Protein Alignment Npc1b and ptchd1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_004911719.1
• Gene: ptchd1 / 101731640
• XenbaseID: XB-GENE-987908
• Length: 914
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1056
• Identity: 216/1056 - (20%)
• Similarity: 398/1056 - (37%)
• Gaps: 273/1056 - (25%)

  Fly   289 WGAFGKTSAPSVCMPTL-------FGEFFYHG----FRIWGTFCAKHPVIVLA---LCSWAIAGL 339
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 Frog     7 WGSF--QSQP-VTLPLLSSLCTRMLRKVLHRGLRNCFSRLGFFIASHPVFFISAPVLIS-ILLGA 67

  Fly   340 SFGIRYMTITTDPVE-LWAGEESQTRIEKDYFDQHFGPFYRTNQMFVKAVNQTYFTHETSN--GV 401
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 Frog    68 SFS-RYR--VEENIEYLLAPKHSLAKIERNLVDSLF-PVNRSK-------HRLYSDLQTPGRYGR 121

  Fly   402 LNFGPAFEYNFLKE-----VFELQDSIMKLGMADNEGLDKICYAPVLMAGETPTVDRCAIQSVYG 461
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 Frog   122 VIITSSRRANMLDQHHTDLILKLHSAVKKI-QVHRPGFN-YTFAHICMLSNEKT---CIVDDIV- 180

  Fly   462 YFQHDMDRFENSYVDS-NNYTINY-LNQLEDCLRVPMMEDCFGTFGGPIEPGIAVGGMPKVAVGE 524
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 Frog   181 ---HILEELKAARSQNRTNYIITYPITKLKD--------------GKEVYNGHQLGG---VTVHS 225

  Fly   525 DPDYMLATGLVLTFLGRNYNDESKLEPNMKWEKLFVDFLRDYKSDRLDIAYMAERSIQDAIVELS 589
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 Frog   226 KDRVKSAEAIQLTYYLQAINSLNEVVAE-KWESVFCETVENFQK--------LNREVK------- 274

  Fly   590 EGEVSTVVISYVVMFVYVAIALGHIRSCRGFLRESRI----MLAIGGIVIVLASVVCS------- 643
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 Frog   275 -------------LYPFTSSSLG-----QDFQKTSRVSERYLITSLALVVSLAVICCSMQDCVRS 321

  Fly   644 ---LGFWGYLDVT-TTMLAIEV--------------IPFLVLAVGVDNIFIMVHTYQRLDHSKFK 690
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 Frog   322 KPWLGLLGLVTISLSTLTAAGIINLTGGKYNSTFLGIPFIMLGHGLYGTFEMLSSWRKTREDQHV 386

  Fly   691 TTHEAIGEAIGQVGPSILQTAGSEMACFAIGC--ISDMPAVKTFAMYAAIAILLDFLLQITAFVA 753
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 Frog   387 KERTAVVYADTMI--SFTLTTAMYLVTFGIGASPFTNIEAARIFCRNSCIAIFFNYLYVLSFYGS 449

  Fly   754 LMAID---EKRYLDGRLDMLC---------CVKS------GGKKINDEDGDGVD-RPKEVGLLET 799
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 Frog   450 SLVFTGYIENNY---QHSIFCRKVPKPEILQVKSLWYRFLMTAKFSDDTADAEETNSYESHLLVC 511

  Fly   800 LFKNFYSPFLLSKPVKVSVLLIFTVITCLSLMVTPSIEKGLDQEMSMPKNSHVV-------KYFR 857
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 Frog   512 FLKRYYCDWITNTYVKPFVILFYLVYISFALMGYLQVHEGSDLRNIVATETRTITYTTVQQKYFS 576

  Fly   858 YMVDLLAMGAPVYWVLKPGLNYSEPLQQNLICGGVECNNNSL--SVQLYTQAQYPEITSLARPAS 920
                                ||| |:....|...::..|.|:  .|..||:. :..|
 Frog   577 --------------------NYS-PVIGFYIYESIDYWNTSVQEDVLEYTKG-FVRI-------- 611

  Fly   921 SWLDDYIDWLAISDCCKYNVTTGGFCSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKYIPYFLFDL 985
            ||.:.|:::|.     |.|::||            || ::.||:            .:.|.....
 Frog   612 SWFESYLNYLR-----KLNMSTG------------LP-KKNFTD------------ILRYSFLKN 646

  Fly   986 PDAECAKAGRASYADAVI----YTIDDVGMSTVQDSYFMQYSTTSTTSEEFYSQLREVRRISGEI 1046
            |.       .|.:::.:|    |..|   :..|....|:...|..|..||.|..|..:|::|  :
 Frog   647 PQ-------YAHFSEDIIIPKKYNND---VEVVASRMFLVAKTMETNREELYDLLETLRKLS--L 699

  Fly  1047 NAMFKENNVDAEIFAYCVF---YIYYEQYLTIWG--------DAMFSLGMSLVAIFLVTLLITGL 1100
            .:..|          :.||   ::|.::|.:..|        .|:|.|..|   .|||...|..:
 Frog   700 TSKVK----------FIVFNPSFVYMDRYASSVGAPLQNSCISALFLLFFS---AFLVASSIINV 751

  Fly  1101 DITSTFIVLFMVICILINMLGMMWAWSINLNAISLVNLVVCVGIGVEFVAHIVRSFKRAEGTAQE 1165
            .||.|      |..:...::|.|..|.:.|:.||::.|:..:...::..|.:|.:|...:..::.
 Frog   752 WITLT------VASVEFGVIGFMTLWKVELDCISVLCLIYGINYTIDNCAPLVSTFILGKEFSRT 810

  Fly  1166 R-ARHSLNVTGSSVLSGITLTKFAGIVVLGFSNSQIFQVFYFRMYLGIVLIGAAHGLILLPVLLS 1229
            : .::||.|.|.::|... |....|::.|....|.:.:..:..::| |..:...|...:|||:|:
 Frog   811 KWVKNSLEVHGVAILQSY-LCYTVGLIPLAAVPSNLTRTLFRCLFL-IAFVTFFHCFAILPVILT 873

  Fly  1230 LLGPPQKLARSSGAEP 1245
            .: ||.|..|.....|
 Frog   874 FV-PPSKKKRKEKKTP 888

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	206/1029 (20%)
ptchd1	XP_004911719.1	Patched	122..877	CDD:308203	175/913 (19%)