Protein Alignment Npc1b and ptchd3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031759849.1
• Gene: ptchd3 / 100494800
• XenbaseID: XB-GENE-950407
• Length: 982
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1025
• Identity: 212/1025 - (20%)
• Similarity: 401/1025 - (39%)
• Gaps: 243/1025 - (23%)

  Fly   313 GFRIWGTFCAKHP--VIVLALCSWAIAGLSFGIRYMTITTDPVELWAGE----ESQTRIEKDYFD 371
            ||...|...|::|  .||:.:    :..:..|:.:..:....:.::..|    .|..:.|.|:..
 Frog    18 GFGSLGRLIARYPWWFIVVPV----VLSIGSGVGFCFLEQRQIMMFENEFPSPGSLLKREGDFIR 78

  Fly   372 QHFGPFYRTNQMFVKAV-NQTYFTH----ETSNGVLNFGPAFEYNFLKEVFELQDSIMKLGMADN 431
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 Frog    79 THF-PMNNTEHLSTRQLYNEGSFASIIIVSLSQNLLN---KSKY---EELQRLDAAVRSLSLGSE 136

  Fly   432 EGLDKICYAPVLMAGETPTVDRCAIQSVYGYFQHD--MDRFENSYVDSNNYTINYLNQLEDCLRV 494
            .....:|   .|:.|.|     |        |..:  :|..:|..:.:|   |.|
 Frog   137 IHFQSLC---ALINGST-----C--------FSANPLLDLIQNGTIRTN---ITY---------- 172

  Fly   495 PMMEDCFGTFGGPIEPGIAVGGMPKVAVGEDPDYMLATGLVLTFLGRNYNDESKLEPNMKW---- 555
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 Frog   173 PM-------FQNRVFLGKYIGG---VTLGPDNTVLRAQALRFVYYLRE-DTEQQLVNNTKWLNNF 226

  Fly   556 ---------------------------------------------------------EKLFVDFL 563
                                                                     :|.||.||
 Frog   227 IASFPQHLQMLQLKSVQVKKSCFFLVQFPPQCLSPVSPALIEHFLQKLVGPHADIFCKKFFVFFL 291

  Fly   564 R-----DYKSDRLDIAYMAERSIQDAIVELSEGEVSTVVISYVVMFVYVAIALGHIRSCRGFLRE 623
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 Frog   292 RWAGLQEQYYLFIFVYYYTSVSLQKQLEEDAKRAMPFFSVTFIVTILFSVLSCVRCHNVR----- 351

  Fly   624 SRIMLAIGGIVIVLASVVCSLGFWGYLDVTTTMLAIEVIPFLVLAVGVDNIFIMVHTYQRLDHSK 688
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 Frog   352 NKIWVALFGVISPGLAILTSFGLLLMCGAPFAITAVNA-PFLILGAGVDNMFIIISCWQQ---TK 412

  Fly   689 FKTT-HEAIGEAIGQVGPSILQTAGSEMACFAIGCISDMPAVKTFAMYAAIAILLDFLLQITAFV 752
            .:.| .|.:.|...:...||..|..:::..|.||.::..|:|::|.:||..|::..::..||.|.
 Frog   413 MRATLEERMAETYQEAAVSITITTLTDVLAFYIGIMTHFPSVQSFCIYAGTALVFCYVYCITFFG 477

  Fly   753 ALMAIDEKRYLDGRLDMLCCVKSGGKKINDEDGDGVDRPKEV----GLLET------------LF 801
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 Frog   478 AVLALNGKLENDNRHWFICV------KVNDTEESGQNTMYQMCCLGGSFETSEGIEIEHPVTVFF 536

  Fly   802 KNFYSPFLLSKPVKVSVLLIFTVITCLSLMVTPSIEKGLDQEMSMPKNSHVVKYF-RYMVDLLAM 865
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 Frog   537 HKYYGVFLTNQWTKLLTVVVYLGYLAISIYGCFKLQGGVDIQKFPNDNSYLSQYYTNEALYFAGY 601

  Fly   866 GAPVYWVLKPGLNYSEPLQQNLICGGVE-CNNNSLSVQLYTQAQYPEITSLARPASSWLDDYIDW 929
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 Frog   602 GPRVMVVVTSEIAYWEPQTSKEIESCMQKLENNS-----YVDKKFTE---------SWLRTYEH- 651

  Fly   930 LAISDCCKYNVTTGGFCSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKYIPYFLFDLPDAECAKAG 994
              :|.....::                     .|::|...:.:....|...|..|: |.|..|..
 Frog   652 --MSKALNVSI---------------------ITKDGFMNNLDIIFAYFAEFKQDI-DKEGNKIK 692

  Fly   995 RASY---ADAVIYTIDDVGMSTVQDSYFMQYSTTSTTSEEFYSQLREVRRISGEINAMFKENNVD 1056
            .:.:   ...|:..||:..|:|                        ::|.|:...|
 Frog   693 ASRFFVQTINVVGAIDERNMAT------------------------QLRGIAASCN--------- 724

  Fly  1057 AEIFAYCVFYIYYEQYLTIWGDAMFSLGMSLVAIFLVTLLITGLDITSTFIVLFMVICILINMLG 1121
            ..:|.|...:|..::|..|...|:.::.::.|.:.:|:||.....:.|.: |.|.:..|::.:.|
 Frog   725 IPLFVYHPIFICLDRYALIIQSAVQNMIVAFVVMLVVSLLFIPNPLCSLW-VTFAIASIIVGVAG 788

  Fly  1122 MMWAWSINLNAISLVNLVVCVGIGVEFVAHIVRS-FKRAEGTAQERARHSLNVTGSSVLSGITLT 1185
            .|..|.:||::|||:.||:|:|..|:|.:||..: |...:...:||...:|:|.|..::.| .|:
 Frog   789 FMAFWRVNLDSISLITLVICIGFSVDFSSHIAYACFSSKKEKTEERVIDALHVLGYPIVQG-ALS 852

  Fly  1186 KFAGIVVLGFSNSQIFQVFYFRMYLGIVLIGAAHGLILLPVLLSLLGPPQ 1235
            ...|:|.|..:.|.||:.| |::...::..|..|||:.:||.|:::..|:
 Frog   853 TILGVVALSVAESYIFKTF-FKLTCLVIAFGVLHGLVFIPVFLTIIACPR 901

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	205/1008 (20%)
ptchd3	XP_031759849.1	Patched	95..898	CDD:308203	195/938 (21%)