Protein Alignment Abca3 and mglA

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608445.2
• Gene: Abca3 / 33103
• FlyBaseID: FBgn0031170
• Length: 1714
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_416654.1
• Gene: mglA / 949036
• ECOCYCID: EG10592
• Length: 506
• Species: Escherichia coli
• Alignment Length: 574
• Identity: 116/574 - (20%)
• Similarity: 223/574 - (38%)
• Gaps: 134/574 - (23%)

  Fly   529 TEPEGKHIGLQMRHLKKRFGNKMVVKGLSMNMFEDEITVLLGHNGAGKTTTISMLTGMFPPTSGT 593
            |.|......|:|..:.|.|.....:..:::.:....|..|:|.|||||:|.:..|.|::...|||
E. coli     5 TTPSSGEYLLEMSGINKSFPGVKALDNVNLKVRPHSIHALMGENGAGKSTLLKCLFGIYQKDSGT 69

  Fly   594 AIINGSDI---------RTNIEGARMSLGICPQHNVLFDEMSVSNHIRFFSRMKGLRGKAVEQEV 649
            .:..|.:|         ...|......|.:..|.:|: |.|.:..:        ..:|..|:|:
E. coli    70 ILFQGKEIDFHSAKEALENGISMVHQELNLVLQRSVM-DNMWLGRY--------PTKGMFVDQD- 124

  Fly   650 AKYLKM------------IELEDKANVASSKLSGGMKRKLSVCCALCGDTKVVLCDEPSSGMDPS 702
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E. coli   125 ----KMYRETKAIFDELDIDIDPRARVGT--LSVSQMQMIEIAKAFSYNAKIVIMDEPTSSLTEK 183

  Fly   703 ARRQLWDLLQQEKV-GRTLLLTTHFMDEADVLGDRIAIMCDGELKCQGTSFFLKKQYGSGYRLIC 766
            ....|:.::::.|. |..::..:|.|:|...|.|.:.::.||:        ::..:..:|..:
E. coli   184 EVNHLFTIIRKLKERGCGIVYISHKMEEIFQLCDEVTVLRDGQ--------WIATEPLAGLTM-- 238

  Fly   767 VKRDDCETNEVTALLNKYIPGLKPECDIGAELSYQLPDSASAKFEEMF----------GQLEEQS 821
                    :::.|::            :|..|:.:.||..:...|.:.          ..:.:.|
E. coli   239 --------DKIIAMM------------VGRSLNQRFPDKENKPGEVILEVRNLTSLRQPSIRDVS 283

  Fly   822 DELHLNGYGVGITSMEEVFMKVGAEKDNTGNI------KDQHEIMNGGSGFRGEDDNESVQSD-G 879
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E. coli   284 FDLH-KGEILGIAGL------VGAKRTDIVETLFGIREKSAGTITLHGKQINNHNANEAINHGFA 341

  Fly   880 IFSENRRLLQGL---------QLLSNQWKAMLLKKFLYTWRNKLLLLIQNIMPVFFV-VVTILII 934
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E. coli   342 LVTEERR-STGIYAYLDIGFNSLISN----------IRNYKNKVGLLDNSRMKSDTQWVIDSMRV 395

  Fly   935 KTQGTFQEL--------KPITIS---LTQYPLAVTVLDRSNVQNGTGYEIANKYEDLARSYGSNY 988
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E. coli   396 KTPGHRTQIGSLSGGNQQKVIIGRWLLTQPEILMLDEPTRGIDVGAKFEIYQLIAELAK---KGK 457

  Fly   989 GLELTGTQGFEDYILDLGKTIQVRINSRYLVAATITESKITAWLNNQALHTAPL 1042
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E. coli   458 GIIIISSEMPE----LLGITDRILVMSNGLVSG-IVDTKTTT--QNEILRLASL 504

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abca3	NP_608445.2	rim_protein	<137..1708	CDD:130324	116/574 (20%)
mglA	NP_416654.1	PRK10982	16..506	CDD:182880	113/563 (20%)