Protein Alignment CG1494 and Abca8a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001268753.1
• Gene: Abca8a / 303638
• RGDID: 1307333
• Length: 1615
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1597
• Identity: 339/1597 - (21%)
• Similarity: 671/1597 - (42%)
• Gaps: 320/1597 - (20%)

  Fly   225 REGFIRLQKSVSESFLVLTSHKSLPTIQIRRFPITGR--EQDPLM---GNLNYGMPFIIIIGFLF 284
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  Rat   174 RHGFVALQAAINSAIIEVTTNHS---VMEEMMSLTGKYIKIDSFIAQEGTTTDYFLFLCIIAF-S 234

  Fly   285 PAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLINMNIGNLIHFVSWYLKGLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVL 349
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  Rat   235 PLTYYISAGVTRERKKMKAFMTVMGLRDSAFWLSW---GLLYGVIVFIVTLFLTFVVYSVQ--FV 294

  Fly   350 TQTPWYILILVLFCYNCAAVAFAIMVAAFFRNALNAVRVLTILWIMSYVPTFILSNNLEGNIHAL 414
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  Rat   295 FMTGFMMIFSLFFFYGLSLISLSFLMSVLLKKSFLTDLVVFFLTV---------SCGSLGFAALY 350

  Fly   415 RYVSYALPNVVATL-VIEFLIERESIVHITWEDSGYRLNYD---GGHIT-----VTASSWIFMLN 470
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  Rat   351 RYLPVSLEWLLSLLSPFAFMLGMTQLL---------RLDYDLESSGHPTGNPNVVIATVFLLFFD 406

  Fly   471 ALVYCAIGLYVD--------------------MWRGGDRSGKKMKKPNTNASVQEDPYHERGDSF 515
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  Rat   407 GVFYLMLTFYFEKVLPGEYGRRHPPLFFLKSSFWTGQNPADRTVLD-------NERDYEFPDDSF 464

  Fly   516 THQGQAIGVNSTKIYEVEP----SHRRFKLKIKKLCKRFATNDR--PALNLFSWNVYENEVTVLM 574
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  Rat   465 -----------------EPVSTDFHGKEVIRIRNLTKEYIQRSKRTEALKDLTLDVYKGQITAIL 512

  Fly   575 GHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSHNI--QTERKAASMELGIAFGHDMLLTGFTVIDYLR 637
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  Rat   513 GHSGAGKSTLLNVLSGLCVPTKGWVTIHDNKLSEMTDLESISKLTGVCPQCNVQFDFLTVRENLR 577

  Fly   638 FICRVKGLHNNIEIDGQSNYFLNVLQIGGLKTKRIRTLTDRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVH 702
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  Rat   578 LFAKIKGIQ---EVDNEVQRVLLALEMKNIQNTLVQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPT 639

  Fly   703 SDLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTIILVSNSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHG 767
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  Rat   640 AGLDPFSRHRVWNLLKERKADRVVLFSTQFMDEADILADRKVFISQGKLRCAGSSLFLKKKWGIG 704

  Fly   768 YRLTCVKGKNYKRDELFGMMNSYMPNMSIERDIGYKVTFVLENKFEDQFPMLIDDLEENMQQLGV 832
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  Rat   705 YHLSLQLSETCVHERITSLVKQHIPDSKLSAESEGKLNYILPLERTNKFPDLYRDL-ERCPDLGI 768

  Fly   833 VSFRIRDTSMEEIFLR----------FGCEDNDQSGAFQSHENAQVLLEEYYSTLAEANE-KGRR 886
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  Rat   769 ENYGVSVTTLTEVFLKLEGKSAIDSDIGETEDVQAGG--TRGPGRLDGEQFVSLLNEMSKTKG-- 829

  Fly   887 TGWKLFFLHGRAVIYKRWIAA--HRHWIVLIFEVLAMALVAVCTFSSIFIYGKN---YELEPLTF 946
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  Rat   830 -GMALWWQQLCAVTRLRFLKLKYRRKSIVILILILGIGLLHILSANVHRLVNQSDYCWELSPHTY 893

  Fly   947 NLS-----QL------------HTVDAFVELFSEEEDVKDMHAY----YTELLYWYDAHVATLTK 990
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  Rat   894 FLTPGQRPQMPLTNLLIINKTGEKIDDFLHSLEQQNIALEVDAFGTRNGTEDSQYNGAIIVAGGE 958

  Fly   991 NRHNAYALLTQNQFTAHVNSRYIFGATFDQKIVTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAVARHLFDEEA 1055
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  Rat   959 KNYN---------FTLACNTK-------------------RLNCFPVLVDIVSNALL-GLFTPSV 994

  Fly  1056 TIDVTLAPLPFRTAINTFPPSSHTFGGCLAFGICFVLTFIWPAFAIYMITERGSLLKKQQFLAGV 1120
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  Rat   995 HIQTDRSSFPEDTGYTQFYHLLYMFSWIL------LMACVPPYISMTSIDDYKNRAQFQLWISGL 1053

  Fly  1121 RVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVV-VMVALYENPNHDVMLYG---YISVTLMLGGF--WVILLA 1179
            ...:||....|::   :.::.|.:: |.:|.|.:...:.|:..   :|.: |..||:  .||.:.
  Rat  1054 SPSAYWFGHALFE---IPVYSALILSVYIAFYFSAPPESMITTRDLFIQI-LYAGGYAMSVIFMM 1114

  Fly  1180 YLMASLCR---------NPCY---GFLWLCGINSIGLVCFSQFYRTHPESMLLEPTFM----AMY 1228
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  Rat  1115 YVISFICRKGRKNSGIWSLCFYIVSFISLC------LMLFKFF----------EDTFLFSSIALI 1163

  Fly  1229 TVATVI-CKL--FMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCCIKSNYGTFTAGIYHDLVILTL 1290
            .|.|:: |.|  |..:||..|.:.|...:|                  |..|.|..:|.|:.|
  Rat  1164 PVVTLVGCTLLHFQNHEFPEISLYPERYYT------------------YLFFLAPFFHFLIFL-- 1208

  Fly  1291 LDIILLACLFVSEYHSILGFADCRLD------TRTN------ESPDSNQESRAFPGILSNDTAAL 1343
               .:|.||     ....|....|:|      :|::      |.|:...|..:...:.:.:....
  Rat  1209 ---FILRCL-----ERKFGMKTMRMDPVFRISSRSDRVFNNPEEPEGEDEDVSLERVRTANALTS 1265

  Fly  1344 VDKEH-----TSRLNEEERSKYAAVGIGIVSKYRRNRVLRDLDFTLAKSECLSITGANNSGKTTL 1403
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  Rat  1266 ADFQEKPVIIASCLRKEYKGKKKC----FVLKGKKKIATRNISLCVRKGEVVGLLGHNGAGKSTS 1326

  Fly  1404 LKVVVNETKMNAGQLWIHDYSVNTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELLYIHAMLQGHRHRI 1468
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  Rat  1327 IKMITGEIKPSAGQVQLKGNSTG----DTPEFLGYCPQENALWQHMTVREHLEIFAAIKGMSK-- 1385

  Fly  1469 GRELSEALLRL---VGLTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLICVDGVPAGLDPTGKRI 1530
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  Rat  1386 -SDAAVAIARLADALKLQDQLKSPVKTLSEGVKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQ- 1448

  Fly  1531 ILMMTSTMQAMGSSFLYT----MLTG---LDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTETENYKSGYQ 1588
                 ...||:.::|..|    :||.   .:||.:..|..:::.|:|..|..:......:...|.
  Rat  1449 -----QMWQAIQATFANTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGKLRCIGSIQHLKSKFGKEYL 1508

  Fly  1589 LEVRFK--RKVNP-NVSMSRATWNLINHFPMSP-NKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLPL 1649
            ||::.|  .:|.| |:.:.|.       ||.:. .:::|:.|..|.|       |:|    |.||
  Rat  1509 LEMKVKTPTQVEPLNMEIMRL-------FPQAARQERYSSLMVYKLP-------RED----VQPL 1555

  Fly  1650 GTTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNMLVGFQIF 1686
                 |:.|..|.......::|:|.::::.|.  |:|
  Rat  1556 -----SQAFFKLETVKQSFDLEEYSLSQSTLE--QVF 1585

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	339/1597 (21%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	62/223 (28%)
Abca8a	NP_001268753.1	rim_protein	<212..1592	CDD:130324	330/1556 (21%)