Protein Alignment Npc1b and ptchd3a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608417.2
• Gene: Npc1b / 33072
• FlyBaseID: FBgn0261675
• Length: 1254
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_003201375.3
• Gene: ptchd3a / 100334931
• ZFINID: ZDB-GENE-111215-6
• Length: 1003
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1030
• Identity: 224/1030 - (21%)
• Similarity: 397/1030 - (38%)
• Gaps: 260/1030 - (25%)

  Fly   299 SVCMPTLFGEFFYHGFRIWGTFCAKHPVIVLALCSWAIAGLSFGIRYMTITTDPVELWAGEESQT 363
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Zfish    42 SICFQK-FGRFV--GTYPWWFFIS--PLLIS-----AVLGTGFCLLEDREANDIEDQFTPVNGPA 96

  Fly   364 RIEKDYFDQHF---GPFYRTNQMFVKAVNQTYFTHETSNGVLNFGPAFEYNFLKEVFELQDSIMK 425
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Zfish    97 KQERRFVQQNFPQNDSLFSNQRLYTDGVYASFIAVTKSSNILT-DAAF-----REIVILDRKVKE 155

  Fly   426 LGMADN------EGLDKICYAPVLMAGETPTVDRC---AIQSVYGYFQHDMDRFENSYVDSNNYT 481
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Zfish   156 LNVSTGHEVLTFEGLCARRY------------KKCIPNKILDIHKYYGENLEATELSFP------ 202

  Fly   482 INYLNQLEDCLRVPMMEDCFGTFG-GPIEPGIAVGGMPKVAVGEDPDYMLATGLVLTFLGRNYND 545
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Zfish   203 -------------------FFRFGFSYIFLGYSVGGV--------------------------NL 222

  Fly   546 ESKLEPNMKWEKLFVDFLRDYKSDRLDI-------AYMAERSIQDAIVELS---------EGEVS 594
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Zfish   223 NSSIIKSAKSVRLFY-FLKEDNRTRTDLWLNEFLKVFPSNLSLNSIKVTHSTSLSRQVEFEANTK 286

  Fly   595 TVVISYVVMFVYVAIALGHIRSCRGF-LRESRIMLAIGGIVIVLASVVCSLGFWGYLDVTTTMLA 658
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Zfish   287 DVIPLFSITYV-IAIAFS-ILSCLRFDCVRNKVWVATFGVFSAGLAVLSSFGMMLHIGVPFVM-T 348

  Fly   659 IEVIPFLVLAVGVDNIFIMVHTYQRLD-HSKFKTTHEAIGEAIGQVGPSILQTAGSEMACFAIGC 722
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Zfish   349 VANSPFLILGIGVDDMFILISCWQQTNVHDRVET---RLSNTYKEAAISITITTLTDVLAFYIGL 410

  Fly   723 ISDMPAVKTFAMYAAIAILLDFLLQITAFVALMAIDEKRYLDGRLDM------------------ 769
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Zfish   411 MTPFRSVRSFCLYTSTSILFCYIYSITFFGAFLVLNGRRENSNKHWLTCKEVPEECAVGQSKWYE 475

  Fly   770 LCCVKSGGKKINDEDGDGVDR---PKEVGLLETLFKNFYSPFLLSKPVKVSVLLIFTVITCLSLM 831
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Zfish   476 LCCI-----------GGAYDRHTGSEEVQPMNHFFKKYYGPFLTKSWTKVFVIVFYCIYLIVSIY 529

  Fly   832 VTPSIEKGLDQEMSMPKNSHVVKYF------------RYMVDLLAMGAPVYWVLKPGLNYSEPLQ 884
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Zfish   530 GCFQIQEGIDLRNLAADDSYVVKYYDNEKAYFSEYGPNIMV-VIRQEFP-YWDEK----YMSDLE 588

  Fly   885 QNLICGGVEC-----NNNSLSVQLYTQAQYPEITSLARPASSWLDDYIDWLAISDCCKYNVTTGG 944
                    .|     |.:.:...::|               ||:..|          ||   .|.
Zfish   589 --------TCIEDFKNLSFIEKDIFT---------------SWIKSY----------KY---YGY 617

  Fly   945 FCSSNSKSEDCLPCERGFTENGLRPDAETFNKYIPYFLFDLPDAECAKAGRASYADAVIYTIDDV 1009
            ....|..:||.      |.||     ..||.::...|..|                 |.:|.:.:
Zfish   618 HTKLNLSAEDV------FKEN-----LGTFLRFYSDFKQD-----------------VNFTNNSI 654

  Fly  1010 GMSTVQDSYFMQYSTTSTTSEEFYSQLREVRRISGEINAMFKENNVDAEIFAYCVFYIYYEQYLT 1074
            ..|    .:|:|....||..:|. :.|.::|..:         ......:..|...:||::||..
Zfish   655 HAS----RFFIQTVNISTALDEM-NMLNKLRDTA---------QKCPVPLLVYHPAFIYHDQYAV 705

  Fly  1075 IWGDAMFSLGMSLVAIFLVTLLITGLDITSTFIVLFMVICILINMLGMMWAWSINLNAISLVNLV 1139
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Zfish   706 IVTNTIQNIAVTTAVMLLISLLLIPNPLCSLW-VTFSIASVIVGVTGFMALWDVNLDTISMIILV 769

  Fly  1140 VCVGIGVEFVAHIVRSF-KRAEGTAQERARHSLNVTGSSVLSGITLTKFAGIVVLGFSNSQIFQV 1203
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Zfish   770 VCIGFSVDFSAHISYAFVSNKKPSANEKAVEALFNLGYPILQGAVST-ILGVVVLSASKNYIFRT 833

  Fly  1204 FYFRMYLGIVLIGAAHGLILLPVLLSLL----GPPQKLARSSGAEPTASITITTN 1254
            |:..|:| ::..|..|||..:||.|:..    |.|.:  ..||.|..|.....||
Zfish   834 FFKIMFL-VIFFGLFHGLTFIPVFLTFFDMCNGTPAE--NKSGPEEQAMKKSYTN 885

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1b	NP_608417.2	2A060601	24..1220	CDD:273337	210/990 (21%)
ptchd3a	XP_003201375.3	None