Protein Alignment CG1494 and CG1801

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_728408.3
• Gene: CG1801 / 33104
• FlyBaseID: FBgn0031171
• Length: 1655
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1800
• Identity: 380/1800 - (21%)
• Similarity: 710/1800 - (39%)
• Gaps: 373/1800 - (20%)

  Fly    37 LFTLVA----VLMRFFIPVNHRSDTVYDPIDLDRSWMQMVEKLEKAR---QVADTYNVKGN---P 91
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  Fly    24 LFEIVALVIMVLVIFLNPIAHSKRLLYTTTENENEQSIVSHKLQDINILTRMADSKREKTKYILA 88

  Fly    92 FTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQKQIEPMTSVGFEDCEEMRESVIENGLFAGLCF-----DGS 151
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  Fly    89 FTPETT---------FTSEVTKNVAKTLELSSTVGYESESEMQNQFDERTTLAGIVFNDLRDDGT 144

  Fly   152 PFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTILLPSELRMLDGDFRMANWMTLYNDDPNTFVLTRLNQPY 216
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  Fly   145 PLT-------------------LSISIRFPSEFRTI------APFLT-----EDRLWITRCS--- 176

  Fly   217 EGGFVG--------------YVREGFIRLQKSVSESFL------VLTSHKSLPTIQIRRFPITGR 261
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  Fly   177 --GRINPGRDRAKHDKQQDIYIREGFLQLQHQIFVEWYHQLRKDIVSTYPE-PNVEVYNILLKAA 238

  Fly   262 EQ----------DPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLINMNIGNLIHF 316
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  Fly   239 DEPCSVMSVAQLPTFLYNFIYLLPFLNIIRNV-AAQV-------EDGVMVHQWHYGYSFG----- 290

  Fly   317 VSWYLKGLIYEM---ISSLIIAALLKIRW--DQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAAVAFAIMVA 376
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  Fly   291 MQWGIKFLVLFLRMCILGVIYTIMLLAFWGFGGREGEFSGTGTIAFVCFITLYTVEIIITGMVVA 355

  Fly   377 AFFRNALNAVRVLTILWIMSYVPTFILSNNLE--GNIHALRYVSYAL------------------ 421
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  Fly   356 KLFANPTNAVLFALMLWLFMYAAFCII---LERYWDIHKY-YVFFILVAFCNCQMHFSMSLFRNC 416

  Fly   422 ---PNVVATLVIEFLIERESIVHITWEDSGYRLNYDGGHITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYVDM 483
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  Fly   417 IEKPEMVNT--IDFVL-----------------------IFTSAIS-----SALIYFLILLAI-Q 450

  Fly   484 WRGGDR-------SGKKMKKPNTNASVQEDPYHERGDSFTH--QGQAIGVNSTKIYEVEPSHRRF 539
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  Fly   451 WRMPGTFLSRRIVNNRPRKQQESDTTIM---YLGRAPSFQNFEFGDVGSVELMRLRHVSTSHR-- 510

  Fly   540 KLKIKKLCKRFATNDRPALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSH 604
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  Fly   511 ------------DSERKILKNISMRIYRGEVFVILGHIGSGKLTLLRILAGLKFPLRGNVYIMGN 563

  Fly   605 NIQTERKAASMELGIAFGHDMLLTGFTVIDYLRFICRVK---GLHNNIEIDGQSNYFLNVL-QIG 665
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  Fly   564 PFEPNGEARRL-VDFRFDEHGLNKHLTVEQTIDYHVRLKLSPSESDRYEIERRK--WLAILDQHV 625

  Fly   666 GLKTKRIRTLTDRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTIILVS 730
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  Fly   626 ESRGVRIGKLSSGSMKLVALCCCLAGDTPIIILEEPTTQLTGREAQIFWSIVHAEKENRAFIIAT 690

  Fly   731 NSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVKGKNYKRDELFGMMNSYMPNMS 795
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  Fly   691 YNVGEAEHVADRIGILSMGVLEASGTPFFLRSKFSSSVDLVIIKKPHVPDQPITDYINQFMQNIE 755

  Fly   796 IERDIGYKVTFVLENKFEDQFPMLIDDLEENMQQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRFGCEDNDQSGAF 860
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  Fly   756 PENEIGDSLTYRLPVIYRPRLQKLLIHLEIDRKMLGIENVRVVGAELSDIYMTL-----VTSFRL 815

  Fly   861 QSHENAQVLLEEYYSTLAEANEKGRRTGWKLFFLHGRAVIYKRWI-AAHRHW-IVLIFEVLAMAL 923
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  Fly   816 QQQMIPDVTQTFKYQVVSQKQLTKQRM---------RAMFYKKMIHTAPNVWPIIMIF--TSFVL 869

  Fly   924 VAVCTFSSIFIYGKNYELEPLTFNLSQLHTVDAFVELFSEEEDV-------KDMHAYYTEL---- 977
            :|:....|:.       |:......:.:|..      |.|.|||       ||  ..|.::
  Fly   870 IAIIARLSVL-------LDMPKERQNSIHIG------FREPEDVVKYLPNLKD--CGYIDIRSAV 919

  Fly   978 ------------LYWYDAHVATLTKNRHNAYALLTQNQFTAHVNSRYIFGA--TFDQKIVTAWFN 1028
                        .:..|:.|......|:|   |..:|:..:       |||  :...:.:..:.:
  Fly   920 KVNKKKSVGVSRTFDDDSFVCEKGSYRNN---LRKKNELRS-------FGAVESDGDEHLNGYIS 974

  Fly  1029 NIPLHSAPYALNVVHNAVARHLFDEEATIDVTLA--PLPFRTA--INTFPPSSHTFGGCLAFGIC 1089
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  Fly   975 QDMFHSAPMMLNLLQNVILRLSYPMQTDLVVLVENHPLPTQLSQKINVLDNKIAHIHVPLVVGCI 1039

  Fly  1090 FVLTFIWPAFAIYMITERGSLLKKQQFLAGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVMVAL---- 1150
            ..||.  ..|.|.::.|....::..|.:||:.:..:|...:.:|.....::...:||:::|
  Fly  1040 IPLTV--SVFVIPLVEEEIYDVRFLQHMAGLGLKVFWGINLFWDWFTFFVYSVIIVVIMSLMGIG 1102

  Fly  1151 ----YENPNHDVML--YGYISVTL-MLGGFWV---ILLAYLMASLCRNPCYGFLWLCGINSIGLV 1205
                |||....|:|  :|..::.| .|...:|   |:.|:|::.|          |.|::  |||
  Fly  1103 GFGFYENAIMVVLLTTFGLAALPLTYLVSMFVNKSIVRAFLVSVL----------LQGVS--GLV 1155

  Fly  1206 CFSQFYRTHPESML------LEPTFMAMYTVATVICKLFMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNS 1264
            .:..::.....:.:      :.|.|..:..|:.|..:...    :.||:|           ||.:
  Fly  1156 LYIIYWDVANSNTIFFYAACMSPGFSLLDGVSNVYAQNLE----QAICID-----------KCEA 1205

  Fly  1265 ------------IPNCCIKSNYGTFTAGIYHDLVILTLLDIILLACLFVSEYHSILGFADCRLDT 1317
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  Fly  1206 TDSCTEENMNEVVPNCKFDTFFKWAAPGILPPILYMVLSALIFLMLIFWIELH--------RREK 1262

  Fly  1318 RTNESPD-SNQESRAFP---GILSNDTAALVDKEHTSR-----LNEEERSKYAAVGIGIVSKYRR 1373
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  Fly  1263 KFHTSRDLRKMRTATYPFDDGDVADVKQKIAEADNTKAKQSVFLVDQVEARVPAAG--------- 1318

  Fly  1374 NRVLRDLDFTLAKSECLSITGANNSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIH--DYSVNTHRVQCYRMV 1436
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  Fly  1319 -KRIHTVSFALNKYMSMGIFGPRNSGKSHLMRQLVGQRGFAFGEIYVRGLDFKYDLESIHTY--M 1380

  Fly  1437 GYCPQKDSLPSEFTPRELLYIHAMLQG-HRHRIGRELSEALLRLVGLTPCWNRSVRMCTTGQIRR 1500
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  Fly  1381 GYSPQHRGLLNELTPREHIRLLCMIRGVPEAKIGEKMHDLCL-MLNMTGWMHRKCSLLTAEKRHK 1444

  Fly  1501 LYFAYAVLGSPDLICVDGVPAGLDPTGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLL 1565
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  Fly  1445 LKIALALVAYNKILVLDEPTCGMPATTRREIWNILRYIRYCGKTIIFATNDELECKILADFIILF 1509

  Fly  1566 LEGQLWMIRPMDTETENYKSGYQLEVRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNKKFSAFMEIKF 1630
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  Fly  1510 QDSEMLAIGSLQYLRYKYSHGFYLEVRL---IRDGATLAESEENL-----RKDVENLAKFVNFLH 1566

  Fly  1631 PDAVLTIERDDSMVFVLPLGTTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFI 1675
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  Fly  1567 NRSELVGRLNNWFKFYVPVGHIVYSFLYGAMEKNKLRLNVSDYCI 1611

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	335/1584 (21%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	67/223 (30%)
CG1801	NP_728408.3	ABC2_membrane_3	<246..379	CDD:463674	32/145 (22%)
		rim_protein	<514..1537	CDD:130324	248/1116 (22%)