Protein Alignment CG1801 and abt-5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_728408.3
• Gene: CG1801 / 33104
• FlyBaseID: FBgn0031171
• Length: 1655
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001364572.1
• Gene: abt-5 / 173081
• WormBaseID: WBGene00000023
• Length: 1582
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1570
• Identity: 333/1570 - (21%)
• Similarity: 587/1570 - (37%)
• Gaps: 442/1570 - (28%)

  Fly   289 FGMQWGIKFLVLFLRMCILGVIYTIML-------------LAFWGFGGREGEFSGTGTIAFVCFI 340
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 Worm   195 FGQNFGLLFAVCML-MPVISVARALVVEKSSVKPYLTTIGLPLWMFYLEHFLF---GVIKNTFLI 255

  Fly   341 TLYTVEIIIT-----GMVVAKLFANPTNAVLFALM-----------------LWLFMYAAFCIIL 383
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 Worm   256 TLLSTLYIFSMDNCPTYVLAGIFMYTCHCVSFSILCTSILPFGKRIVEGMVIIWITLIIAMHLSL 320

  Fly   384 ERYWDIHKYYVFFILVAFCNCQMHFSMSLFRNCIEKPEMVNTIDFVLIFTS---AISSALIYFLI 445
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 Worm   321 EFEFD----WLFWVPLLNPN----YSLKLFVDATFLASGPNGTPTSALFSSKKKTLQSAAVYFGI 377

  Fly   446 LLAIQ-------------------------WRMPGTFLSRRIVNNRPRKQQESDTTIMYL----- 480
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 Worm   378 MISCTVVMLVAAIFMEKLYTFVGHAIFKRFWRILGFSKGKRSKIEERGDGVEDRSTILQCKETVE 442

  Fly   481 GRAPSFQNFEFGDVGSVELMRLRHVSTSHRDSERKILKNISMRIYRGEVFVILGHIGSGKLTLLR 545
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 Worm   443 GRGSA--------IADIELSGLVKV---YQNGE-KAVNGLSLRAIRGQVSILLGHNGCGKSTTFG 495

  Fly   546 ILAGLKFPLRGNVYIMGNPFEPN-GEARRLVDFRFDEHGLNKHLTVEQTIDYHVR----LKLSPS 605
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 Worm   496 MITGMHQATEGKVMIGGIDANANRAEARELIGYCPQYNPIYDELTVWE----HLRLVNALKGRSG 556

  Fly   606 ESDRYEIERRKWLAILDQHVESRGVRIGKLSSGSMKLVALCCCLAGDTPIIILEEPTTQL--TGR 668
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 Worm   557 GSD-FKMDAESLLKQIEL-TDKRNTLAKNLSGGMKRKLCVCMAMIGGSRVILLDEPTAGMDPSAR 619

  Fly   669 -EAQIFWSIVHAEKENRAFIIATYNVGEAEHVADRIGILSMGVLEASGTPFFLRSKFSSSVDLVI 732
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 Worm   620 IDVQNMLALV---KADRTILLTTHYMDEAEKLGDWIFVMSHGKMAASGSKHYLKQKYGGGMLLTL 681

  Fly   733 I-KKPHVPDQPITDYINQF---------------------MQNIEPENEIGDSLTYRLPVIYR-- 773
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 Worm   682 VFKSVHDPMRPRKSYETAYDVCKTVCSTALVKDERGQMIEISILETEKS-------RLPTLLKIL 739

  Fly   774 -----------------PRLQKLLIHLE---IDRKMLGIENVRV-VGAELSDI------------ 805
                             |.:|:....||   |...|..:|.|.: :|.|..||
 Worm   740 ESVMEEDYNNPEFQALEPDIQEKCRTLELATIGVSMSSLEQVFIKIGDECDDIMNGTGVDKKTER 804

  Fly   806 ---YMTLVTSFRLQQQMIPDVTQTF-KYQVVSQKQLTKQRMRAMF-YKKMIHTAPNVWPIIMIFT 865
               :.||| .:::||.     .|.| |..:|....|.|   ||.: |:..:.....:  |:.:.|
 Worm   805 QEKFSTLV-QYKIQQP-----KQGFSKLMMVVWALLQK---RAYYLYRNPVQITLQI--ILPLLT 858

  Fly   866 SFVLIAIIARL---------------------SVLLDMPKERQNSI------------------- 890
            .::......||                     :|||.:..|..:.:
 Worm   859 LWLFAVPFLRLEPKPPKLSDIESFDPSQYPHSTVLLQLENENDDRLANYLNSFSNFEVVKVGYND 923

  Fly   891 HIGFREPEDVVKYLPNLKDCGYIDIRSAVKVNKKKSVGVSRTFDDDSFVCEKGSYRNNLRKKNEL 955
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 Worm   924 HYGYL----VKKYSQVFKTLGFI-----VKVNKK---------GDSKF------YK--------- 955

  Fly   956 RSFGAVESDGDEHLNGYISQDMFHSAPMMLNLLQNVILRLSYPMQTDLVVLVENHPLPTQLSQKI 1020
                  .|.||:            :|.:::|::.:. :.|..|..|         .||...|:.|
 Worm   956 ------ISQGDK------------NAAILMNIIASA-MYLRDPSVT---------KLPHVTSRVI 992

  Fly  1021 NVLDNKIAH------------IHVPLVVGCIIPLTVSVFVIPLVEEEIYDVRFLQHMAGLGLKVF 1073
            .:.|.||.:            ..:.::.|..|..||.     |:||:|......|::.||....:
 Worm   993 WMNDPKIKYEGLASFFLFENIFFLLVLAGIFIQSTVY-----LIEEKICKFAHQQYLTGLSTIAY 1052

  Fly  1074 WGINLFWDW--FTFFVYSVIIVVIMSLMGIGGFGFYENAIMVVLLTTFGLA--ALPLTYLVSMFV 1134
            ||:...||:  ||||:...|..:|       .||..:..|..:::..:||.  ..||.||.|..:
 Worm  1053 WGVVFLWDFLLFTFFLLYTIGFLI-------SFGVLQGHIHEIVVIFYGLLFYFAPLVYLTSALI 1110

  Fly  1135 NKSIVRAFLVSVLLQGVSGLVLYIIYWDVAN-------SNTIFFYAACMSPGFSLLDGVSNVYAQ 1192
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 Worm  1111 NTPTRGNFLLYMFC--CIPWLAYSIVSELHNFPPIQKYSDEIEYGFRIFNPSIGFLAGLMKIAAL 1173

  Fly  1193 NLEQAICIDKCEATDSCTEENMNEVVPNCKFDTFFK-----WAAPGILPPILYMVLSALIFLMLI 1252
            |                        .|....|..|:     |...||...::::....:...:|:
 Worm  1174 N------------------------YPKSGLDKHFEHLTNLWTYEGIFFELMFLFFGGIFLTILL 1214

  Fly  1253 FWIEL---------------HRREKKFHTSRDLRKMRTATYPFDDGDVADVKQKIAEADNTKAKQ 1302
            ....|               ..||:|.:...:..|.           |.:.:|.:.|.|.   .:
 Worm  1215 GCATLKPFRRACFRGTRRRSQPRERKRYKGIESCKA-----------VKEEEQLVQEVDK---NE 1265

  Fly  1303 SVFLVDQVEARVPAAGK--RIHTVSFALNKYMSMGIFGPRNSGKSHLMRQLVGQRGFAFGEIYVR 1365
            :|.::|.:   |...||  .::.:|.::......|:.|...:||:.....:.|......|...:.
 Worm  1266 TVLVIDGL---VKDFGKFRAVNDLSISVGHEECFGMLGANGAGKTTTFDIITGLTMPTGGSATID 1327

  Fly  1366 GLDFKYDLESIHTYMGYSPQHRGLLNELTPREHIRLLCMIRGVPEAK-IGEKMHDLCLMLNMTGW 1429
            |.|.   .|:||  :||.||...:|.:::.|:.:|::..::|.|..| :.|.:.| |:.::..|:
 Worm  1328 GHDI---TETIH--IGYCPQFDAMLQQISCRQTLRIMAKLQGYPNVKEVVELVLD-CVGMSDFGY 1386

  Fly  1430 -MHRKCSLLTAEKRHKLKIALALVAYNKILVLDEPTCGMPATTRREIWNILRYIRYCGKTIIFAT 1493
             :.:.||   ..::.|:.:.:||::....::|||||.|:....|||||:|:..:|...|..|..|
 Worm  1387 KLVKNCS---GGQKRKISVGIALMSRATCIILDEPTAGIDPRARREIWDIIHEMREQAKCSIVLT 1448

  Fly  1494 NDEL-ECKILADFIILFQDSEMLAIGSLQYLRYKYSHGFYLEVRLIRDGATLAESEENLRKDVEN 1557
            :..: ||:.|...|.:.:..||:|:|:.|.|:.:|.:.:.:.:.|            |..:|:|:
 Worm  1449 SHSMEECEALCTRIGILRKGEMIALGTSQSLKSQYGNTYMMTLIL------------NSLEDLES 1501

  Fly  1558 LAKFVN-------FLHNRSELV---------GRLNNWFKFYVPVGHIVYSFLYGAMEKNKLRLNV 1606
            :...|:       .....|.|.         .:.:.|            |..|..:|....:.|.
 Worm  1502 VCVIVSEEMPDAVLKTPESSLTTSIVWELPKSKSDKW------------SEKYNQVEVLAKKANA 1554

  Fly  1607 SDYCIYQADM 1616
            .||.:.||.:
 Worm  1555 KDYMLTQASL 1564

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1801	NP_728408.3	ABC2_membrane_3	<246..379	CDD:463674	24/124 (19%)
		rim_protein	<514..1537	CDD:130324	262/1180 (22%)
abt-5	NP_001364572.1	ABC2_membrane_3	<158..391	CDD:463674	41/207 (20%)
		rim_protein	<419..1569	CDD:130324	288/1334 (22%)