Protein Alignment CG1494 and abca3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_004918068.1
• Gene: abca3 / 100490925
• XenbaseID: XB-GENE-1010698
• Length: 1720
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1861
• Identity: 447/1861 - (24%)
• Similarity: 779/1861 - (41%)
• Gaps: 339/1861 - (18%)

  Fly     8 RKFLLMNWKNHKLQLANPLELLVILLVPPLFTLVAVLMRFFIP-VNHRSDTVYDPIDL------- 64
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 Frog    21 RQLGLLLWKNYILQKRQVLVTVIELALPLLFSAILIALRHRVPSVTYPNATLYREMPFPNLPFIP 85

  Fly    65 -DRSW-MQMVEKLEKARQ--VADTYNVKGNPFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQKQIEPMTSV 125
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 Frog    86 GPRPWELAYVPSHSKAAHSIILDV----GNHLFPYYFANQSARGF----------------PTEE 130

  Fly   126 GFEDCEEMRESVIENGLFAGLCFD------GSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTILLPSEL 184
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 Frog   131 DFED--YIRHNNHSSKILAAVVFEHNFNHSGDP-LPLQVRYRLRFKYSPRNAPMSEQTGLNPNVD 192

  Fly   185 RMLDGDFRMANWMTLYNDDPNTFVLTRLNQPYE-----GGFVGYVREGFIRLQKSVSESFLVLTS 244
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 Frog   193 R---------NWHTRY-----LYPLFQMPGPREAGDKTGGTPGYQREGFLAMQHEVDRAIMRYHA 243

  Fly   245 HKS----LPTIQ--IRRFPITGREQDPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQ 303
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 Frog   244 NESGRLLLDNIDVAIRRFPYPPYVNDLFILAIQNQLPLLLMLSFTYTSLSIVRALVLEKERKLKE 308

  Fly   304 FLINMNIGNLIHFVSWYLKGLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAA 368
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 Frog   309 YMRVMGLSSWLHSTAWFIHFFLLLLVSVFFVTLLLCIQVSSEGAVLTRSDPSLVFVYILVFSVST 373

  Fly   369 VAFAIMVAAFFRNALNAVRVLTILWIMSYVPTFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVATLVIEF- 432
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 Frog   374 ISFSFMISSFFSRANMAAAAGGFLYFLSYIPYFFISPWYDELNHGAKVSSCLFSNVGMAMGAQLI 438

  Fly   433 -LIERESIVHITWEDSGYRLNYDGGHITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYVD-------------- 482
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 Frog   439 GMFEGKG-TGAQWSNLFTPVSVD-DNFTLGQVLQMLMLDCVLYFLVGWYVESVMPGDYGVPQPWY 501

  Fly   483 ------MWRGGDRSGKKMKKPNTNASVQEDPYHERGDSFTHQGQAIGVNSTKIYEVEPSHRRFKL 541
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 Frog   502 FCFLPSYWCGTPRLVEGLEKED-----DEDP--EK----ALKGEYL--------EEEPSDLVPGI 547

  Fly   542 KIKKLCKRF--ATNDRPALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSH 604
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 Frog   548 RIKHLTKVYHASGKKRIAVRDLTLNMYEGQVTVLLGHNGAGKSTTLSMLTGLSPPSSGECYIGGY 612

  Fly   605 NIQTERKAASMELGIAFGHDMLLTGFTVIDYLRFICRVKG-----LHNNIEIDGQSNYFLNVLQI 664
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 Frog   613 EITRDTALIRRSLGLCPQHDVLFQGLTVEEHLYFYAGLKGCPRWCCPEEVE---------KILQI 668

  Fly   665 GGLKTKR--IRTLTDRDLC-LVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTI 726
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 Frog   669 LRLEEKRNALSTQLSGGTCRKLSIGIALIGGSKVVMLDEPTSGMDPASRRDTWELLRQHKHDRTL 733

  Fly   727 ILVSNSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVKGKNYKRDELFGMMNSYM 791
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 Frog   734 LLTTHFMDEADILGDRIAILAQGQLQCCGSPLFLKCKYGAGYHMVMVKEPHCQVEDITHLITSYV 798

  Fly   792 PNMSIERDIGYKVTFVLENKFEDQFPMLIDDLEENMQQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRFG------ 850
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 Frog   799 PNATLESNAGAELSYILPKESTHRFEPLFSELELRREELGIASYGASVTTMEEVFLRVGKLVDTS 863

  Fly   851 ---------------------------CEDNDQSGAFQSHENAQVLLEEYYSTLAEANEKGRRTG 888
                                       |..:|.:      |::..|:.|..|.:   ...|:.|.
 Frog   864 LDIQAIQLPPLQYQHERRANDWGTEESCSMSDCT------EDSGTLITEDCSNI---KLNGKCTL 919

  Fly   889 W-KLFFLHGRAVIYKRWIAAHRHWIVLIFEVL------AMALVAVCTFS----------SIFIYG 936
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 Frog   920 WCQQFY----ALFVKRAAYSWRNWKMVVGQFLVPLVFTTLALVVGKTFPGPQDSPPLDLSLVPYG 980

  Fly   937 KN---YELEPLTFNLSQLHTVDAFVELFS----EEEDVKDMHAYYTELLYWYDAHVATLTKNRHN 994
            ..   |.|.|....|.| ...|.|.:.||    |.::|.|            |.....||:....
 Frog   981 YTVVPYSLPPNASTLLQ-SLADNFRDQFSGQQMEPQEVLD------------DLDNYLLTRASDE 1032

  Fly   995 AYALLTQNQFTA----HVNSRYIFGATFDQKIVTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAVARHLFDEEA 1055
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 Frog  1033 G-ALFAERCLCAADIQNLGSRI---------KVTARFNNQAYHAVASALALVDNALFKLIAGPEA 1087

  Fly  1056 TIDVTLAPLPFRTAINTFPPSSHTFGGCLAFGICFVLTF----IWPAFAIYMITERGSLLKKQQF 1116
            :|.||..|.|..|   |.........|...|.|...|.:    :...|::.::.||....|..||
 Frog  1088 SISVTNYPQPRNT---TETAQDQLLEGQAGFAIAINLLYGMASLASTFSLLLVGERAVKSKHVQF 1149

  Fly  1117 LAGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVM-----VALYENPNH--DVMLYGYISVTLMLGGFW 1174
            ::|....|||...:.:|||..||.|..::.:     |..|...:|  ||:|      .|:|.|:.
 Frog  1150 VSGASALSYWLSALTWDLLNFLIPCTFMLAVFQAFDVRAYTEEHHLVDVIL------MLLLYGWA 1208

  Fly  1175 VILLAYLMASLCRNPCYGF-----------------LWLCGINSIGLVCFSQFYRTHPESMLLEP 1222
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 Frog  1209 VIPLMYLFSFLFTSTATAYTRLTIFNILSGTASFLSVTIMSIPALGLVDLSH---------ILDQ 1264

  Fly  1223 TFMAM--YTVATVICKLFMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCCIKSNYGTFTA-GIYHD 1284
            .|:.:  |.:.......:..|.....|.....:....:.|      |...:.||.:::: |:...
 Frog  1265 VFLVLPNYCLGRSFSDFYQNYHLLKFCRSSPRSAIICQAF------NITCQDNYFSWSSPGVGRY 1323

  Fly  1285 LVILTLLDIILLACLFVSEYHSILGFADCRLDTRTN-----------ESPDSNQESRAFPGILSN 1338
            |..:.:.....|..||:.|....     |||.....           |||.|..|.|
 Frog  1324 LTAMAVQGSAFLCLLFIIESQIF-----CRLYNLCRSYKEHRWASLPESPVSPPEDR-------- 1375

  Fly  1339 DTAALVDKEHTSRLNEEERSKYAAVGIGIVSK-----YRRNRVLRDLD---FTLAKSECLSITGA 1395
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 Frog  1376 DVA-----DERKKVLESPLEQLSALSSPLVIRELSKVYGRRALVLAVDRISLAVGRGECFGLLGF 1435

  Fly  1396 NNSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIHDYSVNTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELLYIHAM 1460
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 Frog  1436 NGAGKTTTFRMLTGDETVSSGDAYIDGYSILRHIKKVQQRIGYCPQFDPLLDHMTGRETLCMYAR 1500

  Fly  1461 LQGHRHRIGRELSEALLRLVGLTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLICVDGVPAGLDP 1525
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 Frog  1501 LRGVPEGYINSCVENMLRGLLLEAHANKLVRTYSGGNKRKLSAGIALIGGPSVIFMDEPSTGMDP 1565

  Fly  1526 TGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTETENYKSGYQLE 1590
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 Frog  1566 VARRLLWDAVTRTRENGKAVIITSHSMEECEALCTRLAIMVNGQLKCLGSPQHLKNKFGSGYTLL 1630

  Fly  1591 VRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLPLGTTTFS 1655
            .:          .||....|:         .|..|:|..||.:||..|....:.:.:.....:::
 Frog  1631 AK----------TSRGAEELM---------AFKDFVETIFPGSVLKHEHQGMVHYHITSQELSWA 1676

  Fly  1656 EIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNMLVGFQIF-TYDQHQDNP 1695
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 Frog  1677 QVFGTLEKAKEKFDLEDYCVSQISLE--QVFLSFSHFQQSP 1715

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	392/1615 (24%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	75/229 (33%)
abca3	XP_004918068.1	rim_protein	17..>90	CDD:130324	18/68 (26%)
		rim_protein	<147..1712	CDD:130324	414/1708 (24%)