  Fly   926 SVGVSRTFDDDSFVCEKGSYRNNLRKKNELRSFGAVESDGDEHLNGYIS-QDMFHSAPMMLNLLQ 989
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  Fly   773 LIVVSEQIKD--YVDDKWKSREGRREINFVSM--AIDTGDRTGLIGWVGPRHYVHAAPMILNLVY 833

  Fly   990 NVILRLSYPMQTDLV---VLVENHPLPTQLSQKINVLDNKIAHIHVPLVVGCIIPLTVSVFVIPL 1051
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  Fly   834 NALAQ-------ELIGPKISIEVTSVPFTLRKKEDFLISNNGDI--PIYVIGYVSIAMIIFSSAV 889

  Fly  1052 VEEEIYDVRFLQHMAGLGLKVFWGINLFWDWFTFFVYSVIIVVIMSLMGIGGFGFYENAIMVVLL 1116
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  Fly   890 IQERVSHMKMLQEVSGLEMITYWLSHLAFDMVVFFI--LVLALLLPL-----YGYAPWYLLLCVL 947

  Fly  1117 TTFGLAALPLTYL-----------VSMFVNKSIVRAFLVSVLLQGVSGLVLYIIYWDVANSNTIF 1170
            ...|||.|...|.           |||.:...|:.:.::.:|  |...|:..::|        :.
  Fly   948 FFTGLAGLIFIYFLISMLSATFLAVSMILLSVIIGSLILMIL--GALALIFKMVY--------VA 1002

  Fly  1171 FYAACMSPGFSLLDGVSNVYAQNLEQAICIDKC------------EATDSCTEENMNE------- 1216
            .|.|.|.|   |:.|.:           ||.||            ||.:..:|...::
  Fly  1003 IYVANMHP---LIAGYN-----------CIQKCFHYMSLCGSYISEAQNPLSENLTSDEMYCINP 1053

  Fly  1217 ---VVPNCKFDTFFKWAAPGILPPILYMVLSALIFLMLIFWIE----LHRREKKFHTSRDLRKMR 1274
               :.|.|.......|      |.:|.|:.:|:|..:||.:.|    :..|.|
  Fly  1054 LAFLEPRCVCVNPMTW------PDMLVMLGTAIILFLLIMFFEYGSCVWYRCK------------ 1100

  Fly  1275 TATYPFDD-GDVADVK-----QKIAEADNTKAKQSVFLVDQVEARVPAAGKRIHTVSFALNKYMS 1333
             ...|:.. |.:.|.|     :||...|..:......:|:.|..:.......::.:||||.....
  Fly  1101 -GCCPYSSKGSIEDPKVSREAEKIRAMDADQIGTRALVVNGVSKKYGCDQLAVNNISFALKPSHC 1164

  Fly  1334 MGIFGPRNSGKSHLMRQLVGQRGFAFGEIYVRGLDFKYDLESIHTYMGYSPQHRGLLNELTPREH 1398
            :|:.||..:||:...:.:||:.....|.||:.|...:.........:||.||.......||.|:.
  Fly  1165 VGLLGPNGAGKTTTFKMIVGEHSIDKGNIYISGYSMRMKRNKAMKELGYCPQSDSFFEFLTGRQL 1229

  Fly  1399 IRLLCMIRGVPEAKIGEKMHDLCLMLNMTGWMHRKCSLLTAEKRHKLKIALALVAYNKILVLDEP 1463
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  Fly  1230 LKVFLLIWGFPSKDLNKRCEKLADQFGFRKHLDKKITYYSGGTKRKINAAVACGA-NSLICLDEP 1293

  Fly  1464 TCGMPATTRREIWNILRYIRYCGKTIIFATNDELECKILADFIILFQDSEMLAIGSLQYLRYKYS 1528
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  Fly  1294 SAGVDPASRRHVWTIINEVAQQGKAVLLTSHNMDEINALCSKSVILVDGSIYAMGSVQHVKNKIA 1358

  Fly  1529 HGFYLE--VRLIRDG--ATLAESEENLRKDVENLAKFVNFLHNRSELVGRL-------NNWFKFY 1582
            .|..|:  |.:..|.  |.|.:.|:::.....|..     |..:.|..|||       .:|
  Fly  1359 KGMTLKLVVNVQPDNMVAMLTKIEDDIYMTYPNAE-----LKEKYEFSGRLTFQISKDTSW---- 1414

  Fly  1583 VPVGHIVYSFLYGAMEKNKLRLNVSDYCIYQADMMSVVAQVQETRAQLK 1631
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  Fly  1415 --------SEIFEYVEGNRSSWHLEDYSLSQPSLEDAFEEIAEERRKKK 1455

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1801	NP_728408.3	ABC2_membrane_3	<246..379	CDD:463674	25/154 (16%)
		rim_protein	<514..1537	CDD:130324	242/1113 (22%)
CG42816	NP_730301.3	rim_protein	<81..1451	CDD:130324	307/1513 (20%)