Protein Alignment Abca3 and CG43672

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608445.2
• Gene: Abca3 / 33103
• FlyBaseID: FBgn0031170
• Length: 1714
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_788912.3
• Gene: CG43672 / 318910
• FlyBaseID: FBgn0263747
• Length: 1690
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1816
• Identity: 404/1816 - (22%)
• Similarity: 767/1816 - (42%)
• Gaps: 273/1816 - (15%)

  Fly    10 FVLLLWKNWTLQWNHKWQMVIELVLPAIFSLLLVLVRTLVDTEQKGVRYYNEQNLTDLNLLQHSL 74
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  Fly     9 FCLLVWKNFQKQKHNKLVLILSLVLPVMSSLFLLFIRSSSDS---NMRDYSIR--AEAELLEFSW 68

  Fly    75 HRSSYLGKLIALIAPNRRR-----KNGGFSKFEFI----LCYSP-VNPVLKKLVEEAW--QSLGK 127
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  Fly    69 --SSLIGKI------QERRAKMASKQRNFTTNVFIPDIRVAFAPNSNAALRRLMGDALGKLSMSE 125

  Fly   128 NKICESENATQLELDTVSKNAFAGVQFDDAWANLTEN-DPLPNDFHFALRFPAELRTATIAIANT 191
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  Fly   126 DKIVDFENCNDMRIHAASEHYLASVCF----RNVDESLNGLPTVLNFAIIMPSELRN----YEDT 182

  Fly   192 WLTMRLFPTIDL----TGPRNEGDDDGGIPPGYLREGFLPLQHSLSMAYLRQKSGE-QDLPNVVM 251
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  Fly   183 WIGDSWKETTTLMDRDVAEEDEFDEDG--YTDYMGEGFVPLQYHISMQFLRATASKVEKLPKVVM 245

  Fly   252 KRYPFPAYIFDPLLEGMSSIMSLIILLSFIYPCTYITKYITAEKEKQLKEVMKIMGLSNWLHWTA 316
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  Fly   246 RRFNENPNVL--LSEGIGTSVVLLILLGFMFPVTILTTLIVEERELGQRYMLKILNASATLQMAA 308

  Fly   317 WFVKSFIMLTISAILIAILVKINWSEDVAVLTHANFTALVFFLIIYIVSSICFCFMMATFFSRAS 381
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  Fly   309 WFFNVFTHFLITSLLITILLKIEWNGATAAVNKCPWPILLCFLISYGCSVTSLIILMTSAMRRSR 373

  Fly   382 TAAAVTGLIWFIAYIPYSFTINSYDDLSLSSK----------LGWS--LISNTAMGFGIKLILGF 434
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  Fly   374 VAMVMAPIIWILLALPL-----------LSKKELLSDGPDVFYGFATVLLCNVSFSRGLSKIFYI 427

  Fly   435 EGTGEGLQWSNFFTPVSVDDTL--TLGAVMIMMLVSC---VIYMIICLYVEQVMPGSFGVPRPWN 494
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  Fly   428 E-----------------DYTLGVTIGKYMFYRVSKSDFGIFVPIVCFYVQTI----FCTLLAMI 471

  Fly   495 FPFTREFWCGER------EYTGVEDIPNGHVEQRDPKAFETEPEGKHIGLQMRHLKKRFGNK-MV 552
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  Fly   472 FENNAYFWLAIRVKNLLKKYHATRSAV-GRLKRQIPEVSFSKTSAEAL-IEFRGVWQKYSNSTYV 534

  Fly   553 VKGLSMNMFEDEITVLLGHNGAGKTTTISMLTGMFPPTSGTAIINGSDIRTNIEGARMSLGICPQ 617
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  Fly   535 VQDITLNVYAGEVVALLGHNASGKSTIIKMLYGRTRPKLGEIYLSGFNIVTQRKEALKNSSISMS 599

  Fly   618 HNVLFDEMSVSNHIRFFSRMKGLRGKAVEQEVAKYLKMIELEDKANVASSKLSGGMKRKLSVCCA 682
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  Fly   600 YKTLFTELVVLDHLVFLSRLRGLSKTEAKLEAKALLRYLKLEDWEKTLVNDLTIGQRRVLQFLCA 664

  Fly   683 LCGDTKVVLCDEPSSGMDPSARRQLWDLLQQEKVGRTLLLTTHFMDEADVLGDRIAIMCDGELKC 747
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  Fly   665 FAGGNQIVILDKPFDGIDEQRTSLFYSLILDQKKNRSIFFTSNNQKVASGIADRIFVLSKGKLQA 729

  Fly   748 QGTSFFLKKQYGSGYRLICVKRDDCETNEVTALLNKYIPGLKPECDIGAELSYQLPDSASAKFEE 812
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  Fly   730 FGTVKKLCRMLNESYRLIIFGNEKCSFKDVYAFMATFIPEIEMDSILADCASFLVKHKYHTELIN 794

  Fly   813 MFGQLEEQSDELHLNGYGVGITSMEEVFMKVGAEKDNTGNIKDQHEIMNGGSGFRGEDDNESVQS 877
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  Fly   795 LIENLARLKNDLNVYSFEIHECSIDDILASL--------YTRDKSTLEFGQPGL------QTLLA 845

  Fly   878 DGIFSENRRLLQGLQLLSNQWKAMLLKKFLYTWRNKLLLLIQNIMPVFFVVVTILIIKTQGTFQE 942
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  Fly   846 SRQQSAKRRFIIPTMYLLEELRQLLIA----DTRNWFLPILKLTLPSLVVVWTLSMPYFWHNCRQ 906

  Fly   943 LKPITISLTQYPLAVTVLDRSNVQNGTGYEIANKYEDLARSYGSNYGLELTGTQGFEDYILDLGK 1007
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  Fly   907 PGHITFPMSDHGDGIILMQKDTLDS----------ELLVAS-------EMYAKVG----VTEVDK 950

  Fly  1008 TIQVR---INSRY----LVAATITES------KITAWLNNQALHTAPLTVNMVHNAIADKLFGSS 1059
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  Fly   951 TVDITTFIYNYEYKNSLLSDADIMEAVIFSNVQIEVLFNTKWPHTAPDSLAQALNSLAVAFIDGD 1015

  Fly  1060 VKIQVTNAPLPYTT-STLLSQLS-TGNNLGTQLASNLCFCMCFVSSIYILFLIKERESRAKLLQF 1122
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  Fly  1016 AGIKVELEVLPFSTIHTLQLHLNIDGYDL--IFASCLSFCFCFIWSIPLLHMTLSRDGRYNYVEL 1078

  Fly  1123 VGGVKVWTFWLSQFICDFASYIVTALIVVITIVCF-----QETGLSTFGELGRYYLLLLLFGFAV 1182
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  Fly  1079 IAGMPTIVLIVAFLIYELLVVLLALFPINIAVIFFHWDLLMDSNIHIYSVYVMFIIAACVFSLNI 1143

  Fly  1183 L---------PFIYIMSLFFREPATGFARVSIVNIFCGMALFIVVVVMSSEL--FDTKDTADILG 1236
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  Fly  1144 LITIMPISDMPFVYL------------------KVLLAYSLGILVYIAVKELRPFTNPNTAHFL- 1189

  Fly  1237 WIFRIFPHFSLAMSLNKVYTNTATRNACAKAGALPPILL---CELVPQCCNLKPYFAWEEPGVLP 1298
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  Fly  1190 -LLDFHPFYALLHNLMRIASISEKIWLCSDRQIYETSVYADQCNTIPNCCD----------DDAQ 1243

  Fly  1299 ETVYMAVTGVVFFLIIIVLEFRLINELMFKIRQLISKPPPPP--------------------TEG 1343
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  Fly  1244 EFYHLRYLCCVYLLLVVV----WISIFIFLKSHMVKRRPRQPKYFWDSDPDSKYDQNILHIMEPS 1304

  Fly  1344 QLDDDVANERERILQMSSNELATKNLVLDRVTKYYGQFMAVNQVSLCVQEVECFGLLGVNGAGKT 1408
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  Fly  1305 ELENTWIHEKSRVSTLERNHIESKALHVEHLSVFFGLKAAIKHIDFMVNRYQVMSVFGANGTGKS 1369

  Fly  1409 TTFKMMTGDERISSGAAYVQGLSL---ESNMNSIYKMIGYCPQFDALLDDLTGREVLRIFCMLRG 1470
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  Fly  1370 VLLKTILGIYTPSSG-RIISSKTVPFKSKDLDSCH-MVGYSAQEFQTMQLMTILETWDLILRIRR 1432

  Fly  1471 VQESRIRQLSEDLAKSFGFMKHIDKQTHAYSGGNKRKLSTAIAVIGSPSVIYLDEPTTGMDPAAR 1535
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  Fly  1433 SKQISFRAEATKLCKIFGLYKYRFNSLSICSQGVLKRLSLGIALMSDAELILLDDPFTHLDIVSQ 1497

  Fly  1536 RQLWNMVCRIRDSGKSIVLT-SHSMEECEALCTRLAIMVNGEFKCIGSTQHLKNKFSKGLILKIK 1599
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  Fly  1498 RSMLHIIHDLRRRGHSIIYTCSDTAYSTPAL--RMATLSYPGIAVIGEREEMQQNYYSSYYM-VE 1559

  Fly  1600 VRRNLEALRQARLSGGYARNPDEQTVPAQMSQRDIDAV------KEF------------------ 1640
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  Fly  1560 TRIHLAEL-------GSPIDFDSQSTEAKEDRAGTTGTLLRHKHQEFSAAFTDSADRWKYLKLCG 1617

  Fly  1641 -VETEYPNSILQEEYQGILTFYIPLTGVKWSRIFGLMESNRDQLNVEDYSVSQTTLEEIFL 1700
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  Fly  1618 VIENVFPHAIIKNVSFPRVCFWLSSHMYPMSRIVDTLHRNKQ--DFYSFSVSQPSVNSVFL 1676

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abca3	NP_608445.2	rim_protein	<137..1708	CDD:130324	362/1677 (22%)
CG43672	NP_788912.3	rim_protein	<266..>732	CDD:130324	129/499 (26%)
		ABC_subfamily_A	519..737	CDD:213230	64/217 (29%)
		P-loop containing Nucleoside Triphosphate Hydrolases	1330..1517	CDD:476819	45/188 (24%)