Protein Alignment CG1494 and CG6052

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_649002.3
• Gene: CG6052 / 39971
• FlyBaseID: FBgn0036747
• Length: 1725
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1813
• Identity: 430/1813 - (23%)
• Similarity: 826/1813 - (45%)
• Gaps: 279/1813 - (15%)

  Fly     9 KFLLMNWKNHKLQLANPLELLVILLVPPLFTLVAVLMRFFIPVNHRSDTVYDPIDLD--RSWMQM 71
            |..|:.|||..||....::::..|::|.||..:.:::|..:......:..|..:.:.  ..:|:|
  Fly    21 KLKLLMWKNWILQWNQKMQIVFALVLPVLFLCLILVLRIIVLPEKMDEIRYPTVSISDLNLYMRM 85

  Fly    72 VEKLEKARQVADTYNVKGN--PFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQKQIEPMTSVGFEDCEEMR 134
            |....:......:.|:..|  .:||:..|.         .|::.....::..:.:..::....|.
  Fly    86 VPLGNRILHENGSLNIPRNFLCYTPNNPIN---------SAIVGATAIRLRLLGTRAYDTALHME 141

  Fly   135 ESVIENGLFAGLCFDGSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPM-LNYTILLPSELRMLDGDFRMANWMT 198
            :.::.:...||:.|:          :.:.:.:.....|: |||::..|||||.:.|.. :..|.|
  Fly   142 QDMVLHNFLAGVQFE----------DNENVNTNDAGYPLNLNYSLRFPSELRTMQGPI-IDTWRT 195

  Fly   199 --LYNDDPNTFVLTRLNQPYEGGF-VGYVREGFIRLQKSVSESFLVLTS---HKSLPTIQIRRFP 257
              |:.....:....||:.  :||. |||:||||:.:|.:::.|:|.|.|   ...:|.|.::|||
  Fly   196 SRLFLSYDTSGSRNRLDN--DGGVPVGYIREGFLPIQHALTMSWLALASGVTDTGIPAIHLQRFP 258

  Fly   258 ITGREQDPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLINMNIGNLIHFVSWYLK 322
            ......|.|:..|...:||:|::.|::||......|.|||:.|:::.:..:.:.|.:|:|:|::|
  Fly   259 YRAYTYDQLLSGLRQLLPFVILLSFIYPASTVTKYVTSEKELQLKEIMKLIGVHNWLHWVAWFVK 323

  Fly   323 GLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAAVAFAIMVAAFFRNALNAVR 387
            ..|..|:...:|.:|:.:::.....|||.:.|..::|.|..|...:|....|:|..|..|..|..
  Fly   324 SYIMLMLVVFLIMSLIMVKFYASVAVLTFSSWVPVLLFLHTYVVTSVCLCFMLAVLFSKASTASA 388

  Fly   388 VLTILWIMSYVPTFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVATLVIEFLIERESI---VH-------- 441
            |..|.|.::|:|            ::..|..|...::::.|:|..:....::   :|
  Fly   389 VAAIFWFLTYIP------------YSFGYYYYERLSLMSKLLISLIFSNSALGFGIHVIVMWEGT 441

  Fly   442 ---ITWEDSGYRLNYDGG----HITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYVDM---------------- 483
               |||.:..:.::.|..    :|.:|.|     ..::::.:|.|||:.
  Fly   442 GEGITWRNMFHPVSTDDSLTLFYIIMTMS-----FGSIMFISICLYVEQVFPGEYGVPRRWNFMC 501

  Fly   484 ----WRGGDRSGKKMKKPNTNASVQEDPYHERGDSFTHQGQAIGVNSTKIYEVEPSHRRFKLKIK 544
                ||      :.:...|...|.|...:.........:.:.:|:   :::.::.::.:.|
  Fly   502 HKNYWR------QYVPSLNIVPSFQTILHGSAKAKSCRRAREVGI---QLFNLQKNYGKLK---- 553

  Fly   545 KLCKRFATNDRPALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSHNIQTE 609
                        |:...|..::.||:|||:||||.||:|.:.::.|:|:|:.||.:::.::|:|.
  Fly   554 ------------AVKGISLKMHRNEITVLLGHNGAGKTTTINMITGIVKPTSGTAIVNGYDIRTH 606

  Fly   610 RKAASMELGIAFGHDMLLTGFTVIDYLRFICRVKGLHNNIEIDGQSNYFLNVLQI---------- 664
            ...|...|||...:::|....:|.|::.|..::||:.....::.:...::.:|::
  Fly   607 LAKARESLGICPQNNILFKEMSVRDHIIFFSKLKGIRGTKAVENEVGKYMTMLKLQDKSYVAAKN 671

  Fly   665 --GGLKTKRIRTLTDRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTII 727
              ||:|.|            :|:|||..||:.::|.|:..|.:|...:..:|:|:..||..|||:
  Fly   672 LSGGMKRK------------LSLCCALCGNAKVVLCDEPSSGIDAAGRRSLWDLLQSEKDGRTIL 724

  Fly   728 LVSNSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVKGKNYKRDELFGMMNSYMP 792
            |.::....|:.:.||:||:|.|:|:|.||..:||..:|.||.|.|:.........:..::..|:|
  Fly   725 LTTHYMDEADVLGDRIAILSEGKLQCQGTSFYLKKRFGTGYLLVCIMQSGCDVGAVTQLIRKYVP 789

  Fly   793 NMSIERDIGYKVTFVLENKFEDQFPMLIDDLEENMQQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRFGCEDNDQS 857
            .:..||.:|.::|:.|..::..:|..|:.||:|...||.:|.:.:...::|::|:....:...|.
  Fly   790 PIKPERVLGTELTYRLPTEYSKKFAELLQDLDEKCAQLQLVGYGLSGATLEDVFMAVNTDKRVQG 854

  Fly   858 GAFQSHENAQVLLEE-YYSTLAEANEKGRRTGWKLFFLHGRAVIYKRWIAAHR-HWIVLIFEVLA 920
            ||.....:..:..:| .:.:......:.||.     |:..:|:..|::....| :|::.|..||.
  Fly   855 GAEGPPVDGSIDFKELVFDSKTREKRRIRRC-----FMFWQALFLKKFYTTTRNYWLLGIQLVLP 914

  Fly   921 MALVAVCTFSSI--FIYGKNYELEPLTFNLSQLHTVDAFVELFSEEEDVKD-----MHAYYTELL 978
            :|::|:...:|.  .||   |||..:..:::|..:  |:|.|   |::..|     ..||...|.
  Fly   915 IAVMALTILNSRGGRIY---YELPAMPISINQYSS--AYVVL---EDNTTDKTSSLADAYSKHLE 971

  Fly   979 YWYDAHVATLTKN---RHNAYALLTQNQFTAHVNSRYIFGATFDQKIVTAWFNNIPLHSAPYALN 1040
            ::  |...||.:.   :...|.|......:..::..::.|.|..:.....|.||.|||:||..||
  Fly   972 HY--ARRCTLLRTGDLKFEDYILSHDVNHSRRIDFHFLAGLTVSENNFIVWLNNKPLHTAPLTLN 1034

  Fly  1041 VVHNAVARHLFDEEATIDVTLAPLPFRTAINTFP-PSSHTFGGCLAFGICFVLTFIWPAFAIYMI 1104
            ::|||:|..|..::|:..||..|||:.....|.. ......|..::..:...:.||...:||.:|
  Fly  1035 LLHNALAIKLLGQDASTYVTNEPLPYSDDTRTLRLNKGQVLGAEISINLSLTMCFITAFYAIPII 1099

  Fly  1105 TERGSLLKKQQFLAGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVMVALYENPNH----DVMLYGYIS 1165
            .||.:..|..|||:||.||:|||..:::|.|..::.....::.:|.::...:    |:..|.|:
  Fly  1100 RERETRAKLLQFLSGVDVCAYWTSHIVWDYLVFVLSALSSILTIAAFKEIGYITPLDLSRYFYM- 1163

  Fly  1166 VTLMLGGFWVILLAYLMASLCRNPCYGFLWLCGINSI-GLVCFSQFYRTHPESMLLEPTFMAM-- 1227
              |::.||..|:|:|..:....:...||..:..||:: |...|..|...:.|:..|:.....:
  Fly  1164 --LLIFGFPGIMLSYAASGCFSDAATGFTRISIINTLMGTGLFLMFMTLNFEAFQLKDVAEKLAW 1226

  Fly  1228 -------YTVATVICKLFMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCC-IKSNYGTFTAGIYHD 1284
                   |::|:....:.:.|..:..|....:.....:: :|.::|.|| |...||....|:..:
  Fly  1227 YFRLSPHYSLASSTHSIHIGYNIRRGCSIGGIRKLPKQL-RCRNVPICCDIPGYYGWRKPGVLVE 1290

  Fly  1285 LVILTLLDIILL---------ACLFVSEYHSILGFADC-----RLDTRTNESPDS-NQESRAFPG 1334
            :..:.:|...|.         .|..::|.   ||  :|     |::..|:...|| ..|.|....
  Fly  1291 ITYMIMLGSTLFLLIVMHDAKVCNLIAEK---LG--NCFSKRKRVEGGTSIENDSVVAEQRVVRE 1350

  Fly  1335 ILSN---DTAALVDKEHTSRLNEEERSKYAAVGIGIVSKYRRNRVLRDLDFTLAKSECLSITGAN 1396
            ::::   |...||.|                    |..:||....::.:.|.:..:||..:.|.|
  Fly  1351 MINSGRKDVPLLVYK--------------------ISKRYRSKLAVKAISFHVPHAECFGLLGIN 1395

  Fly  1397 NSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIHDYSVNTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELLYIHAML 1461
            .:|||:..|::..:.|:.:|:.:|...:::||:|  ||.:|||||.|:|..:.|.||.|.|:.:|
  Fly  1396 GAGKTSTFKMLAGDEKITSGEAYIDGTNISTHKV--YRKIGYCPQFDALFEDLTGRETLNIYCLL 1458

  Fly  1462 QG--HRHRIGRELSEALLRLVGLTP-CW------------NRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSP 1511
            :|  .||               :|| ||            ::..:..:.|..|:|..|.:|||:|
  Fly  1459 RGVQRRH---------------VTPICWGLAISFGFAKHMDKQTKHYSGGNRRKLSTAISVLGNP 1508

  Fly  1512 DLICVDGVPAGLDPTGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPM 1576
            .::.:|...:|:||..:|.:..:...::..|.|.:.|..:..:.|.|..|..::::|:...:..:
  Fly  1509 SVLYLDEPTSGMDPAARRQLWQIIGLIRTAGKSIVLTSHSMDECEALCSRLAIMVDGEFKCLGSV 1573

  Fly  1577 DTETENYKSGYQLEVRFKRK-------------VNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNK------KF 1622
            .:....:..|..|:|:.|.|             .|...|:|......:....:..:.      |.
  Fly  1574 QSLKNQFSKGLILKVKVKHKKKTFQRVVEDSSSSNDKKSISETDLKFLQMASVMESSQADRILKV 1638

  Fly  1623 SAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLPLGTTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNML 1680
            :.|:..:.|||.|..|.:..:.:.:| .:.|.|:||..|..::.::|||||.|.:..|
  Fly  1639 NRFISKEIPDAELKEEYNGLITYYIP-HSKTLSKIFQLLETNSHKLNIEDYLIMQTRL 1695

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	385/1591 (24%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	65/231 (28%)
CG6052	NP_649002.3	rim_protein	21..>54	CDD:130324	11/32 (34%)
		rim_protein	<149..1709	CDD:130324	407/1676 (24%)