Protein Alignment CG1494 and ABCA13

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_011513432.1
• Gene: ABCA13 / 154664
• HGNCID: 14638
• Length: 5059
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1860
• Identity: 399/1860 - (21%)
• Similarity: 733/1860 - (39%)
• Gaps: 438/1860 - (23%)

  Fly    62 IDLDRSWMQMVEKLEKARQVADTYNVKGNPFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQ-----KQIEP 121
            ||:|:    :.|||:       ||....:....|...|    |:....:::..:.     .:.:.
Human  3389 IDVDK----LTEKLQ-------TYGGLLDEMFNHAGAG----RFRFLGSILVNLSSCVALNRFQA 3438

  Fly   122 MTSVGFEDCEEMRESVIENGLFAGLCFDGSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTILLPSELRM 186
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Human  3439 LQSVDILE-TKAHELLQQNSFLASIIFSNSLF--DKNFRSESVK----LPPHVSYTIRTNVLYSV 3496

  Fly   187 LDGDFRMANWMTLYNDDPNTFVLTRLNQPYEGGFVGYVREGFIRLQKSVSES-FLVLTSHKSL-P 249
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Human  3497 RTDVVKNPSW----KFHPQ-------NLPADGFKYNYV---FAPLQDMIERAIILVQTGQEALEP 3547

  Fly   250 TIQIRRFPITGREQDPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLINMNIGNLI 314
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Human  3548 AAQTQAAPYPCHTSDLFLNNVGFFFPLIMMLTWMVSVASMVRKLVYEQEIQIEEYMRMMGVHPVI 3612

  Fly   315 HFVSWYLKGLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAAVAFAIMVAAFF 379
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Human  3613 HFLAWFLENMAVLTISSATLAIVLK-----TSGIFAHSNTFIVFLFLLDFGMSVVMLSYLLSAFF 3672

  Fly   380 RNALNAVRVLTILWIMSYVP---TFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVAT-------LVIEFLI 434
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Human  3673 SQANTAALCTSLVYMISFLPYIVLLVLHNQLS-------FVNQTFLCLLSTTAFGQGVFFITFLE 3730

  Fly   435 ERESIVHITWEDSGYRLNYDGGHITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYV------------------ 481
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Human  3731 GQET--GIQWNNM-YQALEQGG-MTFGWVCWMILFDSSLYFLCGWYLSNLIPGTFGLRKPWYFPF 3791

  Fly   482 --DMWRG-GDRSGKKMKKPNTNASVQEDPYHERGDSFTH-----QGQAIG---VNSTKIYEVEPS 535
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Human  3792 TASYWKSVGFLVEKRQYFLSSSLFFFNENFDNKGSSLQNREGELEGSAPGVTLVSVTKEYE---G 3853

  Fly   536 HRRFKLKIKKLCKRFATNDRPALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVM 600
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Human  3854 H---KAVVQDLSLTF---------------YRDQITALLGTNGAGKTTIISMLTGLHPPTSGTII 3900

  Fly   601 ISSHNIQTERKAASMELGIAFGHDMLLTGFTVIDYLRFICRVKGLH-NNIEIDGQSNYFLNVLQI 664
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Human  3901 INGKNLQTDLSRVRMELGVCPQQDILLDNLTVREHLLLFASIKAPQWTKKELHQQVNQTLQDVDL 3965

  Fly   665 ------------GGLKTKRIRTLTDRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLI 717
                        ||||.|            :|:..||:|.|..:::|:..|.:|..::..:|:::
Human  3966 TQHQHKQTRALSGGLKRK------------LSLGIAFMGMSRTVVLDEPTSGVDPCSRHSLWDIL 4018

  Fly   718 NEEKSKRTIILVSNSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVKGKNYKRDE 782
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Human  4019 LKYREGRTIIFTTHHLDEAEALSDRVAVLQHGRLRCCGPPFCLKEAYGQGLRLTLTRQPSVLEAH 4083

  Fly   783 -------LFGMMNSYMPNMSIERDIGYKVTFVLENKFEDQFPM--LIDDLEENMQQLGVVSFRIR 838
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Human  4084 DLKDMACVTSLIKIYIPQAFLKDSSGSELTYTIP-KDTDKACLKGLFQALDENLHQLHLTGYGIS 4147

  Fly   839 DTSMEEIFLRFGCEDNDQS-------GAFQSH-------------------ENAQVLLEEYYSTL 877
            ||::||:||....:.|.:|       ...|:|                   :..|:|..:..:.|
Human  4148 DTTLEEVFLMLLQDSNKKSHIALGTESELQNHRPTGHLSGYCGSLARPATVQGVQLLRAQVAAIL 4212

  Fly   878 AEANEKGRRTGWKLFFLHGRAVIYKRWIAAHRHWIVLIFEVLAMALVAVCTFSSIFIYGKNYELE 942
            |....:..|.|             |..:|  ...:.::|..|||.|..|...::        |..
Human  4213 ARRLRRTLRAG-------------KSTLA--DLLLPVLFVALAMGLFMVRPLAT--------EYP 4254

  Fly   943 PLTFNLSQLHTVDAFVELFS-----------------EEEDV--KDMHAYYTELLYW-------- 980
            ||  .|:..|...|....||                 .::|:  .|::........|
Human  4255 PL--RLTPGHYQRAETYFFSSSGGDNLDLTRVLLRKFRDQDLPCADLNPRQKNSSCWRTDPFSHP 4317

  Fly   981 --YDAHVATLTKNR---------HNAYALLTQNQFTAHVNSRYIF---------GATFDQKI--- 1022
              .|:.......||         |..:.||..:.|..   ..|:.         |.:|..||
Human  4318 EFQDSCGCLKCPNRSASAPYLTNHLGHTLLNLSGFNM---EEYLLAPSEKPRLGGWSFGLKIPSE 4379

  Fly  1023 --------------VTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAVA-RHLFDEEATID-----VTLAPLPFR 1067
                          ...|:|....||.|..||.::|.:. :||   ..|:|     :||
Human  4380 AGGANGNISKPPTLAKVWYNQKGFHSLPSYLNHLNNLILWQHL---PPTVDWRQYGITL------ 4435

  Fly  1068 TAINTFPPSSHTFGGCL-------------AFGICFVLTF--IWPAFAIYMITERGSLLKKQQFL 1117
                    .||.:||.|             ...:|.||.|  :..:....::.:|....|:.|.:
Human  4436 --------YSHPYGGALLNEDKILESIRQCGVALCIVLGFSILSASIGSSVVRDRVIGAKRLQHI 4492

  Fly  1118 AGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLI-FCACVVVMVALY-------ENPNHDVM---LYGYISVTLMLG 1171
            :|:....||....|||:||.|: .|.||.|:||..       :|.....:   |:||.::..|
Human  4493 SGLGYRMYWFTNFLYDMLFYLVSVCLCVAVIVAFQLTAFTFRKNLAATALLLSLFGYATLPWM-- 4555

  Fly  1172 GFWVILLAYLMASLCRNPCYGFLWLCGINSIGLVCFSQFYRTHPESMLLE--PTFMAMYTVATVI 1234
                    |||:.:..:....|:....:|.|..:|          :||:.  |..:|:.:.|..:
Human  4556 --------YLMSRIFSSSDVAFISYVSLNFIFGLC----------TMLITIMPRLLAIISKAKNL 4602

  Fly  1235 CKLFMIYE-----FKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCCIKSNYG----------TFTAGIYHD 1284
            ..::.:.:     |...|:...:    ||:  |.:.....:..|:|          .|...|:..
Human  4603 QNIYDVLKWVFTIFPQFCLGQGL----VEL--CYNQIKYDLTHNFGIDSYVSPFEMNFLGWIFVQ 4661

  Fly  1285 L----VILTLLDIILLACLFVSEYHSIL----GFADCRLDTRTNESPD-SNQESRAFPGILSNDT 1340
            |    .:|.||.::|        :..:|    |.:..:...::::..| ..:|.|.|.|..:.|.
Human  4662 LASQGTVLLLLRVLL--------HWDLLRWPRGHSTLQGTVKSSKDTDVEKEEKRVFEGRTNGDI 4718

  Fly  1341 AALVDKEHTSRLNEEERSKYAAVGIGIVSKYRR---NRV-LRDLDFTLAKSECLSITGANNSGKT 1401
            ..|.:           .||:          |||   |.: ::|:...:.|.||..:.|.|.:||:
Human  4719 LVLYN-----------LSKH----------YRRFFQNIIAVQDISLGIPKGECFGLLGVNGAGKS 4762

  Fly  1402 TLLKVVVNETKMNAGQLWIHD--------YSVNTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELLYIH 1458
            |..|::..|..:.:|...|..        .|..|..|    ::|||||:|:|....|..|.||.:
Human  4763 TTFKMLNGEVSLTSGHAIIRTPMGDAVDLSSAGTAGV----LIGYCPQQDALDELLTGWEHLYYY 4823

  Fly  1459 AMLQGHRHRIGRELSEALLRLVGLTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLICVDGVPAGL 1523
            ..|:|...:...|::..|:|.:.|....::.|...:.|..|:|..|.|::|.||::.:|...:|:
Human  4824 CSLRGIPRQCIPEVAGDLIRRLHLEAHADKPVATYSGGTKRKLSTALALVGKPDILLLDEPSSGM 4888

  Fly  1524 DPTGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTETENYKSGYQ 1588
            ||..||.:..........|.:.:.|..:..:.|.|..|..:::.|....:.........:..||.
Human  4889 DPCSKRYLWQTIMKEVREGCAAVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGSFKCLGSPQHIKNRFGDGYT 4953

  Fly  1589 LEVRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLPLGTTT 1653
            ::|...::.|.:.::|       :|            :::.||......:..:.:.:.:|.....
Human  4954 VKVWLCKEANQHCTVS-------DH------------LKLYFPGIQFKGQHLNLLEYHVPKRWGC 4999

  Fly  1654 FSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNMLVG-FQIFTYDQHQ 1692
            .:::|..:..:...:||:.|.|.:..|.. |..|..:|.|
Human  5000 LADLFKVIENNKTFLNIKHYSINQTTLEQVFINFASEQQQ 5039

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	367/1689 (22%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	63/232 (27%)
ABCA13	XP_011513432.1	rim_protein	7..>82	CDD:130324
		rim_protein	3068..5049	CDD:130324	399/1860 (21%)