Protein Alignment Abca3 and abca12

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608445.2
• Gene: Abca3 / 33103
• FlyBaseID: FBgn0031170
• Length: 1714
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_686632.6
• Gene: abca12 / 558335
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-9790
• Length: 5913
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1759
• Identity: 491/1759 - (27%)
• Similarity: 834/1759 - (47%)
• Gaps: 278/1759 - (15%)

  Fly   125 LGKNKICESENATQLELDTVSKNAFAGVQFD-----------DAWA-NLTENDPLPNDFHFALRF 177
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Zfish  4228 LEKNKFIMDQITT---LSVLMMNLSSCVNFDRYRGFNSTDELDKQAEKLAQNRELYASIIFKL-- 4287

  Fly   178 PAELRTATIAIANTWLTMRLFPTIDLT---GPRNEGDDDGGIPPGYLRE-------------GFL 226
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Zfish  4288 PKENSSS------------LPPNIDYTIRMNIENVMRTDRARNPFWVKDAYISATRTQRYSRGFV 4340

  Fly   227 PLQHSLSMAYLRQKSGE-QDLPNVVMKRYPFPAYIFDPLLEGMSSIMSLIILLSFIYPCTYITKY 290
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Zfish  4341 YLQESIERAIIEMQTGNAMDGPAVQMQAFPYPCYYKDEYLNSIAFAFPMALMISWVLFIAHFVKK 4405

  Fly   291 ITAEKEKQLKEVMKIMGLSNWLHWTAWFVKSFIMLTISAILIAILVKINWSEDVAVLTHANFTAL 355
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Zfish  4406 LVHERELRLHEYMKMMGVNPISHFFAWLIESGAFLLVTVIILTIILKAG-----GILPRSDGFVL 4465

  Fly   356 VFFLIIYIVSSICFCFMMATFFSRASTAAAVTGLIWFIAYIPYSFTINSYDDLSLSSKLGWSLIS 420
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Zfish  4466 FLYLCDYGFSVLAVSFLVSSFFDKTNIAGLSGSLIYVISFFPFIVLIHLEDNLSFSVKSALSLFS 4530

  Fly   421 NTAMGFGIKLILGFEGTGEGLQWSNFFTPVSVDDTLTLGAVMIMMLVSCVIYMIICLYVEQVMPG 485
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Zfish  4531 PTCFSYASQYIARYEKQEEGIQWSNMYISPLAGDTSSFGWLCWLLLIDSLVYFIIGIYIRMVFPG 4595

  Fly   486 SFGVPRPWNFPFTREFW------CGERE--------YTGVEDIPNGHVEQRDPKAF----ETEPE 532
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Zfish  4596 KYGIAVPWYFPVTKSFWTDMFSCCSKTPKKIGRGLLFTNMMQDQSSMNKSKGKGSLVAKGEEDFS 4660

  Fly   533 GKHIGLQMRHLKKRFGNKMVVKGLSMNMFEDEITVLLGHNGAGKTTTISMLTGMFPPTSGTAIIN 597
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Zfish  4661 GLPVGVSLYGLTKTYGKRNAVDNLNLSFYEGHVTSLLGHNGAGKTTTMSLLTGLFAPTVGTIEVY 4725

  Fly   598 GSDIRTNIEGARMSLGICPQHNVLFDEMSVSNHIRFFSRMKG--LRGKAVEQEVAKYLKMIELED 660
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Zfish  4726 GMDMQMFIDDVRKEMGVCMQYDVLFDHLTTKEHLLLYAQIKAPHWTKQEVKEQVHKILMETDMHA 4790

  Fly   661 KANVASSKLSGGMKRKLSVCCALCGDTKVVLCDEPSSGMDPSARRQLWDLLQQEKVGRTLLLTTH 725
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Zfish  4791 HRHKRVGTLSGGMKRKLSISIAFIGGSRLVVLDEPTTGVDPCSRRSIWDIIIQHKQERTIILSTH 4855

  Fly   726 FMDEADVLGDRIAIMCDGELKCQGTSFFLKKQYGSGYRLICVK-------RDDCETNEVTALLNK 783
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Zfish  4856 HLDEAEVLSDRIAFLERGGLKCCGSPFYLKDKLAKGYNLTLTKKVETADSKEKFDYEKLRDFIHS 4920

  Fly   784 YIPGLKPECDIGAELSYQLP---DSASAKFEEMFGQLEEQSDELHLNGYGVGITSMEEVFMKVGA 845
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Zfish  4921 HLPDARQKDREMGDLVYALPPYTPQNASEYHSLLNSLDQNLDKLHLGCYGISDTTLEEVFLQLTR 4985

  Fly   846 E-----KDNTGNIKDQ--HEIMNGGSGFRGEDDNESVQSDGIFSENRRLLQGLQLLSNQWKAMLL 903
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Zfish  4986 DDLEPKESETWSVSESVIENDMFASRDSLSEDCNSMYLGEKASLTGNSTVRGFALGVQRVIAMLL 5050

  Fly   904 KKFLYTWRNKLLLLIQNIMPVFFVVVTILIIKTQGTFQELKPITIS------------------- 949
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Zfish  5051 KRVHHSRRDWKGLFSQVLLPVLFVIAAMGLGSIKSDLQHFPEIVLSPALYHVDEQYAFFSNQNPN 5115

  Fly   950 -------LTQYP---------------------------------LAVTVLDRSN-VQN--GTGY 971
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Zfish  5116 TSRLVDTMMSYPGIDHVCMTDPTDPVCKGRPSTGSQTWVSGGNSSATFTTCKCSNQVQSCPAQGY 5180

  Fly   972 EIANKYEDLARSYGSNYGLELTGTQGFEDYIL--------------DLGKTIQVRINSRYL-VAA 1021
            :...|     |...|.....|||. ..|:|:|              :.||.:.:.:....| |.|
Zfish  5181 DPPRK-----RCPSSQIVYNLTGV-NIENYLLATANNFIRDRYGGWEFGKPLPIDLKMDMLDVPA 5239

  Fly  1022 TITESKITAWLNNQALHTAPLTVNMVHNAI------ADKLFGSSVKIQVTNAPLPYTTSTLLSQL 1080
            ..|.||:  |.|::..|:.|..:|.::|..      .:|.:..::.|    :..||........|
Zfish  5240 NRTLSKV--WYNSEGHHSMPAYLNSLNNFFLRSSLPPEKRYQYAISI----SSHPYPGQVQDEDL 5298

  Fly  1081 STGNNLGTQLASNLCFCMCF--VSSIYILFLIKERESRAKLLQFVGGVKVWTFWLSQFICDFASY 1143
            ..|..:...:|  ||....:  :::.::::.::|..:.:|.||.:.|:....:|:..|..|.|.|
Zfish  5299 MVGGLVSILVA--LCVLTGYSIMTASFVIYEVQEHHTGSKRLQQISGISEPFYWIINFFYDMALY 5361

  Fly  1144 IVTALIVVITIVCFQETGLSTFGELGRYYLLLLLFGFAVLPFIYIMSLFFREPATGFARVSIVNI 1208
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Zfish  5362 MIPVVLSVVMVAAFQLPAFTERQNLAAVTLLLVLFGFSTFPWMYLLSAMFKDTEMAFIGYVCINL 5426

  Fly  1209 FCGMALFIVVVVMSSELF----------DTKDTADILGWIFRIFPHFSLA---MSLNKVYTNTAT 1260
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Zfish  5427 F----ISVNTIISTSIIYFLGQLNQNDQSIQNIYQTMSNIFLVFPQFSFGNGLMELARV------ 5481

  Fly  1261 RNACAKAGALPPILLCELVPQCCNLKPYFAWEEPGVLPETVYMAVTGVVFFLIIIVLEFRLINEL 1325
                            ::..|..:.....|::.|..:....:|.::..:...|...|...|...|
Zfish  5482 ----------------DMQVQILSGFGVDAYKNPFSMDVLGWMFISMFLQGFICFTLRLLLNKTL 5530

  Fly  1326 MFKIRQLI-----SKPPPPPTEGQLDDDVANERERILQMSSNELATKNLVLDRVTKYYGQF---- 1381
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Zfish  5531 LRKVRRLFCWKRNAVQSYSPNE---DEDVLDER---LRVGRGDASSDILQVNHLTKVYQNFSKRV 5589

  Fly  1382 MAVNQVSLCVQEVECFGLLGVNGAGKTTTFKMMTGDERISSGAAYVQGLSLESNMNSIYKM---- 1442
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Zfish  5590 QAVKSLSVGIPAGECFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDISPSGGSAKIR--DIDGRMVDIIDCRREG 5652

  Fly  1443 --IGYCPQFDALLDDLTGREVLRIFCMLRGVQESRIRQLSEDLAKSFGFMKHIDKQTHAYSGGNK 1505
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Zfish  5653 INIGYCPQVDALDDLLTGEEHLYFYARIRGISKRDISQVVNYLLKKLQLNYHRNNTSESYSCGTR 5717

  Fly  1506 RKLSTAIAVIGSPSVIYLDEPTTGMDPAARRQLWNMVCRIRDSGK-SIVLTSHSMEECEALCTRL 1569
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Zfish  5718 RKLSTALALIGNPQILLLDEPSSGMDPRSKRHLWKIISE-QVMGKCAVVLTSHSMEECEALCTRL 5781

  Fly  1570 AIMVNGEFKCIGSTQHLKNKFSKGLILKIKVRRNLEALRQARLSGGYARNPDEQTVPAQMSQRDI 1634
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Zfish  5782 AIMVKGQFRCLGSLQHIKNRFGSGFTVKM------------YLTG---------------ASYDV 5819

  Fly  1635 DAVKEFVETEYPNSILQEEYQGILTFYIPLTGVKWSRIFGLMESNRDQLNVEDYSVSQTTLEEIF 1699
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Zfish  5820 DMISNFMQQNFPGTCLKDNHSNMVEYHVPVAPGGVASIFSLLESNKTVLQIKHFSVSQTTLDEVF 5884

  Fly  1700 LEFA 1703
            :.||
Zfish  5885 INFA 5888

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abca3	NP_608445.2	rim_protein	<137..1708	CDD:130324	487/1747 (28%)
abca12	XP_686632.6	rim_protein	4..>93	CDD:130324
		COG5412	<2412..2813	CDD:444167
		rim_protein	4105..5897	CDD:130324	491/1759 (28%)