Protein Alignment CG1494 and ABCA1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_005493.2
• Gene: ABCA1 / 19
• HGNCID: 29
• Length: 2261
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1995
• Identity: 413/1995 - (20%)
• Similarity: 777/1995 - (38%)
• Gaps: 490/1995 - (24%)

  Fly    19 KLQLANPLELLVILLVPPLFTLVAVLMRFFIPVNHRSDTV---YDPIDLDRSWMQMVEKLE---- 76
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Human   405 ELAVFHDLEGMWEELSPKIWT--------FMENSQEMDLVRMLLDSRDNDHFWEQQLDGLDWTAQ 461

  Fly    77 -----KARQVADTYNVKGNPFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQK--------QIEPM-TSVGF 127
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Human   462 DIVAFLAKHPEDVQSSNGSVYT------WR-EAFNETNQAIRTISRFMECVNLNKLEPIATEVWL 519

  Fly   128 EDCEEMRESVIENGLFAGLCFDGSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTILLPS----ELRMLD 188
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Human   520 --INKSMELLDERKFWAGIVFTG-------------------ITP---GSIELPHHVKYKIRMDI 560

  Fly   189 GDFRMAN------WMTLYNDDPNTFVLTRLNQPYEGGFVGYVREGFIRLQKSVSESFL-VLTSHK 246
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Human   561 DNVERTNKIKDGYW------DPGPRA-----DPFED--MRYVWGGFAYLQDVVEQAIIRVLTGTE 612

  Fly   247 SLPTIQIRRFPITGREQDPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLINMNIG 311
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Human   613 KKTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVIIKGIVYEKEARLKETMRIMGLD 677

  Fly   312 NLIHFVSWYLKGLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAAVAFAIMVA 376
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Human   678 NSILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKL-----GNLLPYSDPSVVFVFLSVFAVVTILQCFLIS 737

  Fly   377 AFFRNALNAVRVLTILWIMSYVPTFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVATLVIE---------F 432
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Human   738 TLFSRANLAAACGGIIYFTLYLP-YVLC------VAWQDYVGFTL-KIFASLLSPVAFGFGCEYF 794

  Fly   433 LIERESIVHITWEDSGYR--LNYDGGHITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYVDMWRGGDRSGKKMK 495
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Human   795 ALFEEQGIGVQW-DNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLF--DTFLYGVMTWYIEAVFPGQYG---IP 853

  Fly   496 KPNTNASVQEDPYHERGDSFTHQGQAIGVNSTKIYEV----EPSHRRFKLKIKKLCKRFATNDRP 556
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Human   854 RPWYFPCTKSYWFGEESDEKSHPGS----NQKRISEICMEEEPTHLKLGVSIQNLVKVYRDGMKV 914

  Fly   557 ALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSHNIQTERKAASMELGIAF 621
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Human   915 AVDGLALNFYEGQITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGTAYILGKDIRSEMSTIRQNLGVCP 979

  Fly   622 GHDMLLTGFTVIDYLRFICRVKGL---HNNIEIDGQSNYFLNVLQIGGLKTKRIRTLT------- 676
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Human   980 QHNVLFDMLTVEEHIWFYARLKGLSEKHVKAEMEQMA---LDV----GLPSSKLKSKTSQLSGGM 1037

  Fly   677 DRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTIILVSNSPALAENIAD 741
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Human  1038 QRKL---SVALAFVGGSKVVILDEPTAGVDPYSRRGIWELLLKYRQGRTIILSTHHMDEADVLGD 1099

  Fly   742 RMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVK-------------------------------- 774
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Human  1100 RIAIISHGKLCCVGSSLFLKNQLGTGYYLTLVKKDVESSLSSCRNSSSTVSYLKKEDSVSQSSSD 1164

  Fly   775 ---GKNYKRDEL-------FGMMNSYMPNMSIERDIGYKVTFVL--ENKFEDQFPMLIDDLEENM 827
               |.:::.|.|       ..::..::....:..|||:::|:||  |...|..|..|..::::.:
Human  1165 AGLGSDHESDTLTIDVSAISNLIRKHVSEARLVEDIGHELTYVLPYEAAKEGAFVELFHEIDDRL 1229

  Fly   828 QQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRF----GCEDNDQSGAFQSHENAQVLLEEYYSTL--------AEA 880
            ..||:.|:.|.:|::|||||:.    |.:.....|...:..|.:...:: .|.|        |:.
Human  1230 SDLGISSYGISETTLEEIFLKVAEESGVDAETSDGTLPARRNRRAFGDK-QSCLRPFTEDDAADP 1293

  Fly   881 NE-----KGRRT---------------GWKLFFLHGRAVIYKRWIAAHRH------WIVLIFEVL 919
            |:     :.|.|               ||||......|:::||.:.|.|.      .|||....:
Human  1294 NDSDIDPESRETDLLSGMDGKGSYQVKGWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQIVLPAVFV 1358

  Fly   920 AMALVAVCTFSSIF-IYGK--NYELEPLTFN----------------LSQLHTV----------- 954
            .:|||    ||.|. .:||  :.||:|..:|                |..|:.:
Human  1359 CIALV----FSLIVPPFGKYPSLELQPWMYNEQYTFVSNDAPEDTGTLELLNALTKDPGFGTRCM 1419

  Fly   955 -----------------------DAFVELFS---------------EEEDVKDM----------- 970
                                   ...::||.               ..:.:|.|
Human  1420 EGNPIPDTPCQAGEEEWTTAPVPQTIMDLFQNGNWTMQNPSPACQCSSDKIKKMLPVCPPGAGGL 1484

  Fly   971 -----HAYYTELL----------YWYDAHVATLTKN----------RHNAYALLTQN-------- 1002
                 .....::|          |....:|..:.|:          |:..::|...|
Human  1485 PPPQRKQNTADILQDLTGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFRYGGFSLGVSNTQALPPSQ 1549

  Fly  1003 -------QFTAH------------VNSRYIFGATFDQK-IVTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAVA 1047
                   |...|            :||...|....|.| .|..||||...|:....|||::||:.
Human  1550 EVNDAIKQMKKHLKLAKDSSADRFLNSLGRFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAIL 1614

  Fly  1048 RHLFDEEATIDVTLAPLPFRTAINTFPPSSH---------------TFGGCLAFGIC--FVLTFI 1095
            |        .::.....|....|..|   :|               |....:...||  |.::|:
Human  1615 R--------ANLQKGENPSHYGITAF---NHPLNLTKQQLSEVALMTTSVDVLVSICVIFAMSFV 1668

  Fly  1096 WPAFAIYMITERGSLLKKQQFLAGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVMVALYENPNHDVML 1160
            ..:|.:::|.||.|..|..||::||:...||....::|:...::....|:::...::..:
Human  1669 PASFVVFLIQERVSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKS----- 1728

  Fly  1161 YGYISVT--------LMLGGFWVILLAYLMASLCRNPCYGFLWLCGIN-------SIGLVCFSQF 1210
              |:|.|        |:|.|:.:..|.|..:.:.:.|...::.|..:|       |:.......|
Human  1729 --YVSSTNLPVLALLLLLYGWSITPLMYPASFVFKIPSTAYVVLTSVNLFIGINGSVATFVLELF 1791

  Fly  1211 YRTHPESMLLEPTFMAMYTVATVICKLFMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCCIKSNYG 1275
                        |...:..:..::..:|:|  |...|:...:    :::.|..::.:...:....
Human  1792 ------------TDNKLNNINDILKSVFLI--FPHFCLGRGL----IDMVKNQAMADALERFGEN 1838

  Fly  1276 TFTAGIYHDL------------VILTLLDIILLACLFVSEYHSILGFADCRLDTRTNESPDSNQE 1328
            .|.:.:..||            |:..|:.:::....|:....     .:.:|....:|..|..:|
Human  1839 RFVSPLSWDLVGRNLFAMAVEGVVFFLITVLIQYRFFIRPRP-----VNAKLSPLNDEDEDVRRE 1898

  Fly  1329 -SRAFPGILSNDTAALVDKEHTSRLNEEERSKYAAVGIGIVSKYRRNRVLRDLDFTLAKSECLSI 1392
             .|...|...||...:  ||.|.....:.:.....:.:||                 ...||..:
Human  1899 RQRILDGGGQNDILEI--KELTKIYRRKRKPAVDRICVGI-----------------PPGECFGL 1944

  Fly  1393 TGANNSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIHDYSV--NTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELL 1455
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Human  1945 LGVNGAGKSSTFKMLTGDTTVTRGDAFLNKNSILSNIHEV--HQNMGYCPQFDAITELLTGREHV 2007

  Fly  1456 YIHAMLQGHRHRIGRELSEALLRLVGLTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLICVDGVP 1520
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Human  2008 EFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGLVKYGEKYAGNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPT 2072

  Fly  1521 AGLDPTGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTETENYKS 1585
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Human  2073 TGMDPKARRFLWNCALSVVKEGRSVVLTSHSMEECEALCTRMAIMVNGRFRCLGSVQHLKNRFGD 2137

  Fly  1586 GYQLEVRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLPLG 1650
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Human  2138 GYTIVVRIAGS-NPDL------------------KPVQDFFGLAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSS 2183

  Fly  1651 TTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNML-VGFQIFTYDQHQDN 1694
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Human  2184 LSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNFAKDQSDDD 2228

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	366/1753 (21%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	71/229 (31%)
ABCA1	NP_005493.2	rim_protein	6..2236	CDD:130324	413/1995 (21%)
		Annulus domain 1. /evidence=ECO:0000305|PubMed:35974019	69..80
		Annulus domain 2. /evidence=ECO:0000305|PubMed:35974019	368..379
		Gateway domain. /evidence=ECO:0000305|PubMed:35974019	564..594		9/42 (21%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1283..1312		4/28 (14%)