Protein Alignment Npc1b and ptr-18

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_496761.3
• Gene: ptr-18 / 174940
• WormBaseID: WBGene00004232
• Length: 895
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 995
• Identity: 209/995 - (21%)
• Similarity: 387/995 - (38%)
• Gaps: 240/995 - (24%)

  Fly   309 FFYHGFRIWGTFCAKHPVIVLALCS-WAIAGLSFGIRYMTI---------TTDPVELWAGEESQT 363
            |::.|.:|     |.:|...|.:.: ||:......:|:..:         |..|      ...:.
 Worm    23 FYWVGLKI-----ADYPKWTLFITTIWALLMAGGVVRFKEVNNVRDHFSATNSP------SRYEY 76

  Fly   364 RIEKDYFDQHFGPFYRTNQMFVKAVNQTYFTHETSNGVLNFGPAFEYNFLKEVFELQDSIMKLGM 428
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 Worm    77 RVAREFFQELGSPFHVVVAM------------QAADG----GSLLRPKYIDKALEIED-FLQYKL 124

  Fly   429 ADNEGLDKICYAPVLMAGETPTVDRCAIQ-------SVYGYFQHDMDRFENSYVDSNNYTINYLN 486
            ..:.|.....|:           |.|..|       |::.....|....:.::|.
 Worm   125 KGSFGNQSYSYS-----------DFCGTQCETSDAVSIFLSMFRDQQIKKTAHVK---------- 168

  Fly   487 QLEDCLRVPMMEDCFGTFGGPIEPGIAVGGMPKVAVGEDPDYMLATGLVLTFLGRNYNDESKLEP 551
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 Worm   169 -----LTYPSMD----VFGHRV---YLANNIFQVKINNRSSIIEESKLVAINFHAIYNNETMYEI 221

  Fly   552 NMKWEKLFVDFLRDYKSDRLDIAYMAERSIQDAIVELSEGEVS-----TVVISYVVMFV--YVAI 609
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 Worm   222 MKEWEQKLFAYTLSTENDPLIRVYVT-----------SEGLVSEEVRRTGILAMPLMGVTFLIIL 275

  Fly   610 ALGHIRSCRGFLRESRIMLAIGGIVIVLASVVCSLG--FW---GYLDVTTTMLAIEVIPFLVLAV 669
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 Worm   276 AFTILTTLKRDPVKSKPFEAFLGVICPILSLCASFGHLFWMGFEYLPIVT------VVPFLILSI 334

  Fly   670 GVDNIFIMVHTYQRLDHSKFKTTHEAIGEAIGQVGPSILQTAGSEMACFAIGCISDMPAVKTFAM 734
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 Worm   335 GVDDVFIFIHAWHRTPYK--HSVRDRMAETLADAGPSISITSLTNLLSFAIGIFTPTPAIYTFCV 397

  Fly   735 YAAIAILLDFLLQITAFVALMAIDEKR-------YLDGRLDMLCCVKSGGKKINDEDGDGVDRPK 792
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 Worm   398 FISTAVIYDYIYQIFFFSAVLVLSGEREEQRKNAYLWWK-DVPLPEEPTGK-----------QKK 450

  Fly   793 EVGLLETLFK--NFYSPFLLSKPVKV---SVLLIFTVITCLSLMVTPSIEKGLDQEMSMPKNSHV 852
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 Worm   451 ETIVSRVLGKVLDFWVDFIMAKWSKFLIGAIMITYWIFMARGVM---EIAVGLSSEKLFLDDSPL 512

  Fly   853 VKYFRYMVDLLAM--GAPVYWVLKPGLNYSEP---LQQNLICGGVECNNNSLSVQLYTQAQYPEI 912
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 Worm   513 LPLVRLQTNVIFKEGGQVAVFVNNPG-NMSEPDAVPEIMRILRRFEVANNSVG------------ 564

  Fly   913 TSLARPASSWLDDYIDWLAISDCCKYNVTTGGFCSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKY 977
               |.....||..|:.::                              |..|:|   ..|...:|
 Worm   565 ---AASTHMWLLPYLPYV------------------------------GEQEHG---SIEFKYRY 593

  Fly   978 IPYFLFDLPDAECAKAGRASYADAVIYTIDDVGMSTVQDSY-----FMQYSTTSTTSEEFYS--- 1034
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 Worm   594 LPEF-FKLTEFR-----RWSHF---------VNLGNHQDCLSEKPSCLQKFVFSTGFHDAVSWSD 643

  Fly  1035 ---QLREVRRISGEINAMFKENNVDAEIFAYCVFYIYYEQYLTIWGDAMFSLGMSLVAIFLVTLL 1096
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 Worm   644 RLALLENWREMASEYQHL--------NLTIYEDFSMYSDQLLTIVPVTQSTVFCALICMIMILTL 700

  Fly  1097 ITGLD---ITSTFIVLFMVICILINMLGMMWAWSINLNAISLVNLVVCVGIGVEFVAHIVRSFKR 1158
            .|...   :|||..||    .|.:.:.|.:...:|:|:.||:..|::.:|..|:|||||...:.:
 Worm   701 FTPSPVTIVTSTAAVL----SINLGVFGCLVYMNIDLDPISMTTLLMAIGFSVDFVAHITWHYYK 761

  Fly  1159 AE-GTAQERARHSLNVTGSSVLSGITLTKFAGIVVLGFSNSQIFQVFYFRMYLGIVLIGAAHGLI 1222
            .: .:.:.|.||:|......:....|.|..| |.||...::.:.||| .::.:.::.:|..|||:
 Worm   762 GDFHSKRARIRHALAGIAWPMFQAGTSTMLA-ITVLALVHAYMVQVF-VKVVVLVIFLGMFHGLV 824

  Fly  1223 LLPVLLSLL------GPPQK 1236
            :||::.|.|      ||.:|
 Worm   825 VLPIVFSALPFTKTSGPQKK 844

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	199/971 (20%)
ptr-18	NP_496761.3	Patched	72..834	CDD:308203	194/923 (21%)