Protein Alignment Abcd3 and Abcd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608354.1
• Gene: Abcd3 / 32992
• FlyBaseID: FBgn0031069
• Length: 665
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_033018.2
• Gene: Abcd4 / 19300
• MGIID: 1349217
• Length: 606
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 624
• Identity: 167/624 - (26%)
• Similarity: 295/624 - (47%)
• Gaps: 77/624 - (12%)

  Fly    63 VNSVFFKQLRQLLPILIPGFWSVETGLLFLVAAALIGRSVSDIWMIQNATVVESTIIHM------ 121
            :..|||..            ||.:..|:|:....:              |::|..:|:.
Mouse    27 IQKVFFPS------------WSSQNVLMFMTLLCV--------------TLLEQLVIYQVGLIPS 65

  Fly   122 ---------NRTKFKTALLKYLTALPAISVVTNVLKWSLGELKLRFRTNLTHHLYSQYLNGYTYY 177
                     :...||...|..:|.:...|.:.:..:::...|.:.:|.:||.||:..|.....||
Mouse    66 QYYGVLGNKDLDGFKALTLLAVTLIVLNSTLKSFDQFTCNLLYVSWRKDLTEHLHHLYFRARVYY 130

  Fly   178 KMSNLDNRIANADQLLTTDIDKFCESATDLYSNISKPVLDIFIYVYRLTVNLGGKTPSILMLYLL 242
            .::.|.:.|.|.||.::.|:::||...:.:.|.:......:..|.|:...:.|...|..:..|.:
Mouse   131 TLNVLRDDIDNPDQRISQDVERFCRQLSSVTSKLIISPFTLTYYTYQCFQSTGWLGPVSIFGYFI 195

  Fly   243 FAGVFLTRLRRPTGRLTVEEQKLEGEFRYVNSRLITNSEEVAFYQGNVREKLTLLASYSKLRSHL 307
            ...:....|..|.....|:::||||:||:.:.::..|:|..|||:..:.|.:.......:|....
Mouse   196 VGTMVNKTLMGPIVTKLVQQEKLEGDFRFKHMQIRVNAEPAAFYRAGLVEHMRTDRRLQRLLQTQ 260

  Fly   308 RKFLEFRVSMGIIDNIIGKYFASIVGFYAVSIPFFSENHPLLSGENSGQRLQAYYTYGRML-VKL 371
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Mouse   261 RELMSRELWLYIGINTF-DYLGSILSYVVIAIPIFSG----VYGDLSPTELSTLVSKNAFVCIYL 320

  Fly   372 AEAIGRLVLAGREMSRLAGFTARMTELIKVLSDLNKGTYERTMVNGNNLAQNAVGSASSNFGPNK 436
            .....:|:.....:|.:||:|.|:.||.:.|.|:::.:.:          ..|:|.:..:.....
Mouse   321 ISCFTQLIDLSTTLSDVAGYTHRIGELQEALLDMSRKSQD----------CEALGESEWDLDKTP 375

  Fly   437 GIMCFE--DNIIRFEKVPLVTPNGD-VLLQELSFEVKSGTNVLVCGPNGCGKSSLFRILGELWPT 498
            |....|  |.....::|.::.|:.| .|:::||.::..|.::|:.|..|.||:||.|:||.||..
Mouse   376 GCPTTEPSDTAFLLDRVSILAPSSDKPLIKDLSLKICEGQSLLITGNTGTGKTSLLRVLGGLWEG 440

  Fly   499 WGGKVTKPS----RGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQIIYPHTRDDMRRL-----GHSDEDLMHYLDI 554
            ..|.|...:    .|.|| :||:|:.|.||||:|:|||     ::.:     ...||.::.:|::
Mouse   441 MKGSVQMLADFGPHGVLF-LPQKPFFTDGTLREQVIYP-----LKEIYPDSGSADDERIVRFLEL 499

  Fly   555 VQLTYLEQRENGLDSIED--WIDVLSGGEKQRIAMARLFYHKPQFAILDECTSAVSVDVEGKMYS 617
            ..|:.|..|..|||...|  |.||||.||.||::.|||||.:|::|:|||.|||::.:.|.::|.
Mouse   500 AGLSSLVARTGGLDQQVDWNWYDVLSPGEMQRLSFARLFYLQPKYAVLDEATSALTEEAESELYR 564

  Fly   618 YCREVGITLFTVSHRKSLWAHHDYYLQFDGRGSYEFATI 656
            ..:::|:|..:|.||.||...|.:.|:..|.||:|...|
Mouse   565 IGQQLGMTFISVGHRPSLEKFHSWVLRLHGGGSWELTRI 603

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abcd3	NP_608354.1	3a01203	3..653	CDD:273360	165/619 (27%)
Abcd4	NP_033018.2	YddA	19..603	CDD:443337	166/622 (27%)