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Protein Alignment Dhc16F and dhc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001342921.1 Gene:dhc1 / 3361400 PomBaseID:SPAC1093.06C Length:4196 Species:Schizosaccharomyces pombe


Alignment Length:3844 Identity:870/3844 - (22%)
Similarity:1572/3844 - (40%) Gaps:673/3844 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   157 DLNLII--------NRMRNMPDDSFVYMDYMLPHDSEY----------FTPYSL-REVEYKDLNT 202
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pombe   684 DTNLIFTNWINDVSSRNLNFDFDSKIF--YLTQSESAESPLRLSVSIDFDPCSFCKEIR------ 740

  Fly   203 YEPFYTVTRHGVTFWHCSENFFTPLDQWQQEFKQFLSIIQIRSFSIFRLWKGFKVWEKTIKWRKL 267
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pombe   741 ------------TLAHLGYNIPSQL----MELASCLQRIQLIAMCLIDSVQSFN--DVSFEISKT 787

  Fly   268 NEARDYLQNNLFIVIPQLAKAILRMRSDIV----------QLQRLNFV-NV-SNIENW-HPFYFL 319
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pombe   788 EEERFLLQEYELAVRQHIVTGLFISWNDFIVGNLSTPPKCAIGKRNFLKNIHPNVENYAYQFSSL 852

  Fly   320 ------------ETHMRIYEQLHKTFTDFREF---IAKTIFRACTDAIQARGFYPDDEVNYYPSL 369
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pombe   853 TSLLMNKRNAISHTYMQIQEQLFQ--LDICEYSGDIFLTIQRKLQDLIDL--LYVNGYSNLPPFV 913

  Fly   370 K--KMREAHSFMDRARKRAFCKTLTNFLTYCDMMVYQMLYRITKKSFEDLATSFEVHDEVGPSEA 432
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pombe   914 RALNLRFQDLLISRCRK---------FLSFFKTTI--------------LTSGNENNDLKSKFSS 955

  Fly   433 DINKHDRVDKRIEKQRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDRIDIEP-----SEDIIRIIFQRITGLILET 492
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pombe   956 DM---------YEKLRGFLKPTN------LTIQRNIIEFDPPVYRKKEDSIYLL-----DMCLQS 1000

  Fly   493 VLEIHPF-----------TTDPFF--TQYTQPSIMGRQEEVLYEGAPDL---HYLLRADIRFQYN 541
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pombe  1001 VVNI-PLLSIKTTAQRNCTLIGFFPVINRLESEILGIFESLLFHFDSILGYQNYWKKVEPFLNLN 1064

  Fly   542 RKNMFVLIRKAYERARLYTQRFHQIRENFEIDNSTDPTVLNTERDLQILRAYCDRYCNNVRALDG 606
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pombe  1065 SLNL-LLKSELFQLDQCYSLSLYLIHLKSEVDE------IGKVTDFKIFSV------NN------ 1110

  Fly   607 ILEYVFLGLLKLTQTNFKDTVTPVCSRLQNVLATYLPKLAEEETTRLYEEAQDFHGRIC---YEP 668
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pombe  1111 --------------TEFKSQVYLYLREWINALFDRFTFLLGKESEHLLNELDDTHSSLSTVDFTV 1161

  Fly   669 HETLEIVAHIRFLDKCST-ELDGIFDGIDYVHDLLLIIKDFGIPIDD---DSKEDYMDTEDYLNR 729
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pombe  1162 NNTESLINSLKIFKKAGCYKLN--------VEHKIITYQNYEMTFNDCDAFSEFNFSLLKDITSK 1218

  Fly   730 TRETLEEIREKRQDFINRLEDAMQDDIAALKEDIHEVAIEALQPW------LLDANSNRLSVTNK 788
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pombe  1219 WKDLLESFECRRLKLENNKDEILR-NFSEFAKRVNTETLSLISEWCASSLSLIKANYDEFSST-- 1280

  Fly   789 LDSMLERLNKCRETADEFLGYQKEFQIDLTMYDEMASGFYDIRMRQ-NLYRTWSDWEESLAEWIV 852
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pombe  1281 VDDFLFRFSKATEQCLMVKYIKKDLEIEI---EESCD--FSIQTEEIHLYKKFKDVISSNLEFIV 1340

  Fly   853 S---------DFNTLNVVDMVELNS-KTIKNCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLPVIGYL 907
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pombe  1341 EIKNTRWKLFDTATLSVQTTHQINALESVHTSFQHFKLFTNT------KQSLNQLKDCTLLLQKL 1399

  Fly   908 RNPNLRARHWAEIEDLLNRKFFQEKDILIQTYEDVHAFDDVAIGEALMQISSQATGEVQLENMLK 972
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pombe  1400 KSCPLKPVHWISLFEI--TKSTEQLDFEKLLVSDILGIDLQAHESFITTLLNSAVVEANLENQFN 1462

  Fly   973 GIETTWKETELSIVPHHDAKDVFILAGTEELQAVLDDSNVNINTIAASKFVGPIKSKVDEWINAM 1037
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pombe  1463 EVHSFWKNSYFSFKSFKGRN--YIVVGCQELIDAVEKNMDSLNLIKTSRHFKDGDMNITDLQSKM 1525

  Fly  1038 DQFAKTFESWMDCQGAWIYLEAIF-ASADIQRQLPHEAKMFFTVDKSFKETVRQAKKVALALPTM 1101
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pombe  1526 KIIVKFLNIWKEIQQIWTHLSAIFYESTYIQQLLPELAASFFNSSKTYMHLVTLLKERSYLYKVS 1590

  Fly  1102 SSVDVHKVLVENNRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFPRFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQPHLRKC 1166
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pombe  1591 NIPSLLESAAKLSTTLEDSKKSLLKYFELQRHKISRLYFLGDDDLMELISNPCDPFVINKQIIKL 1655

  Fly  1167 FDAIYRLEFGSKEGGDGKMVATNDIVAFLSPEGEKLQFGKGLKARGAVE--EWLSKVEEAMFVSC 1229
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pombe  1656 YPGIRSLIVDTEN--------TN-INGCTTNEGNELLFDNPICLLDNTQPLHWISSLEPFLKATL 1711

  Fly  1230 KRYMRFGYQ----CYPAKER----EDWFQDHPNQVVLTVSQVQWAADIHRIYEGKERNPLNILEK 1286
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pombe  1712 FQLFSTSFQQIRDFYYNKSRNVFCKEWFLRYPSQITLLSLRCTLC---HEIETG-------IADC 1766

  Fly  1287 MAKFEIKCLKD-LGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKDSVRMLIEKEVCKASDFN---W 1347
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pombe  1767 CLDAVFNFINDGISSLVLLADENELSIKKKVTLMFNEL-LHFKETVGLL-----CKNS-FNNYFW 1824

  Fly  1348 LKMLR-FYWAD-ETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCYLCLMGAFQMDLGGAPA 1410
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pombe  1825 SREVKAFYREDHDDEAVVIKMFSLEFIYAFEYSELDDPIVYTDLTRNCFSVLLHSIASNLGGSPI 1889

  Fly  1411 GPAGTGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAWCCFDEFNRIDIEVLSV 1475
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pombe  1890 GPAGTGKTETVKAVSAYLGKNVFVFNCDNAFNYKTIQRILSGLAQIGTYICFDEFNRLDSGTLSA 1954

  Fly  1476 IAQQLITIRTAKAMRVKRFIFEGREIKINRSCC----------VFITMNPGYAGRTELPDNLKAL 1530
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pombe  1955 ISYDIQRIQSL--------------VSHSDGLCQSPILLDAPTIFVTMNPGYLGRFKLPSNLKKL 2005

  Fly  1531 FRPISMMVPDYALISEVILYSEGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAVKSVLVMA 1595
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pombe  2006 FRPIWMGSPDNKKICEILFLSFGFKESSLLSQVLDSFFLCCSGSLSNCLHYDFGLRAMKVVIKAA 2070

  Fly  1596 ----GALKRASPNQREDITLIAALRDSNIPKFLADDAVLFRGILSDL--FPGVEL-----PDSQH 1649
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pombe  2071 KRIKGFLKKKNTICQELEILWYAIREVLYPSLIYQDIPLFFKAEESYFNFPAVKANAFIDPDNFE 2135

  Fly  1650 PHLEASLRLGLRQKNLQAVPTTIR-KCLQLYETMCVRWGVMLVGPTGGGKSVVLHALEFALSHLF 1713
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pombe  2136 VNIEQTL-----SKNFFGNNQYLKLKIMQLYQMSEAYNGIILLGKTGSGKSQIFRILQSALLNIG 2195

  Fly  1714 ENEVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELYGYVDLKTLEWQDGLLGLAVR-TATTVEDEIHQWIMCD 1777
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pombe  2196 ID---------CIVYVISPKALTKESLFGSMNMDTREWTDGVFTKLLRKTRDSCYYKRYMFVF-D 2250

  Fly  1778 GPVDAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERIKLTAWIHMLFEVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDL 1842
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pombe  2251 DELSPEWVEAMNSLLDDNKTLTLSNGERIALQPYVKIFFEADSVASLTRATISRCGLICISNIDD 2315

  Fly  1843 GWIPLID---TWREVDMKHKLPAPLAEF-------------------CYQLFVGYFDKALKIERK 1885
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pombe  2316 NILSSTDKMLSFTSGATNYPLGSSNDEFSTVFSKVLTDEVMMNLISSCYKFSVD-LQHIMNFTKQ 2379

  Fly  1886 RAVYTIHQVLGSKVRLCCELNSAQFEAVKWSAMSEEQGKELVTKIFAWAVLWAIASNLKDAEKVS 1950
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pombe  2380 RFFTTFYSLL-DQTKLFTR-SSNITESLSFKELCNYL-KKKICYILAWC-----CTGDTDAKS-- 2434

  Fly  1951 FEEQWSKAIAQHPNMTLP------NFTLWNYRIDLEKMDWGSWIDIMAKFVFDPETSYY-DMQVP 2008
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pombe  2435 -RERFTHWLMQNASVDLPEIKDFEHVSILDFDVSLETQ---SWYPIAGKTLKSSALKYAGNTVIP 2495

  Fly  2009 TVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVMVTGDTGVGKTVLAISCMKRLSQGNVIPVILNFSAQTSSNRTQE 2073
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pombe  2496 TLDTVRYAEFLNFSLTKNRCVIFCGPPGSGKSMLMLGTLR--SRQDVEVIALNFSISTSSKSVVS 2558

  Fly  2074 MIEGPLEKRKKTQLGAPV------GKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPAIELLRQFLDFKGFYDRE 2132
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pombe  2559 FLEQSTVYYRST--GMTIMCPKNHEKVLVLFCDEINLPRSRNCLAEDVICFLRHMLEHQGFWHPL 2621

  Fly  2133 KLYWKEILDVVLGCACAPPGG-GRNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEETLTQIFNGILRGFLQTFSS 2196
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pombe  2622 HKEWVTIKNIFVCGACNPSTDIGRNDFPERFLRRTVLIFVDYPESYSLVTIYNALLE------KS 2680

  Fly  2197 AV----RALSEPMVNACVDVYMRVATVMLPTPDKSH---YIFNLRDLSKCI-------QGILQAS 2247
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pombe  2681 ALINQYKTIILNIVKASVKFYQ-----VLRENFKSSTQGYVYTPRDLTRWLISFKNYAESYAETN 2740

  Fly  2248 NLHYNQENQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKNIFKALMKEVC---MDHFNRPVINDNEPPILFG 2309
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pombe  2741 NL------SLIKVWYHEACRVLLDRLVS----------QKE-CSWGMTELQKVIVTD------FG 2782

  Fly  2310 DFMVFGKPKNERIYDEIRDH-----------TKLESVLNDYIADY-NSVAVGKQMKLILFQDAME 2362
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pombe  2783 EFEVSVIFEKQIIFTDILKNGLEFLDFASLRPKLESLYKKFYSSHPNNT-------LVFVDETIT 2840

  Fly  2363 HTVRLARLLRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLASHVNEYNCWQIEMRRNYDLNAFHEDLRVLYRI 2427
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pombe  2841 HILRFHRILNNSGMHALLQGSVGLGQKAVVEFVCWLNSFSLFELQKNQTYSIEDFEDNLKSILIL 2905

  Fly  2428 AGIDNQPVTFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGEVPNLFEGDEFEKIILDARDGCNENRKDDPC- 2491
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pombe  2906 AGTTNCKACLAINESIAGVPGFLDLLNNLLTNSEVSNFFDQNDWAEI----KKNLNKLNEFQPLK 2966

  Fly  2492 --TRDDIYKFFINRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCRMFPSLVNCTTIDWFTSWPTEALYSVA-- 2552
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pombe  2967 FDSEESVTEIFMNNVFQNLCVVFYVYTSADVDFQTNSLSPALLNRCTIDYYHSWDYHSMLQIANE 3031

  Fly  2553 -------LGLLTKIAPKMED------RISLASTTVFMHKTVEDASVKFYKEMKRHYYTTPSSYLE 2604
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pombe  3032 VLQETISLNALDHDNPNLKNIKGSSIYDAVAQAVVNTHTSI----VWEFKHLGKTSYFSCLHFIR 3092

  Fly  2605 LLKLYQNLLKIKNMEIIAKRKRIANGLNKLLETNEVIAVMGKELEVMVPQLDEKSAMMKSLVDNL 2669
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pombe  3093 FLNTFCLIFGRDANKLSKEKSRIENGFKKIKETSQGI---DKFKEALSDQQNVLFSKTKTANDRL 3154

  Fly  2670 --TKETKQA-DAVKQSVLEDEMNAKEKAAVAQAISEDAGKDLEIAMPALREAEEALKGLTKADIN 2731
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pombe  3155 QCIIQTKQAVEAKKVYSLQAEASLQKKSFLLNEKKNSVMKEVSYAKPAVIEARKSVSDIKKAHLI 3219

  Fly  2732 ELKSFTTPPALVQFCMEAVCILLGVKPT-WASAKAIMADINFIKRLFEYDKEHMKEDTL---KKV 2792
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pombe  3220 ELRSLSRPPMAIRITMEVVCKLLGFSATDWKNVQQLLKRDDFIPKILNYNLE--KELSINLRRKI 3282

  Fly  2793 KK-YIDHKDFVPAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSKVYKVVEP--------KIKRKEAAE---- 2844
            :: |..:..|......:.||....:.:|:.|:..:|||.:.:||        |:::|.|.|    
pombe  3283 EQDYFSNPIFTFDSVNRASKACGPLLLWIKSICNYSKVLEKLEPLNSEVDRLKLEQKNAEECIQE 3347

  Fly  2845 --AELKEVMTVLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSLEE----KQREFQVIQDNVDLTYGRINRAGRLT 2903
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pombe  3348 TIAACKDLDEKLLQLQEEYASMISEIHSMELQMDEVKCKMQRSIEVITD---------------- 3396

  Fly  2904 SALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVP-------GDVLVAAACVAYLGAFSHEYRRDMSALWVSKCR 2961
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pombe  3397 --LSIERNEW-------SGFLNLYPKRMWNLVGESLMEASFVVYAGNLDPSMRIFLR----NKC- 3447

  Fly  2962 EHKIPSSPEFNLLK--VLGDPYEMRQWNVDGLPKDNI---SIENGIYATRALRWALM-IDPQEQA 3020
             ..|.||..|.:.|  |..:.....|.:::.....|:   |:|| ||..:..:..|: |||..|.
pombe  3448 -EPIISSFGFPISKSAVRTNIERCVQTSIESKYYKNLTDYSLEN-IYIIQENKSPLLIIDPSSQI 3510

  Fly  3021 NRWIRNMERANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPSLRPILQRETYRFEGR- 3084
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pombe  3511 LDILPSLYKGKASDLISFSNKSFQNQIKLALLSGSAIIIKDA-ELWDVSIEPLLKPEFFTGSGEV 3574

  Fly  3085 --TYLKLGDMVIDYDDNFKLYMTTKLP-NPHYLPEVCIN---------VTLVNFLVTESGLEDQL 3137
              |:.|  |.:           |..|| |..:..||..|         :.:|||.::.|.||.|:
pombe  3575 QTTFAK--DTI-----------TITLPLNIIFFSEVQSNELENKASKFMNVVNFTLSISLLETQM 3626

  Fly  3138 LADIVAIELPAMEIQRNDLVVKINSDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAKETS 3202
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pombe  3627 LKSVISVQEPGVFKQKDNCFTLKLSIERQIRSLQEQLLKTLCSSNENIVGTDEIVVLLKNLKEKH 3691

  Fly  3203 LIIAARLIDTEETEKVITASRERYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNVLR- 3266
            ..|.....:::...:.:.....||::.......:..|......:...|.:|..:....|..:|. 
pombe  3692 ETIRLAYSESQSINRKVDELIRRYKLSIKSFLSVVVVFQHFISLKKSYSFSFNFIWSTFHQMLNV 3756

  Fly  3267 -LDHPPQSVEVRISTLMTDELRAIFDNISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTEEEFLFLSR 3330
             |::..|.    ..:|:.|.||.:.......:|...:::|.|||.              |.|..:
pombe  3757 VLENRNQD----FKSLIMDALRDLIRRCFLYIFPEDRVLFLFLLM--------------FFFFPK 3803

  Fly  3331 GPVGNIRTKIQPAKIKMSQIEWDSCIFLEDNFSSFFSGLTDE-----LDKPFFIQMQENKEVFDF 3390
                      :...::...|.....:.||.::.:||...:|.     |:..||.....|  :.:|
pombe  3804 ----------ETESLRKLLIVNGKTLELEQSYLNFFETCSDSNERGGLESLFFKTHASN--IQNF 3856

  Fly  3391 AQTNQPPTDKWNKRLRVFHKLMFISAFR------KPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGTQLSS 3449
            .......|......|::.:.| :.|||:      |..||            |...:.|.....:.
pombe  3857 CTEVLANTHCEEDCLKLLYDL-WSSAFKVEFSNIKYDFL------------KIINDESESRMPTI 3908

  Fly  3450 VYL-DTSAVTPLIFVLSTGSDPMSGFLKFTTQMQFTDKYYSISLGQGQGPLAENLIEKSLRLGH- 3512
            ||| :...:..|   |.....|.:            .|..::|||..:.   |:|.:..|:|.. 
pombe  3909 VYLMENCEIDSL---LQNAKIPQN------------IKKLTVSLGSAEN---ESLADSYLKLAST 3955

  Fly  3513 ---WVFLQNCHLATSFMQTLETIVRNLTLGITKAHVDFRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEP 3574
               |:|:.|.||:|.:.:.|.:.:.|      ..|.:.|:...|......|..:|..|..|....
pombe  3956 EPLWLFINNIHLSTPWAEKLPSKMSN------HLHKNSRIVCLSEIHNQLPHQLLCISRSIVFNK 4014

  Fly  3575 PKGIKANVFGALTDLKQDFFEQHIQNGNWRAIVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESDR 3639
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pombe  4015 QTSFKNNLLNLLELLPT---MTHTLPHNRFRLFFFLSWLHATLAEIYCFTCSSWKEPCYFDDSDF 4076

  Fly  3640 ECGLKTLDFFIDREV-LDEIPWEAILYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRTIL--------TIFSSK 3695
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pombe  4077 YFGTKILCNILYRNVHLEEFSWGTFKDLLLNVVYGPKVSASSDFIALDKILKRLIAQFKTQISSN 4141

  Fly  3696 RIIQPDYKY 3704
            .::..::|:
pombe  4142 ILLTDNFKF 4150

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:462462 87/418 (21%)
DYN1 1047..3704 CDD:227570 689/2858 (24%)
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Dynein_C 3750..4073 CDD:465677
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