DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc16F and Dnah5

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759046.2 Gene:Dnah5 / 294854 RGDID:1560828 Length:4621 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3922 Identity:1183/3922 - (30%)
Similarity:1933/3922 - (49%) Gaps:468/3922 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   382 ARKRAFCKTL---TNFLTYCDMMVYQMLYRITKKSFEDLATSFEVH--------DEVGPSEADIN 435
            |||:...:.|   ...|:|.:......|.::|:.:.|  |....:|        |..|.|:...|
  Rat   940 ARKKKEMEVLEEARELLSYFNHQNTDALLKVTRNTLE--AIRRRIHFSHMINFRDSKGASKVKQN 1002

  Fly   436 KHDRVDKRIEKQRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDRIDIEPS-EDIIRIIFQRITGLILETVLEIHPF 499
                              ..|.|.|.:.|....|.:.|: |||     |:.....:|.::.:   
  Rat  1003 ------------------HLPIFRASVTLAIPNISMTPALEDI-----QQTLNKAVECIISV--- 1041

  Fly   500 TTDPFFTQYTQPSIMGRQEEVLYEGAPDLHYLLRADIRFQYNRKNMFVLIRKAYERARLYTQRFH 564
                      ...:.....|:|.:                          ||..||      :..
  Rat  1042 ----------PKGVRQWSSELLSK--------------------------RKMRER------KMA 1064

  Fly   565 QIRENFEIDNSTDPTVLNTERDLQI------LRAYCDRYCNNVRALDGILEYVFLGLLKLTQTNF 623
            .::.|.:.|:.|:......:..|::      :......|..|:.....|::.|.: |..:..:..
  Rat  1065 AVQSNEDSDSDTEVEESELQETLELASVNLPIPVQTQNYYKNISDNKEIVKLVSV-LSTVISSTK 1128

  Fly   624 KDTVTPV----C------SRLQNVLATYL---PKLAEEETTRLYEEAQDFHGRICYEPHE----- 670
            |:.:|.:    |      ...::.:.|::   |.|:|.|:..||  .|.....|..||..     
  Rat  1129 KEVITSMDRFKCYNHIWQKEKEDTIMTFIAQNPLLSEFESRILY--FQSLEQEINAEPEYICVGS 1191

  Fly   671 ------------TLEIVAHIRFLDK-CS----TELDGIFDGI-DYVHDLLLIIKDFGIPIDD--- 714
                        |.|..|.:..|.: |:    :|::.||..: ::...|...|||    :||   
  Rat  1192 IALYTADLKFSLTAETKAWMMVLGRHCNRKYRSEMENIFTVVEEFQKKLNRPIKD----LDDIRI 1252

  Fly   715 ------DSKEDYMDT--------EDY--LNR-----TRETLEEIREKR---QDFINRLEDAMQDD 755
                  :.:|..:.|        |.|  ||:     .:|.::::...|   :..:.|..| :|::
  Rat  1253 AMAALKEIREQQISTDFQVGPIEESYALLNKYGLLVAKEEMDKVDTLRYAWEKLLARASD-VQNE 1316

  Fly   756 IAALKEDIH-------EVAIEALQPWLLDANSNRLSVTNKLDSMLERLNKCRETADEFLGYQKEF 813
            :.||:....       ||.::..|.:.||.:.|...|:..         |.:|.:|..:.:|.:|
  Rat  1317 LGALQPSFRKELISTVEVFLQDCQQFYLDYDLNGPMVSGL---------KPQEASDRLIIFQNQF 1372

  Fly   814 Q-----------------IDLTMYDEMASGFYDIRMRQNLYRTWSDWEESLAEWIVSDFNTL-NV 860
            .                 :.:|.|.::......:.:.|.:|..::    ::.|.:.|..:|| :.
  Rat  1373 DNIYRKYITYTGGEELFGLPVTQYPQLLEIKKQLNLLQKIYSLYN----NVIETVNSYQDTLWSE 1433

  Fly   861 VDMVELNSKTIK---NCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLPVIGYLRNPNLRARHWAEIED 922
            |::.::||:.::   .|.:..:.|.:......::|:.:.|.|..|::.|:.:..:..|||..|..
  Rat  1434 VNIEKINSELLEFQNRCRKLPRALKDWQAFLDMKKTIDDFSECCPLLEYMASNAMVERHWQRITT 1498

  Fly   923 L------LNRKFFQEKDI----LIQTYEDVHAFDDVAIGEALMQISSQATGEVQLENMLKGIETT 977
            |      :..:.|:.::|    |::..|::   :|:.|         .|..|..:|..||.:...
  Rat  1499 LTGHSLDVGNETFKLRNIMEVPLLKYKEEI---EDICI---------SAVKERDIEQKLKQVINE 1551

  Fly   978 WKETELSIVPHHDAKDVFILAG--TEELQAVLDDSNVNINTIAASKFVGPIKSKVDEWINAMDQF 1040
            |....|:. .....:...:|.|  |.|:.|.::||.:.:.::.::::..|.|:::..|:..:...
  Rat  1552 WDNKTLTF-SSFKTRGELLLRGDSTSEVIASMEDSLMLLGSLLSNRYNMPFKAQIQNWVQCLSNS 1615

  Fly  1041 AKTFESWMDCQGAWIYLEAIFASADIQRQLPHEAKMFFTVDKSFKETVRQAKKV------ALALP 1099
            ....|:||..|..||||||:|...||.:|||.|||.|..:|||:.:.:.:|.::      .:...
  Rat  1616 TDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVGGDIAKQLPKEAKRFSNIDKSWVKIMTRAHEIPNVVQCCVGDE 1680

  Fly  1100 TMSSVDVHKVLVENNRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFPRFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQPHLR 1164
            ||..:..|  |::.   |::..:.|..|||.||:.||||:|:|:..|||||.|......:|.||.
  Rat  1681 TMGQLLPH--LLDQ---LEICQKSLTGYLEKKRLCFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQAHLL 1740

  Fly  1165 KCFDAIYRLEFGSKEGGDGKMVATNDIVAFLSPEGEKLQFGKGLKARGAVEEWLSKVEEAMFVSC 1229
            ..||.|..::|..|        ..:.|::..|.|||.::..|.:.|.|.||.||:.:.|....|.
  Rat  1741 NVFDNIKTVKFHDK--------IYDRILSISSREGETIELDKPVMAEGNVEVWLNSLLEESQSSL 1797

  Fly  1230 KRYMRFGYQCYPAKEREDWFQ------DHPNQVVLTVSQVQWAADIHRIYEGKERNPLNILEKMA 1288
            ...:|..    .|..:|..||      ..|.||.|...|:.|..|.....:.            |
  Rat  1798 HLVIRQA----AANIQESGFQLIEFLSSFPAQVGLLGIQMLWTRDSEEALQN------------A 1846

  Fly  1289 KFEIKCLKD--------LGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKDSVRMLIEKEVCKASDF 1345
            ||:.|.::.        |..|..:|.|::||:.|.....||||.||.:|....|....|...:||
  Rat  1847 KFDKKIMQKTNQSFLELLNMLIEMTTKDLSSMERVKYETLITIHVHQRDIFDDLCHMHVKSPTDF 1911

  Fly  1346 NWLKMLRFYWADETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCYLCLMGAFQMDLGGAPA 1410
            .|||..|||:.::::.....:......|..|:||....||:||||||||:.|..|..|.:|||||
  Rat  1912 EWLKQCRFYFKEDSDKTMIHITDVAFTYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPA 1976

  Fly  1411 GPAGTGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAWCCFDEFNRIDIEVLSV 1475
            |||||||||||||:.:.|.|..|||||||.:|::.:||.|.||||.|:|.|||||||||:.||||
  Rat  1977 GPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIDLPVLSV 2041

  Fly  1476 IAQQLITIRTAKAMRVKRFIF-EGREIKINRSCCVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPISMMVP 1539
            .|||:..|.|.|....|.||| :|..:.:|....:|:|||||||||.|||:|||..||.::||||
  Rat  2042 AAQQISIILTCKKEHKKSFIFTDGDNVTMNPEFGLFLTMNPGYAGRQELPENLKINFRSVAMMVP 2106

  Fly  1540 DYALISEVILYSEGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAVKSVLVMAGALKRASPN 1604
            |..:|..|.|.|.||.|..:||||...:||||.:|||:|.|||||:|.:.|||...||.||||..
  Rat  2107 DRQIIIRVKLASCGFIDNVVLARKFFTLYQLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKRASHT 2171

  Fly  1605 QREDITLIAALRDSNIPKFLADDAVLFRGILSDLFPGVELPDSQHPHLEASLRLGLRQKNLQAVP 1669
            ..|...::..|||.|:.|.:.:|..||..::.||||.:.|..:.:|.||.::...:.:..|...|
  Rat  2172 DTESTIVMRVLRDMNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPNILLDKAGYPELETAISKQVEEAGLINHP 2236

  Fly  1670 TTIRKCLQLYETMCVRWGVMLVGPTGGGKSVVLHALEFALSHLFENEVQDPNFRPVVIQTMNPKA 1734
            ....|.:||:||..||.|:|.:||:|.||:..:|.|..|::..         .:|.....|||||
  Rat  2237 PWKLKVIQLFETQRVRHGMMTLGPSGSGKTSCIHTLMKAMTDC---------GKPHREMRMNPKA 2292

  Fly  1735 VTMNELYGYVDLKTLEWQDGLLGLAVRTATTVEDEIHQWIMCDGPVDAVWIENLNTVLDDNKMLC 1799
            :|..:::|.:|:.|.:|.||:.....|.....:...|.||:.||||||:||||||:||||||.|.
  Rat  2293 ITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGEHIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLT 2357

  Fly  1800 LANSERIKLTAWIHMLFEVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGWIPLIDTWREVDMKHKLPAPL 1864
            |||.:||.:.....::||..::..||||||||.|||::....|.|.|:::.:    :|.:.|.. 
  Rat  2358 LANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLDWSPILEGF----LKRRSPQE- 2417

  Fly  1865 AEFCYQLFVGYF---------DKALKIERKRA---VYTIHQVLGSKVRLCCELNSAQFEAVKWSA 1917
            ||...||:...|         :...|:|...|   ..:.|.:.|               .:....
  Rat  2418 AEILRQLYAETFPDLYRFSIQNLEFKMEILEAFVITQSTHMLQG---------------LIPTKE 2467

  Fly  1918 MSEEQGKELVTKIFAWAVLWAIASNLKDAEKVSFEEQWSKA----IAQHPNMTLPNFTLWNYRID 1978
            .:.:...|.:.::|.:|::|::.:.| :.|.....|.|.::    ....|.:|.|..|:::|.:.
  Rat  2468 QAGDVDPEHLGRLFVFAMMWSVGAVL-ELEGRRRMELWLRSREGPTLHLPQLTDPGDTMFDYYVA 2531

  Fly  1979 LEKMDWGSWIDIMAKFVFDPETS--YYDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVMVTGDTGVGKTV 2041
            .:. .|..|...:.::|:.|:|:  |..:.||.||..:..::...:.|:|..|::.|:.|..|||
  Rat  2532 PDG-TWRHWSMCIPEYVYPPDTTPEYGSILVPNVDNVRTDFLIKTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTV 2595

  Fly  2042 LAISCMKRLSQGNVIPVILNFSAQTSSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLGAPVGKTVIVFIDDVNMPK 2106
            :....|.:....:.....||||:.|:....|..||..::||..|..|.|.||.:.|||||:|||.
  Rat  2596 IIKGFMSKFDPESHTVKNLNFSSATTPLMFQRTIESYVDKRMGTTYGPPAGKKMAVFIDDLNMPV 2660

  Fly  2107 LDTYGASPAIELLRQFLDFKGFYDREKL-YWKEILDVVLGCACAPPGGGRNPLTPRFVRHFALFS 2170
            ::.:|.....|::||.::..|||:.||. .:..|:|:....|...||||||.:..|..|.|::|:
  Rat  2661 INEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFYNLEKPGEFTSIVDIQFLAAMIHPGGGRNDIPQRLKRQFSIFN 2725

  Fly  2171 LPKPNEETLTQIFNGILRGFLQTFSSAVRALSEPMVNACVD-------VYMRVATVMLPTPDKSH 2228
            ...|::.::.:||..|..|:.    .|.|..|:.:.:|.:.       ::......|||||.|.|
  Rat  2726 CTLPSDASMDKIFGVIGEGYY----CAQRGFSKEVQDAVIKLVPLTRRLWQMTKLKMLPTPAKFH 2786

  Fly  2229 YIFNLRDLSKCIQGILQASNLHYNQENQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKNIFKALMKEVCMDH 2293
            |:|||||||:..||:|..::......:::|||:.||..||..||.....|...|...:..:..:.
  Rat  2787 YVFNLRDLSRIWQGMLNITSEVIKDTDELLRLWKHECKRVIADRFSMSSDVTWFDKAVVSLVEEE 2851

  Fly  2294 FNR---PVINDNEPPILFGDFM-----VFGKPKNE------RIYDEIRDHTKLESVLNDYIADYN 2344
            |..   ||: |......|.||:     ..|:...|      ::|:.|.....|:..|:.::..||
  Rat  2852 FGEEKTPVV-DCGVDAYFVDFLRDAPEATGETPEETDAEMPKLYEPIASLNHLQERLSVFLQLYN 2915

  Fly  2345 SVAVGKQMKLILFQDAMEHTVRLARLLRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLASHVNEYNCWQIEMR 2409
            ....|..|.::.|:|||.|.|:::|::|:.|||.|||||.|.||||||||||.:..|..:||.:.
  Rat  2916 ESIRGTGMDMVFFRDAMVHLVKISRVIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGYTSFQITLT 2980

  Fly  2410 RNYDLNAFHEDLRVLYRIAGIDNQPVTFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGEVPNLFEGDEFEKI 2474
            |:|:.:...|||:||||.||...:.:||:..|::|.||.|||.:||:|:||||.|||..||.::|
  Rat  2981 RSYNTSNLMEDLKVLYRTAGQQGKGITFIFTDNEIKEESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEIDEI 3045

  Fly  2475 ILDARDGCNENRKDDPCTRDDIYKFFINRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCRMFPSLVNCTTIDW 2539
            ..|......:.....|.|.|::|::|::|||.|||:|:..||||:.||.|...||:|::..||||
  Rat  3046 NSDLTSIMKKEHPKRPPTNDNLYEYFMSRVRGNLHIVLCFSPVGEKFRNRALKFPALISGCTIDW 3110

  Fly  2540 FTSWPTEALYSVALGLLT--KIAPKMEDRISLASTTVFMHKTVEDASVKFYKEMKRHYYTTPSSY 2602
            |:.||.:||.:|:...|:  .|....|.:..|..........|.:....:::..:|..:.||.||
  Rat  3111 FSRWPKDALVAVSEHFLSSYNIDCTAEIKKELVQCMGSFQDGVAEKCADYFQRFRRSTHVTPKSY 3175

  Fly  2603 LELLKLYQNLLKIKNMEIIAKRKRIANGLNKLLETNEVIAVMGKELEVMVPQLDEKSAMMKSLVD 2667
            |..::.|:.:.:.|::|:.:...|:..||.||.|.:|.:|.:.:||.|...:|...:.....::.
  Rat  3176 LSFIQGYKFIYEEKHVEVQSLANRMNTGLEKLKEASESVAALSQELAVKEKELQVANEKADMVLK 3240

  Fly  2668 NLTKETKQADAVKQSVLEDEMNAKEKA-AVAQAISED---AGKDLEIAMPALREAEEALKGLTKA 2728
            .:|.:.:.|:.||..|    ...|:|| |:..:||:|   |.:.||.|.|||.|||.||:.:..:
  Rat  3241 EVTMKAQAAEKVKAEV----QKVKDKAQAIVDSISKDKAIAEEKLEAAKPALEEAEAALQTIKPS 3301

  Fly  2729 DINELKSFTTPPALVQFCMEAVCILL-----GVK---------PTWASAKAIMADINFIKRLFEY 2779
            ||..:::...||.|:...|:.|.:|.     .||         |:|..:..:|...||::.|.::
  Rat  3302 DIATVRTLGRPPHLIMRIMDCVLLLFHRRVNAVKIDLDKSCTVPSWQESLKLMTAGNFLQNLQQF 3366

  Fly  2780 DKEHMKEDTLKKVKKYIDHKDFVPAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSKVYKVVEP-------KI 2837
            .|:.:.|:.::.:..|.:..|:.....::|......:..|..:|..|..:.|.|.|       :.
  Rat  3367 PKDTINEEVIEFLSPYFEMSDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMASFFSINKEVLPLKANLIVQE 3431

  Fly  2838 KRKEAAEAELKEVMTVLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSLEEKQREFQVIQDNVDLTYGRINRAGRL 2902
            .|...|..:|::....|..||.||..|:|:       .|:...|.|.:.::.|....::..|..|
  Rat  3432 NRHALAMQDLQKAQAELDDKQAELDVVQAE-------YEQAMTEKQTLLEDADRCRHKMQTASTL 3489

  Fly  2903 TSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVLVAAACVAYLGAFSHEYRRDMSALWVSKCREHKIPS 2967
            .|.|:.|:.||.|..|.....:..:.||||:|.|.::|.|.|:.|:|..:...|..:.:..|||.
  Rat  3490 ISGLAGEKERWTEQSKEFAAQIKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRDLLLNDWKKEMKARKIPF 3554

  Fly  2968 SPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNISIENGIYATRALRWALMIDPQEQANRWIRNMERANN 3032
            ..:.||.::|.|...:.:||:.|||.|::||:|||..|:|.|..|:||||.|...||||.|..|.
  Rat  3555 GNDLNLNEMLIDAPTISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKASRSPLLIDPQTQGKIWIRNKESQNE 3619

  Fly  3033 LQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPSLRPILQRETYRFEGRTY-LKLGDMVIDY 3096
            ||:..:........||:::..|.|:|:|::.|.:||:|..:|::...: .|.|: :|:||..:|.
  Rat  3620 LQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIK-TGSTFKVKVGDKEVDV 3683

  Fly  3097 DDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFLVTESGLEDQLLADIVAIELPAMEIQRNDLVVKIN 3161
            .|.||||:|||||||.|.||:.....:::|.||..|||||||..::..|...:|.:|..|:.::.
  Rat  3684 MDGFKLYITTKLPNPAYTPEISARTAIIDFTVTVKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLLEEVT 3748

  Fly  3162 SDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAKETSLIIAARLIDTEETEKVITASRERY 3226
            ::|::...|||.:|..|.:::|::::||.|:..|::.|:|:..:..:|..:.|||..|.::||.|
  Rat  3749 ANKRRTKELEDNLLYRLTSTQGSLVEDESLIVVLSNTKKTAEEVTQKLEISGETEIQINSAREEY 3813

  Fly  3227 RILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNVLRLDHPPQSVEVRISTLMTDELRAIFD 3291
            |.:|:||:||||::..:..::.|||.||:.|..:|...|...........||..::......:|.
  Rat  3814 RPVATRGSILYFLITEMRLVNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIGNIIEHMTYEVFK 3878

  Fly  3292 NISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTEEEFLFLSRGPVGNIRTKIQPAKIK--MSQIEWDS 3354
            ...:||:|.||.:|:.||.|.::.|...|..||||.|.:|. .::..|..|.|..  :..:.|.:
  Rat  3879 YAVQGLYEEHKFLFTLLLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGG-ASLDLKACPHKPSKWILDMTWLN 3942

  Fly  3355 CIFLEDNFSSFFSGLTDELDKPFFIQMQENKEVFD--FAQTN---QPPTDKWNKRLRVFHKLMFI 3414
            .:.|     |.....:|.||     |:..|::::.  |.:.|   :|..:.::|.|..|.:|:.|
  Rat  3943 LVEL-----SKLKQFSDILD-----QISRNEKLWRIWFDKENPEEEPLPNAYDKSLDCFRRLLLI 3997

  Fly  3415 SAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGT--QLSSVYLDTSAVTPLIFVLSTGSDPMSGFLKF 3477
            .::...|.:.....|:..::|:.:.|   |.  .|...:.::...||||.:||.||||....:..
  Rat  3998 RSWCPDRTIAQARKYIMDSMGENYAE---GVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDSIIAL 4059

  Fly  3478 TTQMQFTDKYYSISLGQGQGPLAENLIEKSLRLGHWVFLQNCHLATSFMQTLETIVRNLTLGITK 3542
            ..:::...:|  :|:||||...|..|:.:::..|.||.||||||...|:..|..:|..    ...
  Rat  4060 GKRLKIETRY--VSMGQGQEVHARKLLHQTMANGGWVLLQNCHLGLDFLDELMDVVTE----TET 4118

  Fly  3543 AHVDFRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEPPKGIKANVFGALTDLKQDFFEQHIQNGNWRAIV 3607
            .|..|||::::...:.|||::||.|:|..||||:|::|.:......:.||..:..: ...|:.::
  Rat  4119 VHDTFRLWITTEVHKQFPITLLQMSIKFANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDLLDVSV-GAQWKPML 4182

  Fly  3608 FGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESDRECGLKTLDFFI-DREVLDEIPWEAILYINGDIT 3671
            :.:...|:.:.||||||||||||.|||:::|....::.:...: |.::...:.|..:.|:.|:|.
  Rat  4183 YAVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADFNATVQFIQNHLDDMDIKKGVSWTTVRYMIGEIQ 4247

  Fly  3672 WGGRVTDYWDLRCLRTILTIFSSKRIIQPDYKYCRGDSYYRDPRKKTLTEYSAYVQGFPVLEDPE 3736
            :||||||.:|.|.|.|...::.|:.:..||:.:.:|   |..|:..|:..|..|:|..|..:.||
  Rat  4248 YGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENMFGPDFTFYQG---YNIPKCSTVDGYLQYIQSLPAYDSPE 4309

  Fly  3737 IFGMNQNANIVFQTKETAFFINTLLLGQPRSAADEGQAMENEIAQQTIARIQKALATKIKRE--P 3799
            :||::.||:|.:|:|.....::|:|..||:.::..|    :|..:..:||:...:..|:..:  |
  Rat  4310 VFGLHPNADITYQSKLAKDVLDTILGIQPKDSSGGG----DETREAVVARLADDMLEKLPEDYSP 4370

  Fly  3800 IHDTLSVLDAKGQVPSLTIVLVQEIDRFNIALGIIHDSLVNLSKAIKGLVVMSEELENVFKALLS 3864
            . :....|...|....:.|.|.|||||....|.::..:|..|..|:.|.::||:.|.:....:..
  Rat  4371 F-EVKERLQKMGPFQPMNIFLRQEIDRMQRVLSLVRSTLTELKLAVDGTIIMSDNLRDALDCMFD 4434

  Fly  3865 NQVPASWAKRSFLSIKPLPSYISDFQRRIDFIQQWAENGAPRSYWISGFFFPQSFLTGVLQTYAR 3929
            .::||.|.|.|::| ..|..:.::...|......|..||.|..:|::|||.||.|||.:.|...|
  Rat  4435 ARIPARWKKASWVS-STLGFWFTELLERNCQFTSWVSNGRPHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEITR 4498

  Fly  3930 -RRVLPIDSLKIDFDVFERELVQQDFFEMHTNNMSDQKLYGNLPECTDAIINVHGIFIEAARWDL 3993
             .:...:|::.:..:|  .:.::.|.....|..                 :.|:|:::|.|.||.
  Rat  4499 ANKGWALDNMVLCNEV--TKFMKDDISAPPTEG-----------------VYVYGLYLEGAGWDK 4544

  Fly  3994 SKGGLCDANFGELFSRMPVVRFKPCLEISPTVR----YEAPLYKTQQRSGVLSTTGHSTNFILAV 4054
            ....|.::....||..|||:|.   ...:.|.|    |..|:||...|:.:        |:|.||
  Rat  4545 RNMKLIESKPKVLFELMPVIRI---FAENNTARDPRLYCCPIYKKPVRTDL--------NYIAAV 4598

  Fly  4055 LLRSHNDPEFWIMRGTALVSAV 4076
            .|::...||.||:||.||:..|
  Rat  4599 DLKTAQAPEHWILRGVALLCDV 4620

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:285579 113/426 (27%)
P-loop_NTPase 1373..1603 CDD:304359 135/230 (59%)
P-loop_NTPase 1687..1832 CDD:304359 60/144 (42%)
P-loop_NTPase 1994..2264 CDD:304359 92/279 (33%)
P-loop_NTPase 2343..2613 CDD:304359 112/271 (41%)
MT 2625..2957 CDD:289543 97/356 (27%)
AAA_9 2985..3201 CDD:289547 86/216 (40%)
Dynein_heavy 3342..4066 CDD:281078 207/740 (28%)
Dnah5XP_008759046.2 DHC_N1 250..802 CDD:400611
DHC_N2 1399..1804 CDD:400618 114/434 (26%)
DYN1 <1640..4282 CDD:227570 927/2739 (34%)
AAA_6 1939..2266 CDD:403853 168/326 (52%)
Dynein_C 4326..4618 CDD:408026 87/327 (27%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.