Protein Alignment Npc1b and Ptchd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001342199.1
• Gene: Ptchd4 / 627626
• MGIID: 1920485
• Length: 904
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 972
• Identity: 182/972 - (18%)
• Similarity: 383/972 - (39%)
• Gaps: 181/972 - (18%)

  Fly   319 TFC-------AKHPVIVLALCSWAIAGLSFGI----RYMTITTDPVELWAGEESQTRIEKDYFDQ 372
            :||       ::|||..|.:.  |:..::||:    |:.| ..|...|.|...|..:||:.....
Mouse    29 SFCHRLGLCVSRHPVFFLTVP--AVLTITFGLSALNRFQT-EGDLERLVAPSHSLAKIERSLASS 90

  Fly   373 HFGPFYRTNQMFVKAVNQTYFTHETSNGVLNFGPAFEYNFLKE---VFELQDSIMKLGM---ADN 431
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Mouse    91 LFPLDQSKSQLY----SDLHTPGRYGRVILLSSPG--DNILLQAEGILQTHRAVMEMKVNHKGYN 149

  Fly   432 EGLDKICYAPVLMAGETPTVDRCAIQSVYGYFQHDMDRFENSYVDSNNYTINYLN-QLEDCLRVP 495
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Mouse   150 YTFSHLC---VLRNQD----KKCVLDDIISVLE-DLRQAAVSNKTTARVQVRYPNTKLKD----- 201

  Fly   496 MMEDCFGTFGGPIEPGIAVGGMPKVAVGEDPDYMLATGLVLTFLGRNYNDESKLEPNMKWEKLFV 560
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Mouse   202 ---------GRNSFIGHQLGGVVEVPNSKDQRVKSARAIQITYYLQTYGSATQDLIGEKWENEFC 257

  Fly   561 DFLRDYKSDRLDIAY--MAERSIQDAIVELSEGEVSTVVISYVVMFVYVAIALGHIRSCRGFLRE 623
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Mouse   258 KLMRKLQEEHQDLQLYSLASFSLWRDFHKTSILTRSKVLVS-LVLILTTATLSSSMKDC---LR- 317

  Fly   624 SRIMLAIGGIVIVLASVVCSLGFWGYLD--VTTTMLAIEVIPFLVLAVGVDNIFIMVHTYQRL-D 685
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Mouse   318 SKPFLGLLGVLTVCISIATAAGIFFITDGKYNSTLLG---IPFFAMGHGTKGVFELLSGWRRTKE 379

  Fly   686 HSKFKTTHEAIGEAIGQVGPSILQTAGSEMACFAIGC--ISDMPAVKTFAMYAAIAILLDFLLQI 748
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Mouse   380 NLPFK---DRVADAYSDVMVTYTMTSSLYFITFGMGASPFTNIEAVKIFCQNMCVSILLNYFYIF 441

  Fly   749 TAFVALMA----IDEKRYLDGRLDMLCC-----------------VKSGGKKINDEDGDGVDRPK 792
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Mouse   442 SFFGSCLVFAGQLEQNRY----HSIFCCKIPSAEYLDRKPVWFQTVMSDG---HQQTSHHETNPY 499

  Fly   793 EVGLLETLFKNFYSPFLLSKPVKVSVLLIFTVITCLSLMVTPSIEKGLDQEMSMPKNSHVVKYFR 857
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Mouse   500 QHHFIQHFLREHYNEWITNIYVKPFVVILYLIYASFSFMGCLQISDGASIINLLASDSPSVSYAM 564

  Fly   858 YMVDLLAMGAPV--YWVLKPGLNYSEPLQQNL--ICGGVECNNNSLSVQLYTQAQYPEITSLARP 918
            ......:..:||  ::|.:|...::..:|::|  :|.|            :|
Mouse   565 VQQKYFSNYSPVIGFYVYEPLEYWNSSVQEDLQRLCSG------------FT------------- 604

  Fly   919 ASSWLDDYIDWLAISDCCKYNVTTGGFCSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKYIPYFLF 983
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Mouse   605 AVSWVEQYYQFLKTSN-----------ISANNKTDFISVLQSSFLK---KPEFQHFRNDIIF--- 652

  Fly   984 DLPDAECAKAGRASYADAVIYTIDDVGMSTVQDSYFMQYSTTSTTSEEFYSQLREVRRISGEINA 1048
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Mouse   653 -------SRAGDEN--------------NIIASRLYLVARTSRDKQKEVIEVLDKLRPLSLSKSI 696

  Fly  1049 MFKENNVDAEIFAYCVFYIYYEQYLTIWGDAMFSLGMSLVAIFLVTLLITGLDITSTFIVLFMVI 1113
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Mouse   697 RFIVFNPS------FVFTDHYSLSVTV---PVLIAGFGVLLVLILTFFLV-IHPLGNFWLILSVT 751

  Fly  1114 CILINMLGMMWAWSINLNAISLVNLVVCVGIGVEFVAHIVRSFKRA-EGTAQERARHSLNVTGSS 1177
            .|.:.:||:|..|:::::.||::.|:..:...::..|.::.:|..| |.|..:..:.||...|::
Mouse   752 SIELGVLGLMTLWNVDMDCISILCLIYTLNFAIDHCAPLLYTFVLATEHTRTQCIKSSLQEHGTA 816

  Fly  1178 VLSGITLTKFAGIVVLGFSNSQIFQVFYFRMYLGIVLIGAA---HGLILLPVLLSLLGPPQK 1236
            :|..|| :...|::.|.|..|.:    .|.::..::|.|..   |..::|||.|:...|.:|
Mouse   817 ILQNIT-SFLIGLLPLLFVPSNL----TFTLFKCLLLTGGCTLLHCFVILPVFLTFFPPSKK 873

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	175/954 (18%)
Ptchd4	NP_001342199.1	Patched	84..870	CDD:308203	164/909 (18%)