DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc16F and Dync1h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_062099.3 Gene:Dync1h1 / 29489 RGDID:2511 Length:4644 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4240 Identity:1118/4240 - (26%)
Similarity:1936/4240 - (45%) Gaps:642/4240 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   230 WQQEFKQFLSIIQIRSFSIFRLWKGFKVWEKTIKWRKLNE------------------ARDYLQN 276
            |.::..:.|:....|...:  |.||   ||..::.:||.:                  ||...|.
  Rat   648 WAKQIDRQLTAYMKRVEDV--LGKG---WENHVEGQKLKQDGDSFRMKLNTQEIFDDWARKVQQR 707

  Fly   277 NLFIV--IPQLAKAILRMRSDIVQLQRLNFV--------NVSNIENWHPFYFLETHMRIYEQLHK 331
            ||.:.  |..:..|.:|.||..|...::||:        .|.|:: |..|   ...:.|..:.|:
  Rat   708 NLGVSGRIFTIESARVRGRSGNVLKLKVNFLPEIITLSKEVRNLK-WLGF---RVPLAIVNKAHQ 768

  Fly   332 TFTDFREFIA-----KTIFRAC-------TDAIQARGFYPDDEVNYYPSLKKMREAHSFMDRARK 384
            ....:...|:     :|..|.|       |.::...|...:.:......:..:.|::......::
  Rat   769 ANQLYPFAISLIESVRTYERTCEKVEERNTISLLVAGLKKEVQALIAEGIALVWESYKLDPYVQR 833

  Fly   385 RAFCKTLTNFLTYC-DMMVYQMLYRITKKSFE----DLATSFEVHDEVGPSEADINKH------- 437
            .|  :|:.||.... |:::.:....:..:|.|    |..|..|:.:.|..:..|:|.|       
  Rat   834 LA--ETVFNFQEKVDDLLIIEEKIDLEVRSLETCMYDHKTFSEILNRVQKAVDDLNLHSYSNLPI 896

  Fly   438 --DRVDKRIEK---QRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDRIDIEPSEDIIRIIFQ-----RITGLILE- 491
              :::|..||:   .|.|...:: :...:|....|:.:::...|..::..:     :|..::.| 
  Rat   897 WVNKLDMEIERILGVRLQAGLRA-WTQVLLGQAEDKAEVDMDTDAPQVSHKPGGEPKIKNVVHEL 960

  Fly   492 ----TVLEIHPFTTDPFFTQYTQ-----------PSIMGRQEEVLYEGAPDLHYLLRADIRFQYN 541
                .|:.::|...:..:..|.:           |.|..::.:|      .:||.|..:.:|..|
  Rat   961 RITNQVIYLNPPIEECRYKLYQEMFAWKMIVLSLPRIQSQRYQV------GVHYELTEEEKFYRN 1019

  Fly   542 RKNMF----VLIRKAYERARLYTQRFHQIRENFEIDNSTDPTVLNTERDLQI-LRAYC--DRYCN 599
            .....    |.:.::|                    ::....|...|:.::: |:..|  |....
  Rat  1020 ALTRMPDGPVALEESY--------------------SAVMGIVTEVEQYVKVWLQYQCLWDMQAE 1064

  Fly   600 NV--RALDGILEY-VFLGLLKLTQTNFKDTVT-----PVC---SRLQN------------VLATY 641
            |:  |..:.:.:: ..|..::..:..|.:..|     ||.   .::|:            ||:.:
  Rat  1065 NIYNRLGEDLSKWQALLVQIRRARGTFDNAETKKEFGPVVIDYGKVQSKVNLKYDSWHKEVLSKF 1129

  Fly   642 LPKLAEEETTRLYEEAQDFHGRICYEPHETLEIVAHIRFLDKCSTELDGIFDGIDYVHDLLLIIK 706
            ...|....|        :||.:|.....|..:     ..:|..||.....|  |.||..|...||
  Rat  1130 GQMLGSNMT--------EFHSQISKSRQELEQ-----HSVDTASTSDAVTF--ITYVQSLKRKIK 1179

  Fly   707 DFGIPIDDDSKEDYMDTEDYLNRTR----------ETLEEIREKRQDFINRLEDAMQDDIAALKE 761
            .|     :...|.|.:.:..|.:.|          :.:|.......|.:.|.:.|:|..:|.|:.
  Rat  1180 QF-----EKQVELYRNGQRLLEKQRFQFPPSWLYIDNIEGEWGAFNDIMRRKDSAIQQQVANLQM 1239

  Fly   762 DI--HEVAIEALQPWLLDANSNRLSVTNKL--DSMLERL--------------NKCR------ET 802
            .|  .:.|:|:....||........||..|  :..|:.|              .||.      |.
  Rat  1240 KIVQEDRAVESRTTDLLTDWEKTKPVTGNLRPEEALQALTIYEGKFGRLKDDREKCAKAKEALEL 1304

  Fly   803 ADEFL--GYQKEFQIDLTMYDEMASGFYDIRMRQNLYRTWSD----WE--ESLAE--WI-VSDFN 856
            .|..|  |.::..|:.|   :|:          |:|...||:    ||  :.:.|  |: |....
  Rat  1305 TDTGLLSGSEERVQVAL---EEL----------QDLKGVWSELSKVWEQIDQMKEQPWVSVQPRK 1356

  Fly   857 TLNVVDMVELNSKTIKNCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLPVIGYLRNPNLRARHWAEIE 921
            ....:|.: ||.  :||   |...|.:......:|:..:.:.:...::..|::..|:.|||.::.
  Rat  1357 LRQNLDGL-LNQ--LKN---FPARLRQYASYEFVQRLLKGYMKINMLVIELKSEALKDRHWKQLM 1415

  Fly   922 DLLNRKFFQEKDILIQTYEDVHAFDDVAIGEALMQ-ISSQATGEVQLENMLKGIETTWKETELSI 985
            ..|:..:...:..|.|.: ||    |:...||::: :...|.||:.||..||.|...|...||.:
  Rat  1416 KRLHVNWVVSELTLGQIW-DV----DLQKNEAIVKDVLLVAQGEMALEEFLKQIREVWNTYELDL 1475

  Fly   986 VPHHDAKDVFILAGTEELQAVLDDSNVNINTIAASKFVGPIKSKVDE----WINAMDQFAKTFES 1046
            |.:.:  ...::.|.::|   .:....:||:::|.| :.|.....:|    |.:.:::....|:.
  Rat  1476 VNYQN--KCRLIRGWDDL---FNKVKEHINSVSAMK-LSPYYKVFEEDALSWEDKLNRIMALFDV 1534

  Fly  1047 WMDCQGAWIYLEAIF-ASADIQRQLPHEAKMFFTVDKSFKETVRQAKKVALALPTMSSVDVHKVL 1110
            |:|.|..|:|||.|| .||||:..||.|.:.|.::...|...:::..|..|.:..::...|.:.|
  Rat  1535 WIDVQRRWVYLEGIFTGSADIKHLLPVETQRFQSISTEFLALMKKVSKSPLVMDVLNIQGVQRSL 1599

  Fly  1111 VENNRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFPRFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQPHLRKCFDAIYRLEF 1175
            .....||..|.:.|..|||.:|..||||||:.:::||||:..::....:|.|.:|.|        
  Rat  1600 ERLADLLGKIQKALGEYLERERSSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNVAKLQKHFKKMF-------- 1656

  Fly  1176 GSKEGGDGKMVATND---IVAFLSPEGEKLQFGK--GLKARGAVEEWLSKVEEAMFVSCKRYMR- 1234
                .|...::...|   ::...|.|||::.|..  .:.....:.|||:.||:.|.|:..:.:. 
  Rat  1657 ----AGVSSIILNEDSSVVLGISSREGEEVMFKTPVSITEHPKINEWLTLVEKEMRVTLAKLLAE 1717

  Fly  1235 -------FGYQCYPAKERE-----DWFQDHPNQVVLTVSQVQWAADIH----RIYEGKERNPLNI 1283
                   ||    .|...:     .|...:..|:|:..:|:.|:.::.    .:..|.:..||..
  Rat  1718 SVTEVEIFG----KATSIDPNTYITWIDKYQAQLVVLSAQIAWSENVENALSNVGGGGDVGPLQS 1778

  Fly  1284 LEKMAKFEIKCLKDLGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKDSVRMLIEKEVCKASDFNWL 1348
            :  ::..|:    .|..||.........|.|:.|..|||..||.:|..|.||:.::..|..|.||
  Rat  1779 V--LSNVEV----TLNVLADSVLMEQPPLRRRKLEHLITELVHQRDVTRSLIKSKIDNAKSFEWL 1837

  Fly  1349 KMLRFYW----ADETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCYLCLMGAFQMDLGGAP 1409
            ..:|||:    .|..:.:..:||.|...|.:||||....||.|||||||||.:..|.:..|||:|
  Rat  1838 SQMRFYFDPKQTDVLQQLSIQMANAKFNYGFEYLGVQDKLVQTPLTDRCYLTMTQALEARLGGSP 1902

  Fly  1410 AGPAGTGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAWCCFDEFNRIDIEVLS 1474
            .|||||||||:.|.|...|.:..:||||.:..|::.|||.|.||.|.|||.|||||||::..:||
  Rat  1903 FGPAGTGKTESVKALGHQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLS 1967

  Fly  1475 VIAQQLITIRTA----------KAMRVKRFIFEGREIKINRSCCVFITMNPGYAGRTELPDNLKA 1529
            .::||:..|:.|          |...........:::|::....:|||||||||||:.||||||.
  Rat  1968 AVSQQVQCIQEALREHSNPNYDKTSAPITCELLNKQVKVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKK 2032

  Fly  1530 LFRPISMMVPDYALISEVILYSEGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAVKSVLVM 1594
            |||.::|..||..||::|:|||:||...::||.|:|..::||.:|||.|:|||||:||:|||||.
  Rat  2033 LFRSLAMTKPDRQLIAQVMLYSQGFRTAEVLANKIVPFFKLCDEQLSSQSHYDFGLRALKSVLVS 2097

  Fly  1595 AGALKR---------------------ASPNQREDITLIAALRDSNIPKFLADDAVLFRGILSDL 1638
            ||.:||                     .:.|..|...||.::.::.:||.:|:|..|...:|||:
  Rat  2098 AGNVKRERIQKIKREKEERGEAVDEGEIAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDV 2162

  Fly  1639 FPGVELPDSQHPHLEASLRLGLRQKNLQAVPTT-----------IRKCLQLYETMCVRWGVMLVG 1692
            ||||:....:...|...|:     |..|.:..|           :.|.||||:...:..|:|:||
  Rat  2163 FPGVQYHRGEMTALREELK-----KVCQEMYLTYGDGEEVGGMWVEKVLQLYQITQINHGLMMVG 2222

  Fly  1693 PTGGGKSVVLHALEFALSHLFENEVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELYGYVDLKTLEWQDGLLG 1757
            |:|.|||:....|..||..|...|        .|...::|||::.:.|||.:|..|.||.|||..
  Rat  2223 PSGSGKSMAWRVLLKALERLEGVE--------GVAHIIDPKAISKDHLYGTLDPNTREWTDGLFT 2279

  Fly  1758 LAVR-TATTVEDEI--HQWIMCDGPVDAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERIKLTAWIHMLFEVQ 1819
            ..:| ....|..|:  .|||:.||.||..|:||||:||||||:|.|.|.||:.|...:.::||||
  Rat  2280 HVLRKIIDNVRGELQKRQWIVFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRIMFEVQ 2344

  Fly  1820 DLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGW-------------IPLIDTWREVDMKHK--------LPAP 1863
            ||..|:.|||||||||:.....|..             |||.:...|...:.|        ..:|
  Rat  2345 DLKYATLATVSRCGMVWFSEDVLSTDMIFNNFLARLRSIPLDEGEDEAQRRRKGKEDEGEEAASP 2409

  Fly  1864 LAEF---CYQLFVGYF----------DKALKIE------RKRAVYTIHQVLGSKVRLCCELNSAQ 1909
            :.:.   ...:...||          :.|.|:|      |.|.:.::..:|....|     |.||
  Rat  2410 MLQIQRDAATIMQPYFTSNGLVTKALEHAFKLEHIMDLTRLRCLGSLFSMLHQACR-----NVAQ 2469

  Fly  1910 FEAVKWS-AMSEEQGKELVTKIFAWAVLWAIA--SNLKDAEKVSFEEQWSKAIAQHPNMTLPNFT 1971
            :.|.... .|..||.:..:.:...:|:||:::  |.||...::.   ::.:.|...|..|.||..
  Rat  2470 YNANHPDFPMQIEQLERYIQRYLVYAILWSLSGDSRLKMRAELG---EYIRRITTVPLPTAPNIP 2531

  Fly  1972 LWNYRIDLEKMDWGSW------IDIMAKFVFDPETSYYDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVM 2030
            :.:|.:.:.. :|..|      |::....|..|     |:.|||:||.::..:.........|::
  Rat  2532 IIDYEVSISG-EWSPWQAKVPQIEVETHKVAAP-----DVVVPTLDTVRHEALLYTWLAEHKPLV 2590

  Fly  2031 VTGDTGVGKTVLAISCMKRLSQGNVIPVILNFSAQTSSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLG---APV- 2091
            :.|..|.|||:...|.::.|....|:.  ||||:.|:.....:..:...|.| :|..|   ||| 
  Rat  2591 LCGPPGSGKTMTLFSALRALPDMEVVG--LNFSSATTPELLLKTFDHYCEYR-RTPNGVVLAPVQ 2652

  Fly  2092 -GKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPAIELLRQFLDFKGFYDREKLYWKEILDVVLGCACAPP-GGG 2154
             ||.:::|.|::|:|.:|.||....|..:||.::..|||......|.::..:....||.|| ..|
  Rat  2653 LGKWLVLFCDEINLPDMDKYGTQRVISFIRQMVEHGGFYRTSDQTWVKLERIQFVGACNPPTDPG 2717

  Fly  2155 RNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEETLTQIFNGILRGFLQTFSSAVRALSEPMVNACVDVYMRVATV 2219
            |.||:.||:||..:..:..|...:||||:....|..|:...| :|..:||:..|.|:.| .::..
  Rat  2718 RKPLSHRFLRHVPVVYVDYPGPASLTQIYGTFNRAMLRLIPS-LRTYAEPLTAAMVEFY-TMSQE 2780

  Fly  2220 MLPTPDKSHYIFNLRDLSKCIQGILQASN-LHYNQENQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKNIFK 2283
            ......:.|||::.|::::.::||.:|.. |.......::|::.||..|:|.|||:..|::....
  Rat  2781 RFTQDTQPHYIYSPREMTRWVRGIFEALRPLETLPVEGLIRIWAHEALRLFQDRLVEDEERRWTD 2845

  Fly  2284 ALMKEVCMDHF---------NRPVINDNEPPILFGDFMVFGKPKNERIYDEIRDHTKLE-SVLND 2338
            ..:..|.:.||         :||::..|   .|..|::    |.::   :|:||:.|.. .|..:
  Rat  2846 ENIDMVALKHFPNIDKEKAMSRPILYSN---WLSKDYI----PVDQ---EELRDYVKARLKVFYE 2900

  Fly  2339 YIADYNSVAVGKQMKLILFQDAMEHTVRLARLLRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLASHVNEYNC 2403
            ...|         :.|:||.:.::|.:|:.|:.|..:|:.||:||:|.||.:|:|..:.:|..:.
  Rat  2901 EELD---------VPLVLFNEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSV 2956

  Fly  2404 WQIEMRRNYDLNAFHEDLRVLYRIAGIDNQPVTFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGEVPNLFEG 2468
            :||::.|.|....|.||||.:.|.:|..|:.:.|::.:|.:::..|||.:|.:|.:||||.||||
  Rat  2957 YQIKVHRKYTGEDFDEDLRTVLRRSGCKNEKIAFIMDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEG 3021

  Fly  2469 DEFEKIILDARDGC-NENRKDDPCTRDDIYKFFINRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCRMFPSLV 2532
            ||:..::...::|. .|....|  :.:::||:|.::|..|||||.:|:|..:..:.|....|:|.
  Rat  3022 DEYATLMTQCKEGAQKEGLMLD--SHEELYKWFTSQVIRNLHVVFTMNPSSEGLKDRAATSPALF 3084

  Fly  2533 NCTTIDWFTSWPTEALYSVALGLLTKI------------APKMEDRI--------SLASTTVFMH 2577
            |...::||..|.|||||.|.....:|:            .|.:.|::        ::.::.||:|
  Rat  3085 NRCVLNWFGDWSTEALYQVGKEFTSKMDLEKPNYIVPDYMPVVYDKLPQPPTHREAIVNSCVFVH 3149

  Fly  2578 KTVEDASVKFYKEMKRHYYTTPSSYLELLKLYQNLLKIKNMEIIAKRKRIANGLNKLLETNEVIA 2642
            :|:..|:.:..|...|....||..||:.:..|.||...|..|:..::..:..||.|:.||.:.:.
  Rat  3150 QTLHQANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFHEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVE 3214

  Fly  2643 VMGKELEVMVPQLDEKSAMMKSLVDNLTKETKQADAVKQSVLEDEMNA---KEKAAVA---QAIS 2701
            .:.::|.:...:|:.|:|.....:..:.|:  |.:|.|:.|:..|:..   |::..:|   .::.
  Rat  3215 ELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVKD--QQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQMSVK 3277

  Fly  2702 EDAGKDLEIAMPALREAEEALKGLTKADINELKSFTTPPALVQFCMEAVCILLGVKPT-WASAKA 2765
            |    ||:...||:.||:.|:|.:.|..:.|::|...|||.|:..:|::|:|||...| |...::
  Rat  3278 E----DLDKVEPAVIEAQNAVKSIKKQHLVEVRSMANPPAAVKLALESICLLLGESTTDWKQIRS 3338

  Fly  2766 IMADINFIKRLFEYDKEHMKEDTLKKVKK-YIDHKDFVPAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSKV 2829
            |:...|||..:..:..|.:.:...:|:|| |:.:..:......:.|.....|..|.|:...::.:
  Rat  3339 IIMRENFIPTIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADM 3403

  Fly  2830 YKVVEPKIKRKEAAEAELKEVMTVLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSLEEKQREF-------QVIQD 2887
            .|.|||       ...||:::....:..|::...||..|:.|..|:...:.|:       |.|:.
  Rat  3404 LKRVEP-------LRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKA 3461

  Fly  2888 NVDLTYGRINRAGRLTSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVLVAAACVAYLGAFSHEYRRDM 2952
            ::.....::||:..|..:||.|:.||.:|.::....::.:.||.|::||.:||.|.|..:.|:::
  Rat  3462 DLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNL 3526

  Fly  2953 SALWVSKCREHKIPSSPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNISIENGIYATRALRWALMIDPQ 3017
            ...|....::..|....:....:.|.:..|..:|....||.|::..||.|...|..|:.|:|||.
  Rat  3527 FTTWSHHLQQANIQFRTDIARTEYLSNADERLRWQASSLPADDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPS 3591

  Fly  3018 EQANRWIRNMERANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPSLRPILQRETYRFE 3082
            .||..:|.|..:...:......|....:.||:|:|.|.|:|:::: |:.||.|.|:|.||..|..
  Rat  3592 GQATEFIMNEYKDRKITRTSFLDDAFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ESYDPVLNPVLNREVRRTG 3655

  Fly  3083 GRTYLKLGDMVIDYDDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFLVTESGLEDQLLADIVAIELP 3147
            ||..:.|||..||...:|.::::|:.|...:.|::|..||.|||.||.|.|:.|.|.:::..|.|
  Rat  3656 GRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDLCSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNEVLKAERP 3720

  Fly  3148 AMEIQRNDLVVKINSDKQ-QLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAKETSLIIAARLID 3211
            .::.:|:|| :|:..:.| :|..||..:|:.|...:|.||||:.::.||.:.|..:..:..::.:
  Rat  3721 DVDEKRSDL-LKLQGEFQLRLRQLEKSLLQALNEVKGRILDDDTIITTLENLKREAAEVTRKVEE 3784

  Fly  3212 TEETEKVITASRERYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNVL--------RLD 3268
            |:...:.:....::|..|::..:.:||.:..|.::..:|||||::|..::.|||        ..|
  Rat  3785 TDIVMQEVETVSQQYLPLSTACSSIYFTMESLKQVHFLYQYSLQFFLDIYHNVLYENPNLKGATD 3849

  Fly  3269 HPPQSVEVRISTLMTDELRAIFDNISRGLFENHKIIFSFLLA-LSVERQEGRVT-EEEFLFLSRG 3331
            |..     |:|.:..|..:..|:.::||:.....|.|:.||| :.::...|..| :.||....||
  Rat  3850 HTQ-----RLSVITKDLFQVAFNRVARGMLHQDHITFAMLLARIKLKGTMGEPTYDAEFQHFLRG 3909

  Fly  3332 -----PVGNIRTKIQPAKIKMSQ-IEWDSCIFLEDNFSSFFSGLTDELDKPFFIQMQEN--KEVF 3388
                 ..|: ..|:|...::.:: :...||:   ..|....:.:  :.|:.|.|.::.:  ::..
  Rat  3910 KEIVLSAGS-TPKVQGLTVEQAEAVARLSCL---PAFKDLIAKV--QADEQFGIWLESSSPEQTV 3968

  Fly  3389 DFAQTNQPPTDKWNKRLRVFHKLMFISAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGTQLSSVYLD 3453
            .:..|.:.|.....:.:   |:|:.|.|||..|.|.....::.:.:|:.|      ..:....||
  Rat  3969 PYLWTEETPATPIGQAI---HRLLLIQAFRPDRLLAMAHMFVSTNLGESF------MSIMEQPLD 4024

  Fly  3454 TSAV--------TPLIFVLSTGSDPMSGFLKFTTQMQFTDKYYSISLGQGQG-PLAENLIEKSLR 3509
            .:.:        ||::.....|.| .||.::.....|.| :..||::|..:| ..|:..|..:::
  Rat  4025 LTHIVGTEVKPNTPVLMCSVPGYD-ASGHVEDLAAEQNT-QITSIAIGSAEGFNQADKAINTAVK 4087

  Fly  3510 LGHWVFLQNCHLATSFMQTLETIVRNLTLGITKAHVDFRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEP 3574
            .|.||.|:|.|||..::..||..:.:|     :.|..|||:|:.......|:::|:.......||
  Rat  4088 SGRWVMLKNVHLAPGWLMQLEKKLHSL-----QPHACFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEP 4147

  Fly  3575 PKGIKANVFGALTDLKQDFFEQHIQNGNWRA-IVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESD 3638
            |.|:|||:....:.:.   ..:..::.|.|| :.|.|..||||:.||.::.||||:..|||.|||
  Rat  4148 PPGVKANMLRTFSSIP---VSRMCKSPNERARLYFLLAWFHAVIQERLRYAPLGWSKKYEFGESD 4209

  Fly  3639 RECGLKTLDFFID-----REVL--DEIPWEAILYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRTILTIFSSKR 3696
            ......|:|.::|     |:.:  |:|||.|:..:.....:||||.:.:|.|.|.|.|....:.|
  Rat  4210 LRSACDTVDTWLDDTAKGRQNISPDKIPWSALKTLMAQSIYGGRVDNEFDQRLLNTFLERLFTTR 4274

  Fly  3697 IIQPDYKY-CRGDSYYRD---PRKKTLTEYSAYVQGFPVLEDPEIFGMNQNANIVFQTKETAFFI 3757
            ....::|. |:.|. ::|   |......|:..:|:..|..:.|...|:..||..|..|.:....|
  Rat  4275 SFDSEFKLACKVDG-HKDIQMPDGIRREEFVQWVELLPDAQTPSWLGLPNNAERVLLTTQGVDMI 4338

  Fly  3758 NTLLLGQPRSAADEGQAMENEIAQQTIARI------QKALATKIKR--EPIHDTLSVLDAKGQVP 3814
            :.:|..|.....|:....|.|...:|.:..      .:.|.|....  ..|..|||.|  |..|.
  Rat  4339 SKMLKMQMLEDEDDLAYAETEKKTRTDSTSDGRPAWMRTLHTTASNWLHLIPQTLSPL--KRTVE 4401

  Fly  3815 SLTIVLVQEIDRFNIALGI-----IHDSLVNLSKAIKGLVVMSEELENVFKALLSNQVPASWAKR 3874
            ::...|.:..:| .:.:|.     :...|.::.:..:|....:..|..:...|:...:|.||:..
  Rat  4402 NIKDPLFRFFER-EVKMGAKLLQDVRQDLADVVQVCEGKKKQTNYLRTLINELVKGILPRSWSHY 4465

  Fly  3875 SFLSIKPLPSYISDFQRRIDFIQ---QWAENGAPRS-----YWISGFFFPQSFLTGVLQTYARRR 3931
            :..:...:..::|||..||..:|   |.|..|..:.     ..:.|.|.|::::|...|..|:..
  Rat  4466 TVPAGMTVIQWVSDFSERIKQLQNISQAAAAGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQYVAQAN 4530

  Fly  3932 VLPIDSLKIDFDVFERELVQQDFFEMHTNNMSDQKLYGNLPECTDAIINVHGIFIEAARWDLSKG 3996
            ...::.|.::.:|              |.:.|.     .|..|:   ..|.|:.::.|....:|.
  Rat  4531 SWSLEELCLEVNV--------------TASQST-----TLDACS---FGVTGLKLQGATCSNNKL 4573

  Fly  3997 GLCDANFGELFSRMPVVRFKPCLEISPTVRYEA---PLYKTQQRSGVLSTTGHSTNFILAVLLRS 4058
            .|.:|    :.:.:|:.:.:...:.|...:...   |:|....|:.::.|    .:|.:|    :
  Rat  4574 SLSNA----ISTVLPLTQLRWGKQTSAEKKASVVTLPVYLNFTRADLIFT----VDFEIA----T 4626

  Fly  4059 HNDPEFWIMRGTALV 4073
            ..||..:..||.|::
  Rat  4627 KEDPRSFYERGVAVL 4641

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:462462 110/424 (26%)
DYN1 1047..3704 CDD:227570 851/2866 (30%)
AAA_6 1373..1699 CDD:463697 153/367 (42%)
Dynein_C 3750..4073 CDD:465677 67/346 (19%)
Dync1h1NP_062099.3 Stem. /evidence=ECO:0000250 2..1865 283/1326 (21%)
DHC_N1 240..830 CDD:462457 36/190 (19%)
Interaction with DYNC1I2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10893223 446..701 10/57 (18%)
Interaction with DYNC1LI2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10893223 649..800 33/159 (21%)
DYN1 1044..4327 CDD:227570 976/3453 (28%)
AAA 1. /evidence=ECO:0000250 1866..2097 115/230 (50%)
AAA 2. /evidence=ECO:0000250 2178..2450 92/284 (32%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2389..2409 2/19 (11%)
AAA 3. /evidence=ECO:0000250 2554..2803 75/258 (29%)
AAA 4. /evidence=ECO:0000250 2897..3166 85/279 (30%)
Stalk. /evidence=ECO:0000250 3187..3498 79/323 (24%)
AAA 5. /evidence=ECO:0000250 3551..3780 79/230 (34%)
AAA 6. /evidence=ECO:0000250 4003..4219 65/231 (28%)
Dynein_C 4331..4642 CDD:465677 67/348 (19%)

Return to query results.
Submit another query.