DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG1695 and tbc

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_728346.2 Gene:CG1695 / 33046 FlyBaseID:FBgn0031116 Length:1192 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_608395.6 Gene:tbc / 318059 FlyBaseID:FBgn0052506 Length:1155 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1255 Identity:816/1255 - (65%)
Similarity:931/1255 - (74%) Gaps:183/1255 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    17 NASGDVSNAETELKERLIASVKKEVKQLMEEAVTKKYVHEESSSVTSLCGAVEACLSHGLRRRAL 81
            ||.|      ::.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Fly     5 NADG------SDYKERLIASVKKEVKQLMEEAVTKKYVHEESSSVTSLCGAVEACLSQGLRRRAL 63

  Fly    82 GLFKTSSTTALIQKIAKICPEADYVSRRLLELELAQESHAVSGKRSSCSSDSIIKPKLLSKGSGS 146
            |||||||||||:.||||.||||:::|:.:.|:|.:..|     ||||.||||..:|.:|.|.|.:
  Fly    64 GLFKTSSTTALLHKIAKSCPEAEHISKLVQEIEASDPS-----KRSSSSSDSFQRPPMLKKSSSN 123

  Fly   147 SNSVTTINTVTNGAGAGPGGGGGASAPLG---------KYLWIRLALHEKRLAKIIEHLVSNANS 202
            |     ::|.||.|.:........|....         |||||||||:||||.||||:|||||:|
  Fly   124 S-----MSTGTNAAASTSSASASISVSASTSSMSLASMKYLWIRLALYEKRLTKIIEYLVSNASS 183

  Fly   203 YYDREALVADPDYGSILSSLLVGPCALEFTRAKTADHYWSDPCADELVQRHRISSGNRTPPTTHR 267
            :|||::||||.||||||||||||||||||||||||||||:||.||||||||||||..|:..|..|
  Fly   184 FYDRDSLVADSDYGSILSSLLVGPCALEFTRAKTADHYWTDPHADELVQRHRISSCRRSSSTCSR 248

  Fly   268 P-IINFKRSLHTSSEDTSSGSFKACSPASVAKDYVESLHQNSRTTLLYGKNNVLVLPKDVSEPMP 331
            | ||||||||:|||::..:||||:.:.||||||||||||||::.|||||||||.||||||:||||
  Fly   249 PAIINFKRSLNTSSDEAGTGSFKSIASASVAKDYVESLHQNAKATLLYGKNNVQVLPKDVAEPMP 313

  Fly   332 GYLSLHQSIQSLTIKWTPNQLMNGYNDGDGG---DKSFYWSYALNINVDEIVYVHCHQNRGGDTG 393
            |||||||.||:||||||||||||||.:.:..   ||..:|:|||||||||||||||||:||.|:|
  Fly   314 GYLSLHQHIQTLTIKWTPNQLMNGYTEAEEAEDIDKDAFWAYALNINVDEIVYVHCHQSRGEDSG 378

  Fly   394 GTIILVGQDGVQRPPIHFPEGGHLQAFLSCLETGLLPHGQLDPPLWSQRGIGKLFPWPKSVRRHI 458
            ||:||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||:|.||:|:||.|
  Fly   379 GTVILVGQDGVQRPPIHFPEGGHMQQFLSCLETGLLPHGQLDPPLWSQRGIGKMFLWPRSMRRRI 443

  Fly   459 LPSVMEAGGSVTDETPIDYVFRVVSKCQHEEFLASHPILELGRSSPRRKHLGSCSTTGSSDCSSK 523
            ||||||:    .||||||||||:|||.:||||.|:|.||:..||:|||..|.|||||||||||:|
  Fly   444 LPSVMES----VDETPIDYVFRIVSKSRHEEFAATHSILDFVRSTPRRAQLSSCSTTGSSDCSNK 504

  Fly   524 SLSIDQSSCETPLI------------QASQSTSIELVCSTMRRQIISRAFYGWLAYCRHLSTVRT 576
            ||||||...|:|||            || ||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   505 SLSIDQFPMESPLILQQQQQQQQQLLQA-QSTSIEMVCSTMRRQIISRAFYGWLAYCRHLSTVRT 568

  Fly   577 HLSGLVNGRIMPDLAADEEGLTRGKWLAMHEDGVVTGDLELYRLVYFGGVEPELRKEVWPYLLGH 641
            ||||||:|||.|::.|||||||:.:|..::.:||:....|.|||||||||:||||:|||||||||
  Fly   569 HLSGLVHGRITPEMKADEEGLTKERWQLLNVNGVLENATEFYRLVYFGGVQPELRQEVWPYLLGH 633

  Fly   642 YDFGSTPEERKKQDETCKHYYETTMSEWLAVEAIVRQREKEKTALAVAKLSAEQARLAANATSSS 706
            |.||||.|:||||||||||||||||||||||:|||:||||||||.||||||        :.::|.
  Fly   634 YAFGSTTEDRKKQDETCKHYYETTMSEWLAVDAIVQQREKEKTARAVAKLS--------SGSNSG 690

  Fly   707 NPHQKLANGSQQLQLEHGNGEEDQENLVLDEGENDVFDDNDFSDISDPGDL-FDEPELGQEAEEQ 770
            |.....|     ..||.|.           :.||:||:  |.||||||||| |||    |:.::|
  Fly   691 NDRTVRA-----ADLEAGG-----------DLENEVFE--DISDISDPGDLEFDE----QQQQQQ 733

  Fly   771 EQ------------------------SNLEEEVFEKQEDEEDQEDHDQR----EMPRLSEKLVLE 807
            :|                        |...:|.| .:.||.|:||:.|:    |....||..:.:
  Fly   734 QQAECAVSGNHLTVKPIPRAMKTSTDSGHVDESF-NELDEPDEEDNKQKQQQDEKISESESKLPD 797

  Fly   808 FQNID---NMEPLRLQENCFADSETENDLGLGLDSSGNILMLSIKSSPSTSSYETVGNEFLDMAE 869
            ::.::   |.||     :|                          |:.:.|||||||        
  Fly   798 YRKLEEQINQEP-----SC--------------------------SASTASSYETVG-------- 823

  Fly   870 AKLEEEEPPGQL-------------SKFHSADDVRLDNQDEEESSQP-----ATAVIITEAASLD 916
                    ||::             .::.||||::|  .|:|::.:|     |.|||||: ||:|
  Fly   824 --------PGEVHQRPNSDTRSVLSPEYLSADDLQL--PDDEDAVRPPPPPAAAAVIITK-ASVD 877

  Fly   917 ALDDDPTEEFTSRKTSLMSPLNEDI----TVVASLDALQEPKSACVSPASSNGGVYSVELLEQFG 977
            ..:.:.:.:  :.:...||||.|..    ....::||||:|||||.|||||||||||.|||||||
  Fly   878 ITNWERSPK--AAEGDQMSPLEEQAGESGGAGVNMDALQQPKSACASPASSNGGVYSSELLEQFG 940

  Fly   978 LNLHRIEKDVQRCDRNYWYFANENLDKLRNVISTYVWEHLDVGYMQGMCDLVAPLLVIFDDESLS 1042
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   941 LNLHRIEKDVQRCDRNYWYFANENLDKLRNVISTYVWEHLDVGYMQGMCDLVAPLLVIFDDESLS 1005

  Fly  1043 YSCFCKLMERMIENFPSGGAMDMHFANMRSLIQILDSEMYDLMDSNGDYTHFYFCYRWFLLDFKR 1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1006 YSCFCKLMERMIENFPSGGAMDMHFANMRSLIQILDSEMYDLMDSNGDYTHFYFCYRWFLLDFKR 1070

  Fly  1108 ELVYDDVFATWEVIWAAKHIASGHFVLFLALALLETYRDIILSNSMDFTDVIKFFNEMAERHNAQ 1172
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1071 ELVYDDVFATWEVIWAAKHIASGHFVLFLALALLETYRDIILSNSMDFTDVIKFFNEMAERHNAQ 1135

  Fly  1173 SILQLSRSLVLQLQTIIENK 1192
            |:|||:||||||||.|||||
  Fly  1136 SVLQLARSLVLQLQMIIENK 1155

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG1695NP_728346.2 RUN_SGSM1_like 39..233 CDD:439049 131/202 (65%)
PH_RUTBC 310..485 CDD:275431 141/177 (80%)
TBC 947..1124 CDD:214540 172/176 (98%)
tbcNP_608395.6 RUN_SGSM1_like 21..214 CDD:439049 131/202 (65%)
PH_RUTBC 292..466 CDD:275431 141/177 (80%)
TBC 923..1087 CDD:214540 162/163 (99%)

Return to query results.
Submit another query.