Protein Alignment CG1801 and abca12

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_728408.3
• Gene: CG1801 / 33104
• FlyBaseID: FBgn0031171
• Length: 1655
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031748843.1
• Gene: abca12 / 101731410
• XenbaseID: XB-GENE-6041943
• Length: 7516
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1909
• Identity: 402/1909 - (21%)
• Similarity: 713/1909 - (37%)
• Gaps: 461/1909 - (24%)

  Fly    17 LNLWRR---------TLFEIV--ALVIMVLVIFLNPIAHSKRLLYTTTENENEQSIVSHKLQDIN 70
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 Frog  5770 LNQWDKLQQAGTLIGRLQELLNNSVIDNILTNFLN------------TNASHINNTINSALNIIN 5822

  Fly    71 ILTRMADSKREKTKYILAFTPETTFTSEVTKNVAKTLELSSTVGYESESEMQNQFDE----RTTL 131
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 Frog  5823 LLNTNINN-------IQQFQPIAT----VINNLLSCMTYNRIQPMNSVEEMQAKAVELQNNNKLF 5876

  Fly   132 AGIVFNDLRDDGTPLTLSISIRFPSEFR---TIAPFLTEDRLWITRCSGRINPGRDRAKHDKQQD 193
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 Frog  5877 AAVAF-DLPSETTGQS-KASFNLPKQIKYTISMEPVLSEDTNIIRKSYWTPVPASSLNKYSR--- 5936

  Fly   194 IYIREGFLQLQHQIFVEWYHQLRKDIVSTYPEPNVEVYNILL--KAADEPCSVMSVAQLPTFLYN 256
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 Frog  5937 -----GFVYLQENI----------DRAIIEMQTNKSVANVGLQYQSVPFPC-----YKRDRFLAS 5981

  Fly   257 FIYLLP---------FLN-IIRNVAAQVEDGVMVHQWHYGYSFGMQWGIKFLVLFLR---MCILG 308
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 Frog  5982 MGYTLPIALMITWVLFISAFVKKIVHEKE--MRLHE--YMRMMGVNSSSHFCAWFIESASFLLIT 6042

  Fly   309 VIYTIMLLAFWGFGGREGEF--SGTGTIAFVCFITLYTVEIIITGMVVAKLFANPTNAVLFALML 371
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 Frog  6043 VSILVLLLKF-------GQILPSSNGFILFLLFLD-YSLTIIAMSYLISVFFHNTNVAGLSGSLI 6099

  Fly   372 WLFMYAAFCIILERYWDIHKYYVFFILVAFCNCQMHFSMSLFRNCIE------------------ 418
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 Frog  6100 YIITFFPFIVIATK----SSVLSFSAKTLLC----IFSPTALSNAIQYVVYYEEQSVGIQWSNMY 6156

  Fly   419 -KPEMVNTIDFVLIFTSAISSALIYFLILLAIQWRMPG--------------------------- 455
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 Frog  6157 ISPLLGDSMTFGWLCWLLFIDAMIYFLVGFYIRMVFPGKYGIPAPWYFPFQMSFWLKCCGLESLR 6221

  Fly   456 -------TFLSRRIVNNRPRKQQESDTTIMYLGRAPSFQNFEFGD--VGSVELMRLRHVSTSHRD 511
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 Frog  6222 PTKSSGLTFTNIMADNIYHKKGAENDLC--------SLNEQEPNDLTVG-VSLHGLTKVFQS--- 6274

  Fly   512 SERKILKNISMRIYRGEVFVILGHIGSGKLTLLRILAGLKFPLRGNVYIMGNPFEPNGEARR--- 573
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 Frog  6275 --KTAVNNLNLNFYEGHITALLGHNGAGKTTTLSMLTGLFGASSGTIYVYGDDIRTNLDRARSNM 6337

  Fly   574 ----LVDFRFDEHGLNKHLTVEQTI--------DYHVRLKLSPSESDRYEIERRKWLAILDQHVE 626
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 Frog  6338 GVCMQYDVHFDHLTTKEHLLLYGSIKAPHWTRAHLHIEVKRNLKDTGLYN-HRHK---------- 6391

  Fly   627 SRGVRIGKLSSGSMKLVALCCCLAGDTPIIILEEPTTQLTGREAQIFWSIVHAEKENRAFIIATY 691
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 Frog  6392 ----PVKALSGGMKRKLSICIALIGGSKVVILDEPTTGVDPCSRRSIWEVISKQKKDKTIILSTH 6452

  Fly   692 NVGEAEHVADRIGILSMGVLEASGTPFFLRSKFSSSVDLVIIKK-PHVPDQP------ITDYINQ 749
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 Frog  6453 HLDEAEVLSDRIAFLEQGGLKCCGTPLYLKQKFGSGYHLTLTKKFPNRENQEECDVELVTDLIKS 6517

  Fly   750 FMQNIEPENEIGDSLTYRLPVI-------YRPRLQKLLIHLEIDRKM--LGIENVRVVGAELSDI 805
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 Frog  6518 HIPEACLKEDVGGELVYLLPSFNAEISGAYLSLLQAL------DSRMNDLHIGCYGISDTTIEEV 6576

  Fly   806 YMTL------------------------------------VTSFRLQQQMIPDVTQTFKYQVVSQ 834
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 Frog  6577 FLKLTDNLDEDEQDAMAWSSTKTVVPIPNEENLHVQDELSLTNYRFTDRDDQPLTNEEKLTGVS- 6640

  Fly   835 KQLTKQRMRAMFYKKMIHTAPNVW---------PIIMIFTSFVLIAI-IARLS--------VLL- 880
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 Frog  6641 --LLLKKIMAIFIKR-FHNSRRNWKGLISQVLLPVL-----FVVIAMGLGSLSSSAVSFPELLLT 6697

  Fly   881 -DMPKERQNSIHIG-FREPE----DVVKYLPNL--------KDC------------------GYI 913
             |:......|:..| :.|..    ..:...|.:        .:|                  |..
 Frog  6698 PDLYGTSSQSVAFGLYNESSSNLVSAMNSFPGIDNSCLNQNSNCLSQNGLGLWTSDNQSLSYGSC 6762

  Fly   914 DIRSAVKVNKKKSVGV--SRTFDDDSFVCEKG----SY--RNNL---RKKNELRSFG------AV 961
            :..:...|....|...  .|||.:.......|    ||  ..||   :|:....|||      .:
 Frog  6763 NCSTGAPVCDASSAAPPHRRTFSEQMLYNVSGYNMESYLLTTNLQFIQKRYGGWSFGIPWVSSKL 6827

  Fly   962 ESDGDEHLNGYISQDMF-----HSAPMMLNLLQNVILRLSYPM-QTD-LVVLVENHPLP---TQL 1016
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 Frog  6828 ETLVPQNPNMTISKVWFNNDGPHSLPAFINSFSNFLLRTNLPSNESDQYSISVASKPLSGTVIQT 6892

  Fly  1017 SQKINVLDNKIAHIHVPLVVGCII---PLTVSVFVIPLVEEEIYDVRFLQHMAGLGLKVFWGINL 1078
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 Frog  6893 STTVTLVNT--------LIALCVLAGYSITTASFATYVVKEHHSGAKRLQHIAGVGETCYWVTNF 6949

  Fly  1079 FWDWFTFFVYSVIIVVIMSLMGIGGFGFYEN-AIMVVLLTTFGLAALPLTYLVS-MFVNKSIVRA 1141
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 Frog  6950 IYDSIIYLIPVSLSLATIAIFKLPAFYDYPNLGAMSLLFILFGFATFSWMYLLAGTF--KSPGNA 7012

  Fly  1142 FLVSV---LLQGVSGL----VLYIIYWDVANSNTIFFYAACMSPGFSLLDGVSNVYAQ------- 1192
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 Frog  7013 FITYVSINLFIGINTIISTSVVYFLYVQRSPSDSDY---QSLNQTYTVLTDVFKIFPQFCFGYGM 7074

  Fly  1193 ---NLEQAICIDKCEATDSCTEENMNEVVPNCKFDTFFKWAAPGILPPILYMVLSAL------IF 1248
               :.:||:             :..:.:.........|..       .||..:|||:      .|
 Frog  7075 IMLSQQQAL-------------QMQSAIYGGTSTTNIFSM-------DILGWMLSAMAIQGAFCF 7119

  Fly  1249 LM-------LIFWIELHRREKKFHTSRDLRKMRTAT-YPFDDGDVADVKQKIAEADNTKAKQSVF 1305
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 Frog  7120 LLRLLINDGIIFSF------KSFVKRNCMKSYLVVTKNPEEDEDVRAERERV---DSGQADPDLL 7175

  Fly  1306 LVDQVEARVPAAGKRIHTVSFALNKYMSM------GIFGPRNSGKSHLMRQLVGQRGFAFGEIYV 1364
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 Frog  7176 QLQGLTKVYHHVGKNMVAVN---NMTLSIPAGECFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDVAPSKGNIQV 7237

  Fly  1365 RG--------LDFKYDLESIHTYMGYSPQHRGLLNELTPREHIRLLCMIRGVPEAKIGEKMHDLC 1421
            |.        |.|..|..:    .||.||...|...||..||:.....:.|:||.||......|.
 Frog  7238 RNNAGNLENVLGFNTDWSA----FGYCPQEDALDELLTGEEHLYFYARLHGIPEKKIKAVSFSLL 7298

  Fly  1422 LMLNMTGWMHRKCSLLTAEKRHKLKIALALVAYNKILVLDEPTCGMPATTRREIWNIL--RYIRY 1484
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 Frog  7299 QKLQLVQYKDRTTAAYSCGTRRKLSTALALIGRPSILLLDEPSSGMDPKTKRHLWKIISEEVKEK 7363

  Fly  1485 CGKTIIFATNDELECKILADFIILFQDSEMLAIGSLQYLRYKYSHGFYLEVRLIRDGATLAESEE 1549
            |  .::..::...||:.|...:.:....:...|||||:::.::..||.:::.| :|.:.
 Frog  7364 C--AVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVKGKFQCIGSLQHIKSRFGSGFTVKMHL-KDSSV------ 7419

  Fly  1550 NLRKDVENLAKFVNFLHNRSELVGRLNNWFKFYVPVGHIVYSFLYGAMEKNKLRLNVSDYCIYQA 1614
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 Frog  7420 ----NVEALTSFMCRHFPNTYLKDQHFTMVEYHVPVTAGGVAGIFDLLEANKSDLDIIHFSVSQT 7480

  Fly  1615 DMMSVVAQVQETRAQLKHHLVQTE 1638
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 Frog  7481 TLDEVFINFAQSQVSPDNSSVNSQ 7504

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1801	NP_728408.3	ABC2_membrane_3	<246..379	CDD:463674	29/147 (20%)
		rim_protein	<514..1537	CDD:130324	271/1219 (22%)
abca12	XP_031748843.1	rim_protein	4..>82	CDD:130324
		rim_protein	5675..7493	CDD:130324	401/1896 (21%)