Protein Alignment CG1494 and ABCA9

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_024306297.1
• Gene: ABCA9 / 10350
• HGNCID: 39
• Length: 1634
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1858
• Identity: 384/1858 - (20%)
• Similarity: 707/1858 - (38%)
• Gaps: 461/1858 - (24%)

  Fly     9 KFLLMNWKNHKLQLANPLELLVILLVPPLFTLVAVLMRFFIPVNHRSDT-VYDPIDLDRSWMQMV 72
            |..|..|:..:..|   ||.|.      .|.||..|..||..::...|| ....:||.|
Human    26 KNCLKKWRMKRQTL---LEWLF------SFLLVLFLYLFFSNLHQVHDTPQMSSMDLGR------ 75

  Fly    73 EKLEKARQVADTYNVKGNPFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQKQ--IEPMTSVGFEDCEEMRE 135
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Human    76 ---------VDSFN------DTNYVIAFAPES-KTTQEIMNKVASAPFLKGRTIMGWPDEKSMDE 124

  Fly   136 SVIENGLFAGLCFDGSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTILLPSELRMLDGDFRMANWMTLY 200
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Human   125 ------LDLNYSIDAVRVIFTDTFSYHLKFSWGHRIPM-----------------------MKEH 160

  Fly   201 NDDPNTFVLTRLNQPYEGGFVGYVREGFIRLQKSVSESFL-VLTSHKSLPTIQIRRFPITGREQD 264
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Human   161 RDHSAHCQAVNEKMKCEGS--EFWEKGFVAFQAAINAAIIEIATNH----SVMEQLMSVTGVHMK 219

  Fly   265 --PLMGNLNYGMPFII---IIGFLFPAQLFVWQV---VSEKQSQVRQFLINMNIGNLIHFVSWYL 321
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Human   220 ILPFVAQGGVATDFFIFFCIISF----STFIYYVSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSW-- 278

  Fly   322 KGLIYE---MISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLF-CYNCAAVAFAIMVAAFFRNA 382
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Human   279 -GLMYAGFILIMATLMALIVK---SAQIVVLT---GFVMVFTLFLLYGLSLITLAFLMSVLIKKP 336

  Fly   383 L---NAVRVLTILW-------IMSYVPTFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVATLVIEFLIERE 437
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Human   337 FLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAF-----LEWTLCLLS-------------PFAFTVGMA 383

  Fly   438 SIVHITWE-DSGYRLNYDGGHITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYVD------------------- 482
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Human   384 QLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYFDKILPAEYGHRCSPLFFLKS 448

  Fly   483 -MWRGGDRSGKKMKKPNTNASVQEDPYHERGDSFTHQGQAIGVNSTKIYEVEPSHRRF----KLK 542
             .|....|:...:.:..|::    ||  ...|.|                 ||....|    .::
Human   449 CFWFQHGRANHVVLENETDS----DP--TPNDCF-----------------EPVSPEFCGKEAIR 490

  Fly   543 IKKLCKRFATN-DR-PALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSHN 605
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Human   491 IKNLKKEYAGKCERVEALKGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGSVTVYNHT 555

  Fly   606 IQTERKAASMELGIAFGHDMLLTGF-----------TVIDYLRFICRVKGL--HNNIEIDGQSNY 657
            :.   :.|.:|....|      |||           ||.:.||...::||:  |   |::.:...
Human   556 LS---RMADIENISKF------TGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPH---EVEKEVQR 608

  Fly   658 FLNVLQIGGLKTKRIRTLTDRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLINEEKS 722
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Human   609 VVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLLKEGKS 673

  Fly   723 KRTIILVSNSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVKGKNYKRDELFGMM 787
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Human   674 DRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNERCDPESITSLV 738

  Fly   788 NSYMPNMSIERDIGYKVTFVLENKFEDQFPMLIDDLEENMQQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRF-GC 851
            ..::.:..:......|:.::|..:..::||.|..||:....| |:..:.:..|::.|:||:. |.
Human   739 KQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQ-GIEDYGVSITTLNEVFLKLEGK 802

  Fly   852 EDNDQS-----GAFQSHENAQ-----VLLEEYYSTLAEAN------------------------E 882
            ...|:|     |..|: :.|:     |.||:..|:..|..                        :
Human   803 STIDESDIGIWGQLQT-DGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVALWRQQVCAIAKVRFLKLK 866

  Fly   883 KGRRTGWKLFFLHGRAVIYKRWIAAHRHWIVLIFEVLAMALVAVCTFSSIFIYGKNY--ELEPLT 945
            |.|::.|.:..|.|.:.|.:  :..|     |.:|                .|.|:|  ||.|.|
Human   867 KERKSLWTILLLFGISFIPQ--LLEH-----LFYE----------------SYQKSYPWELSPNT 908

  Fly   946 FNLSQ--------LH---------TVDAFVELFSEEEDVKDMHAYYTELLYWYDAHVATLTKNRH 993
            :.||.        .|         |:|.|:.....:....::.|:.|.
Human   909 YFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTR----------------- 956

  Fly   994 NAYALLTQNQFTAHVNSRYIFGATFDQKIVTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAV------ARHLFD 1052
                  ......::..:..:.|...|.:...| .|...|:..|..|:|:.|.:      :.|:..
Human   957 ------NGTDDPSYNGAIIVSGDEKDHRFSIA-CNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNSSEHIQT 1014

  Fly  1053 EEATIDVTLAPLPFRTAINTFPPSSHTFGGCLAFGICFVLTFIWPAFAIYMITERGSLLKKQQFL 1117
            :.:|.........:....|||            |.|....:|. |..|:..|.:.......|..:
Human  1015 DRSTFFEEHMDYEYGYRSNTF------------FWIPMAASFT-PYIAMSSIGDYKKKAHSQLRI 1066

  Fly  1118 AGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVMVALYENPNHDVML-----------YGYISVTLML- 1170
            :|:...:||....|.|:....:....:.:|..:: :|...:.:           .||:|..:.|
Human  1067 SGLYPSAYWFGQALVDVSLYFLILLLMQIMDYIF-SPEEIIFIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLT 1130

  Fly  1171 -------------GGFW----VILLAYLMASLCRNPCYGFLWLCGINSIGLVCFSQFYRTHPESM 1218
                         .|.|    :|::.:.:.:...|. ||||.|             |:.|    |
Human  1131 YVISFIFRNGRKNSGIWSFFFLIVVIFSIVATDLNE-YGFLGL-------------FFGT----M 1177

  Fly  1219 LLEPTFMAMYTVATVICKLFMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCCIKSNYGTFTAGIYH 1283
            |:.|        .|:|..||:..|.....||.:....|..|:....||              ..|
Human  1178 LIPP--------FTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESEIVYLALLIP--------------YLH 1220

  Fly  1284 DLVILTLLDIILLAC---------LFVSEYHSILGFADCRLDTRTN------ESPDSNQESRAFP 1333
            .|:.|.:|..:.:.|         :|             |:..|:|      |.|:..:|.....
Human  1221 FLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVF-------------RISPRSNAIFPNPEEPEGEEEDIQME 1272

  Fly  1334 GILSNDTAALVDKEHT-----SRLNEEERSKYAAVGIGIVSKYRRNRVLRDLDFTLAKSECLSIT 1393
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Human  1273 RMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCL----RKEYAGKKKNCFSKRKKKIATRNVSFCVKKGEVIGLL 1333

  Fly  1394 GANNSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIHDYSVNTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELLYIH 1458
            |.|.:||:|.:|::..:||..|||:.:.    .:...:....:|||||:::|....|.|:.|.::
Human  1334 GHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILK----GSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVY 1394

  Fly  1459 AMLQGHRHRIGRELSEALLRLVG---LTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLICVDGVP 1520
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Human  1395 AAVKGLRK---GDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPS 1456

  Fly  1521 AGLDPTG-KRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTETENYK 1584
            .|:||.| :::..::.:|.:......|.|.....:||.:..|..:::.|:|..|..:......:.
Human  1457 TGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFG 1521

  Fly  1585 SGYQLEVRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPM-SPNKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLP 1648
            ..|.||::.|..    ..|......::..||. :..::||:.|..|.|     :|.      |.|
Human  1522 KDYLLEMKLKNL----AQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLP-----VED------VRP 1571

  Fly  1649 LGTTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNMLVGFQIF 1686
            |....|.   |.:.|.:|:  :|:|.::::.|.  |:|
Human  1572 LSQAFFK---LEIVKQSFD--LEEYSLSQSTLE--QVF 1602

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	342/1641 (21%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	70/234 (30%)
ABCA9	XP_024306297.1	ABC2_membrane_3	53..416	CDD:463674	76/450 (17%)
		rim_protein	<245..1609	CDD:130324	329/1569 (21%)