Protein Alignment Npc1b and Ptr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1005
• Identity: 237/1005 - (23%)
• Similarity: 419/1005 - (41%)
• Gaps: 225/1005 - (22%)

  Fly   301 CMPTLFGEFFYHGFRIWGTFCAKH-------PVIVLALCSWAIAGLSFGIRYMTITTDPVELWAG 358
            |:.....:.|||    .|...|||       ||::..||......|.:.|       ||..|::.
  Fly     7 CVDKTLNKSFYH----LGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQI-------DPEYLFSP 60

  Fly   359 EESQTRIEKDYFDQHFGPFYRTNQMFVKAVNQTYFTHETSNGVL----NFGPAF-------EYNF 412
            ...:.:.|:...:|:|            .||   :||..:.|.:    .||...       |...
  Fly    61 IAGEGKTERAIVEQYF------------KVN---YTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMI 110

  Fly   413 LKEVFELQDSIMKLGMADNEGLDKICYAPVLMAGETPTV-DRCAIQSVYGYFQHDMDRFENSYVD 476
            .:|||:      :|...||    .|..|.....|:|.|. |.||             |:||...:
  Fly   111 RREVFQ------ELRQLDN----IIQNATTTYDGDTYTYKDNCA-------------RWENECFE 152

  Fly   477 SNNYTINYLNQLEDCLRVPMMEDCFGTFGGPIE------PGIAVGGMPKVAVGEDPDYML---AT 532
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  Fly   153 ND---ILNLDALMDDIEAGQLNLTFPFMFNPVTWDAHLFP-VFFGG---TKLTED-NYVISVPAI 209

  Fly   533 GLVLTFLGRNYNDESKLEPNMKWEKLFVDFLRDYKSD----RLDIAYMAERSIQDAIVELSEGEV 593
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  Fly   210 QLVYFVTADTKRQDAK---GAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRTLDHEL----EKNT 267

  Fly   594 STVVISYVVMFVYVAIALGHIRSC-RGFLRESRIMLAIGGIVIVLASVVCSLGFWGYLDVTTTML 657
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  Fly   268 KTVVPYFSSTF--LLMGLFSIITCMMGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGI--EFI 328

  Fly   658 AIEV-IPFLVLAVGVDNIFIMVHTYQRLDHSKFK-TTHEAIGEAIGQVGPSILQTAGSEMACFAI 720
            .|.: .|||::.:|:|:.|:|:..::|   :|.| ...|.:|..:.:...||..|:.::...|.|
  Fly   329 GINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRR---TKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLI 390

  Fly   721 GCISDMPAVKTFAMYAAIAILLDFLLQITAFVALMAID---EKRYL----------------DGR 766
            |.||...:|:.|..|:..|:...||..||.|.|.|||.   |::.|                :.|
  Fly   391 GIISPFRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKEKR 455

  Fly   767 LDMLCCVKSGGKKINDEDG--DGVDRPKEVGLLETLFKNFYSPFLLSKPVKVSVLLIFT---VIT 826
            ..:...:.:||...||.|.  |..|.     :|...||:..:..:.:|..|..::|.|.   |..
  Fly   456 NFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDH-----MLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGA 515

  Fly   827 CLSLMVTPSIEKGLDQEMSMPKNSHVVKY----------FRYMVDLLAMGAPVYWVLKPGLNYSE 881
            |..:   ..|::||::.....::|:.|::          |.|.:.::..|.         ||||:
  Fly   516 CYGI---TQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGP---------LNYSD 568

  Fly   882 PLQQNLICGGVECNNNSLSVQLY-TQAQYPEITSLARPASSWLDDYIDWLAISDCCKYNVTTGGF 945
            ||.|.    .||...::|....| |..:|.|         |||..::.:|
  Fly   569 PLVQE----QVENLTSTLEHTSYVTSRRYTE---------SWLRSFLSFL--------------- 605

  Fly   946 CSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKYI-PYFLFDLPDAECAKAGRASYADAVIYTIDDV 1009
                .::.:.|        |....|.:||...: .::||         .|.....| |.:..|:.
  Fly   606 ----ERNNELL--------NVTVDDEQTFIDAVKEHWLF---------PGNPFSLD-VRFNEDET 648

  Fly  1010 GMSTVQDSYFMQYSTTSTTSEEFYSQLREVRRISGEINAMFKENNVDAEIFAYCVFYIYYEQYLT 1074
              ..:...:.:|....:.|:.| ...:|::|:|.       |::.::|.||.  .::::::|:..
  Fly   649 --QIIASRFLIQAVNITDTNHE-KEMVRDLRQIC-------KDSPLNASIFH--PYFVFFDQFEL 701

  Fly  1075 IWGDAMFSLGMSLVAIFLVTLLITGLDITSTFIVLFMVICILINMLGMMWAWSINLNAISLVNLV 1139
            :...::.::.:..:.:.:::.:... :|..:..|.|.||.|.:.:.|.|..|.:||::||::||:
  Fly   702 VRPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIP-NILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLI 765

  Fly  1140 VCVGIGVEFVAHIVRSFKRA-EGTAQERARHSLNVTGSSVLSGITLTKFAGIVVLGFSNSQIFQV 1203
            :|:|..|:|.|||..::..: :.:.:.|.|.:|:..|..::.|.:.| ..|||.|..:.|.||.|
  Fly   766 MCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSST-ILGIVALLLAQSYIFLV 829

  Fly  1204 FYFRMYLGIVLIGAAHGLILLPVLLSLLGP 1233
            | |:|...::..||.|||.||||||||.||
  Fly   830 F-FKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP 858

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	224/990 (23%)
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	210/933 (23%)