Protein Alignment Abcd3 and yddA

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608354.1
• Gene: Abcd3 / 32992
• FlyBaseID: FBgn0031069
• Length: 665
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_416013.1
• Gene: yddA / 945945
• ECOCYCID: EG11742
• Length: 561
• Species: Escherichia coli
• Alignment Length: 621
• Identity: 140/621 - (22%)
• Similarity: 252/621 - (40%)
• Gaps: 135/621 - (21%)

  Fly    71 LRQLLP---ILIPGFW-----SVETGLLFLVAAALIGRSVSDIWM------IQNATVVESTIIHM 121
            ||.|:.   .|:..||     .....|:.::.|.::|.....:|:      ..||       :..
E. coli     8 LRMLIAKYLCLLKPFWLRKNNKTSVLLIIIILAMILGVVKIQVWLNDWNNDFFNA-------LSQ 65

  Fly   122 NRTKFKTALLKYLTALPAISVVTNVLK-WSLGELKLRFRTNLTHHLYSQYLNGYTYY------KM 179
            ..|.....|:.:..||..|.|:.:|.| |.:..|.:|:|..||.:..:::.....||      :.
E. coli    66 KETDKLWQLVLWFPALLGIFVLISVNKTWLIKLLTIRWREWLTDYYLNRWFADKNYYFTQIYGEH 130

  Fly   180 SNLDNRIANADQLLTTDIDKFCESATDLYSNISKPVLDIFIYVYRLTV----------------- 227
            .|.|    |.||.:          |.|:...|||.:...|.::..|::
E. coli   131 KNTD----NPDQRI----------AEDILLLISKTLSLSFGFIQSLSMLITFTVILWESAGTLSF 181

  Fly   228 -------NLGGKTPSILMLYLLFAGVFLTRLRRPTGRLTVEEQKLEGEFRYVNSRLITNSEE--- 282
                   |:.|.....::|.::...:|..::.:....|.||:|:.|..||   :.|:.::::
E. coli   182 TVGGTEWNIQGYMVYTVVLIVIGGTLFTHKVGKRIRPLNVEKQRSEATFR---TNLVQHNKQAEL 243

  Fly   283 VAFYQGNVREKLTLLASYSKLRSHLRKFLEFRVSMGIIDNIIGKYFASIVGFYAVSIPFFSENHP 347
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E. coli   244 IALSNAESLQRQELSDNFHTIKENWHRLMNRQRWLDYWQNIYSRSLS--------VLPYFLLLPQ 300

  Fly   348 LLSGE-NSGQRLQAYYTYGRMLVKLAEAIGRLVLAGREMSRLAGFTARMTELIKVLSDLNKGTYE 411
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E. coli   301 FISGQINLGGLMKSRQAF--MLV--SNNLSWFIYKYDELAELAAVIDRLYEFHQLT--------E 353

  Fly   412 RTMVNGNNLAQNAVGSASSNFGPNKGIMCFEDNIIRFEKVPLVTPNGDVLLQELSFEVKSGTNVL 476
            :...|.....|:||..|              |..||       ||:..::|:.|:|.|..|..:|
E. coli   354 QRPTNKPKNCQHAVQVA--------------DASIR-------TPDNKIILENLNFHVSPGKWLL 397

  Fly   477 VCGPNGCGKSSLFRILGELWPTWGGKVTKPSRGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQI--IYPHTRDDMR 539
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E. coli   398 LKGYSGAGKTTLLKTLSHCWPWFKGDISSPADS--WYVSQTPLIKTGLLKEIICKALP------- 453

  Fly   540 RLGHSDEDLMHYLDIVQLTYLEQRENGLDSIEDWIDVLSGGEKQRIAMARLFYHKPQFAILDECT 604
             |...|:.|...|..|.|..|..|.:..|.   |.|:||.|||||||:|||...:|::..|||.|
E. coli   454 -LPVDDKSLSEVLHQVGLGKLAARIHDHDR---WGDILSSGEKQRIALARLILRRPKWIFLDETT 514

  Fly   605 SAVSVDVEGKMYSYCRE----VGITLFTVSHRKSLW 636
            |.:......::....||    .|:.:  |:|:..:|
E. coli   515 SHLEEQEAIRLLRLVREKLPTSGVIM--VTHQPGVW 548

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abcd3	NP_608354.1	3a01203	3..653	CDD:273360	140/621 (23%)
yddA	NP_416013.1	YddA	18..559	CDD:443337	137/611 (22%)