DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Elys and Ahctf1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_608340.2 Gene:Elys / 32971 FlyBaseID:FBgn0031052 Length:2111 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001258199.1 Gene:Ahctf1 / 360886 RGDID:1561291 Length:2240 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2425 Identity:518/2425 - (21%)
Similarity:879/2425 - (36%) Gaps:686/2425 - (28%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 SRTIAFPERIVPGFGREPSAHLDAAEYLGGIIRDGQWGWVTWRYGSDATLLVCSMSTGDYLSWHC 75
            |..:.|||..:...|.:   .:.....|.|....|:.|......|..  |.|.:..||:.||.: 
  Rat    10 SDLLQFPEVTIEALGED---EITLESVLRGKFAAGKNGLACLACGPQ--LEVVNSLTGERLSAY- 68

  Fly    76 FWSESDDLGPRKSIRCVEELFPGEHER-PAMLAICLESWN--SGDQRPIDCPLSTQVLIYAIRNS 137
                               .|.|.:|: |.:||:...||:  :|....::....:.:.:|.:..|
  Rat    69 -------------------RFSGVNEQPPVVLAVKEFSWHKRTGLLIGLEEADGSVLCLYDLGIS 114

  Fly   138 QVLRRFDL------------HGITCSALTFLDKRIYGLTRLRRFKGCLAVATEEGTVLLVDLNSD 190
            :|::...|            ||...::...|.      ..||...|..||.|:.|.:||:||..|
  Rat   115 RVVKAVVLPGRVTAIEPIINHGGASASTQHLH------PSLRWLFGVAAVVTDVGQILLIDLCLD 173

  Fly   191 SLQASTQRRSLCSPSSKDEPSDGNLYFVSSEESKRQLSSKLTHCRS----KGAHLAVRM-DVASI 250
            .|..           |::|....:|..::.      :.:::.|.|.    :|.||..:: ..:.:
  Rat   174 DLSC-----------SQNEVEASDLEVITG------IPAEVPHIRESVMREGRHLCFQLVSPSGV 221

  Fly   251 GISCLMGISMAPGYAAGLEDGRILIYDL--INFDVTTDLNSPVKRKGVNRAVKRMCLIMPPDDPK 313
            .||.|..|:.....|.|..||.:.::::  :..:..|.|      :|....|..:....|.:||:
  Rat   222 AISTLSYINRTNQLAVGFADGYLALWNMKSMKREYYTQL------EGGRVPVYAVVFQEPENDPR 280

  Fly   314 PCFYICALYQ---------NIDVLQMML--------HSVCYRGSYRDRETHTIRFKDYRSRTVRN 361
            .|.|:.|:..         ::.:||:..        ..:.|.|.....|.:|:.           
  Rat   281 NCCYLWAVQSTQESEGDVVSLHLLQLAFGDRKCLASGQILYEGLEYCEERYTLD----------- 334

  Fly   362 RQILDGGI---------CSVIGCATASTFSFAGDN----------GTLLIVISW----HSSADKK 403
               |.||:         ..::||.:...|...||.          .|.:.|.:|    :...:..
  Rat   335 ---LSGGMFPLRGQTSNTKLLGCQSIERFPSHGDREESMREALSPDTSVSVFTWQVNIYGQGEPS 396

  Fly   404 NKLVLFDINQWYKDEMPTSVHKNEVPNYMSGYILSGLQTGLA-------LDLRSTTILHFVSLQR 461
            ..|.|||||:||..:||.|:...|..:..|.:.|..|::.::       ||:    ::|..||.|
  Rat   397 VYLGLFDINRWYHAQMPDSLRSGESLHNCSYFALWSLESVVSRTSPHHILDI----LVHERSLSR 457

  Fly   462 -----Y---DEHFYPNSLTFDCSLLTPTGKRYYAQDGVQHRFLNALRCDRATL-FLRPQIYHEDI 517
                 |   ::.|.|::..||.:.|..:|..:....|.|...|..|:....|| .:.|..|:..:
  Rat   458 GVPPSYPPPEQFFNPSTFNFDATCLLNSGVIHVTCTGFQKETLTFLKKSGPTLNEVIPDSYNRCL 522

  Fly   518 VRLRLLPQFCELNPNATFSKIAMYELILSVALEHNCGALLNDCARSWMDGSFLCNMIDNTQLSLS 582
            |...|.|:..::.| ::.|:....|.|||.|::.:...||....|:|     :.....|:..:|.
  Rat   523 VAGLLSPRLIDIQP-SSLSQEEQLEAILSAAIQTSSLGLLTGYIRTW-----IIEEQPNSAANLR 581

  Fly   583 TLTNWILKRAGQIKTRCSELCHGIFDYGGYPLDQRERREFQ---VLSGQLRELVRLQSYIVE-QG 643
            .:..|...:....|.....||..:||.....:|.:..:..|   :|...|..:  |..:.:| ||
  Rat   582 FVLEWTWNKVILTKEDFDRLCVPLFDGSCRFIDPQTIQSIQQCHLLLSNLSTV--LSCFAMEAQG 644

  Fly   644 RRRLTSSILDDCRANERALKTVLEYQRVLLWFIDHGLLPEGQHMDNLV---------PGEQAFVR 699
               :|...|.|........:.:.:|.:::|||...||||||  :|:.:         |..|.:..
  Rat   645 ---ITERGLVDLNNKHMVTQLICQYAQMVLWFCHSGLLPEG--LDDTLQLSRLRYNYPVIQNYYT 704

  Fly   700 LQHEYSEKRAQGK----ILYIDSL-------------------GKRASFPEPYPPDSLHAYIHLM 741
            .:.:..|:..:||    .|.||.|                   ||       |||.|:||.:.:.
  Rat   705 SRRQKCERSPRGKWSRDCLLIDGLVSQLGDEVEKLWKRDEGGTGK-------YPPASIHALLDIY 762

  Fly   742 LSPDIELCHKHALILYLLMDLNQQL-------VGRFQIAFQLDKDLATSLRCFWYLDHGDYERGV 799
            |..:|....|||:.:|||:|:....       :..|..||.:.......::.||.|||.|||.|:
  Rat   763 LLDNISEASKHAITIYLLLDIMYSFPNKTDTPIESFPTAFAISWGQVKLVQGFWLLDHNDYENGL 827

  Fly   800 EELYKEPAPAKNLKSWQMRLLIDKLLAEGAVKAAKKVVSRPPGPLSSA----LHMKVLLANENIT 860
            :.|: .|..||. .|||...:|:..:::|..|.|.:.:......:||:    ||:.|||.|..:.
  Rat   828 DLLF-HPVTAKP-ASWQHSKIIEAFMSQGEHKQALRYLQTMKPTVSSSSDVLLHLSVLLFNRCMV 890

  Fly   861 EAFQIARLDDDE-DGQPLLERFFRHCIEIRRFKVLAELYLREPEERLLYSLLRQCRSRQTDCVQL 924
            ||:.:.|.:.:. :.:.||:..:..|.|:...:.|.:|.....|:..|.:.|:...|.|.....|
  Rat   891 EAWNLLRQNSNTVNIEELLKHAYEVCQEMGLMEDLLKLPFTNTEQECLVNFLQSSSSVQNHEFLL 955

  Fly   925 IMLLQKSKFIEAVSF---------MDEVAAERERDESSNTILPAYSATMGPVTQNIA-----GTY 975
            :..||::.:|.|:..         .|.....|||..:.|:||..|...:..|.:.:|     ..:
  Rat   956 VHHLQRANYISALKLNQTLKNNLTSDRDPRLRERSVTRNSILDQYGKILPRVQRKLAVERAKPYH 1020

  Fly   976 LRIRDTLEPYQKTGPLEPFSCQLVKQNASGQLGGIFQSSAVSAHWATQCESPPKMTPVSIQSKIG 1040
            |......:...:..||..|.    |:..:|.:  |.:|:.:|                ::.||||
  Rat  1021 LSTSSVFQEVSRPKPLSAFP----KKALTGTV--ITRSTFIS----------------NVLSKIG 1063

  Fly  1041 ---YTNVPFLRHAQYGHSELPLPRRIVKPVPHQVVEKRQRELEDQRTNLQDQRQLGTERPNKRPC 1102
               .::.|....:.:...:...|..:|...||.       ||        .:..:||  |...|.
  Rat  1064 EVWASHEPRNGISLFNSPKTEQPSPVVHSFPHP-------EL--------PEAFVGT--PISNPS 1111

  Fly  1103 LMVERMVEDVKDYVRSIREKSSNQMEQEEVKQNEATNLLQPPNFLQARQSTTIRQSSSSPQPI-- 1165
            ..:.|:::.|   |..| .:.|.::|..:.....:...|...:...:.|.....|.:|.|..:  
  Rat  1112 QRISRLLDLV---VHPI-PQPSQRLEFIQQSPTRSPLCLLSSSLPLSSQLKRPHQQASRPSELLL 1172

  Fly  1166 --PPILKGSGAVDAVKRAPPVATFTALAGPKRF-RFVPPIPLRTDKSDKSTEMGSEGAAEGEEET 1227
              .|::        ||:|..:|.....:|   | .|.||..||:..  ::|.:.|          
  Rat  1173 LETPLI--------VKKAKSLALSATSSG---FAEFTPPSILRSGL--RTTSLAS---------- 1214

  Fly  1228 DEIIVEIESRSEPRSACSYESDEEDEFLSPLVSANVSLVDPVPSRNSPHYFAPPAG-PQPRNSLL 1291
                                                      ||::......||.. .:.|.|.:
  Rat  1215 ------------------------------------------PSQSPGRSLTPPFRLKETRISFM 1237

  Fly  1292 HGGNGSGSKIGTATGSESSSGFGSFSTVQPAQTSSHSQFVPTVCSSKMGETQSQVFSSGSCGIKI 1356
            ..|..: ....|||...::..|.|        ||.|...:|       .||:         .:|.
  Rat  1238 EEGMNT-HWTDTATDDRNAKAFVS--------TSFHKCGLP-------AETE---------WMKT 1277

  Fly  1357 SERTTICGEMESTDLGAELTAAPSAQWSLPSARPAIQGHHQMMDTTLGMSTYDVASLEQQDTQDV 1421
            :::.|..    ..|:.|::.....|:                     .:.|:...|||:   .||
  Rat  1278 NDKNTYF----PLDVPAKVPQKVVAE---------------------SLDTHSPRSLEK---LDV 1314

  Fly  1422 ENEEELKLGDTKSLEEQQNPQDEQ---------KP-------------EQEQDQDEDQAQEPLAT 1464
            ..:..:.....::||....|..|.         ||             :.|:|.|::        
  Rat  1315 SKDSTVSSRSDQTLEYHDAPSPEDLEGGVFVSPKPASSSTELTTNSMVQTEKDNDKN-------- 1371

  Fly  1465 GGQLAFLSNSEGT--AQEPLSSPIYSLSSEDSNVSSAGIRNPMLPTLHTDDPM----YSIVVES- 1522
                  |..||||  |.|.....|.:.....|..|..             ||:    .|:.|.| 
  Rat  1372 ------LFKSEGTPSAMEKQIGTIEASVEAFSEFSHL-------------DPVERAEASLGVSSV 1417

  Fly  1523 -PGSITTSRSVTHTPTSFLPSDTNV-SQTSSPQAPHGEDGDGTPISLYRANSLETVDDLDTTKGS 1585
             .|..:||:|    .||.|....:: |:||.|.|.|.|         :.||.:|.|:..::|...
  Rat  1418 REGETSTSKS----KTSVLDGIVSIESRTSIPIADHNE---------FVANKVEDVESSESTTSK 1469

  Fly  1586 LEEEEEYD-DDDCVIALDGTEVRGYV---------ARPQQSAASSSAE----LFAFKDECQ---E 1633
            .....|.. |.:..:.|.|.|:...|         .|||.||..|..:    :...|.|.|   |
  Rat  1470 CPVTSERSLDKELTLNLKGDEMEAVVPKESVGLPEERPQTSAGPSDTQEIHLIGCEKLEVQNSEE 1534

  Fly  1634 EAAGVPSPFL-SLGA--------------------TVNSDSDVAD------------TIVLDSDE 1665
            .|..:..|.| .|||                    ..:::.|||:            :::|:.:|
  Rat  1535 VAKSLSFPELCPLGAHRPQYNFDVIEQQFRDLPDDKDSAECDVAEVDGELFVAQSNFSLILEGEE 1599

  Fly  1666 ETAKEKDTQ--PE----QRKDWPMEEETPSNESVATVEFSEQKQPRADMDIGMEVDAVPDVLEVL 1724
            ...:..|:.  |:    ..|:.|:..|.|.||...|           |:...:..|.        
  Rat  1600 GEVEASDSNVLPKVTNIATKEKPVSCEEPDNEGHVT-----------DLPSAVTGDQ-------- 1645

  Fly  1725 EVPEMEPLPVLSDVDIEMAVDEVPNVLEVLEVPELEPLPAGQATQSSGLGEIPEEDVDAEAEEQV 1789
            |..::|.||.:.: .:::|:.|  |:|:|     ::...:.:||..:.:     |||| |....:
  Rat  1646 ESHKVETLPYVPE-PVKVAIAE--NLLDV-----IKDTRSKEATHVAAV-----EDVD-EDRAVM 1696

  Fly  1790 VVKVEH---VADEQPK--EGDKTESKEASEEETQHNPEPLLPEEEDSRHSLKLIFSGDEDEEEQD 1849
            :.|..|   :.:..||  :..:.|:..||:.:....|..|...:    .:|.|..:.:::.....
  Rat  1697 IPKAAHPSRLTNSTPKTVKERRAETVSASQGDDSIAPRTLTRRQ----RALSLNVTSEQEPSAAA 1757

  Fly  1850 VPTRAIHTLRPRRSFTEHQDSPRTLRPRRVSQEHRDSPTPV-AGRTMSLRSTDAPTLSPASNPPV 1913
            .|.:....::..|.|:|...|...:.|.  :|....||:|. .||............|.|...|.
  Rat  1758 TPQKKTRKVKETREFSESTCSDVKVAPE--NQLTAPSPSPSRRGRKKKDLGQGPLATSGAVEEPQ 1820

  Fly  1914 STPKRRGLQHKYLLEVIDEHSPSDLSLPRTRSRTRLSVDSEATSSRPGTP--------------T 1964
            :||:|..|:       :....|:....| :|::.:||      |:|.|||              .
  Rat  1821 ATPERLRLR-------VQPPEPAAEETP-SRAKAKLS------SARKGTPRRLRKSIEDGPSADI 1871

  Fly  1965 MTKARGKRAT-----------------------------SQAPPTASPSVRR---SLRGHSEPPA 1997
            :.:.||::|.                             .|..|.....||.   |:.|.:|.|.
  Rat  1872 VNEVRGRKAAGHGRTVRELRSASVEDTQKMEYEQDEERGDQQLPLKRKRVREREDSVSGVTEEPK 1936

  Fly  1998 ALSAQLVRK-----PKTARAGVRSRKTSSGVQSPVAVSPTPIDAPIDVPDSTAPEEEQPRLRRTA 2057
            ..|:||..:     |.|.|.  |.|:       |..|.|...|......:.|:|::|.|.:||:.
  Rat  1937 LDSSQLTLQVGLDVPATPRK--RGRR-------PKRVVPLGADGTTPGKEQTSPQKEGPVVRRST 1992

  Fly  2058 R----RRISEL---------------------SDQSANGT--------GDLRSEAS---SSRTGS 2086
            |    |.:|.|                     :.:||:|:        .||..||:   |:..|.
  Rat  1993 RNTPARNVSTLEKPILVPNKEAATVMTSKKKPTKKSADGSPKGPFPAVSDLADEAAHRESTDQGV 2057

  Fly  2087 KSNSAASTQNRELRPRLRRT 2106
            .:::|.:|.:...|.|.|||
  Rat  2058 LTSAAFTTPSWSTRTRSRRT 2077

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ElysNP_608340.2 ELYS-bb <166..482 CDD:465233 83/377 (22%)
ELYS 714..914 CDD:464050 64/230 (28%)
DUF5585 1855..>2095 CDD:465521 71/327 (22%)
Ahctf1NP_001258199.1 ELYS-bb 2..489 CDD:465233 116/550 (21%)
ELYS 722..945 CDD:464050 64/231 (28%)
PRK12678 1713..>1927 CDD:237171 43/233 (18%)

Return to query results.
Submit another query.