Protein Alignment Abca3 and araG

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608445.2
• Gene: Abca3 / 33103
• FlyBaseID: FBgn0031170
• Length: 1714
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_416413.1
• Gene: araG / 946408
• ECOCYCID: EG10058
• Length: 504
• Species: Escherichia coli
• Alignment Length: 494
• Identity: 109/494 - (22%)
• Similarity: 199/494 - (40%)
• Gaps: 102/494 - (20%)

  Fly   538 LQMRHLKKRFGNKMVVKGLSMNMFEDEITVLLGHNGAGKTTTISMLTGMFPPTSGTAIINGSDIR 602
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E. coli     8 LSFRGIGKTFPGVKALTDISFDCYAGQVHALMGENGAGKSTLLKILSGNYAPTTGSVVINGQEMS 72

  Fly   603 TNIEGARMSLG--ICPQHNVLFDEMSVSNHIRFFSRMKGLRGKAVEQEVAKY-----LKMIELED 660
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E. coli    73 FSDTTAALNAGVAIIYQELHLVPEMTVAENI-YLGQLPH-KGGIVNRSLLNYEAGLQLKHLGMDI 135

  Fly   661 KANVASSKLSGGMKRKLSVCCALCGDTKVVLCDEPSSGMDPSARRQLWDLLQQ-EKVGRTLLLTT 724
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E. coli   136 DPDTPLKYLSIGQWQMVEIAKALARNAKIIAFDEPTSSLSAREIDNLFRVIRELRKEGRVILYVS 200

  Fly   725 HFMDEADVLGDRIAIMCDGELKCQGTSF----------------------FLKKQYG-SGYRLIC 766
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E. coli   201 HRMEEIFALSDAITVFKDGRYVKTFTDMQQVDHDALVQAMVGRDIGDIYGWQPRSYGEERLRLDA 265

  Fly   767 VKRDDCETNEVTALLNKYIPGLKPECDIGAELSYQLPDSASAKFEEMFG---------QLEEQSD 822
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E. coli   266 VKAPGVRTPISLAVRSGEIVGLFGL--VGA--------GRSELMKGMFGGTQITAGQVYIDQQPI 320

  Fly   823 ELHLNGYGVGITSM-------EEVFMKVGAEKDNTGNIKDQHEIMNGG----SGFRGEDDNESVQ 876
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E. coli   321 DIRKPSHAIAAGMMLCPEDRKAEGIIPVHSVRDNI-NISARRKHVLGGCVINNGWEENNADHHIR 384

  Fly   877 SDGIFSEN-RRLLQGLQLLSNQWKAMLLKKFLYTWRN---KLLLL--------------IQNIMP 923
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E. coli   385 SLNIKTPGAEQLIMNLS-GGNQQKAILGR-----WLSEEMKVILLDEPTRGIDVGAKHEIYNV-- 441

  Fly   924 VFFVVVTILIIKTQGTFQELKPITISLTQYPLAVTVLDR 962
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E. coli   442 -------IYALAAQGV-----AVLFASSDLPEVLGVADR 468

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abca3	NP_608445.2	rim_protein	<137..1708	CDD:130324	109/494 (22%)
araG	NP_416413.1	araG	4..504	CDD:183077	109/494 (22%)