Protein Alignment Npc1b and ptr-5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_510810.3
• Gene: ptr-5 / 181764
• WormBaseID: WBGene00004220
• Length: 961
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 795
• Identity: 163/795 - (20%)
• Similarity: 327/795 - (41%)
• Gaps: 188/795 - (23%)

  Fly   519 KVAVGEDPDYMLATGL----VLTFLGRNYNDESKLEPNM-KWEKLFVDF-LRDYKSDRLDIAYMA 577
            |:...:.|.:.:.|.:    |:.|:.|...|.:..|.:: :||....:: |.::|||.:::..:.
 Worm   244 KLTTSDMPPHRIITNMKHVEVIVFIFRGDRDSADKEKDLSRWELDAYEWSLNEHKSDIVEVQIVG 308

  Fly   578 ERSIQDAIVELSEGEVSTVVIS----YVVMFVYVAIALGHI-RSCRGFLRESRIMLAIGGIVIVL 637
            ...:.:.:  :.:|...|...:    :.:.||.:.:.|..: .:|   |.:.::::::|.::..:
 Worm   309 TDVLDNEM--MKDGRRLTPFFAAGFGFEITFVSLCVILTAVYHNC---LDQGKLLISLGAVLCPI 368

  Fly   638 ASVVCSLGFWGYLDVTTTMLAIEVIPFLVLAVGVDNIFIMVHTYQRLDHSKFKTTHEAIGEAIGQ 702
            .::..:.|....|.:.|....: |:||||:.:|||:.|:|:|::|:...::...|...:|.....
 Worm   369 LAITSTYGIVSILGMRTNSFML-VMPFLVMGIGVDSCFLMIHSWQKERRAQASGTGNRLGMVYES 432

  Fly   703 VGPSILQTAGSEMACFAIGCISDMPAVKTFAMYAAIAILLDFLLQITAFVALMAI----DEKRYL 763
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 Worm   433 VGPSITITSLTDFLSFAIGALAPTPETRLFCIASSIALALTYILQLVLFGPILAVATRYEHKTTT 497

  Fly   764 DGRLDMLCCVKSGGKKINDEDGDGVDRPKEVGLLETLFKNFYSPFLLSKPVKVSVLL---IFTVI 825
            ....:....:|:..||.                     .|.|...|.:|...|.|:|   |:...
 Worm   498 TSNCNWRKWLKACWKKC---------------------INVYCKILSNKFFAVVVMLGTAIYWYF 541

  Fly   826 TCLSLMVTPSIEKGLDQEMSMPKNSHVVK---------YFRYMVDLLAMGAPV----------YW 871
            ....||   :::..||....:||:|.:.:         :..|....:.:.||:          ||
 Worm   542 AIYGLM---TMKTRLDAVKILPKDSPLQRPNLVLTNLVWANYHPVTILINAPLDLENRHQMDRYW 603

  Fly   872 VLKPGLNYSEPLQQNLICGGVECNNNSLSVQLYTQAQYPEITSLARPASSWLDDYIDWLAISDCC 936
                  |..:..::...|.|                   :.::|     |||.|||.:....:
 Worm   604 ------NMVDEFEKMHNCKG-------------------KASTL-----SWLRDYIKFSYHGE-- 636

  Fly   937 KYNVTTGGFCSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKYIPY----FLFDLPDAECAKAGRAS 997
            .:|:                     |...||. ..|.:.:..||    ....||  |..|:....
 Worm   637 PFNL---------------------FAFFGLM-TPEVYEEVDPYQANITTAKLP--EFLKSPFFK 677

  Fly   998 YADAVIYTIDDVGMSTVQDSYFMQYSTTSTTSEEFYSQL-REVRRISGEINAMFKENNVDAEIFA 1061
            :.|:.|:...:.|:..: |.:.|..:..:|:|.:...|| .:.|:::         ||
 Worm   678 HWDSFIHYHYEEGVIKL-DRFMMNVAYDNTSSWDTRIQLMTDWRKVA---------NN------- 725

  Fly  1062 YCVFYIYYEQYLTIWG------DAMFSLGMSLVAIFLVTLLITGLDITSTFI--------VLFMV 1112
                  |.:..:|:|.      |.|.|||.:.....:.||:...: :.:.||        ....:
 Worm   726 ------YSDLNVTVWEPNGMFVDQMLSLGRTATQTGIWTLVCMAV-VCAIFIPNPCSIITATVSI 783

  Fly  1113 ICILINMLGMMWAWSINLNAISLVNLVVCVGIGVEFVAHIVRSFKRA---------------EGT 1162
            ..|...::|.:..||.:|:.:.:..:::.:|:.|:|:||:...|:.|               :|:
 Worm   784 ASITTGVMGFLSLWSFDLDPVVMAAVLMSIGLSVDFIAHVAYHFQLAHRKEIRNGKIKKIPLKGS 848

  Fly  1163 AQERARHSLN-VTGSSVLSGITLTKFAGIVVLGFSNSQIFQVFYFRMYLGIVLIGAAHGLILLPV 1226
            . ||..|:|. |....:.:|:  :....|:.|.|..|....||...::| :|..|..|||::||.
 Worm   849 T-ERLEHTLGAVAWPMIQAGV--STICCILPLLFRASYSPSVFVAAIFL-VVTFGMLHGLLILPT 909

  Fly  1227 LLSLLGPPQKLARSS 1241
            .|:.|  |:.:..::
 Worm   910 FLAAL--PESVTTAN 922

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	155/772 (20%)
ptr-5	NP_510810.3	Patched	92..915	CDD:308203	162/786 (21%)